MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptobacillus moniliformis DSM 12112 plasmid pSMON01

Total Repeats: 332

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013516	TC	3	6	7	12	0 %	50 %	0 %	50 %	268687600
2	NC_013516	TTC	2	6	58	63	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268687600
3	NC_013516	ATTT	2	8	79	86	25 %	75 %	0 %	0 %	268687600
4	NC_013516	ATT	2	6	97	102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268687600
5	NC_013516	TCA	2	6	104	109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268687600
6	NC_013516	TAA	2	6	110	115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268687600
7	NC_013516	TTATC	2	10	141	150	20 %	60 %	0 %	20 %	268687600
8	NC_013516	TCTTTT	2	12	258	269	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	268687600
9	NC_013516	T	6	6	330	335	0 %	100 %	0 %	0 %	268687600
10	NC_013516	T	6	6	359	364	0 %	100 %	0 %	0 %	268687600
11	NC_013516	TCT	2	6	368	373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268687600
12	NC_013516	AT	3	6	479	484	50 %	50 %	0 %	0 %	268687600
13	NC_013516	TGT	2	6	499	504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268687600
14	NC_013516	T	6	6	535	540	0 %	100 %	0 %	0 %	268687600
15	NC_013516	TA	3	6	558	563	50 %	50 %	0 %	0 %	268687600
16	NC_013516	TTG	2	6	652	657	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268687600
17	NC_013516	T	7	7	665	671	0 %	100 %	0 %	0 %	268687600
18	NC_013516	TAT	2	6	688	693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268687600
19	NC_013516	T	7	7	693	699	0 %	100 %	0 %	0 %	268687600
20	NC_013516	TCT	2	6	716	721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268687600
21	NC_013516	TCT	2	6	746	751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268687600
22	NC_013516	TA	3	6	796	801	50 %	50 %	0 %	0 %	268687600
23	NC_013516	TTA	2	6	848	853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268687600
24	NC_013516	TC	3	6	860	865	0 %	50 %	0 %	50 %	268687600
25	NC_013516	TTC	2	6	868	873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268687600
26	NC_013516	TTC	2	6	892	897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268687600
27	NC_013516	TTTCTT	2	12	914	925	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	268687600
28	NC_013516	ATTTCA	2	12	938	949	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	268687600
29	NC_013516	TTTTC	2	10	972	981	0 %	80 %	0 %	20 %	268687600
30	NC_013516	CAT	2	6	1041	1046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268687600
31	NC_013516	T	6	6	1064	1069	0 %	100 %	0 %	0 %	268687600
32	NC_013516	TAA	2	6	1122	1127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268687600
33	NC_013516	AGC	2	6	1189	1194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268687600
34	NC_013516	TGT	2	6	1204	1209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268687600
35	NC_013516	T	7	7	1233	1239	0 %	100 %	0 %	0 %	268687600
36	NC_013516	TAT	2	6	1261	1266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268687600
37	NC_013516	TTC	2	6	1267	1272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268687600
38	NC_013516	TTC	2	6	1279	1284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268687600
39	NC_013516	TA	3	6	1308	1313	50 %	50 %	0 %	0 %	268687600
40	NC_013516	T	6	6	1315	1320	0 %	100 %	0 %	0 %	268687600
41	NC_013516	TTA	2	6	1379	1384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268687600
42	NC_013516	AAT	2	6	1400	1405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268687600
43	NC_013516	TCA	2	6	1430	1435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268687600
44	NC_013516	TA	3	6	1455	1460	50 %	50 %	0 %	0 %	268687600
45	NC_013516	T	6	6	1541	1546	0 %	100 %	0 %	0 %	268687600
46	NC_013516	A	6	6	1598	1603	100 %	0 %	0 %	0 %	268687600
47	NC_013516	GTTG	2	8	1633	1640	0 %	50 %	50 %	0 %	268687600
48	NC_013516	TTTA	2	8	1690	1697	25 %	75 %	0 %	0 %	268687600
49	NC_013516	TTC	2	6	1732	1737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268687600
50	NC_013516	T	6	6	1748	1753	0 %	100 %	0 %	0 %	268687600
51	NC_013516	AAT	2	6	1756	1761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268687600
52	NC_013516	TTC	2	6	1796	1801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268687600
53	NC_013516	AAT	2	6	1837	1842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268687600
54	NC_013516	TTG	2	6	1843	1848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268687600
55	NC_013516	TTG	2	6	1866	1871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268687600
56	NC_013516	CTT	2	6	2357	2362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268687601
57	NC_013516	ATT	2	6	2369	2374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268687601
58	NC_013516	TAC	2	6	2384	2389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268687601
59	NC_013516	TAT	2	6	2390	2395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268687601
60	NC_013516	ATA	2	6	2401	2406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268687601
61	NC_013516	TAA	2	6	2410	2415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268687601
62	NC_013516	TATG	2	8	2468	2475	25 %	50 %	25 %	0 %	268687601
63	NC_013516	TA	3	6	2480	2485	50 %	50 %	0 %	0 %	268687601
64	NC_013516	AAT	2	6	2504	2509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268687601
65	NC_013516	TAAA	2	8	2515	2522	75 %	25 %	0 %	0 %	268687601
66	NC_013516	AT	3	6	2570	2575	50 %	50 %	0 %	0 %	268687601
67	NC_013516	TA	3	6	2576	2581	50 %	50 %	0 %	0 %	268687601
68	NC_013516	TAA	2	6	2669	2674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268687601
69	NC_013516	TAT	2	6	2678	2683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268687601
70	NC_013516	ATA	2	6	2694	2699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268687601
71	NC_013516	ATTTA	2	10	2714	2723	40 %	60 %	0 %	0 %	268687601
72	NC_013516	AT	3	6	2728	2733	50 %	50 %	0 %	0 %	268687601
73	NC_013516	AT	3	6	2738	2743	50 %	50 %	0 %	0 %	268687601
74	NC_013516	AAT	2	6	2744	2749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268687601
75	NC_013516	TCA	2	6	2778	2783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268687601
76	NC_013516	AT	3	6	2833	2838	50 %	50 %	0 %	0 %	268687601
77	NC_013516	TAT	2	6	2852	2857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268687601
78	NC_013516	ATA	2	6	2858	2863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268687601
79	NC_013516	AT	3	6	2866	2871	50 %	50 %	0 %	0 %	268687601
80	NC_013516	A	7	7	2885	2891	100 %	0 %	0 %	0 %	268687601
81	NC_013516	AATATA	2	12	2926	2937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268687601
82	NC_013516	TCATT	2	10	2938	2947	20 %	60 %	0 %	20 %	268687601
83	NC_013516	TTA	2	6	2962	2967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268687601
84	NC_013516	TA	4	8	2980	2987	50 %	50 %	0 %	0 %	268687601
85	NC_013516	A	6	6	2987	2992	100 %	0 %	0 %	0 %	268687601
86	NC_013516	TAGAT	2	10	3002	3011	40 %	40 %	20 %	0 %	268687601
87	NC_013516	AT	3	6	3010	3015	50 %	50 %	0 %	0 %	268687601
88	NC_013516	T	6	6	3015	3020	0 %	100 %	0 %	0 %	268687601
89	NC_013516	TAAA	2	8	3041	3048	75 %	25 %	0 %	0 %	268687601
90	NC_013516	AT	3	6	3084	3089	50 %	50 %	0 %	0 %	268687601
91	NC_013516	A	8	8	3096	3103	100 %	0 %	0 %	0 %	268687601
92	NC_013516	TCC	2	6	3129	3134	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268687602
93	NC_013516	TA	3	6	3176	3181	50 %	50 %	0 %	0 %	268687602
94	NC_013516	AAAAT	2	10	3185	3194	80 %	20 %	0 %	0 %	268687602
95	NC_013516	A	7	7	3201	3207	100 %	0 %	0 %	0 %	268687602
96	NC_013516	A	6	6	3213	3218	100 %	0 %	0 %	0 %	268687602
97	NC_013516	A	6	6	3229	3234	100 %	0 %	0 %	0 %	268687602
98	NC_013516	T	7	7	3235	3241	0 %	100 %	0 %	0 %	268687602
99	NC_013516	ATATA	2	10	3243	3252	60 %	40 %	0 %	0 %	268687602
100	NC_013516	AT	5	10	3270	3279	50 %	50 %	0 %	0 %	268687602
101	NC_013516	ATA	2	6	3321	3326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268687602
102	NC_013516	A	7	7	3405	3411	100 %	0 %	0 %	0 %	268687602
103	NC_013516	AATT	2	8	3426	3433	50 %	50 %	0 %	0 %	268687602
104	NC_013516	TAT	3	9	3462	3470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268687602
105	NC_013516	AAT	2	6	3471	3476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268687602
106	NC_013516	A	6	6	3489	3494	100 %	0 %	0 %	0 %	268687602
107	NC_013516	AT	3	6	3530	3535	50 %	50 %	0 %	0 %	268687602
108	NC_013516	AT	3	6	3578	3583	50 %	50 %	0 %	0 %	268687602
109	NC_013516	A	7	7	3585	3591	100 %	0 %	0 %	0 %	268687602
110	NC_013516	CTA	2	6	3629	3634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268687602
111	NC_013516	T	6	6	3643	3648	0 %	100 %	0 %	0 %	268687602
112	NC_013516	CAT	2	6	3650	3655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268687602
113	NC_013516	AT	3	6	3661	3666	50 %	50 %	0 %	0 %	268687602
114	NC_013516	TAA	2	6	3701	3706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268687602
115	NC_013516	AT	3	6	3722	3727	50 %	50 %	0 %	0 %	268687602
116	NC_013516	T	6	6	3727	3732	0 %	100 %	0 %	0 %	268687602
117	NC_013516	AT	3	6	3791	3796	50 %	50 %	0 %	0 %	268687602
118	NC_013516	T	6	6	3805	3810	0 %	100 %	0 %	0 %	268687602
119	NC_013516	GTT	2	6	3820	3825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268687602
120	NC_013516	ATA	2	6	3842	3847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268687602
121	NC_013516	T	8	8	3848	3855	0 %	100 %	0 %	0 %	268687602
122	NC_013516	TA	3	6	3876	3881	50 %	50 %	0 %	0 %	268687602
123	NC_013516	T	6	6	3909	3914	0 %	100 %	0 %	0 %	268687603
124	NC_013516	ATT	2	6	3919	3924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268687603
125	NC_013516	AATC	2	8	3942	3949	50 %	25 %	0 %	25 %	268687603
126	NC_013516	ATT	2	6	3952	3957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268687603
127	NC_013516	T	6	6	3980	3985	0 %	100 %	0 %	0 %	268687603
128	NC_013516	ATC	2	6	4129	4134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268687603
129	NC_013516	TTTA	2	8	4162	4169	25 %	75 %	0 %	0 %	268687603
130	NC_013516	ATT	3	9	4172	4180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268687603
131	NC_013516	TA	3	6	4221	4226	50 %	50 %	0 %	0 %	268687603
132	NC_013516	TTG	2	6	4230	4235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268687603
133	NC_013516	T	7	7	4240	4246	0 %	100 %	0 %	0 %	268687603
134	NC_013516	TTC	2	6	4249	4254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268687603
135	NC_013516	ATTTT	2	10	4268	4277	20 %	80 %	0 %	0 %	268687603
136	NC_013516	AT	3	6	4284	4289	50 %	50 %	0 %	0 %	268687603
137	NC_013516	TAA	2	6	4318	4323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268687603
138	NC_013516	TAA	2	6	4336	4341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268687603
139	NC_013516	ATA	2	6	4347	4352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268687603
140	NC_013516	T	6	6	4365	4370	0 %	100 %	0 %	0 %	268687603
141	NC_013516	TAA	2	6	4441	4446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268687603
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.