MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Spirosoma linguale DSM 74 plasmid pSLIN05

Total Repeats: 101

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013735	TTC	2	6	1143	1148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284005955
2	NC_013735	ACT	2	6	1155	1160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284005955
3	NC_013735	A	6	6	1193	1198	100 %	0 %	0 %	0 %	284005955
4	NC_013735	GATT	2	8	1217	1224	25 %	50 %	25 %	0 %	284005955
5	NC_013735	TTG	2	6	1360	1365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284005955
6	NC_013735	CAAA	2	8	1501	1508	75 %	0 %	0 %	25 %	284005956
7	NC_013735	TCA	2	6	1588	1593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284005956
8	NC_013735	TA	3	6	1606	1611	50 %	50 %	0 %	0 %	284005956
9	NC_013735	TGT	2	6	1623	1628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284005956
10	NC_013735	TAT	2	6	1642	1647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284005956
11	NC_013735	CTG	2	6	1662	1667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284005956
12	NC_013735	AGG	2	6	1674	1679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284005956
13	NC_013735	TAG	2	6	1781	1786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284005957
14	NC_013735	CTG	3	9	1797	1805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284005957
15	NC_013735	CA	3	6	1813	1818	50 %	0 %	0 %	50 %	284005957
16	NC_013735	AC	3	6	1821	1826	50 %	0 %	0 %	50 %	284005957
17	NC_013735	AATACA	2	12	1991	2002	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	284005958
18	NC_013735	CAG	2	6	2018	2023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284005958
19	NC_013735	CAG	2	6	2060	2065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284005958
20	NC_013735	ATGA	2	8	2252	2259	50 %	25 %	25 %	0 %	284005958
21	NC_013735	A	7	7	2290	2296	100 %	0 %	0 %	0 %	284005958
22	NC_013735	GAT	2	6	2342	2347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284005958
23	NC_013735	CCGA	2	8	2373	2380	25 %	0 %	25 %	50 %	284005958
24	NC_013735	A	6	6	2394	2399	100 %	0 %	0 %	0 %	284005958
25	NC_013735	TTC	2	6	2405	2410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284005958
26	NC_013735	GTA	2	6	2536	2541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284005959
27	NC_013735	ATC	2	6	2542	2547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284005959
28	NC_013735	CTT	2	6	2581	2586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284005959
29	NC_013735	CTC	2	6	2605	2610	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284005959
30	NC_013735	T	6	6	2625	2630	0 %	100 %	0 %	0 %	284005959
31	NC_013735	T	6	6	2730	2735	0 %	100 %	0 %	0 %	284005960
32	NC_013735	T	6	6	2851	2856	0 %	100 %	0 %	0 %	284005960
33	NC_013735	T	6	6	2953	2958	0 %	100 %	0 %	0 %	284005961
34	NC_013735	CTT	2	6	2960	2965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284005961
35	NC_013735	TTCT	2	8	2978	2985	0 %	75 %	0 %	25 %	284005961
36	NC_013735	TAG	2	6	3116	3121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284005961
37	NC_013735	GAC	2	6	3167	3172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284005961
38	NC_013735	CTT	2	6	3206	3211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284005961
39	NC_013735	TCC	2	6	3263	3268	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284005961
40	NC_013735	TCTT	2	8	3269	3276	0 %	75 %	0 %	25 %	284005961
41	NC_013735	TCA	2	6	3322	3327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284005961
42	NC_013735	CAA	2	6	3346	3351	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284005961
43	NC_013735	CAC	2	6	3450	3455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284005961
44	NC_013735	GAC	2	6	3494	3499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284005961
45	NC_013735	TTC	2	6	3585	3590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284005961
46	NC_013735	AAC	2	6	3674	3679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284005961
47	NC_013735	CTT	2	6	3722	3727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284005961
48	NC_013735	GAA	2	6	3767	3772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284005961
49	NC_013735	GA	3	6	3815	3820	50 %	0 %	50 %	0 %	284005961
50	NC_013735	TGT	2	6	3842	3847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284005961
51	NC_013735	TCTTT	2	10	4410	4419	0 %	80 %	0 %	20 %	284005962
52	NC_013735	TTC	2	6	4420	4425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284005962
53	NC_013735	GCCAAA	2	12	4815	4826	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	284005963
54	NC_013735	AAG	2	6	4842	4847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284005963
55	NC_013735	GCA	2	6	4861	4866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284005963
56	NC_013735	GCAAC	2	10	4925	4934	40 %	0 %	20 %	40 %	284005963
57	NC_013735	CCG	2	6	4990	4995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284005963
58	NC_013735	AGG	2	6	4999	5004	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284005963
59	NC_013735	CTG	2	6	5007	5012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284005963
60	NC_013735	CAA	2	6	5033	5038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284005963
61	NC_013735	TGG	2	6	5095	5100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284005963
62	NC_013735	CGG	2	6	5103	5108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284005963
63	NC_013735	TGCG	2	8	5186	5193	0 %	25 %	50 %	25 %	284005964
64	NC_013735	GCT	2	6	5311	5316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284005964
65	NC_013735	GGGC	2	8	5330	5337	0 %	0 %	75 %	25 %	284005964
66	NC_013735	CGA	2	6	5368	5373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284005964
67	NC_013735	TCA	2	6	5457	5462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284005964
68	NC_013735	CCA	2	6	5467	5472	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284005964
69	NC_013735	GC	4	8	5620	5627	0 %	0 %	50 %	50 %	284005964
70	NC_013735	AGC	2	6	5631	5636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284005964
71	NC_013735	CCA	2	6	5671	5676	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284005964
72	NC_013735	ACC	2	6	5705	5710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284005964
73	NC_013735	G	6	6	5783	5788	0 %	0 %	100 %	0 %	284005964
74	NC_013735	AGC	2	6	5877	5882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284005964
75	NC_013735	ACC	2	6	5892	5897	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284005964
76	NC_013735	GCT	2	6	5930	5935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284005964
77	NC_013735	CGT	2	6	5985	5990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284005964
78	NC_013735	GAG	2	6	5993	5998	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284005964
79	NC_013735	A	6	6	6002	6007	100 %	0 %	0 %	0 %	284005964
80	NC_013735	CAG	2	6	6056	6061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284005964
81	NC_013735	A	6	6	6173	6178	100 %	0 %	0 %	0 %	284005964
82	NC_013735	GC	3	6	6259	6264	0 %	0 %	50 %	50 %	284005964
83	NC_013735	AAC	2	6	6267	6272	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284005964
84	NC_013735	GGC	2	6	6292	6297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284005964
85	NC_013735	GGT	2	6	6300	6305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284005964
86	NC_013735	AGCGA	2	10	6317	6326	40 %	0 %	40 %	20 %	284005964
87	NC_013735	AAG	2	6	6327	6332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284005964
88	NC_013735	GAT	2	6	6356	6361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284005964
89	NC_013735	GGGTC	2	10	6368	6377	0 %	20 %	60 %	20 %	284005964
90	NC_013735	AAGCC	2	10	6438	6447	40 %	0 %	20 %	40 %	284005964
91	NC_013735	CAG	2	6	6539	6544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284005964
92	NC_013735	CAG	3	9	6554	6562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284005964
93	NC_013735	TGA	2	6	6779	6784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284005965
94	NC_013735	T	6	6	6819	6824	0 %	100 %	0 %	0 %	284005965
95	NC_013735	GTTG	2	8	7266	7273	0 %	50 %	50 %	0 %	284005966
96	NC_013735	TG	3	6	7320	7325	0 %	50 %	50 %	0 %	284005966
97	NC_013735	ACA	2	6	7346	7351	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284005966
98	NC_013735	CAA	2	6	7383	7388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284005966
99	NC_013735	CAA	2	6	7493	7498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284005966
100	NC_013735	ATGAGT	2	12	7540	7551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284005966
101	NC_013735	CAGC	2	8	7553	7560	25 %	0 %	25 %	50 %	284005966

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.