MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sideroxydans lithotrophicus ES-1 chromosome

Total Repeats: 60283

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
52501	NC_013959	CATG	2	8	2628197	2628204	25 %	25 %	25 %	25 %	291615041
52502	NC_013959	CAG	2	6	2628297	2628302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291615041
52503	NC_013959	CAC	2	6	2628358	2628363	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291615041
52504	NC_013959	CGC	2	6	2628453	2628458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291615041
52505	NC_013959	CCA	2	6	2628471	2628476	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291615041
52506	NC_013959	TGA	2	6	2628620	2628625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291615041
52507	NC_013959	GCA	2	6	2628665	2628670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291615041
52508	NC_013959	CGG	3	9	2628671	2628679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291615041
52509	NC_013959	CGCGC	2	10	2628691	2628700	0 %	0 %	40 %	60 %	291615041
52510	NC_013959	A	6	6	2628776	2628781	100 %	0 %	0 %	0 %	291615042
52511	NC_013959	GC	3	6	2628832	2628837	0 %	0 %	50 %	50 %	291615042
52512	NC_013959	CGG	2	6	2628874	2628879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291615042
52513	NC_013959	CGC	2	6	2628897	2628902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291615042
52514	NC_013959	CGCTG	2	10	2628939	2628948	0 %	20 %	40 %	40 %	291615042
52515	NC_013959	ACGCA	2	10	2628979	2628988	40 %	0 %	20 %	40 %	291615042
52516	NC_013959	CGC	2	6	2629002	2629007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291615042
52517	NC_013959	CTC	2	6	2629117	2629122	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291615042
52518	NC_013959	GCTTC	2	10	2629139	2629148	0 %	40 %	20 %	40 %	291615042
52519	NC_013959	CG	3	6	2629170	2629175	0 %	0 %	50 %	50 %	291615042
52520	NC_013959	CCA	2	6	2629197	2629202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291615042
52521	NC_013959	CG	3	6	2629230	2629235	0 %	0 %	50 %	50 %	291615042
52522	NC_013959	GCCC	2	8	2629257	2629264	0 %	0 %	25 %	75 %	291615042
52523	NC_013959	CAGC	2	8	2629305	2629312	25 %	0 %	25 %	50 %	291615042
52524	NC_013959	CTG	2	6	2629352	2629357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291615042
52525	NC_013959	CTATG	2	10	2629377	2629386	20 %	40 %	20 %	20 %	291615042
52526	NC_013959	CT	3	6	2629397	2629402	0 %	50 %	0 %	50 %	291615042
52527	NC_013959	CGC	2	6	2629431	2629436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291615042
52528	NC_013959	GCA	2	6	2629455	2629460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291615042
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52531	NC_013959	CGC	2	6	2629607	2629612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291615043
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52541	NC_013959	GCGAT	2	10	2629966	2629975	20 %	20 %	40 %	20 %	291615043
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52547	NC_013959	GCATC	2	10	2630227	2630236	20 %	20 %	20 %	40 %	291615043
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52551	NC_013959	GC	3	6	2630392	2630397	0 %	0 %	50 %	50 %	291615043
52552	NC_013959	CCGCAC	2	12	2630422	2630433	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	291615043
52553	NC_013959	TGC	2	6	2630445	2630450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291615043
52554	NC_013959	CTG	2	6	2630456	2630461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291615043
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52560	NC_013959	CGG	3	9	2630577	2630585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291615043
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52572	NC_013959	TGCC	2	8	2631130	2631137	0 %	25 %	25 %	50 %	291615044
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52593	NC_013959	GCC	2	6	2632009	2632014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291615045
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52597	NC_013959	CTG	2	6	2632259	2632264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291615045
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52600	NC_013959	TGA	2	6	2632404	2632409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291615045
52601	NC_013959	GC	4	8	2632436	2632443	0 %	0 %	50 %	50 %	291615045
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52604	NC_013959	CGTTG	2	10	2632611	2632620	0 %	40 %	40 %	20 %	291615046
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52609	NC_013959	CT	3	6	2632904	2632909	0 %	50 %	0 %	50 %	291615046
52610	NC_013959	TCG	2	6	2632913	2632918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291615046
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52616	NC_013959	CCT	2	6	2633028	2633033	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	291615046
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52618	NC_013959	TCT	2	6	2633114	2633119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	291615046
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52724	NC_013959	GATC	2	8	2639172	2639179	25 %	25 %	25 %	25 %	291615054
52725	NC_013959	TGCC	2	8	2639199	2639206	0 %	25 %	25 %	50 %	291615054
52726	NC_013959	CGTACC	2	12	2639284	2639295	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	291615054
52727	NC_013959	ATTG	2	8	2639311	2639318	25 %	50 %	25 %	0 %	291615054
52728	NC_013959	TGC	2	6	2639343	2639348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291615054
52729	NC_013959	AGCC	2	8	2639354	2639361	25 %	0 %	25 %	50 %	291615054
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52731	NC_013959	GCA	2	6	2639403	2639408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291615054
52732	NC_013959	CGC	2	6	2639460	2639465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291615054
52733	NC_013959	GTC	3	9	2639477	2639485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291615054
52734	NC_013959	CCGC	2	8	2639493	2639500	0 %	0 %	25 %	75 %	291615054
52735	NC_013959	GCA	2	6	2639564	2639569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291615054
52736	NC_013959	GTC	2	6	2639591	2639596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291615054
52737	NC_013959	TGC	2	6	2639617	2639622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291615054
52738	NC_013959	GTG	3	9	2639666	2639674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	291615054
52739	NC_013959	CGT	2	6	2639737	2639742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291615054
52740	NC_013959	GGCAT	2	10	2639838	2639847	20 %	20 %	40 %	20 %	291615054
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52742	NC_013959	CGG	2	6	2639871	2639876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	291615054
52743	NC_013959	TCG	2	6	2640044	2640049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291615054
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52758	NC_013959	GCA	2	6	2640873	2640878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291615054
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52765	NC_013959	CGA	2	6	2641098	2641103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291615054
52766	NC_013959	GCA	2	6	2641169	2641174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291615054
52767	NC_013959	C	7	7	2641177	2641183	0 %	0 %	0 %	100 %	291615054
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52785	NC_013959	CGC	2	6	2641935	2641940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	291615054
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52820	NC_013959	ATCGC	2	10	2643591	2643600	20 %	20 %	20 %	40 %	291615056
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52833	NC_013959	GGTCG	2	10	2644042	2644051	0 %	20 %	60 %	20 %	291615057
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52835	NC_013959	TGT	2	6	2644140	2644145	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	291615057
52836	NC_013959	CGT	2	6	2644195	2644200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291615057
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52838	NC_013959	CCA	2	6	2644401	2644406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	291615057
52839	NC_013959	TGA	3	9	2644416	2644424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291615057
52840	NC_013959	CGA	2	6	2644443	2644448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	291615057
52841	NC_013959	C	6	6	2644635	2644640	0 %	0 %	0 %	100 %	291615058
52842	NC_013959	TGC	2	6	2644736	2644741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	291615058
52843	NC_013959	CG	3	6	2644762	2644767	0 %	0 %	50 %	50 %	291615058
52844	NC_013959	ATG	2	6	2644824	2644829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	291615058
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52846	NC_013959	TACAG	2	10	2645245	2645254	40 %	20 %	20 %	20 %	291615059
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52963	NC_013959	CG	3	6	2650983	2650988	0 %	0 %	50 %	50 %	291615065
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