MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sebaldella termitidis ATCC 33386 plasmid pSTERM02

Total Repeats: 215

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013519	A	6	6	127	132	100 %	0 %	0 %	0 %	268796559
2	NC_013519	A	6	6	147	152	100 %	0 %	0 %	0 %	268796559
3	NC_013519	ACAG	2	8	189	196	50 %	0 %	25 %	25 %	268796559
4	NC_013519	ATT	2	6	208	213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268796559
5	NC_013519	AGA	2	6	298	303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268796559
6	NC_013519	TCAA	2	8	386	393	50 %	25 %	0 %	25 %	268796559
7	NC_013519	T	6	6	709	714	0 %	100 %	0 %	0 %	268796560
8	NC_013519	TAA	2	6	727	732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268796560
9	NC_013519	ATT	2	6	754	759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268796560
10	NC_013519	TTC	2	6	868	873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268796560
11	NC_013519	AAT	2	6	880	885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268796560
12	NC_013519	GAA	2	6	950	955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268796560
13	NC_013519	GAA	2	6	983	988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268796560
14	NC_013519	AT	3	6	1179	1184	50 %	50 %	0 %	0 %	268796561
15	NC_013519	AATAA	2	10	1222	1231	80 %	20 %	0 %	0 %	268796561
16	NC_013519	A	6	6	1245	1250	100 %	0 %	0 %	0 %	268796561
17	NC_013519	AAG	2	6	1256	1261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268796561
18	NC_013519	ATT	2	6	1335	1340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268796561
19	NC_013519	A	6	6	1515	1520	100 %	0 %	0 %	0 %	268796561
20	NC_013519	AAT	2	6	1582	1587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268796561
21	NC_013519	AAG	2	6	1694	1699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268796562
22	NC_013519	AAC	2	6	1765	1770	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268796562
23	NC_013519	TAA	2	6	1779	1784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268796562
24	NC_013519	T	8	8	1936	1943	0 %	100 %	0 %	0 %	268796562
25	NC_013519	AGA	2	6	3197	3202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268796563
26	NC_013519	A	7	7	3349	3355	100 %	0 %	0 %	0 %	268796563
27	NC_013519	GAAAA	2	10	3424	3433	80 %	0 %	20 %	0 %	268796563
28	NC_013519	A	6	6	3430	3435	100 %	0 %	0 %	0 %	268796563
29	NC_013519	TAT	2	6	3438	3443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268796563
30	NC_013519	ATC	2	6	3444	3449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268796563
31	NC_013519	TAA	2	6	3577	3582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268796563
32	NC_013519	AAT	2	6	3609	3614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268796563
33	NC_013519	A	7	7	3713	3719	100 %	0 %	0 %	0 %	268796563
34	NC_013519	AAC	2	6	3780	3785	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268796563
35	NC_013519	TCAT	2	8	3812	3819	25 %	50 %	0 %	25 %	268796563
36	NC_013519	AT	3	6	3837	3842	50 %	50 %	0 %	0 %	268796563
37	NC_013519	ATTT	2	8	3883	3890	25 %	75 %	0 %	0 %	268796563
38	NC_013519	AGG	2	6	3892	3897	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268796563
39	NC_013519	GAT	2	6	3924	3929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268796564
40	NC_013519	A	7	7	3931	3937	100 %	0 %	0 %	0 %	268796564
41	NC_013519	CTTA	2	8	3967	3974	25 %	50 %	0 %	25 %	268796564
42	NC_013519	TAT	2	6	3986	3991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268796564
43	NC_013519	T	6	6	4015	4020	0 %	100 %	0 %	0 %	268796564
44	NC_013519	GAA	2	6	4059	4064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268796564
45	NC_013519	ATAA	2	8	4098	4105	75 %	25 %	0 %	0 %	268796564
46	NC_013519	TGA	2	6	4160	4165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268796564
47	NC_013519	AGA	2	6	4181	4186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268796564
48	NC_013519	GAA	2	6	4204	4209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268796564
49	NC_013519	AAG	2	6	4249	4254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268796564
50	NC_013519	A	7	7	4293	4299	100 %	0 %	0 %	0 %	268796564
51	NC_013519	TAAT	2	8	4313	4320	50 %	50 %	0 %	0 %	268796564
52	NC_013519	A	6	6	4884	4889	100 %	0 %	0 %	0 %	268796565
53	NC_013519	GAAG	2	8	4920	4927	50 %	0 %	50 %	0 %	268796565
54	NC_013519	A	6	6	4933	4938	100 %	0 %	0 %	0 %	268796565
55	NC_013519	AGA	2	6	4952	4957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268796565
56	NC_013519	A	6	6	4982	4987	100 %	0 %	0 %	0 %	268796565
57	NC_013519	AT	3	6	5000	5005	50 %	50 %	0 %	0 %	268796565
58	NC_013519	ATTGAT	2	12	5037	5048	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	268796565
59	NC_013519	TG	3	6	5065	5070	0 %	50 %	50 %	0 %	268796565
60	NC_013519	TGA	2	6	5080	5085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268796565
61	NC_013519	AT	3	6	5093	5098	50 %	50 %	0 %	0 %	268796565
62	NC_013519	A	6	6	5161	5166	100 %	0 %	0 %	0 %	268796565
63	NC_013519	TGG	2	6	5167	5172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268796565
64	NC_013519	GAA	2	6	5202	5207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268796565
65	NC_013519	TTG	2	6	5245	5250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268796565
66	NC_013519	AT	3	6	5255	5260	50 %	50 %	0 %	0 %	268796565
67	NC_013519	ATT	2	6	5263	5268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268796565
68	NC_013519	T	6	6	5299	5304	0 %	100 %	0 %	0 %	268796565
69	NC_013519	GTC	2	6	5334	5339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268796565
70	NC_013519	ATG	2	6	5346	5351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268796565
71	NC_013519	ATT	2	6	5394	5399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268796565
72	NC_013519	AT	3	6	5426	5431	50 %	50 %	0 %	0 %	268796565
73	NC_013519	T	6	6	5431	5436	0 %	100 %	0 %	0 %	268796565
74	NC_013519	AGA	3	9	5492	5500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268796565
75	NC_013519	A	7	7	5513	5519	100 %	0 %	0 %	0 %	268796565
76	NC_013519	ATT	2	6	5544	5549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268796565
77	NC_013519	A	8	8	5557	5564	100 %	0 %	0 %	0 %	268796565
78	NC_013519	AGG	2	6	5604	5609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268796565
79	NC_013519	GAA	2	6	5644	5649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268796566
80	NC_013519	A	7	7	5653	5659	100 %	0 %	0 %	0 %	268796566
81	NC_013519	A	8	8	5661	5668	100 %	0 %	0 %	0 %	268796566
82	NC_013519	A	7	7	5698	5704	100 %	0 %	0 %	0 %	268796566
83	NC_013519	AGA	2	6	5718	5723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268796566
84	NC_013519	TGA	2	6	5735	5740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268796566
85	NC_013519	AT	3	6	5744	5749	50 %	50 %	0 %	0 %	268796566
86	NC_013519	ATT	2	6	5778	5783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268796566
87	NC_013519	GAA	2	6	5809	5814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268796566
88	NC_013519	CAA	2	6	5829	5834	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268796566
89	NC_013519	TAAAA	2	10	5844	5853	80 %	20 %	0 %	0 %	268796566
90	NC_013519	T	6	6	6003	6008	0 %	100 %	0 %	0 %	268796566
91	NC_013519	TAA	2	6	6044	6049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268796566
92	NC_013519	A	7	7	6142	6148	100 %	0 %	0 %	0 %	268796566
93	NC_013519	TAA	2	6	6155	6160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268796566
94	NC_013519	CAA	2	6	6321	6326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268796566
95	NC_013519	A	7	7	6331	6337	100 %	0 %	0 %	0 %	268796566
96	NC_013519	TAA	2	6	6368	6373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268796566
97	NC_013519	TTA	2	6	6386	6391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268796566
98	NC_013519	TTC	2	6	6411	6416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268796566
99	NC_013519	A	7	7	6420	6426	100 %	0 %	0 %	0 %	268796566
100	NC_013519	A	6	6	6433	6438	100 %	0 %	0 %	0 %	268796566
101	NC_013519	AT	3	6	6458	6463	50 %	50 %	0 %	0 %	268796566
102	NC_013519	A	6	6	6466	6471	100 %	0 %	0 %	0 %	268796566
103	NC_013519	AATT	2	8	6489	6496	50 %	50 %	0 %	0 %	268796566
104	NC_013519	AAT	2	6	6529	6534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268796566
105	NC_013519	T	8	8	6542	6549	0 %	100 %	0 %	0 %	268796566
106	NC_013519	TAA	2	6	7073	7078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268796567
107	NC_013519	TA	3	6	7099	7104	50 %	50 %	0 %	0 %	268796567
108	NC_013519	ATT	2	6	7106	7111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268796567
109	NC_013519	AAAC	2	8	7220	7227	75 %	0 %	0 %	25 %	268796567
110	NC_013519	AT	4	8	7262	7269	50 %	50 %	0 %	0 %	268796567
111	NC_013519	ATG	2	6	7298	7303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268796567
112	NC_013519	A	7	7	7337	7343	100 %	0 %	0 %	0 %	268796567
113	NC_013519	A	8	8	7353	7360	100 %	0 %	0 %	0 %	268796567
114	NC_013519	TGA	2	6	7371	7376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268796567
115	NC_013519	GAA	3	9	7390	7398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268796567
116	NC_013519	A	6	6	7402	7407	100 %	0 %	0 %	0 %	268796567
117	NC_013519	ATG	2	6	7451	7456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268796567
118	NC_013519	AG	3	6	7465	7470	50 %	0 %	50 %	0 %	268796567
119	NC_013519	A	8	8	7483	7490	100 %	0 %	0 %	0 %	268796567
120	NC_013519	AT	3	6	7545	7550	50 %	50 %	0 %	0 %	268796567
121	NC_013519	A	6	6	7601	7606	100 %	0 %	0 %	0 %	268796567
122	NC_013519	GAT	2	6	7669	7674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268796567
123	NC_013519	TATT	2	8	7787	7794	25 %	75 %	0 %	0 %	268796567
124	NC_013519	A	7	7	7898	7904	100 %	0 %	0 %	0 %	268796567
125	NC_013519	TTTTG	2	10	7908	7917	0 %	80 %	20 %	0 %	268796567
126	NC_013519	ATG	2	6	7928	7933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268796567
127	NC_013519	A	6	6	7967	7972	100 %	0 %	0 %	0 %	268796567
128	NC_013519	TCAA	2	8	7974	7981	50 %	25 %	0 %	25 %	268796567
129	NC_013519	ATTTGA	2	12	8001	8012	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	268796567
130	NC_013519	CAGA	2	8	8048	8055	50 %	0 %	25 %	25 %	268796567
131	NC_013519	GAC	2	6	8098	8103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268796567
132	NC_013519	GAT	2	6	8218	8223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268796567
133	NC_013519	GGA	2	6	8233	8238	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268796567
134	NC_013519	AC	3	6	8241	8246	50 %	0 %	0 %	50 %	268796567
135	NC_013519	AAC	2	6	8286	8291	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268796567
136	NC_013519	TGA	2	6	8310	8315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268796567
137	NC_013519	ATG	2	6	8333	8338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268796567
138	NC_013519	GAA	2	6	8363	8368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268796567
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140	NC_013519	A	6	6	8488	8493	100 %	0 %	0 %	0 %	268796567
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.