MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptosporangium roseum DSM 43021 chromosome

Total Repeats: 252732

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_013595	GTC	2	6	239192	239197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271961832
5002	NC_013595	CG	3	6	239201	239206	0 %	0 %	50 %	50 %	271961832
5003	NC_013595	GACGGC	2	12	239207	239218	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	271961832
5004	NC_013595	GTC	3	9	239225	239233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271961832
5005	NC_013595	GCT	2	6	239272	239277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271961832
5006	NC_013595	AGC	2	6	239280	239285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271961832
5007	NC_013595	TGC	2	6	239319	239324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271961832
5008	NC_013595	GAA	2	6	239333	239338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	271961832
5009	NC_013595	CAG	3	9	239381	239389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271961832
5010	NC_013595	CGG	2	6	239398	239403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271961832
5011	NC_013595	AGGGG	2	10	239407	239416	20 %	0 %	80 %	0 %	271961832
5012	NC_013595	GCG	2	6	239461	239466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271961832
5013	NC_013595	CG	3	6	239501	239506	0 %	0 %	50 %	50 %	271961832
5014	NC_013595	AGC	3	9	239508	239516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271961832
5015	NC_013595	ACC	2	6	239547	239552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	271961832
5016	NC_013595	GTC	2	6	239603	239608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271961832
5017	NC_013595	AAC	2	6	239613	239618	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	271961832
5018	NC_013595	GTG	2	6	239622	239627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	271961832
5019	NC_013595	CGG	2	6	239652	239657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271961832
5020	NC_013595	TCG	2	6	239679	239684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271961832
5021	NC_013595	CGA	2	6	239707	239712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271961832
5022	NC_013595	GAT	2	6	239762	239767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	271961832
5023	NC_013595	CCG	2	6	239811	239816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271961832
5024	NC_013595	TGGGCC	2	12	239820	239831	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	271961832
5025	NC_013595	GCA	2	6	239890	239895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271961832
5026	NC_013595	CGT	2	6	239906	239911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271961832
5027	NC_013595	TCC	2	6	239943	239948	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	271961832
5028	NC_013595	GCT	2	6	239950	239955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271961832
5029	NC_013595	TGGC	2	8	239964	239971	0 %	25 %	50 %	25 %	271961832
5030	NC_013595	GGC	2	6	239975	239980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271961832
5031	NC_013595	GGTG	2	8	240019	240026	0 %	25 %	75 %	0 %	271961832
5032	NC_013595	CTC	2	6	240032	240037	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	271961832
5033	NC_013595	GGCCAG	2	12	240074	240085	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	271961832
5034	NC_013595	ACC	2	6	240108	240113	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	271961832
5035	NC_013595	GGC	2	6	240125	240130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271961832
5036	NC_013595	CCA	2	6	240190	240195	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	271961832
5037	NC_013595	GAC	2	6	240200	240205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271961832
5038	NC_013595	GCG	2	6	240450	240455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271961833
5039	NC_013595	CGG	2	6	240457	240462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271961833
5040	NC_013595	CGT	2	6	240550	240555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271961833
5041	NC_013595	GCG	2	6	240567	240572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271961833
5042	NC_013595	GCA	2	6	240605	240610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271961833
5043	NC_013595	GGC	2	6	240627	240632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271961833
5044	NC_013595	GAC	2	6	240714	240719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271961834
5045	NC_013595	GCA	2	6	240729	240734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271961834
5046	NC_013595	CAG	2	6	240772	240777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271961834
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5048	NC_013595	GCGA	2	8	240809	240816	25 %	0 %	50 %	25 %	271961834
5049	NC_013595	CGC	2	6	240844	240849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271961834
5050	NC_013595	CGC	2	6	240877	240882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271961834
5051	NC_013595	GC	3	6	240906	240911	0 %	0 %	50 %	50 %	271961834
5052	NC_013595	GCA	2	6	240915	240920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271961834
5053	NC_013595	CCG	2	6	240984	240989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271961834
5054	NC_013595	CGG	2	6	241047	241052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271961834
5055	NC_013595	CGG	3	9	241218	241226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271961834
5056	NC_013595	GCC	2	6	241238	241243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271961834
5057	NC_013595	GGC	2	6	241285	241290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271961834
5058	NC_013595	CTT	2	6	241296	241301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	271961834
5059	NC_013595	GCA	2	6	241317	241322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271961834
5060	NC_013595	GCC	2	6	241358	241363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271961834
5061	NC_013595	CCAG	2	8	241401	241408	25 %	0 %	25 %	50 %	271961834
5062	NC_013595	GCGA	2	8	241436	241443	25 %	0 %	50 %	25 %	271961834
5063	NC_013595	CAG	2	6	241552	241557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271961834
5064	NC_013595	GAG	2	6	241567	241572	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	271961834
5065	NC_013595	CAG	2	6	241627	241632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271961834
5066	NC_013595	ACG	2	6	241667	241672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271961834
5067	NC_013595	AGG	2	6	241775	241780	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	271961834
5068	NC_013595	GGC	2	6	241816	241821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271961834
5069	NC_013595	GTG	2	6	242177	242182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	271961835
5070	NC_013595	CGA	2	6	242183	242188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271961835
5071	NC_013595	CTG	2	6	242228	242233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271961835
5072	NC_013595	TCA	2	6	242280	242285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	271961835
5073	NC_013595	GGC	2	6	242298	242303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271961835
5074	NC_013595	GAC	2	6	242432	242437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271961835
5075	NC_013595	TCGAC	2	10	242469	242478	20 %	20 %	20 %	40 %	271961835
5076	NC_013595	CCA	2	6	242491	242496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	271961835
5077	NC_013595	CGC	2	6	242500	242505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271961835
5078	NC_013595	GC	3	6	242508	242513	0 %	0 %	50 %	50 %	271961835
5079	NC_013595	GAC	2	6	242524	242529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271961835
5080	NC_013595	ACC	2	6	242596	242601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	271961835
5081	NC_013595	CAT	2	6	244312	244317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	271961836
5082	NC_013595	GATC	2	8	244321	244328	25 %	25 %	25 %	25 %	271961836
5083	NC_013595	CCG	2	6	244362	244367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271961836
5084	NC_013595	GCT	2	6	244399	244404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271961836
5085	NC_013595	GGC	2	6	244442	244447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271961836
5086	NC_013595	GCCA	2	8	244465	244472	25 %	0 %	25 %	50 %	271961836
5087	NC_013595	CGA	2	6	244474	244479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271961836
5088	NC_013595	GGC	2	6	244518	244523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271961836
5089	NC_013595	CCACA	2	10	244535	244544	40 %	0 %	0 %	60 %	271961836
5090	NC_013595	ACG	2	6	244620	244625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271961836
5091	NC_013595	CGT	2	6	244669	244674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271961836
5092	NC_013595	GAC	3	9	244712	244720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271961836
5093	NC_013595	CACCGC	2	12	244733	244744	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	271961836
5094	NC_013595	CAG	2	6	244809	244814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271961836
5095	NC_013595	ACCA	2	8	244830	244837	50 %	0 %	0 %	50 %	271961836
5096	NC_013595	CGG	2	6	244961	244966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271961836
5097	NC_013595	GA	3	6	245012	245017	50 %	0 %	50 %	0 %	271961836
5098	NC_013595	GCT	2	6	245020	245025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271961836
5099	NC_013595	GTC	2	6	245041	245046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271961836
5100	NC_013595	TCG	2	6	245060	245065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271961836
5101	NC_013595	GAC	2	6	245152	245157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271961836
5102	NC_013595	GCC	2	6	245214	245219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	271961837
5103	NC_013595	GACCTT	2	12	245224	245235	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	271961837
5104	NC_013595	GGTG	2	8	245248	245255	0 %	25 %	75 %	0 %	271961837
5105	NC_013595	TGG	2	6	245324	245329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	271961837
5106	NC_013595	GTG	2	6	245333	245338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	271961837
5107	NC_013595	GATC	2	8	245418	245425	25 %	25 %	25 %	25 %	271961837
5108	NC_013595	GGGAC	2	10	245443	245452	20 %	0 %	60 %	20 %	271961837
5109	NC_013595	AGG	2	6	245551	245556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	271961837
5110	NC_013595	TCT	2	6	245631	245636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	271961837
5111	NC_013595	C	6	6	245653	245658	0 %	0 %	0 %	100 %	271961837
5112	NC_013595	TC	3	6	245660	245665	0 %	50 %	0 %	50 %	271961837
5113	NC_013595	TGA	2	6	245673	245678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	271961837
5114	NC_013595	CGA	2	6	245706	245711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271961837
5115	NC_013595	GTCG	2	8	246355	246362	0 %	25 %	50 %	25 %	271961838
5116	NC_013595	TG	3	6	246392	246397	0 %	50 %	50 %	0 %	271961838
5117	NC_013595	TC	3	6	246430	246435	0 %	50 %	0 %	50 %	271961838
5118	NC_013595	CGG	2	6	246486	246491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271961838
5119	NC_013595	CGT	2	6	246501	246506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271961838
5120	NC_013595	CAT	2	6	246603	246608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	271961838
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5122	NC_013595	CGT	2	6	246669	246674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271961838
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5480	NC_013595	ACC	2	6	263364	263369	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	271961853
5481	NC_013595	GCG	2	6	263393	263398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271961853
5482	NC_013595	CGG	2	6	263405	263410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271961853
5483	NC_013595	CGGG	2	8	263447	263454	0 %	0 %	75 %	25 %	271961853
5484	NC_013595	CCT	2	6	263539	263544	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	271961853
5485	NC_013595	CG	3	6	263557	263562	0 %	0 %	50 %	50 %	271961853
5486	NC_013595	GCT	2	6	263573	263578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271961853
5487	NC_013595	GGA	2	6	263579	263584	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	271961853
5488	NC_013595	AGC	2	6	263641	263646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271961853
5489	NC_013595	CGA	2	6	263696	263701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271961853
5490	NC_013595	ACC	2	6	263736	263741	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	271961853
5491	NC_013595	GGT	2	6	263780	263785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	271961853
5492	NC_013595	GGA	2	6	263813	263818	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	271961853
5493	NC_013595	CGT	2	6	263855	263860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271961853
5494	NC_013595	CCGG	2	8	263874	263881	0 %	0 %	50 %	50 %	271961853
5495	NC_013595	CAC	2	6	263907	263912	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	271961853
5496	NC_013595	TGA	2	6	263926	263931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	271961853
5497	NC_013595	GCG	2	6	263932	263937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	271961853
5498	NC_013595	GTC	2	6	264000	264005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	271961853
5499	NC_013595	G	6	6	264013	264018	0 %	0 %	100 %	0 %	271961853
5500	NC_013595	CGA	2	6	264098	264103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	271961853

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