MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ED98 plasmid pAVX

Total Repeats: 310

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013453	TCT	2	6	146	151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	262260516
2	NC_013453	ATA	2	6	183	188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	262260516
3	NC_013453	TAG	2	6	289	294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262260516
4	NC_013453	TAA	2	6	1360	1365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	262260517
5	NC_013453	TA	3	6	1394	1399	50 %	50 %	0 %	0 %	262260517
6	NC_013453	TA	3	6	1415	1420	50 %	50 %	0 %	0 %	262260517
7	NC_013453	AGTG	2	8	1421	1428	25 %	25 %	50 %	0 %	262260517
8	NC_013453	CAA	2	6	1445	1450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	262260517
9	NC_013453	TTTC	2	8	1482	1489	0 %	75 %	0 %	25 %	262260517
10	NC_013453	TA	3	6	1517	1522	50 %	50 %	0 %	0 %	262260517
11	NC_013453	CTTT	2	8	1524	1531	0 %	75 %	0 %	25 %	262260517
12	NC_013453	T	6	6	1529	1534	0 %	100 %	0 %	0 %	262260517
13	NC_013453	ATA	2	6	1635	1640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	262260517
14	NC_013453	GAT	2	6	1680	1685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262260517
15	NC_013453	AACA	2	8	1730	1737	75 %	0 %	0 %	25 %	262260517
16	NC_013453	T	6	6	1826	1831	0 %	100 %	0 %	0 %	262260517
17	NC_013453	CCA	2	6	1932	1937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	262260517
18	NC_013453	CTT	2	6	1975	1980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	262260517
19	NC_013453	AAT	3	9	2059	2067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	262260517
20	NC_013453	CTT	2	6	2131	2136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	262260517
21	NC_013453	AAT	2	6	2143	2148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	262260517
22	NC_013453	CTA	2	6	2376	2381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	262260517
23	NC_013453	CTTT	2	8	2407	2414	0 %	75 %	0 %	25 %	262260517
24	NC_013453	TACA	2	8	2480	2487	50 %	25 %	0 %	25 %	262260517
25	NC_013453	AAGCT	2	10	2524	2533	40 %	20 %	20 %	20 %	262260517
26	NC_013453	TCA	2	6	2562	2567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	262260517
27	NC_013453	CTTA	2	8	2660	2667	25 %	50 %	0 %	25 %	262260517
28	NC_013453	AAT	2	6	2668	2673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	262260517
29	NC_013453	CTT	2	6	2725	2730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	262260517
30	NC_013453	AAT	2	6	2738	2743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	262260517
31	NC_013453	TTA	2	6	2772	2777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	262260517
32	NC_013453	TTA	2	6	2913	2918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	262260517
33	NC_013453	TAT	2	6	3353	3358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	262260518
34	NC_013453	CTT	2	6	3425	3430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	262260518
35	NC_013453	T	6	6	3435	3440	0 %	100 %	0 %	0 %	262260518
36	NC_013453	AT	3	6	3464	3469	50 %	50 %	0 %	0 %	262260518
37	NC_013453	TAT	2	6	3477	3482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	262260518
38	NC_013453	CTT	2	6	3491	3496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	262260518
39	NC_013453	TG	3	6	3499	3504	0 %	50 %	50 %	0 %	262260518
40	NC_013453	CTT	2	6	3507	3512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	262260518
41	NC_013453	CCTT	2	8	3515	3522	0 %	50 %	0 %	50 %	262260518
42	NC_013453	TAA	2	6	3549	3554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	262260518
43	NC_013453	TCAT	2	8	3562	3569	25 %	50 %	0 %	25 %	262260518
44	NC_013453	C	6	6	3577	3582	0 %	0 %	0 %	100 %	262260519
45	NC_013453	TAT	2	6	3665	3670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	262260519
46	NC_013453	ACATA	2	10	3680	3689	60 %	20 %	0 %	20 %	262260519
47	NC_013453	CGCC	2	8	3718	3725	0 %	0 %	25 %	75 %	262260519
48	NC_013453	TTC	2	6	3728	3733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	262260519
49	NC_013453	TTCT	2	8	3767	3774	0 %	75 %	0 %	25 %	262260519
50	NC_013453	TTA	2	6	3911	3916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	262260519
51	NC_013453	CAT	2	6	3965	3970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	262260519
52	NC_013453	ACTT	2	8	4026	4033	25 %	50 %	0 %	25 %	262260519
53	NC_013453	TAA	2	6	4068	4073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	262260519
54	NC_013453	TTG	2	6	4103	4108	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	262260519
55	NC_013453	TA	3	6	4646	4651	50 %	50 %	0 %	0 %	262260520
56	NC_013453	A	7	7	4660	4666	100 %	0 %	0 %	0 %	262260520
57	NC_013453	AGG	2	6	4686	4691	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	262260520
58	NC_013453	TGT	2	6	4750	4755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	262260520
59	NC_013453	A	6	6	4830	4835	100 %	0 %	0 %	0 %	262260521
60	NC_013453	TTG	2	6	4922	4927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	262260521
61	NC_013453	GTC	3	9	4928	4936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262260521
62	NC_013453	GAT	2	6	4977	4982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262260521
63	NC_013453	AT	3	6	5063	5068	50 %	50 %	0 %	0 %	262260521
64	NC_013453	AT	3	6	5135	5140	50 %	50 %	0 %	0 %	262260521
65	NC_013453	T	6	6	5146	5151	0 %	100 %	0 %	0 %	262260521
66	NC_013453	AG	3	6	5174	5179	50 %	0 %	50 %	0 %	262260521
67	NC_013453	ATCAT	2	10	5258	5267	40 %	40 %	0 %	20 %	262260521
68	NC_013453	A	6	6	5279	5284	100 %	0 %	0 %	0 %	262260521
69	NC_013453	ATC	2	6	5288	5293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	262260521
70	NC_013453	GAT	2	6	5353	5358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262260521
71	NC_013453	TAA	2	6	5556	5561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	262260522
72	NC_013453	A	7	7	5583	5589	100 %	0 %	0 %	0 %	262260522
73	NC_013453	A	6	6	5601	5606	100 %	0 %	0 %	0 %	262260522
74	NC_013453	TATT	2	8	5626	5633	25 %	75 %	0 %	0 %	262260522
75	NC_013453	AAT	2	6	5655	5660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	262260522
76	NC_013453	GGAA	2	8	5881	5888	50 %	0 %	50 %	0 %	262260523
77	NC_013453	TAA	3	9	5890	5898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	262260523
78	NC_013453	AAC	2	6	5942	5947	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	262260523
79	NC_013453	CAT	2	6	5959	5964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	262260523
80	NC_013453	GAT	2	6	5965	5970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262260523
81	NC_013453	AGA	2	6	5995	6000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	262260523
82	NC_013453	AAT	2	6	6176	6181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	262260524
83	NC_013453	ATT	2	6	6201	6206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	262260524
84	NC_013453	TAA	2	6	6211	6216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	262260524
85	NC_013453	TAT	2	6	6232	6237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	262260524
86	NC_013453	TCC	2	6	6247	6252	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	262260524
87	NC_013453	AT	5	10	6277	6286	50 %	50 %	0 %	0 %	262260524
88	NC_013453	TTA	2	6	6300	6305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	262260524
89	NC_013453	TTG	2	6	6325	6330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	262260524
90	NC_013453	T	6	6	6334	6339	0 %	100 %	0 %	0 %	262260524
91	NC_013453	ATT	2	6	6395	6400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	262260524
92	NC_013453	ATTA	2	8	6410	6417	50 %	50 %	0 %	0 %	262260524
93	NC_013453	TAT	2	6	6449	6454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	262260525
94	NC_013453	AAT	2	6	6508	6513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	262260525
95	NC_013453	CTT	2	6	6573	6578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	262260525
96	NC_013453	TAT	2	6	6678	6683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	262260525
97	NC_013453	TAG	2	6	6684	6689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262260525
98	NC_013453	TCA	2	6	6765	6770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	262260525
99	NC_013453	ATC	2	6	6802	6807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	262260525
100	NC_013453	TAT	2	6	6864	6869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	262260525
101	NC_013453	ACCA	2	8	6909	6916	50 %	0 %	0 %	50 %	262260525
102	NC_013453	TTA	2	6	6917	6922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	262260525
103	NC_013453	T	6	6	6947	6952	0 %	100 %	0 %	0 %	262260525
104	NC_013453	ATTG	2	8	6954	6961	25 %	50 %	25 %	0 %	262260525
105	NC_013453	TGTT	2	8	7027	7034	0 %	75 %	25 %	0 %	262260525
106	NC_013453	T	6	6	7040	7045	0 %	100 %	0 %	0 %	262260525
107	NC_013453	CAC	2	6	7092	7097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	262260525
108	NC_013453	TAT	2	6	7128	7133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	262260525
109	NC_013453	GAAA	2	8	7211	7218	75 %	0 %	25 %	0 %	262260525
110	NC_013453	GA	3	6	7281	7286	50 %	0 %	50 %	0 %	262260525
111	NC_013453	AAC	2	6	7291	7296	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	262260525
112	NC_013453	TAC	2	6	7300	7305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	262260525
113	NC_013453	CTT	2	6	7311	7316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	262260525
114	NC_013453	T	7	7	7403	7409	0 %	100 %	0 %	0 %	262260525
115	NC_013453	TGC	2	6	7429	7434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262260525
116	NC_013453	AGCT	2	8	7459	7466	25 %	25 %	25 %	25 %	262260525
117	NC_013453	T	6	6	7489	7494	0 %	100 %	0 %	0 %	262260525
118	NC_013453	T	7	7	7514	7520	0 %	100 %	0 %	0 %	262260525
119	NC_013453	ATT	2	6	7561	7566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	262260525
120	NC_013453	A	6	6	7567	7572	100 %	0 %	0 %	0 %	262260525
121	NC_013453	T	7	7	7641	7647	0 %	100 %	0 %	0 %	262260525
122	NC_013453	ATC	2	6	8168	8173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	262260526
123	NC_013453	GAT	2	6	8233	8238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262260526
124	NC_013453	T	6	6	8242	8247	0 %	100 %	0 %	0 %	262260526
125	NC_013453	TGA	2	6	8257	8262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262260526
126	NC_013453	CT	3	6	8347	8352	0 %	50 %	0 %	50 %	262260526
127	NC_013453	A	6	6	8375	8380	100 %	0 %	0 %	0 %	262260526
128	NC_013453	AT	3	6	8386	8391	50 %	50 %	0 %	0 %	262260526
129	NC_013453	AT	3	6	8458	8463	50 %	50 %	0 %	0 %	262260526
130	NC_013453	TAA	2	6	8846	8851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	262260527
131	NC_013453	TCT	2	6	8935	8940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	262260527
132	NC_013453	CTG	2	6	9009	9014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262260527
133	NC_013453	TGT	2	6	9047	9052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	262260527
134	NC_013453	ATTCT	2	10	9111	9120	20 %	60 %	0 %	20 %	262260528
135	NC_013453	TCAA	2	8	9122	9129	50 %	25 %	0 %	25 %	262260528
136	NC_013453	TA	3	6	9135	9140	50 %	50 %	0 %	0 %	262260528
137	NC_013453	TTCT	2	8	9216	9223	0 %	75 %	0 %	25 %	262260528
138	NC_013453	AT	4	8	9282	9289	50 %	50 %	0 %	0 %	262260528
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271	NC_013453	GAT	2	6	16060	16065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262260537
272	NC_013453	GGTT	2	8	16067	16074	0 %	50 %	50 %	0 %	262260537
273	NC_013453	TCT	2	6	16111	16116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	262260537
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275	NC_013453	ATG	2	6	16139	16144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262260537
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278	NC_013453	A	6	6	16173	16178	100 %	0 %	0 %	0 %	262260537
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289	NC_013453	TAT	2	6	16581	16586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	262260538
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305	NC_013453	TAT	2	6	16908	16913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	262260538
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309	NC_013453	TA	3	6	17033	17038	50 %	50 %	0 %	0 %	262260538
310	NC_013453	ATA	2	6	17061	17066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	262260538

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.