MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptosporangium roseum DSM 43021 chromosome

Total Repeats: 252732

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013595	CTG	2	6	22166	22171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271961627
502	NC_013595	CCG	2	6	22237	22242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271961627
503	NC_013595	CGT	2	6	22252	22257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271961627
504	NC_013595	GGCG	2	8	22351	22358	0 %	0 %	75 %	25 %	271961627
505	NC_013595	GAGC	3	12	22407	22418	25 %	0 %	50 %	25 %	271961627
506	NC_013595	GC	3	6	22425	22430	0 %	0 %	50 %	50 %	271961627
507	NC_013595	GGA	2	6	22441	22446	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	271961627
508	NC_013595	TCG	2	6	22482	22487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271961627
509	NC_013595	CGGC	2	8	22507	22514	0 %	0 %	50 %	50 %	271961627
510	NC_013595	GCT	2	6	22519	22524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271961627
511	NC_013595	CGC	2	6	22573	22578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271961627
512	NC_013595	GGC	2	6	22582	22587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271961627
513	NC_013595	AGG	2	6	22671	22676	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	271961627
514	NC_013595	CTG	2	6	22715	22720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271961627
515	NC_013595	CGA	2	6	22771	22776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271961627
516	NC_013595	TGC	2	6	22791	22796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271961627
517	NC_013595	CGT	2	6	22813	22818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271961627
518	NC_013595	ACG	2	6	22872	22877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271961627
519	NC_013595	CCG	2	6	22878	22883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271961627
520	NC_013595	GCACCG	2	12	22917	22928	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	271961627
521	NC_013595	GGC	2	6	22981	22986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271961627
522	NC_013595	GCC	2	6	23063	23068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271961627
523	NC_013595	GGC	2	6	23077	23082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271961627
524	NC_013595	GAT	2	6	23101	23106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	271961627
525	NC_013595	CGG	3	9	23484	23492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271961628
526	NC_013595	GCAT	2	8	23510	23517	25 %	25 %	25 %	25 %	271961628
527	NC_013595	CCG	2	6	23548	23553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271961628
528	NC_013595	ACG	2	6	23612	23617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271961628
529	NC_013595	GTC	2	6	23635	23640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271961628
530	NC_013595	CCG	2	6	23708	23713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271961628
531	NC_013595	CGG	2	6	23808	23813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271961628
532	NC_013595	ACC	2	6	23817	23822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	271961628
533	NC_013595	G	6	6	23846	23851	0 %	0 %	100 %	0 %	271961628
534	NC_013595	CGG	2	6	23920	23925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271961628
535	NC_013595	GCC	2	6	23938	23943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271961628
536	NC_013595	GGAT	2	8	23969	23976	25 %	25 %	50 %	0 %	271961628
537	NC_013595	CCAG	2	8	23986	23993	25 %	0 %	25 %	50 %	271961628
538	NC_013595	GGT	2	6	24031	24036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	271961628
539	NC_013595	GCCG	2	8	24042	24049	0 %	0 %	50 %	50 %	271961628
540	NC_013595	GTC	2	6	24092	24097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271961628
541	NC_013595	CTG	2	6	24211	24216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271961629
542	NC_013595	TCG	2	6	24224	24229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271961629
543	NC_013595	AGG	2	6	24232	24237	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	271961629
544	NC_013595	GCT	2	6	24282	24287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271961629
545	NC_013595	GC	3	6	24420	24425	0 %	0 %	50 %	50 %	271961629
546	NC_013595	CG	3	6	24482	24487	0 %	0 %	50 %	50 %	271961629
547	NC_013595	GGC	2	6	24489	24494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271961629
548	NC_013595	TCGCCG	2	12	24500	24511	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	271961629
549	NC_013595	ATC	2	6	24589	24594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	271961629
550	NC_013595	TCG	2	6	24602	24607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271961629
551	NC_013595	CTG	2	6	24625	24630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271961629
552	NC_013595	CCT	2	6	24645	24650	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	271961629
553	NC_013595	AGA	2	6	24759	24764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	271961630
554	NC_013595	TGT	2	6	24771	24776	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	271961630
555	NC_013595	GTG	2	6	24781	24786	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	271961630
556	NC_013595	GAG	3	9	24838	24846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	271961630
557	NC_013595	GAC	2	6	24847	24852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271961630
558	NC_013595	G	6	6	24888	24893	0 %	0 %	100 %	0 %	271961630
559	NC_013595	CGC	2	6	24936	24941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271961630
560	NC_013595	GCG	3	9	24992	25000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271961630
561	NC_013595	GGC	2	6	25017	25022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271961630
562	NC_013595	TCG	2	6	25034	25039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271961630
563	NC_013595	GAG	2	6	25042	25047	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	271961630
564	NC_013595	GGT	2	6	25140	25145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	271961630
565	NC_013595	GCC	2	6	25146	25151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271961630
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567	NC_013595	TGA	2	6	25227	25232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	271961630
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569	NC_013595	CCGG	2	8	25246	25253	0 %	0 %	50 %	50 %	271961630
570	NC_013595	GCAG	2	8	25254	25261	25 %	0 %	50 %	25 %	271961630
571	NC_013595	CGG	2	6	25266	25271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271961630
572	NC_013595	TCG	2	6	25274	25279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271961630
573	NC_013595	CGT	2	6	25308	25313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271961630
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589	NC_013595	GCC	2	6	25809	25814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271961631
590	NC_013595	TGC	2	6	25826	25831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271961631
591	NC_013595	CGG	2	6	25841	25846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271961631
592	NC_013595	CCT	2	6	25853	25858	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	271961631
593	NC_013595	TGG	2	6	25859	25864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	271961631
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598	NC_013595	GGCG	2	8	26678	26685	0 %	0 %	75 %	25 %	271961632
599	NC_013595	CGT	2	6	26796	26801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271961632
600	NC_013595	CTT	3	9	26808	26816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	271961632
601	NC_013595	CGC	2	6	26889	26894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271961632
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604	NC_013595	TGA	2	6	26939	26944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	271961632
605	NC_013595	TGG	2	6	26945	26950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	271961632
606	NC_013595	CTG	2	6	27013	27018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271961632
607	NC_013595	TCA	2	6	27029	27034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	271961632
608	NC_013595	CAA	2	6	27045	27050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	271961632
609	NC_013595	ATC	2	6	27055	27060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	271961632
610	NC_013595	GGCAAG	2	12	27061	27072	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	271961632
611	NC_013595	GGT	2	6	27081	27086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	271961632
612	NC_013595	ACC	2	6	27095	27100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	271961632
613	NC_013595	CCGG	2	8	27117	27124	0 %	0 %	50 %	50 %	271961633
614	NC_013595	CCT	2	6	27132	27137	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	271961633
615	NC_013595	CAG	2	6	27183	27188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271961633
616	NC_013595	CCG	2	6	27214	27219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271961633
617	NC_013595	GGAC	2	8	27227	27234	25 %	0 %	50 %	25 %	271961633
618	NC_013595	GCC	2	6	27236	27241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271961633
619	NC_013595	AGC	2	6	27259	27264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271961633
620	NC_013595	GCC	2	6	27283	27288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271961633
621	NC_013595	GGCC	2	8	27293	27300	0 %	0 %	50 %	50 %	271961633
622	NC_013595	GCCG	2	8	27318	27325	0 %	0 %	50 %	50 %	271961633
623	NC_013595	ACCGG	2	10	27334	27343	20 %	0 %	40 %	40 %	271961633
624	NC_013595	CGG	2	6	27375	27380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271961633
625	NC_013595	GGA	2	6	27396	27401	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	271961633
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753	NC_013595	GGC	2	6	31853	31858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271961635
754	NC_013595	GCG	2	6	31895	31900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271961635
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756	NC_013595	CGC	2	6	31942	31947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271961635
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758	NC_013595	CTG	2	6	32012	32017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271961635
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761	NC_013595	GCCG	2	8	32141	32148	0 %	0 %	50 %	50 %	271961635
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867	NC_013595	CGGCG	2	10	35467	35476	0 %	0 %	60 %	40 %	271961638
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869	NC_013595	GC	3	6	35539	35544	0 %	0 %	50 %	50 %	271961638
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