MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus lugdunensis HKU09-01 chromosome

Total Repeats: 52593

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013893	AAG	2	6	577	582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289549372
2	NC_013893	CATTA	2	10	623	632	40 %	40 %	0 %	20 %	289549372
3	NC_013893	TCA	2	6	654	659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289549372
4	NC_013893	ACA	2	6	680	685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289549372
5	NC_013893	ATG	2	6	810	815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289549372
6	NC_013893	AGTT	2	8	1076	1083	25 %	50 %	25 %	0 %	289549373
7	NC_013893	TGT	3	9	1114	1122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289549373
8	NC_013893	GTA	2	6	1126	1131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289549373
9	NC_013893	TAAT	2	8	1145	1152	50 %	50 %	0 %	0 %	289549373
10	NC_013893	AAT	2	6	1155	1160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289549373
11	NC_013893	AATTG	2	10	1189	1198	40 %	40 %	20 %	0 %	289549373
12	NC_013893	TAAA	2	8	1227	1234	75 %	25 %	0 %	0 %	289549373
13	NC_013893	CAA	2	6	1238	1243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289549373
14	NC_013893	TTC	2	6	1337	1342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289549373
15	NC_013893	TTC	2	6	1347	1352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289549373
16	NC_013893	CAT	2	6	1376	1381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289549373
17	NC_013893	TAA	2	6	1437	1442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289549373
18	NC_013893	TTA	2	6	1478	1483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289549373
19	NC_013893	TAA	2	6	1603	1608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289549374
20	NC_013893	A	6	6	1612	1617	100 %	0 %	0 %	0 %	289549374
21	NC_013893	AT	3	6	1624	1629	50 %	50 %	0 %	0 %	289549374
22	NC_013893	TAG	2	6	1640	1645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289549374
23	NC_013893	CTG	2	6	1690	1695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289549374
24	NC_013893	AGAA	2	8	1700	1707	75 %	0 %	25 %	0 %	289549374
25	NC_013893	ATA	2	6	1731	1736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289549374
26	NC_013893	TTGA	2	8	1791	1798	25 %	50 %	25 %	0 %	289549374
27	NC_013893	AAT	2	6	1812	1817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289549374
28	NC_013893	A	6	6	1833	1838	100 %	0 %	0 %	0 %	289549374
29	NC_013893	GCTT	2	8	1890	1897	0 %	50 %	25 %	25 %	289549374
30	NC_013893	TCAT	2	8	1938	1945	25 %	50 %	0 %	25 %	289549374
31	NC_013893	CTA	2	6	1950	1955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289549374
32	NC_013893	AC	3	6	1967	1972	50 %	0 %	0 %	50 %	289549374
33	NC_013893	T	6	6	1987	1992	0 %	100 %	0 %	0 %	289549374
34	NC_013893	ATCA	2	8	2310	2317	50 %	25 %	0 %	25 %	289549375
35	NC_013893	AGA	2	6	2325	2330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289549375
36	NC_013893	TTGA	2	8	2339	2346	25 %	50 %	25 %	0 %	289549375
37	NC_013893	A	6	6	2350	2355	100 %	0 %	0 %	0 %	289549375
38	NC_013893	GTAG	2	8	2357	2364	25 %	25 %	50 %	0 %	289549375
39	NC_013893	TAA	2	6	2438	2443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289549375
40	NC_013893	TCA	2	6	2501	2506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289549376
41	NC_013893	ATT	2	6	2541	2546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289549376
42	NC_013893	T	7	7	2574	2580	0 %	100 %	0 %	0 %	289549376
43	NC_013893	A	6	6	2606	2611	100 %	0 %	0 %	0 %	289549376
44	NC_013893	AATT	2	8	2613	2620	50 %	50 %	0 %	0 %	289549376
45	NC_013893	ATT	2	6	2643	2648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289549376
46	NC_013893	TCA	2	6	2651	2656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289549376
47	NC_013893	AAT	2	6	2743	2748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289549376
48	NC_013893	ATG	2	6	3224	3229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289549377
49	NC_013893	TAT	2	6	3285	3290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289549377
50	NC_013893	TCA	2	6	3299	3304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289549377
51	NC_013893	ACA	2	6	3350	3355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289549377
52	NC_013893	AT	3	6	3383	3388	50 %	50 %	0 %	0 %	289549377
53	NC_013893	GC	3	6	3409	3414	0 %	0 %	50 %	50 %	289549377
54	NC_013893	ATT	2	6	3472	3477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289549377
55	NC_013893	TTG	2	6	3543	3548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289549377
56	NC_013893	A	6	6	3599	3604	100 %	0 %	0 %	0 %	289549377
57	NC_013893	GGT	2	6	3611	3616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289549377
58	NC_013893	ACA	2	6	3646	3651	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289549377
59	NC_013893	AAC	2	6	3654	3659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289549377
60	NC_013893	TAA	2	6	3724	3729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289549377
61	NC_013893	ATT	2	6	3749	3754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289549377
62	NC_013893	AGA	2	6	3772	3777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289549377
63	NC_013893	GTAT	2	8	3782	3789	25 %	50 %	25 %	0 %	289549377
64	NC_013893	GAA	2	6	3827	3832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289549377
65	NC_013893	TA	3	6	3879	3884	50 %	50 %	0 %	0 %	289549377
66	NC_013893	AATTAT	2	12	4016	4027	50 %	50 %	0 %	0 %	289549377
67	NC_013893	T	6	6	4369	4374	0 %	100 %	0 %	0 %	289549378
68	NC_013893	TG	3	6	4383	4388	0 %	50 %	50 %	0 %	289549378
69	NC_013893	CTG	2	6	4395	4400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289549378
70	NC_013893	TGT	2	6	4487	4492	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289549378
71	NC_013893	T	6	6	4499	4504	0 %	100 %	0 %	0 %	289549378
72	NC_013893	TTC	3	9	4511	4519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289549378
73	NC_013893	GAA	2	6	4528	4533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289549378
74	NC_013893	T	6	6	4535	4540	0 %	100 %	0 %	0 %	289549378
75	NC_013893	A	6	6	4581	4586	100 %	0 %	0 %	0 %	289549378
76	NC_013893	TAT	2	6	4591	4596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289549378
77	NC_013893	CTT	2	6	4627	4632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289549378
78	NC_013893	T	6	6	4646	4651	0 %	100 %	0 %	0 %	289549378
79	NC_013893	TTC	2	6	4664	4669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289549378
80	NC_013893	A	7	7	4806	4812	100 %	0 %	0 %	0 %	289549378
81	NC_013893	TAA	2	6	4816	4821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289549378
82	NC_013893	TGCT	2	8	4834	4841	0 %	50 %	25 %	25 %	289549378
83	NC_013893	AGC	2	6	5093	5098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289549379
84	NC_013893	TA	3	6	5104	5109	50 %	50 %	0 %	0 %	289549379
85	NC_013893	TGA	2	6	5123	5128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289549379
86	NC_013893	GT	3	6	5154	5159	0 %	50 %	50 %	0 %	289549379
87	NC_013893	ATG	2	6	5242	5247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289549379
88	NC_013893	TCA	2	6	5252	5257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289549379
89	NC_013893	AGA	2	6	5288	5293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289549379
90	NC_013893	AGA	2	6	5309	5314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289549379
91	NC_013893	ACA	2	6	5340	5345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289549379
92	NC_013893	TGG	2	6	5393	5398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289549379
93	NC_013893	CAGT	2	8	5407	5414	25 %	25 %	25 %	25 %	289549379
94	NC_013893	GCA	2	6	5415	5420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289549379
95	NC_013893	CGT	2	6	5430	5435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289549379
96	NC_013893	AGTA	2	8	5453	5460	50 %	25 %	25 %	0 %	289549379
97	NC_013893	ATT	2	6	5477	5482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289549379
98	NC_013893	AGA	2	6	5513	5518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289549379
99	NC_013893	AGA	2	6	5558	5563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289549379
100	NC_013893	GTG	2	6	5569	5574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289549379
101	NC_013893	AGA	2	6	5603	5608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289549379
102	NC_013893	TGA	2	6	5612	5617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289549379
103	NC_013893	CAA	2	6	5635	5640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289549379
104	NC_013893	ATT	3	9	5656	5664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289549379
105	NC_013893	CAAA	2	8	5695	5702	75 %	0 %	0 %	25 %	289549379
106	NC_013893	TTA	2	6	5706	5711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289549379
107	NC_013893	TGA	2	6	5756	5761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289549379
108	NC_013893	AGC	2	6	5840	5845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289549379
109	NC_013893	AAC	2	6	5853	5858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289549379
110	NC_013893	TA	3	6	5863	5868	50 %	50 %	0 %	0 %	289549379
111	NC_013893	TCAA	2	8	5917	5924	50 %	25 %	0 %	25 %	289549379
112	NC_013893	TAC	2	6	5926	5931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289549379
113	NC_013893	ATT	2	6	6003	6008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289549380
114	NC_013893	TGTT	2	8	6196	6203	0 %	75 %	25 %	0 %	289549380
115	NC_013893	ATT	2	6	6243	6248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289549380
116	NC_013893	AATG	2	8	6254	6261	50 %	25 %	25 %	0 %	289549380
117	NC_013893	ATG	2	6	6340	6345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289549380
118	NC_013893	ATG	2	6	6448	6453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289549380
119	NC_013893	TAAA	2	8	6583	6590	75 %	25 %	0 %	0 %	289549380
120	NC_013893	GATGTA	2	12	6620	6631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289549380
121	NC_013893	TG	3	6	7116	7121	0 %	50 %	50 %	0 %	289549381
122	NC_013893	TGA	2	6	7131	7136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289549381
123	NC_013893	ACGT	2	8	7163	7170	25 %	25 %	25 %	25 %	289549381
124	NC_013893	TTG	2	6	7202	7207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289549381
125	NC_013893	AAT	2	6	7233	7238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289549381
126	NC_013893	TTC	2	6	7268	7273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289549381
127	NC_013893	GT	3	6	7278	7283	0 %	50 %	50 %	0 %	289549381
128	NC_013893	CAAAGG	2	12	7300	7311	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	289549381
129	NC_013893	TCG	2	6	7434	7439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289549381
130	NC_013893	TCA	2	6	7569	7574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289549381
131	NC_013893	ATA	2	6	7580	7585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289549381
132	NC_013893	CCGC	2	8	7617	7624	0 %	0 %	25 %	75 %	289549381
133	NC_013893	TTG	2	6	7627	7632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289549381
134	NC_013893	AAT	2	6	7637	7642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289549381
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136	NC_013893	AATC	2	8	7726	7733	50 %	25 %	0 %	25 %	289549381
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