MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptosporangium roseum DSM 43021 chromosome

Total Repeats: 252732

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_013595	CGG	3	9	620739	620747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271962180
14002	NC_013595	G	6	6	620751	620756	0 %	0 %	100 %	0 %	271962180
14003	NC_013595	GC	3	6	621247	621252	0 %	0 %	50 %	50 %	271962181
14004	NC_013595	CGA	2	6	621285	621290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271962181
14005	NC_013595	TGG	2	6	621321	621326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	271962181
14006	NC_013595	TCG	2	6	621338	621343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271962181
14007	NC_013595	CGG	2	6	621372	621377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271962181
14008	NC_013595	CGC	2	6	621435	621440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271962181
14009	NC_013595	GCCG	2	8	621446	621453	0 %	0 %	50 %	50 %	271962181
14010	NC_013595	CG	4	8	621452	621459	0 %	0 %	50 %	50 %	271962181
14011	NC_013595	CGA	2	6	621762	621767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271962182
14012	NC_013595	CGG	2	6	621795	621800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271962182
14013	NC_013595	CGG	3	9	621848	621856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271962182
14014	NC_013595	ATC	2	6	621914	621919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	271962182
14015	NC_013595	TTC	2	6	622015	622020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	271962182
14016	NC_013595	GTC	2	6	622033	622038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271962182
14017	NC_013595	TCG	2	6	622046	622051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271962182
14018	NC_013595	GTC	2	6	622057	622062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271962182
14019	NC_013595	CGG	2	6	622067	622072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271962182
14020	NC_013595	GCG	2	6	622134	622139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271962182
14021	NC_013595	CG	3	6	622138	622143	0 %	0 %	50 %	50 %	271962182
14022	NC_013595	GC	3	6	622194	622199	0 %	0 %	50 %	50 %	271962182
14023	NC_013595	TTC	2	6	622219	622224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	271962182
14024	NC_013595	GGC	2	6	622258	622263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271962182
14025	NC_013595	GCT	2	6	622284	622289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271962182
14026	NC_013595	CGA	2	6	622335	622340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271962182
14027	NC_013595	GAT	2	6	622347	622352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	271962182
14028	NC_013595	CGT	2	6	622392	622397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271962182
14029	NC_013595	ACG	2	6	622436	622441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271962182
14030	NC_013595	TCG	2	6	622553	622558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271962182
14031	NC_013595	TAC	2	6	622667	622672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	271962182
14032	NC_013595	ATCC	2	8	622685	622692	25 %	25 %	0 %	50 %	271962182
14033	NC_013595	G	6	6	622700	622705	0 %	0 %	100 %	0 %	271962182
14034	NC_013595	CTG	2	6	622723	622728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271962182
14035	NC_013595	CGA	2	6	622877	622882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271962183
14036	NC_013595	TCT	2	6	622886	622891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	271962183
14037	NC_013595	GGCC	2	8	622907	622914	0 %	0 %	50 %	50 %	271962183
14038	NC_013595	CGC	2	6	622982	622987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271962183
14039	NC_013595	GAT	2	6	623004	623009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	271962183
14040	NC_013595	GCT	2	6	623073	623078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271962183
14041	NC_013595	CGA	2	6	623129	623134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271962183
14042	NC_013595	CGC	2	6	623141	623146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271962183
14043	NC_013595	CAG	3	9	623193	623201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271962183
14044	NC_013595	GGC	2	6	623223	623228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271962183
14045	NC_013595	TCG	2	6	623281	623286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271962183
14046	NC_013595	CGG	2	6	623303	623308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271962183
14047	NC_013595	CGGGC	2	10	623312	623321	0 %	0 %	60 %	40 %	271962183
14048	NC_013595	ACC	2	6	623341	623346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	271962183
14049	NC_013595	GCG	2	6	623354	623359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271962183
14050	NC_013595	ACC	2	6	623374	623379	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	271962183
14051	NC_013595	GCC	2	6	623380	623385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271962183
14052	NC_013595	TCCAG	2	10	623387	623396	20 %	20 %	20 %	40 %	271962183
14053	NC_013595	TCG	2	6	623404	623409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271962183
14054	NC_013595	CGG	2	6	623420	623425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271962183
14055	NC_013595	GCC	2	6	623466	623471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271962183
14056	NC_013595	TCA	2	6	623483	623488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	271962183
14057	NC_013595	TCG	2	6	623491	623496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271962183
14058	NC_013595	GCT	2	6	623510	623515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271962183
14059	NC_013595	GGTGG	2	10	623530	623539	0 %	20 %	80 %	0 %	271962183
14060	NC_013595	GCC	2	6	623542	623547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271962183
14061	NC_013595	CGG	2	6	623555	623560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271962183
14062	NC_013595	CGG	2	6	623576	623581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271962183
14063	NC_013595	CGA	2	6	623597	623602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271962183
14064	NC_013595	CGCTCG	2	12	623611	623622	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	271962183
14065	NC_013595	CG	3	6	623674	623679	0 %	0 %	50 %	50 %	271962183
14066	NC_013595	ATC	2	6	623725	623730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	271962183
14067	NC_013595	CGTGG	2	10	623743	623752	0 %	20 %	60 %	20 %	271962183
14068	NC_013595	CG	3	6	623772	623777	0 %	0 %	50 %	50 %	271962183
14069	NC_013595	GGT	2	6	623859	623864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	271962183
14070	NC_013595	CCGG	2	8	623902	623909	0 %	0 %	50 %	50 %	271962183
14071	NC_013595	GCC	2	6	624064	624069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271962183
14072	NC_013595	GCC	2	6	624071	624076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271962183
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14074	NC_013595	GCGGTC	2	12	624211	624222	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	271962183
14075	NC_013595	CGC	2	6	624288	624293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271962183
14076	NC_013595	CGCC	2	8	624312	624319	0 %	0 %	25 %	75 %	271962183
14077	NC_013595	CCGG	2	8	624364	624371	0 %	0 %	50 %	50 %	271962183
14078	NC_013595	CCCG	2	8	624386	624393	0 %	0 %	25 %	75 %	271962183
14079	NC_013595	CGC	2	6	624428	624433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271962183
14080	NC_013595	CAG	2	6	624453	624458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271962183
14081	NC_013595	GTCC	2	8	624473	624480	0 %	25 %	25 %	50 %	271962183
14082	NC_013595	CGGT	2	8	624484	624491	0 %	25 %	50 %	25 %	271962183
14083	NC_013595	CGC	2	6	624513	624518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271962183
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14085	NC_013595	CCG	2	6	624669	624674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271962184
14086	NC_013595	GAG	2	6	624681	624686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	271962184
14087	NC_013595	CTC	2	6	624687	624692	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	271962184
14088	NC_013595	GGC	2	6	624707	624712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271962184
14089	NC_013595	CGG	2	6	624770	624775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271962184
14090	NC_013595	GGAGG	2	10	624785	624794	20 %	0 %	80 %	0 %	271962184
14091	NC_013595	GAC	2	6	624822	624827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271962184
14092	NC_013595	TCGA	2	8	624832	624839	25 %	25 %	25 %	25 %	271962184
14093	NC_013595	GCGG	2	8	624840	624847	0 %	0 %	75 %	25 %	271962184
14094	NC_013595	GCC	2	6	624951	624956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271962184
14095	NC_013595	CAG	2	6	624981	624986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271962184
14096	NC_013595	GCCC	3	12	624994	625005	0 %	0 %	25 %	75 %	271962184
14097	NC_013595	GC	3	6	625015	625020	0 %	0 %	50 %	50 %	271962184
14098	NC_013595	GCG	2	6	625032	625037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271962184
14099	NC_013595	GTC	2	6	625050	625055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271962184
14100	NC_013595	GGAC	2	8	625110	625117	25 %	0 %	50 %	25 %	271962184
14101	NC_013595	GTA	2	6	625167	625172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	271962184
14102	NC_013595	CGG	2	6	625199	625204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271962184
14103	NC_013595	CGC	2	6	625210	625215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271962184
14104	NC_013595	GGA	2	6	625325	625330	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	271962184
14105	NC_013595	TCGGCG	2	12	625360	625371	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	271962184
14106	NC_013595	GCT	2	6	625395	625400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271962184
14107	NC_013595	CCA	2	6	625409	625414	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	271962184
14108	NC_013595	CGG	2	6	625426	625431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271962184
14109	NC_013595	CGATGA	2	12	625478	625489	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	271962184
14110	NC_013595	GC	3	6	625659	625664	0 %	0 %	50 %	50 %	271962185
14111	NC_013595	GCG	2	6	625678	625683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271962185
14112	NC_013595	TGC	2	6	625704	625709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271962185
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14115	NC_013595	CCG	2	6	625735	625740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271962185
14116	NC_013595	CAGC	2	8	625774	625781	25 %	0 %	25 %	50 %	271962185
14117	NC_013595	TGG	2	6	625824	625829	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	271962185
14118	NC_013595	CCACC	2	10	625840	625849	20 %	0 %	0 %	80 %	271962185
14119	NC_013595	GCC	2	6	625852	625857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271962185
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14232	NC_013595	CCGGG	2	10	630706	630715	0 %	0 %	60 %	40 %	271962191
14233	NC_013595	CCGGGT	2	12	630736	630747	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	271962191
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14238	NC_013595	CTC	2	6	630878	630883	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	271962191
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14240	NC_013595	CTG	2	6	630908	630913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271962191
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14344	NC_013595	CGG	2	6	634669	634674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271962195
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14349	NC_013595	CAG	2	6	634880	634885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271962195
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14474	NC_013595	ATC	2	6	640933	640938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	271962202
14475	NC_013595	GCC	2	6	641053	641058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271962202
14476	NC_013595	GGT	2	6	641106	641111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	271962202
14477	NC_013595	GTC	3	9	641125	641133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271962202
14478	NC_013595	CCG	2	6	641247	641252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271962202
14479	NC_013595	GGT	2	6	641253	641258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	271962202
14480	NC_013595	CGA	2	6	641271	641276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271962202
14481	NC_013595	TCGA	2	8	641287	641294	25 %	25 %	25 %	25 %	271962202
14482	NC_013595	AGG	2	6	641309	641314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	271962202
14483	NC_013595	CCG	2	6	641345	641350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271962202
14484	NC_013595	GGCG	2	8	641355	641362	0 %	0 %	75 %	25 %	271962202
14485	NC_013595	CAA	2	6	641427	641432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	271962202
14486	NC_013595	CCA	2	6	641442	641447	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	271962202
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14488	NC_013595	ACGGCG	2	12	641513	641524	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	271962202
14489	NC_013595	CGA	2	6	641550	641555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271962202
14490	NC_013595	CGG	2	6	641624	641629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271962202
14491	NC_013595	GCT	2	6	641658	641663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271962202
14492	NC_013595	GGC	2	6	641664	641669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271962202
14493	NC_013595	GCG	2	6	641672	641677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271962202
14494	NC_013595	CCG	2	6	641724	641729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271962202
14495	NC_013595	GAC	2	6	641740	641745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271962202
14496	NC_013595	GC	3	6	641754	641759	0 %	0 %	50 %	50 %	271962202
14497	NC_013595	TGG	2	6	641836	641841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	271962202
14498	NC_013595	GCC	2	6	641845	641850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271962202
14499	NC_013595	CCG	2	6	641856	641861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271962202
14500	NC_013595	CGG	2	6	641862	641867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271962202

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