MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Spirosoma linguale DSM 74 plasmid pSLIN04

Total Repeats: 131

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013734	AAT	2	6	664	669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284005940
2	NC_013734	CCAG	2	8	781	788	25 %	0 %	25 %	50 %	284005940
3	NC_013734	AAG	2	6	917	922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284005940
4	NC_013734	GGC	2	6	924	929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284005940
5	NC_013734	CTTA	2	8	1020	1027	25 %	50 %	0 %	25 %	284005940
6	NC_013734	TTTGA	2	10	1028	1037	20 %	60 %	20 %	0 %	284005940
7	NC_013734	ATT	2	6	1154	1159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284005940
8	NC_013734	GAA	2	6	1205	1210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284005940
9	NC_013734	AG	3	6	1236	1241	50 %	0 %	50 %	0 %	284005940
10	NC_013734	ATCA	2	8	1265	1272	50 %	25 %	0 %	25 %	284005940
11	NC_013734	AAAG	2	8	1306	1313	75 %	0 %	25 %	0 %	284005940
12	NC_013734	AGT	2	6	1363	1368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284005940
13	NC_013734	GGC	2	6	1402	1407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284005940
14	NC_013734	AAG	2	6	1521	1526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284005940
15	NC_013734	CAA	2	6	1528	1533	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284005940
16	NC_013734	A	6	6	1630	1635	100 %	0 %	0 %	0 %	284005940
17	NC_013734	GTA	2	6	1660	1665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284005941
18	NC_013734	ATT	2	6	1674	1679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284005941
19	NC_013734	CAAA	2	8	1919	1926	75 %	0 %	0 %	25 %	284005941
20	NC_013734	AGC	2	6	1927	1932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284005941
21	NC_013734	GTG	2	6	1939	1944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284005941
22	NC_013734	GAT	2	6	1990	1995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284005942
23	NC_013734	CAA	3	9	2004	2012	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284005942
24	NC_013734	T	6	6	2104	2109	0 %	100 %	0 %	0 %	284005943
25	NC_013734	CG	3	6	2121	2126	0 %	0 %	50 %	50 %	284005943
26	NC_013734	TCG	2	6	2204	2209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284005943
27	NC_013734	CCGG	2	8	2243	2250	0 %	0 %	50 %	50 %	284005943
28	NC_013734	TGC	2	6	2297	2302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284005943
29	NC_013734	CCG	2	6	2325	2330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284005943
30	NC_013734	TC	4	8	2354	2361	0 %	50 %	0 %	50 %	284005943
31	NC_013734	TCCAA	2	10	2367	2376	40 %	20 %	0 %	40 %	284005943
32	NC_013734	CCA	2	6	2397	2402	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284005943
33	NC_013734	GAC	2	6	2404	2409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284005943
34	NC_013734	CCA	2	6	2429	2434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284005943
35	NC_013734	ATC	2	6	2602	2607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284005943
36	NC_013734	CAC	2	6	2688	2693	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284005943
37	NC_013734	TTC	2	6	2756	2761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284005944
38	NC_013734	GCT	2	6	2806	2811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284005944
39	NC_013734	C	6	6	2959	2964	0 %	0 %	0 %	100 %	284005944
40	NC_013734	GGT	2	6	3041	3046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284005944
41	NC_013734	TCA	2	6	3145	3150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284005944
42	NC_013734	TGC	3	9	3162	3170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284005944
43	NC_013734	GTA	2	6	3181	3186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284005944
44	NC_013734	CGT	2	6	3232	3237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284005944
45	NC_013734	CAC	2	6	3296	3301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284005944
46	NC_013734	CCG	2	6	3409	3414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284005944
47	NC_013734	CAG	2	6	3512	3517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284005944
48	NC_013734	TGT	2	6	3550	3555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284005944
49	NC_013734	CAG	2	6	3561	3566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284005944
50	NC_013734	ATC	2	6	3600	3605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284005944
51	NC_013734	CGG	2	6	3609	3614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284005945
52	NC_013734	GCA	2	6	3642	3647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284005945
53	NC_013734	TGC	2	6	3669	3674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284005945
54	NC_013734	GGGCCT	2	12	3771	3782	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	284005945
55	NC_013734	GGGC	2	8	3913	3920	0 %	0 %	75 %	25 %	284005945
56	NC_013734	ACC	2	6	3922	3927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284005945
57	NC_013734	CTT	2	6	3928	3933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284005945
58	NC_013734	CGGA	2	8	3945	3952	25 %	0 %	50 %	25 %	284005945
59	NC_013734	AT	3	6	4187	4192	50 %	50 %	0 %	0 %	284005946
60	NC_013734	TAC	2	6	4559	4564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284005946
61	NC_013734	CAG	2	6	4585	4590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284005946
62	NC_013734	CTA	2	6	4636	4641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284005946
63	NC_013734	ACA	2	6	4717	4722	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284005946
64	NC_013734	CAT	2	6	4783	4788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284005946
65	NC_013734	CAG	2	6	5374	5379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284005948
66	NC_013734	GGA	2	6	5405	5410	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284005948
67	NC_013734	CAA	2	6	5454	5459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284005948
68	NC_013734	GTC	2	6	5495	5500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284005948
69	NC_013734	CCA	2	6	5559	5564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284005948
70	NC_013734	TCTA	2	8	5621	5628	25 %	50 %	0 %	25 %	284005948
71	NC_013734	ACT	2	6	5668	5673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284005948
72	NC_013734	AT	3	6	5683	5688	50 %	50 %	0 %	0 %	284005948
73	NC_013734	TG	3	6	5843	5848	0 %	50 %	50 %	0 %	284005949
74	NC_013734	GTAGCC	2	12	5946	5957	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	284005949
75	NC_013734	GACCC	2	10	5967	5976	20 %	0 %	20 %	60 %	284005949
76	NC_013734	TTG	2	6	6011	6016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284005949
77	NC_013734	CGG	2	6	6037	6042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284005949
78	NC_013734	GGC	2	6	6056	6061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284005949
79	NC_013734	A	8	8	6070	6077	100 %	0 %	0 %	0 %	284005949
80	NC_013734	AGT	2	6	6192	6197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284005949
81	NC_013734	CAG	2	6	6274	6279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284005949
82	NC_013734	CAG	2	6	6287	6292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284005949
83	NC_013734	TGG	2	6	6334	6339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284005949
84	NC_013734	TGT	2	6	6411	6416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284005949
85	NC_013734	A	6	6	6980	6985	100 %	0 %	0 %	0 %	284005950
86	NC_013734	GAG	2	6	7003	7008	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284005950
87	NC_013734	TCAG	2	8	7087	7094	25 %	25 %	25 %	25 %	284005950
88	NC_013734	CTA	2	6	7111	7116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284005950
89	NC_013734	GCA	2	6	7118	7123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284005950
90	NC_013734	TCA	2	6	7213	7218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284005950
91	NC_013734	CAG	2	6	7269	7274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284005950
92	NC_013734	GGA	2	6	7280	7285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284005950
93	NC_013734	GCC	2	6	7290	7295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284005950
94	NC_013734	CAG	3	9	7362	7370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284005950
95	NC_013734	AT	3	6	7438	7443	50 %	50 %	0 %	0 %	284005950
96	NC_013734	CTC	2	6	7444	7449	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284005950
97	NC_013734	CAG	2	6	7527	7532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284005950
98	NC_013734	GGC	2	6	7542	7547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284005950
99	NC_013734	GGA	2	6	7566	7571	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284005950
100	NC_013734	AGGG	2	8	7582	7589	25 %	0 %	75 %	0 %	284005950
101	NC_013734	GGC	2	6	7590	7595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284005950
102	NC_013734	TCAT	2	8	7602	7609	25 %	50 %	0 %	25 %	284005950
103	NC_013734	GCG	2	6	7621	7626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284005950
104	NC_013734	GGT	2	6	7647	7652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284005950
105	NC_013734	G	6	6	7670	7675	0 %	0 %	100 %	0 %	284005950
106	NC_013734	ATT	2	6	7689	7694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284005950
107	NC_013734	ATC	2	6	7823	7828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284005951
108	NC_013734	CAG	2	6	7882	7887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284005951
109	NC_013734	ATC	2	6	7898	7903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284005951
110	NC_013734	GGC	2	6	7944	7949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284005951
111	NC_013734	TCA	2	6	7950	7955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284005951
112	NC_013734	CAT	3	9	7990	7998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284005951
113	NC_013734	CAA	2	6	8239	8244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284005952
114	NC_013734	AGCC	2	8	8282	8289	25 %	0 %	25 %	50 %	284005952
115	NC_013734	TGT	2	6	8327	8332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284005952
116	NC_013734	TGT	2	6	8348	8353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284005952
117	NC_013734	CTG	2	6	8473	8478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284005952
118	NC_013734	AAT	2	6	8490	8495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284005952
119	NC_013734	GTC	2	6	8748	8753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284005953
120	NC_013734	GAACC	2	10	8807	8816	40 %	0 %	20 %	40 %	284005953
121	NC_013734	GGCA	2	8	8852	8859	25 %	0 %	50 %	25 %	284005953
122	NC_013734	ATC	2	6	8878	8883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284005953
123	NC_013734	CGA	2	6	8900	8905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284005953
124	NC_013734	GCT	2	6	8939	8944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284005953
125	NC_013734	CCG	2	6	8982	8987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284005953
126	NC_013734	TGG	2	6	9018	9023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284005953
127	NC_013734	GCA	2	6	9212	9217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284005953
128	NC_013734	GC	3	6	9258	9263	0 %	0 %	50 %	50 %	284005953
129	NC_013734	TTG	2	6	9337	9342	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284005953
130	NC_013734	CAG	2	6	9369	9374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284005953
131	NC_013734	ACCT	2	8	9378	9385	25 %	25 %	0 %	50 %	284005953

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.