MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptosporangium roseum DSM 43021 chromosome

Total Repeats: 252732

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013595	CGTCC	2	10	423	432	0 %	20 %	20 %	60 %	271961610
2	NC_013595	CAG	2	6	433	438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271961610
3	NC_013595	GGT	2	6	486	491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	271961610
4	NC_013595	GGA	2	6	528	533	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	271961610
5	NC_013595	GCC	2	6	578	583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271961610
6	NC_013595	TGG	2	6	602	607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	271961610
7	NC_013595	CCCG	2	8	644	651	0 %	0 %	25 %	75 %	271961610
8	NC_013595	GCC	2	6	669	674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271961610
9	NC_013595	GCA	2	6	702	707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271961610
10	NC_013595	CAC	2	6	736	741	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	271961610
11	NC_013595	CCG	2	6	790	795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271961610
12	NC_013595	TCCTAT	2	12	838	849	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	271961610
13	NC_013595	CGG	2	6	884	889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271961610
14	NC_013595	CCCGC	2	10	898	907	0 %	0 %	20 %	80 %	271961610
15	NC_013595	CGG	2	6	911	916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271961610
16	NC_013595	GCG	2	6	923	928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271961610
17	NC_013595	CTC	2	6	962	967	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	271961610
18	NC_013595	CGG	2	6	1020	1025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271961610
19	NC_013595	GCCC	2	8	1071	1078	0 %	0 %	25 %	75 %	271961610
20	NC_013595	GCC	2	6	1144	1149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271961610
21	NC_013595	CTG	2	6	1228	1233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271961610
22	NC_013595	ACG	2	6	1265	1270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271961610
23	NC_013595	GC	3	6	1271	1276	0 %	0 %	50 %	50 %	271961610
24	NC_013595	GGA	2	6	1296	1301	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	271961610
25	NC_013595	TCA	2	6	1316	1321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	271961610
26	NC_013595	CG	3	6	1366	1371	0 %	0 %	50 %	50 %	271961610
27	NC_013595	GAC	2	6	1390	1395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271961610
28	NC_013595	AGG	2	6	1427	1432	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	271961610
29	NC_013595	TTC	2	6	1435	1440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	271961610
30	NC_013595	CAA	2	6	1467	1472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	271961610
31	NC_013595	AGC	2	6	1505	1510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271961610
32	NC_013595	GGA	2	6	1521	1526	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	271961610
33	NC_013595	GCC	2	6	1572	1577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271961610
34	NC_013595	AAG	2	6	1609	1614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	271961610
35	NC_013595	AGG	2	6	1622	1627	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	271961610
36	NC_013595	GCC	2	6	1633	1638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271961610
37	NC_013595	CCA	2	6	1676	1681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	271961610
38	NC_013595	GTCG	2	8	1743	1750	0 %	25 %	50 %	25 %	271961610
39	NC_013595	CCG	2	6	1838	1843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271961610
40	NC_013595	TCGA	2	8	1858	1865	25 %	25 %	25 %	25 %	271961610
41	NC_013595	GCG	2	6	1874	1879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271961610
42	NC_013595	TCGCGC	2	12	1882	1893	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	271961610
43	NC_013595	CAG	2	6	1969	1974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271961610
44	NC_013595	CGG	2	6	1977	1982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271961610
45	NC_013595	ACCAC	2	10	1988	1997	40 %	0 %	0 %	60 %	271961610
46	NC_013595	CGCT	2	8	2023	2030	0 %	25 %	25 %	50 %	271961610
47	NC_013595	CGT	2	6	2041	2046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271961610
48	NC_013595	CAC	2	6	2073	2078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	271961610
49	NC_013595	AGC	2	6	2087	2092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271961610
50	NC_013595	CGAG	2	8	2686	2693	25 %	0 %	50 %	25 %	271961611
51	NC_013595	CCG	2	6	2829	2834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271961611
52	NC_013595	GCG	2	6	2856	2861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271961611
53	NC_013595	GGCG	2	8	2863	2870	0 %	0 %	75 %	25 %	271961611
54	NC_013595	CTC	2	6	2891	2896	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	271961611
55	NC_013595	TCG	2	6	2937	2942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271961611
56	NC_013595	GTC	2	6	2960	2965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271961611
57	NC_013595	GGA	2	6	3007	3012	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	271961611
58	NC_013595	CGA	2	6	3027	3032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271961611
59	NC_013595	GCC	2	6	3041	3046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271961611
60	NC_013595	GAC	2	6	3110	3115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271961611
61	NC_013595	CGC	2	6	3172	3177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271961611
62	NC_013595	ACCG	2	8	3179	3186	25 %	0 %	25 %	50 %	271961611
63	NC_013595	CGAGGT	2	12	3307	3318	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	271961611
64	NC_013595	CGG	2	6	3334	3339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271961611
65	NC_013595	GCCG	2	8	3371	3378	0 %	0 %	50 %	50 %	271961611
66	NC_013595	CAC	3	9	3382	3390	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	271961611
67	NC_013595	CGCT	2	8	3422	3429	0 %	25 %	25 %	50 %	271961611
68	NC_013595	CCGA	2	8	3434	3441	25 %	0 %	25 %	50 %	271961611
69	NC_013595	TCG	2	6	3477	3482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271961611
70	NC_013595	CGA	2	6	3547	3552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271961611
71	NC_013595	GTC	2	6	3554	3559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271961611
72	NC_013595	CGA	2	6	3622	3627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271961611
73	NC_013595	ACC	2	6	3645	3650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	271961611
74	NC_013595	ACC	2	6	3707	3712	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	271961611
75	NC_013595	CCA	2	6	3714	3719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	271961611
76	NC_013595	CGG	2	6	3736	3741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271961611
77	NC_013595	GAC	2	6	3752	3757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271961611
78	NC_013595	GGC	2	6	3970	3975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271961612
79	NC_013595	GCG	2	6	3998	4003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271961612
80	NC_013595	CG	3	6	4020	4025	0 %	0 %	50 %	50 %	271961612
81	NC_013595	CG	3	6	4076	4081	0 %	0 %	50 %	50 %	271961612
82	NC_013595	CGG	2	6	4085	4090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271961612
83	NC_013595	CGGG	2	8	4137	4144	0 %	0 %	75 %	25 %	271961612
84	NC_013595	GAGGC	2	10	4151	4160	20 %	0 %	60 %	20 %	271961612
85	NC_013595	CG	3	6	4192	4197	0 %	0 %	50 %	50 %	271961612
86	NC_013595	CCGG	2	8	4201	4208	0 %	0 %	50 %	50 %	271961612
87	NC_013595	GAC	2	6	4307	4312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271961612
88	NC_013595	GTGC	2	8	4342	4349	0 %	25 %	50 %	25 %	271961612
89	NC_013595	TCG	2	6	4356	4361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271961612
90	NC_013595	ATC	2	6	4364	4369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	271961612
91	NC_013595	CCG	2	6	4377	4382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271961612
92	NC_013595	CCG	2	6	4386	4391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271961612
93	NC_013595	CG	4	8	4395	4402	0 %	0 %	50 %	50 %	271961612
94	NC_013595	CTC	2	6	4451	4456	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	271961612
95	NC_013595	AGGA	2	8	4464	4471	50 %	0 %	50 %	0 %	271961612
96	NC_013595	GGCAG	2	10	4495	4504	20 %	0 %	60 %	20 %	271961612
97	NC_013595	CG	3	6	4516	4521	0 %	0 %	50 %	50 %	271961612
98	NC_013595	GGA	2	6	4531	4536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	271961612
99	NC_013595	TCC	2	6	4539	4544	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	271961612
100	NC_013595	GGC	2	6	4681	4686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271961613
101	NC_013595	ACG	2	6	4718	4723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271961613
102	NC_013595	TCG	2	6	4724	4729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271961613
103	NC_013595	CGG	2	6	4745	4750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271961613
104	NC_013595	TGG	2	6	4778	4783	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	271961613
105	NC_013595	CG	4	8	4799	4806	0 %	0 %	50 %	50 %	271961613
106	NC_013595	GAG	2	6	4852	4857	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	271961613
107	NC_013595	CTG	2	6	4867	4872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271961613
108	NC_013595	CGGC	2	8	4874	4881	0 %	0 %	50 %	50 %	271961613
109	NC_013595	CGG	2	6	4896	4901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271961613
110	NC_013595	GAC	2	6	4918	4923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271961613
111	NC_013595	CGC	2	6	4932	4937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271961613
112	NC_013595	AAG	2	6	4951	4956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	271961613
113	NC_013595	GCG	2	6	4973	4978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271961613
114	NC_013595	GCG	2	6	4982	4987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271961613
115	NC_013595	CGG	2	6	5025	5030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271961613
116	NC_013595	GAG	2	6	5083	5088	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	271961613
117	NC_013595	GGC	2	6	5089	5094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271961613
118	NC_013595	ATG	2	6	5164	5169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	271961613
119	NC_013595	GCT	2	6	5193	5198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271961613
120	NC_013595	CGT	2	6	5211	5216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271961613
121	NC_013595	GGC	2	6	5246	5251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271961613
122	NC_013595	GCT	2	6	5274	5279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271961613
123	NC_013595	CG	3	6	5293	5298	0 %	0 %	50 %	50 %	271961613
124	NC_013595	CGA	2	6	5301	5306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271961613
125	NC_013595	GGC	2	6	5373	5378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271961613
126	NC_013595	TCA	2	6	5405	5410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	271961613
127	NC_013595	CCG	2	6	5411	5416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271961613
128	NC_013595	AGG	2	6	5444	5449	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	271961613
129	NC_013595	GTC	2	6	5467	5472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271961613
130	NC_013595	CGG	2	6	5493	5498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271961613
131	NC_013595	AGG	2	6	5516	5521	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	271961613
132	NC_013595	CGT	2	6	5559	5564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271961613
133	NC_013595	GCC	2	6	5565	5570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271961613
134	NC_013595	GGGCA	2	10	5981	5990	20 %	0 %	60 %	20 %	271961614
135	NC_013595	GCG	2	6	6077	6082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271961614
136	NC_013595	GTCCG	2	10	6092	6101	0 %	20 %	40 %	40 %	271961614
137	NC_013595	CGG	2	6	6119	6124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271961614
138	NC_013595	CCCG	2	8	6192	6199	0 %	0 %	25 %	75 %	271961614
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140	NC_013595	GCT	2	6	6214	6219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271961614
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142	NC_013595	CGA	2	6	6292	6297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271961614
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148	NC_013595	GCG	2	6	6397	6402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271961614
149	NC_013595	GGC	2	6	6404	6409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271961614
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166	NC_013595	GCCA	2	8	6794	6801	25 %	0 %	25 %	50 %	271961614
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169	NC_013595	CGA	2	6	6889	6894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271961614
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241	NC_013595	ATC	2	6	9644	9649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	271961616
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245	NC_013595	CGA	2	6	9811	9816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271961616
246	NC_013595	CGC	2	6	9854	9859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271961616
247	NC_013595	TCA	3	9	9864	9872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	271961616
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249	NC_013595	CCG	2	6	10096	10101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271961617
250	NC_013595	ACG	2	6	10119	10124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271961617
251	NC_013595	CG	3	6	10161	10166	0 %	0 %	50 %	50 %	271961617
252	NC_013595	TCG	2	6	10167	10172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271961617
253	NC_013595	ACC	2	6	10191	10196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	271961617
254	NC_013595	TCG	2	6	10208	10213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271961617
255	NC_013595	CGT	2	6	10225	10230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271961617
256	NC_013595	GCGCT	2	10	10250	10259	0 %	20 %	40 %	40 %	271961617
257	NC_013595	GCCG	2	8	10309	10316	0 %	0 %	50 %	50 %	271961617
258	NC_013595	GAT	2	6	10360	10365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	271961617
259	NC_013595	ACG	2	6	10407	10412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271961617
260	NC_013595	TCC	2	6	10434	10439	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	271961617
261	NC_013595	CTG	2	6	10457	10462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271961617
262	NC_013595	CGC	2	6	10509	10514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271961617
263	NC_013595	CGA	2	6	10573	10578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271961617
264	NC_013595	GCT	2	6	10582	10587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271961617
265	NC_013595	GC	3	6	10632	10637	0 %	0 %	50 %	50 %	271961617
266	NC_013595	TCG	2	6	10641	10646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271961617
267	NC_013595	GCC	2	6	10647	10652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271961617
268	NC_013595	CGA	2	6	10660	10665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271961617
269	NC_013595	ACCGG	2	10	10671	10680	20 %	0 %	40 %	40 %	271961617
270	NC_013595	GAG	2	6	10718	10723	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	271961617
271	NC_013595	GTC	2	6	10748	10753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271961617
272	NC_013595	AGG	2	6	10815	10820	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	271961617
273	NC_013595	CGA	2	6	10849	10854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271961617
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275	NC_013595	GTC	2	6	10916	10921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271961617
276	NC_013595	AAC	2	6	10925	10930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	271961617
277	NC_013595	ACC	2	6	10955	10960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	271961617
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279	NC_013595	CTG	2	6	11078	11083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271961617
280	NC_013595	GAG	2	6	11093	11098	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	271961617
281	NC_013595	GC	4	8	11113	11120	0 %	0 %	50 %	50 %	271961617
282	NC_013595	CGTCGG	2	12	11175	11186	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	271961617
283	NC_013595	GGC	2	6	11195	11200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271961617
284	NC_013595	GCT	2	6	11209	11214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271961617
285	NC_013595	CGA	2	6	11221	11226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271961617
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287	NC_013595	CAG	2	6	11285	11290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271961617
288	NC_013595	CGA	2	6	11296	11301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271961617
289	NC_013595	CGA	2	6	11380	11385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271961617
290	NC_013595	ATC	2	6	11432	11437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	271961617
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292	NC_013595	CCT	2	6	11467	11472	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	271961617
293	NC_013595	GAG	2	6	11477	11482	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	271961617
294	NC_013595	GTC	2	6	11489	11494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271961617
295	NC_013595	CGG	2	6	11506	11511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271961617
296	NC_013595	GCG	2	6	11556	11561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271961617
297	NC_013595	GCGCG	2	10	11572	11581	0 %	0 %	60 %	40 %	271961617
298	NC_013595	GAC	2	6	11594	11599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271961617
299	NC_013595	TCG	2	6	11601	11606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271961617
300	NC_013595	CTT	2	6	11611	11616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	271961617
301	NC_013595	ACG	2	6	11621	11626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271961617
302	NC_013595	CAC	2	6	11630	11635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	271961617
303	NC_013595	GCT	2	6	11638	11643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271961617
304	NC_013595	TTC	2	6	11645	11650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	271961617
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322	NC_013595	CCG	2	6	12276	12281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271961617
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341	NC_013595	ACA	2	6	13122	13127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	271961618
342	NC_013595	CGG	2	6	13144	13149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271961618
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373	NC_013595	CGA	3	9	15716	15724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271961620
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375	NC_013595	CGAT	2	8	15811	15818	25 %	25 %	25 %	25 %	271961620
376	NC_013595	CTG	2	6	15819	15824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271961620
377	NC_013595	ACGG	2	8	15825	15832	25 %	0 %	50 %	25 %	271961620
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379	NC_013595	CAT	2	6	15947	15952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	271961620
380	NC_013595	TCT	2	6	16043	16048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	271961620
381	NC_013595	GGA	2	6	16049	16054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	271961620
382	NC_013595	TGG	2	6	16106	16111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	271961621
383	NC_013595	CGA	2	6	16118	16123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271961621
384	NC_013595	TCA	2	6	16204	16209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	271961621
385	NC_013595	TGA	2	6	16337	16342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	271961621
386	NC_013595	CTGA	2	8	16378	16385	25 %	25 %	25 %	25 %	271961621
387	NC_013595	CAC	2	6	16386	16391	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	271961621
388	NC_013595	GA	3	6	16405	16410	50 %	0 %	50 %	0 %	271961621
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499	NC_013595	CCG	2	6	22101	22106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271961627
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