MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Streptosporangium roseum DSM 43021 plasmid pSROS01

Total Repeats: 641

Go To Repeat Summary Page

< Previous 12Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013596	GCT	2	6	23005	23010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271972146
502	NC_013596	GCCG	2	8	23064	23071	0 %	0 %	50 %	50 %	271972146
503	NC_013596	CCT	2	6	23097	23102	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	271972146
504	NC_013596	CCA	2	6	23103	23108	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	271972146
505	NC_013596	GCG	2	6	23116	23121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271972146
506	NC_013596	CGG	2	6	23124	23129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271972146
507	NC_013596	GGC	2	6	23152	23157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271972146
508	NC_013596	CGT	2	6	23181	23186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271972146
509	NC_013596	CCG	2	6	23209	23214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271972146
510	NC_013596	GCCCG	2	10	23244	23253	0 %	0 %	40 %	60 %	271972146
511	NC_013596	GCA	3	9	23337	23345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271972146
512	NC_013596	CCA	2	6	23349	23354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	271972146
513	NC_013596	CGC	2	6	23397	23402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271972146
514	NC_013596	GCC	2	6	23499	23504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271972146
515	NC_013596	GCT	2	6	23508	23513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271972146
516	NC_013596	GTC	2	6	23574	23579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271972146
517	NC_013596	GGC	2	6	23653	23658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271972146
518	NC_013596	GCG	2	6	23690	23695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271972146
519	NC_013596	GTC	2	6	23704	23709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271972146
520	NC_013596	GCG	2	6	23716	23721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271972146
521	NC_013596	GCC	2	6	23729	23734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271972146
522	NC_013596	ATC	2	6	23749	23754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	271972146
523	NC_013596	GCA	2	6	23826	23831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271972146
524	NC_013596	GGCC	2	8	23832	23839	0 %	0 %	50 %	50 %	271972146
525	NC_013596	GGC	2	6	23931	23936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271972146
526	NC_013596	GC	3	6	23979	23984	0 %	0 %	50 %	50 %	271972146
527	NC_013596	CAG	2	6	24013	24018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271972146
528	NC_013596	CCA	2	6	24031	24036	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	271972146
529	NC_013596	CG	3	6	24051	24056	0 %	0 %	50 %	50 %	271972146
530	NC_013596	GCA	2	6	24057	24062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271972146
531	NC_013596	CGG	2	6	24896	24901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271972147
532	NC_013596	GC	4	8	24915	24922	0 %	0 %	50 %	50 %	271972147
533	NC_013596	GCC	2	6	24926	24931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271972147
534	NC_013596	GGC	2	6	24936	24941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271972147
535	NC_013596	CTC	3	9	24945	24953	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	271972147
536	NC_013596	GCG	2	6	25035	25040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271972147
537	NC_013596	GGCTTG	2	12	25042	25053	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	271972147
538	NC_013596	CGT	2	6	25056	25061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271972147
539	NC_013596	GCGCG	2	10	25074	25083	0 %	0 %	60 %	40 %	271972147
540	NC_013596	GCCGGA	2	12	25084	25095	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	271972147
541	NC_013596	CCG	2	6	25100	25105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271972147
542	NC_013596	GAG	2	6	25130	25135	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	271972147
543	NC_013596	CTC	2	6	25170	25175	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	271972147
544	NC_013596	GGC	2	6	25194	25199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271972147
545	NC_013596	GTC	2	6	25234	25239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271972147
546	NC_013596	CGG	2	6	25286	25291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271972147
547	NC_013596	CG	3	6	25293	25298	0 %	0 %	50 %	50 %	271972147
548	NC_013596	CAG	2	6	25332	25337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271972147
549	NC_013596	GGT	2	6	25353	25358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	271972147
550	NC_013596	GCG	2	6	25375	25380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271972147
551	NC_013596	GGT	2	6	25386	25391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	271972147
552	NC_013596	TCA	2	6	25406	25411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	271972147
553	NC_013596	GC	3	6	25431	25436	0 %	0 %	50 %	50 %	271972148
554	NC_013596	CGT	2	6	25534	25539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271972148
555	NC_013596	GCGG	2	8	25547	25554	0 %	0 %	75 %	25 %	271972148
556	NC_013596	ATC	2	6	25557	25562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	271972148
557	NC_013596	GGC	2	6	25565	25570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271972148
558	NC_013596	CGT	2	6	25597	25602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271972148
559	NC_013596	CGGC	2	8	25614	25621	0 %	0 %	50 %	50 %	271972148
560	NC_013596	CAG	2	6	25673	25678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271972148
561	NC_013596	GTG	2	6	25703	25708	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	271972148
562	NC_013596	GGC	2	6	25772	25777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271972148
563	NC_013596	CAGGA	2	10	25807	25816	40 %	0 %	40 %	20 %	271972148
564	NC_013596	GCG	2	6	25839	25844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271972148
565	NC_013596	AGC	2	6	25845	25850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271972148
566	NC_013596	CCCG	2	8	25882	25889	0 %	0 %	25 %	75 %	271972148
567	NC_013596	GCG	2	6	25920	25925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271972148
568	NC_013596	CGT	2	6	25960	25965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271972148
569	NC_013596	CGG	2	6	25978	25983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271972148
570	NC_013596	GC	3	6	26049	26054	0 %	0 %	50 %	50 %	271972148
571	NC_013596	GGCC	2	8	26072	26079	0 %	0 %	50 %	50 %	271972148
572	NC_013596	CCG	2	6	26137	26142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271972148
573	NC_013596	TCG	2	6	26157	26162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271972148
574	NC_013596	CCA	2	6	26167	26172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	271972148
575	NC_013596	GCC	2	6	26174	26179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271972148
576	NC_013596	GTC	3	9	26198	26206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271972148
577	NC_013596	CAG	2	6	26219	26224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271972148
578	NC_013596	CCGG	2	8	26228	26235	0 %	0 %	50 %	50 %	271972148
579	NC_013596	TGG	2	6	26239	26244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	271972148
580	NC_013596	CGG	2	6	26263	26268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271972148
581	NC_013596	CTG	2	6	26270	26275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271972148
582	NC_013596	GCGG	2	8	26338	26345	0 %	0 %	75 %	25 %	271972148
583	NC_013596	CGC	2	6	26369	26374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271972148
584	NC_013596	GGC	2	6	26375	26380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271972148
585	NC_013596	GGTC	2	8	26410	26417	0 %	25 %	50 %	25 %	271972148
586	NC_013596	GGGT	2	8	26463	26470	0 %	25 %	75 %	0 %	271972148
587	NC_013596	GCT	2	6	26577	26582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271972149
588	NC_013596	CAG	2	6	26584	26589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271972149
589	NC_013596	ACG	2	6	26612	26617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271972149
590	NC_013596	GCG	2	6	26624	26629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271972149
591	NC_013596	GCG	2	6	26707	26712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271972149
592	NC_013596	CGG	2	6	26724	26729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271972149
593	NC_013596	TCG	2	6	26735	26740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271972149
594	NC_013596	AGC	2	6	26741	26746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271972149
595	NC_013596	TCG	2	6	26747	26752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271972149
596	NC_013596	CGG	2	6	26798	26803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271972149
597	NC_013596	CGG	2	6	26835	26840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271972149
598	NC_013596	GCC	2	6	26846	26851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271972149
599	NC_013596	AGC	2	6	26852	26857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271972149
600	NC_013596	GGC	2	6	26920	26925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271972149
601	NC_013596	GGC	2	6	26965	26970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271972149
602	NC_013596	GCGG	2	8	26998	27005	0 %	0 %	75 %	25 %	271972149
603	NC_013596	GCG	3	9	27029	27037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271972149
604	NC_013596	TCG	2	6	27041	27046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271972149
605	NC_013596	GGCA	2	8	27064	27071	25 %	0 %	50 %	25 %	271972149
606	NC_013596	CCT	2	6	27126	27131	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	271972149
607	NC_013596	AGG	3	9	27135	27143	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	271972149
608	NC_013596	CAC	2	6	27145	27150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	271972149
609	NC_013596	AGC	2	6	27151	27156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271972149
610	NC_013596	GGC	2	6	27172	27177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271972149
611	NC_013596	CTC	2	6	27199	27204	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	271972149
612	NC_013596	GCGG	2	8	27208	27215	0 %	0 %	75 %	25 %	271972149
613	NC_013596	TGA	2	6	27216	27221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	271972149
614	NC_013596	CGT	2	6	27228	27233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271972149
615	NC_013596	CGC	2	6	27297	27302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271972149
616	NC_013596	CAGC	2	8	27352	27359	25 %	0 %	25 %	50 %	271972149
617	NC_013596	GCCG	2	8	27439	27446	0 %	0 %	50 %	50 %	271972149
618	NC_013596	CGG	2	6	27458	27463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271972149
619	NC_013596	GC	3	6	27473	27478	0 %	0 %	50 %	50 %	271972149
620	NC_013596	GCC	2	6	27481	27486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271972149
621	NC_013596	CTC	2	6	27523	27528	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	271972149
622	NC_013596	GCGG	2	8	27541	27548	0 %	0 %	75 %	25 %	271972149
623	NC_013596	CGT	2	6	27549	27554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271972149
624	NC_013596	GCT	2	6	27556	27561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271972149
625	NC_013596	GCC	2	6	27584	27589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271972149
626	NC_013596	CCGG	2	8	27599	27606	0 %	0 %	50 %	50 %	271972149
627	NC_013596	CGG	2	6	27639	27644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271972149
628	NC_013596	GCGG	2	8	27682	27689	0 %	0 %	75 %	25 %	271972149
629	NC_013596	GGT	2	6	27733	27738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	271972149
630	NC_013596	CAT	2	6	27751	27756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	271972149
631	NC_013596	CAG	2	6	27862	27867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271972150
632	NC_013596	CGT	2	6	27875	27880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271972150
633	NC_013596	GTC	3	9	27885	27893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271972150
634	NC_013596	TCT	3	9	27911	27919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	271972150
635	NC_013596	CTC	2	6	27924	27929	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	271972150
636	NC_013596	CTG	2	6	27933	27938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271972150
637	NC_013596	TCC	3	9	27940	27948	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	271972150
638	NC_013596	CGGG	2	8	27992	27999	0 %	0 %	75 %	25 %	271972150
639	NC_013596	GAC	2	6	28011	28016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271972150
640	NC_013596	CGA	2	6	28028	28033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271972150
641	NC_013596	GCG	3	9	28039	28047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271972150

< Previous 12Next >