MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946 chromosome

Total Repeats: 43647

< Previous12...76777879808182838485868788Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
43501	NC_013512	TCA	2	6	2299101	2299106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268680903
43502	NC_013512	GATCAG	2	12	2299114	2299125	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	268680903
43503	NC_013512	CAG	3	9	2299123	2299131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268680903
43504	NC_013512	AAT	2	6	2299154	2299159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268680903
43505	NC_013512	AAC	2	6	2299190	2299195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268680903
43506	NC_013512	CAA	2	6	2299231	2299236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268680903
43507	NC_013512	CCA	2	6	2299252	2299257	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268680903
43508	NC_013512	CAC	2	6	2299279	2299284	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268680903
43509	NC_013512	TCT	2	6	2299410	2299415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268680903
43510	NC_013512	TGG	2	6	2299422	2299427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268680903
43511	NC_013512	A	6	6	2299524	2299529	100 %	0 %	0 %	0 %	268680903
43512	NC_013512	AAT	2	6	2299805	2299810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268680904
43513	NC_013512	GAA	2	6	2299895	2299900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268680904
43514	NC_013512	GAA	2	6	2299970	2299975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268680904
43515	NC_013512	TGA	2	6	2299987	2299992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268680904
43516	NC_013512	AGA	2	6	2300002	2300007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268680904
43517	NC_013512	AAG	2	6	2300034	2300039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268680904
43518	NC_013512	A	6	6	2300187	2300192	100 %	0 %	0 %	0 %	268680904
43519	NC_013512	AG	3	6	2300206	2300211	50 %	0 %	50 %	0 %	268680904
43520	NC_013512	AG	3	6	2300215	2300220	50 %	0 %	50 %	0 %	268680904
43521	NC_013512	AG	3	6	2300248	2300253	50 %	0 %	50 %	0 %	268680904
43522	NC_013512	T	7	7	2300257	2300263	0 %	100 %	0 %	0 %	268680904
43523	NC_013512	AAC	2	6	2300297	2300302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268680904
43524	NC_013512	T	6	6	2300347	2300352	0 %	100 %	0 %	0 %	268680904
43525	NC_013512	ACA	2	6	2300359	2300364	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268680904
43526	NC_013512	TCCA	2	8	2300392	2300399	25 %	25 %	0 %	50 %	268680904
43527	NC_013512	CTT	2	6	2300430	2300435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268680904
43528	NC_013512	GAA	2	6	2300438	2300443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268680904
43529	NC_013512	ACA	2	6	2300459	2300464	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268680904
43530	NC_013512	AAC	2	6	2300506	2300511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268680904
43531	NC_013512	A	7	7	2300543	2300549	100 %	0 %	0 %	0 %	268680904
43532	NC_013512	TCG	2	6	2300565	2300570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268680904
43533	NC_013512	AAAC	2	8	2300571	2300578	75 %	0 %	0 %	25 %	268680904
43534	NC_013512	GAT	2	6	2300582	2300587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268680904
43535	NC_013512	AAT	2	6	2300639	2300644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268680904
43536	NC_013512	GAA	2	6	2300714	2300719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268680904
43537	NC_013512	CAA	2	6	2300769	2300774	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268680904
43538	NC_013512	AG	3	6	2300866	2300871	50 %	0 %	50 %	0 %	268680904
43539	NC_013512	TCAA	2	8	2300874	2300881	50 %	25 %	0 %	25 %	268680904
43540	NC_013512	A	6	6	2300901	2300906	100 %	0 %	0 %	0 %	268680904
43541	NC_013512	ACC	2	6	2300920	2300925	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268680904
43542	NC_013512	AAT	2	6	2300999	2301004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268680904
43543	NC_013512	ACC	2	6	2301032	2301037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268680904
43544	NC_013512	AGT	2	6	2301170	2301175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268680904
43545	NC_013512	ACC	2	6	2301194	2301199	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268680904
43546	NC_013512	AAC	2	6	2301217	2301222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268680904
43547	NC_013512	TTAACA	2	12	2301253	2301264	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	268680904
43548	NC_013512	CAA	3	9	2301345	2301353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268680905
43549	NC_013512	ATC	2	6	2301364	2301369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268680905
43550	NC_013512	ATG	2	6	2301378	2301383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268680905
43551	NC_013512	T	6	6	2301385	2301390	0 %	100 %	0 %	0 %	268680905
43552	NC_013512	CT	3	6	2301473	2301478	0 %	50 %	0 %	50 %	268680905
43553	NC_013512	ACC	2	6	2301500	2301505	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268680905
43554	NC_013512	AAAAC	2	10	2301612	2301621	80 %	0 %	0 %	20 %	268680905
43555	NC_013512	GTG	2	6	2301738	2301743	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268680905
43556	NC_013512	AAC	2	6	2301847	2301852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268680905
43557	NC_013512	TTA	2	6	2301922	2301927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268680905
43558	NC_013512	TGA	2	6	2301937	2301942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268680905
43559	NC_013512	TA	3	6	2302045	2302050	50 %	50 %	0 %	0 %	268680906
43560	NC_013512	AAT	2	6	2302063	2302068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268680906
43561	NC_013512	TCTCT	2	10	2302115	2302124	0 %	60 %	0 %	40 %	268680906
43562	NC_013512	T	6	6	2302124	2302129	0 %	100 %	0 %	0 %	268680906
43563	NC_013512	TAG	2	6	2302139	2302144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268680906
43564	NC_013512	GGTT	2	8	2302270	2302277	0 %	50 %	50 %	0 %	268680906
43565	NC_013512	TAT	2	6	2302306	2302311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268680906
43566	NC_013512	ACG	2	6	2302405	2302410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268680906
43567	NC_013512	ATG	2	6	2302502	2302507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268680906
43568	NC_013512	TTA	2	6	2302560	2302565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268680906
43569	NC_013512	TCA	2	6	2302579	2302584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268680906
43570	NC_013512	CTT	2	6	2302589	2302594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268680906
43571	NC_013512	ACA	2	6	2302621	2302626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268680906
43572	NC_013512	ACTC	2	8	2302698	2302705	25 %	25 %	0 %	50 %	268680906
43573	NC_013512	AAC	2	6	2302731	2302736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268680906
43574	NC_013512	CTC	2	6	2302742	2302747	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268680906
43575	NC_013512	ATG	2	6	2302850	2302855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268680906
43576	NC_013512	AAG	2	6	2302916	2302921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268680906
43577	NC_013512	CA	3	6	2302926	2302931	50 %	0 %	0 %	50 %	268680906
43578	NC_013512	CAT	2	6	2302950	2302955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268680906
43579	NC_013512	ACA	2	6	2303095	2303100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268680906
43580	NC_013512	AATGGC	2	12	2303173	2303184	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	268680906
43581	NC_013512	AAT	2	6	2303215	2303220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268680906
43582	NC_013512	AAC	2	6	2303226	2303231	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268680906
43583	NC_013512	TGG	2	6	2303256	2303261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268680906
43584	NC_013512	CTC	2	6	2303400	2303405	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268680906
43585	NC_013512	TCC	2	6	2303482	2303487	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268680906
43586	NC_013512	T	8	8	2303502	2303509	0 %	100 %	0 %	0 %	268680906
43587	NC_013512	GTG	2	6	2303522	2303527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268680906
43588	NC_013512	T	6	6	2303532	2303537	0 %	100 %	0 %	0 %	268680906
43589	NC_013512	TTA	2	6	2303606	2303611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268680906
43590	NC_013512	CAC	2	6	2303649	2303654	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268680906
43591	NC_013512	A	6	6	2303670	2303675	100 %	0 %	0 %	0 %	268680906
43592	NC_013512	ATG	2	6	2303775	2303780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268680907
43593	NC_013512	AAC	2	6	2303844	2303849	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268680907
43594	NC_013512	ACA	2	6	2303865	2303870	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268680907
43595	NC_013512	TGG	2	6	2303951	2303956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268680907
43596	NC_013512	AAC	2	6	2303984	2303989	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268680907
43597	NC_013512	GTG	2	6	2304064	2304069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268680907
43598	NC_013512	T	7	7	2304074	2304080	0 %	100 %	0 %	0 %	268680907
43599	NC_013512	GGA	2	6	2304096	2304101	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268680907
43600	NC_013512	ACC	2	6	2304102	2304107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268680907
43601	NC_013512	TTG	2	6	2304157	2304162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268680907
43602	NC_013512	TAT	2	6	2304176	2304181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268680907
43603	NC_013512	TAC	2	6	2304221	2304226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268680907
43604	NC_013512	ACA	2	6	2304264	2304269	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268680907
43605	NC_013512	TCTA	2	8	2304345	2304352	25 %	50 %	0 %	25 %	268680907
43606	NC_013512	ATG	2	6	2304391	2304396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268680907
43607	NC_013512	TAT	2	6	2304398	2304403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268680907
43608	NC_013512	GAT	2	6	2304429	2304434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268680907
43609	NC_013512	TAA	3	9	2304452	2304460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268680907
43610	NC_013512	TTGAAG	2	12	2304583	2304594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268680907
43611	NC_013512	A	7	7	2304697	2304703	100 %	0 %	0 %	0 %	268680907
43612	NC_013512	GTT	2	6	2304708	2304713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268680907
43613	NC_013512	GCA	2	6	2304726	2304731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268680907
43614	NC_013512	TTA	2	6	2304733	2304738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268680907
43615	NC_013512	A	6	6	2304836	2304841	100 %	0 %	0 %	0 %	268680907
43616	NC_013512	CAA	2	6	2304868	2304873	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268680907
43617	NC_013512	ATT	2	6	2304903	2304908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268680907
43618	NC_013512	CAG	2	6	2304929	2304934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268680907
43619	NC_013512	CCAA	2	8	2304939	2304946	50 %	0 %	0 %	50 %	268680907
43620	NC_013512	ATG	2	6	2304961	2304966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268680907
43621	NC_013512	ATG	2	6	2305099	2305104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268680907
43622	NC_013512	CTG	2	6	2305201	2305206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268680907
43623	NC_013512	GAT	2	6	2305266	2305271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268680907
43624	NC_013512	TAT	2	6	2305301	2305306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268680907
43625	NC_013512	AAT	2	6	2305311	2305316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268680907
43626	NC_013512	GGT	2	6	2305329	2305334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268680907
43627	NC_013512	CAG	2	6	2305345	2305350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268680907
43628	NC_013512	CAA	2	6	2305372	2305377	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268680907
43629	NC_013512	T	6	6	2305442	2305447	0 %	100 %	0 %	0 %	268680907
43630	NC_013512	AGA	2	6	2305451	2305456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268680907
43631	NC_013512	TTTA	2	8	2305468	2305475	25 %	75 %	0 %	0 %	268680907
43632	NC_013512	ATA	2	6	2305504	2305509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268680907
43633	NC_013512	CAAC	2	8	2305513	2305520	50 %	0 %	0 %	50 %	268680907
43634	NC_013512	ACA	2	6	2305530	2305535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268680907
43635	NC_013512	AGG	2	6	2305697	2305702	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268680907
43636	NC_013512	ACCGTT	2	12	2305719	2305730	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	268680907
43637	NC_013512	GAA	2	6	2305758	2305763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268680907
43638	NC_013512	A	6	6	2305766	2305771	100 %	0 %	0 %	0 %	268680907
43639	NC_013512	TGT	2	6	2305772	2305777	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268680907
43640	NC_013512	AAT	2	6	2305851	2305856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268680907
43641	NC_013512	ACC	2	6	2305944	2305949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268680907
43642	NC_013512	TGA	2	6	2306000	2306005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268680907
43643	NC_013512	ATT	2	6	2306016	2306021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268680907
43644	NC_013512	AAT	2	6	2306082	2306087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268680907
43645	NC_013512	AG	3	6	2306096	2306101	50 %	0 %	50 %	0 %	268680907
43646	NC_013512	TAC	2	6	2306285	2306290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268680907
43647	NC_013512	AGATG	2	10	2306294	2306303	40 %	20 %	40 %	0 %	268680907

< Previous12...76777879808182838485868788Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.