MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptomyces scabiei 87.22 chromosome

Total Repeats: 257804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013929	GGCC	2	8	1201	1208	0 %	0 %	50 %	50 %	290954632
2	NC_013929	CGG	2	6	1241	1246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	290954632
3	NC_013929	TCG	2	6	1250	1255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	290954632
4	NC_013929	AGC	2	6	1277	1282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	290954632
5	NC_013929	AGG	2	6	1325	1330	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	290954632
6	NC_013929	CGGAGC	2	12	1376	1387	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	290954632
7	NC_013929	CGG	2	6	1464	1469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	290954632
8	NC_013929	GCT	2	6	1508	1513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	290954632
9	NC_013929	GAC	2	6	1536	1541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	290954632
10	NC_013929	CT	3	6	1544	1549	0 %	50 %	0 %	50 %	290954632
11	NC_013929	AGG	2	6	1580	1585	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	290954632
12	NC_013929	GAG	2	6	1633	1638	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	290954632
13	NC_013929	GACG	2	8	1639	1646	25 %	0 %	50 %	25 %	290954632
14	NC_013929	ATC	2	6	1724	1729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	290954633
15	NC_013929	CAC	3	9	1967	1975	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	290954633
16	NC_013929	CT	3	6	2039	2044	0 %	50 %	0 %	50 %	290954633
17	NC_013929	CGA	2	6	2063	2068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	290954633
18	NC_013929	CGGG	2	8	2116	2123	0 %	0 %	75 %	25 %	290954633
19	NC_013929	CAG	2	6	2139	2144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	290954633
20	NC_013929	CAT	2	6	2165	2170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	290954633
21	NC_013929	CGA	2	6	2171	2176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	290954633
22	NC_013929	GGC	2	6	2213	2218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	290954633
23	NC_013929	ACA	2	6	2227	2232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	290954633
24	NC_013929	CGC	2	6	2240	2245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	290954633
25	NC_013929	CGC	2	6	2285	2290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	290954633
26	NC_013929	CCCG	2	8	2293	2300	0 %	0 %	25 %	75 %	290954633
27	NC_013929	AGCGC	2	10	2483	2492	20 %	0 %	40 %	40 %	290954633
28	NC_013929	CCA	2	6	2570	2575	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	290954633
29	NC_013929	GGA	2	6	2582	2587	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	290954633
30	NC_013929	ACG	2	6	2641	2646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	290954633
31	NC_013929	CGA	3	9	2651	2659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	290954633
32	NC_013929	GGC	2	6	2663	2668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	290954633
33	NC_013929	AGCC	2	8	2720	2727	25 %	0 %	25 %	50 %	290954633
34	NC_013929	GCG	2	6	2767	2772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	290954633
35	NC_013929	ACC	2	6	2773	2778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	290954633
36	NC_013929	CCA	2	6	2830	2835	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	290954633
37	NC_013929	CCA	2	6	3004	3009	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	290954633
38	NC_013929	ATC	2	6	3021	3026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	290954633
39	NC_013929	TCC	2	6	3103	3108	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	290954633
40	NC_013929	ATG	2	6	3124	3129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	290954633
41	NC_013929	TCG	2	6	3136	3141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	290954633
42	NC_013929	AGC	2	6	3165	3170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	290954633
43	NC_013929	TCG	2	6	3214	3219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	290954633
44	NC_013929	CGG	2	6	3224	3229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	290954633
45	NC_013929	CG	3	6	3307	3312	0 %	0 %	50 %	50 %	290954633
46	NC_013929	CGC	2	6	3314	3319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	290954633
47	NC_013929	CGC	2	6	3326	3331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	290954633
48	NC_013929	CCA	2	6	3500	3505	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	290954633
49	NC_013929	GGA	2	6	3536	3541	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	290954633
50	NC_013929	GCG	2	6	3542	3547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	290954633
51	NC_013929	CTG	2	6	3555	3560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	290954633
52	NC_013929	CGC	2	6	3620	3625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	290954633
53	NC_013929	C	6	6	3661	3666	0 %	0 %	0 %	100 %	290954633
54	NC_013929	GCA	2	6	3719	3724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	290954633
55	NC_013929	CGG	2	6	3738	3743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	290954633
56	NC_013929	GGC	2	6	3747	3752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	290954633
57	NC_013929	GCGG	2	8	3770	3777	0 %	0 %	75 %	25 %	290954633
58	NC_013929	GC	3	6	3782	3787	0 %	0 %	50 %	50 %	290954633
59	NC_013929	GCG	2	6	3798	3803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	290954633
60	NC_013929	CGA	2	6	3926	3931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	290954633
61	NC_013929	AGC	2	6	3991	3996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	290954633
62	NC_013929	CGA	2	6	4066	4071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	290954633
63	NC_013929	CAG	2	6	4089	4094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	290954633
64	NC_013929	CG	3	6	4162	4167	0 %	0 %	50 %	50 %	290954633
65	NC_013929	GTG	2	6	4378	4383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	290954634
66	NC_013929	GTT	2	6	4442	4447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	290954634
67	NC_013929	GGCG	2	8	4450	4457	0 %	0 %	75 %	25 %	290954634
68	NC_013929	CTG	2	6	4478	4483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	290954634
69	NC_013929	TGC	2	6	4509	4514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	290954634
70	NC_013929	GTG	2	6	4521	4526	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	290954634
71	NC_013929	GAG	2	6	4592	4597	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	290954634
72	NC_013929	TTCC	2	8	4673	4680	0 %	50 %	0 %	50 %	290954634
73	NC_013929	GCT	2	6	4703	4708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	290954634
74	NC_013929	CTG	2	6	4766	4771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	290954634
75	NC_013929	GCC	2	6	4854	4859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	290954634
76	NC_013929	CGT	2	6	4953	4958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	290954635
77	NC_013929	TGC	2	6	4972	4977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	290954635
78	NC_013929	AGT	2	6	5019	5024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	290954635
79	NC_013929	TCG	2	6	5057	5062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	290954635
80	NC_013929	GGC	2	6	5074	5079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	290954635
81	NC_013929	CGG	2	6	5142	5147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	290954635
82	NC_013929	CGT	2	6	5151	5156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	290954635
83	NC_013929	AGG	2	6	5210	5215	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	290954635
84	NC_013929	CCG	2	6	5276	5281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	290954635
85	NC_013929	ACG	2	6	5285	5290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	290954635
86	NC_013929	CCG	2	6	5309	5314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	290954635
87	NC_013929	CGG	2	6	5316	5321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	290954635
88	NC_013929	TGC	2	6	5325	5330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	290954635
89	NC_013929	CCAGGG	2	12	5343	5354	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	290954635
90	NC_013929	GTG	2	6	5381	5386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	290954635
91	NC_013929	GAG	2	6	5395	5400	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	290954635
92	NC_013929	TGGG	2	8	5407	5414	0 %	25 %	75 %	0 %	290954635
93	NC_013929	GCG	2	6	5521	5526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	290954635
94	NC_013929	GC	3	6	5549	5554	0 %	0 %	50 %	50 %	290954635
95	NC_013929	TGG	2	6	5562	5567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	290954635
96	NC_013929	TGG	2	6	5585	5590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	290954635
97	NC_013929	GCC	2	6	5602	5607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	290954635
98	NC_013929	GCCG	2	8	5670	5677	0 %	0 %	50 %	50 %	290954635
99	NC_013929	CGG	2	6	5780	5785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	290954635
100	NC_013929	GGATGC	2	12	5814	5825	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	290954635
101	NC_013929	TGGTC	2	10	5847	5856	0 %	40 %	40 %	20 %	290954635
102	NC_013929	CGA	2	6	5910	5915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	290954635
103	NC_013929	GCG	2	6	5926	5931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	290954635
104	NC_013929	CGA	2	6	5940	5945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	290954635
105	NC_013929	GGC	2	6	5997	6002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	290954635
106	NC_013929	TCG	2	6	6014	6019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	290954635
107	NC_013929	CGT	2	6	6036	6041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	290954635
108	NC_013929	GCC	2	6	6079	6084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	290954635
109	NC_013929	CGG	2	6	6138	6143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	290954635
110	NC_013929	AGC	2	6	6158	6163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	290954635
111	NC_013929	CGTC	2	8	6218	6225	0 %	25 %	25 %	50 %	290954635
112	NC_013929	GGCG	2	8	6258	6265	0 %	0 %	75 %	25 %	290954635
113	NC_013929	CGA	2	6	6282	6287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	290954635
114	NC_013929	GGA	2	6	6351	6356	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	290954635
115	NC_013929	CGG	2	6	6372	6377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	290954635
116	NC_013929	GGT	2	6	6444	6449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	290954635
117	NC_013929	CGG	2	6	6483	6488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	290954635
118	NC_013929	GTA	2	6	6577	6582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	290954635
119	NC_013929	CGCAG	2	10	6585	6594	20 %	0 %	40 %	40 %	290954635
120	NC_013929	TGA	2	6	6600	6605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	290954635
121	NC_013929	GAT	2	6	6613	6618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	290954635
122	NC_013929	TCG	2	6	6668	6673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	290954635
123	NC_013929	TGC	2	6	6696	6701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	290954635
124	NC_013929	CAG	2	6	6707	6712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	290954635
125	NC_013929	GCA	2	6	6804	6809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	290954635
126	NC_013929	GCG	2	6	6863	6868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	290954635
127	NC_013929	TCT	2	6	6885	6890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	290954635
128	NC_013929	CTC	2	6	6957	6962	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	290954635
129	NC_013929	CGG	2	6	7116	7121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	290954635
130	NC_013929	TCTGG	2	10	7138	7147	0 %	40 %	40 %	20 %	290954635
131	NC_013929	TGC	2	6	7148	7153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	290954635
132	NC_013929	GTG	2	6	7166	7171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	290954635
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135	NC_013929	CCCG	2	8	7277	7284	0 %	0 %	25 %	75 %	290954635
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256	NC_013929	CG	3	6	11505	11510	0 %	0 %	50 %	50 %	290954639
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260	NC_013929	TGG	2	6	11621	11626	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	290954639
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262	NC_013929	GGA	2	6	11693	11698	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	290954639
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379	NC_013929	CTC	2	6	16654	16659	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	290954642
380	NC_013929	ACA	2	6	16685	16690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	290954642
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382	NC_013929	GAA	3	9	16732	16740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	290954642
383	NC_013929	CCCG	2	8	16770	16777	0 %	0 %	25 %	75 %	290954642
384	NC_013929	CGC	2	6	16785	16790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	290954642
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500	NC_013929	CGTC	2	8	22566	22573	0 %	25 %	25 %	50 %	290954653

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