MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Slackia heliotrinireducens DSM 20476 chromosome

Total Repeats: 60079

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
60001	NC_013165	GCA	2	6	3158649	3158654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257065512
60002	NC_013165	TCT	2	6	3158677	3158682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257065512
60003	NC_013165	CTT	3	9	3158683	3158691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257065512
60004	NC_013165	TTG	2	6	3158720	3158725	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257065512
60005	NC_013165	CG	3	6	3158732	3158737	0 %	0 %	50 %	50 %	257065512
60006	NC_013165	TCG	2	6	3159341	3159346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257065513
60007	NC_013165	CTT	2	6	3159371	3159376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257065513
60008	NC_013165	CGA	2	6	3159394	3159399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257065513
60009	NC_013165	TCT	2	6	3159429	3159434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257065513
60010	NC_013165	TAC	2	6	3159536	3159541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257065513
60011	NC_013165	TCC	2	6	3159573	3159578	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257065513
60012	NC_013165	CTTT	2	8	3159649	3159656	0 %	75 %	0 %	25 %	257065513
60013	NC_013165	TACC	2	8	3159744	3159751	25 %	25 %	0 %	50 %	257065513
60014	NC_013165	TCT	2	6	3159792	3159797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257065513
60015	NC_013165	GGA	2	6	3159802	3159807	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257065513
60016	NC_013165	GTAT	2	8	3159821	3159828	25 %	50 %	25 %	0 %	257065513
60017	NC_013165	CAA	2	6	3159884	3159889	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257065513
60018	NC_013165	CTTC	2	8	3161388	3161395	0 %	50 %	0 %	50 %	257065514
60019	NC_013165	GCG	2	6	3161450	3161455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257065514
60020	NC_013165	CCTTG	2	10	3161488	3161497	0 %	40 %	20 %	40 %	257065514
60021	NC_013165	CTGACG	2	12	3161543	3161554	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	257065514
60022	NC_013165	ACC	2	6	3161577	3161582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257065514
60023	NC_013165	ATG	2	6	3161625	3161630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257065514
60024	NC_013165	GGC	2	6	3161659	3161664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257065514
60025	NC_013165	TCG	2	6	3161715	3161720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257065514
60026	NC_013165	TCG	2	6	3161730	3161735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257065514
60027	NC_013165	TTC	2	6	3161813	3161818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257065514
60028	NC_013165	CGA	2	6	3161863	3161868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257065514
60029	NC_013165	GTC	2	6	3161876	3161881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257065514
60030	NC_013165	GAT	2	6	3161903	3161908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257065514
60031	NC_013165	TCT	2	6	3161910	3161915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257065514
60032	NC_013165	CTT	2	6	3161968	3161973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257065515
60033	NC_013165	CTT	3	9	3161983	3161991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257065515
60034	NC_013165	GCT	2	6	3162050	3162055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257065515
60035	NC_013165	CTG	3	9	3162088	3162096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257065515
60036	NC_013165	GAT	2	6	3162106	3162111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257065515
60037	NC_013165	AGA	2	6	3162126	3162131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257065515
60038	NC_013165	GGA	2	6	3162148	3162153	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257065515
60039	NC_013165	CAT	2	6	3162169	3162174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257065515
60040	NC_013165	TCA	2	6	3162180	3162185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257065515
60041	NC_013165	ATG	2	6	3162194	3162199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257065515
60042	NC_013165	GCA	2	6	3162240	3162245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257065515
60043	NC_013165	TGCGAA	2	12	3162262	3162273	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	257065515
60044	NC_013165	CGA	2	6	3162354	3162359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257065515
60045	NC_013165	AGC	2	6	3162459	3162464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257065515
60046	NC_013165	TCC	2	6	3162509	3162514	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257065515
60047	NC_013165	GC	3	6	3162520	3162525	0 %	0 %	50 %	50 %	257065515
60048	NC_013165	ATG	2	6	3162611	3162616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257065515
60049	NC_013165	TGA	2	6	3162645	3162650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257065515
60050	NC_013165	AACCG	2	10	3162842	3162851	40 %	0 %	20 %	40 %	257065516
60051	NC_013165	GCA	2	6	3162897	3162902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257065516
60052	NC_013165	GCA	2	6	3162925	3162930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257065516
60053	NC_013165	TCT	2	6	3162971	3162976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257065516
60054	NC_013165	ACG	2	6	3163427	3163432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257065517
60055	NC_013165	GCG	2	6	3163434	3163439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257065517
60056	NC_013165	ACGGC	2	10	3163443	3163452	20 %	0 %	40 %	40 %	257065517
60057	NC_013165	TACG	2	8	3163518	3163525	25 %	25 %	25 %	25 %	257065517
60058	NC_013165	CGG	2	6	3163793	3163798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257065518
60059	NC_013165	TCT	2	6	3163814	3163819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257065518
60060	NC_013165	TATTT	2	10	3163820	3163829	20 %	80 %	0 %	0 %	257065518
60061	NC_013165	CTG	2	6	3163938	3163943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257065518
60062	NC_013165	GAA	2	6	3164242	3164247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257065519
60063	NC_013165	GAC	2	6	3164278	3164283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257065519
60064	NC_013165	CG	3	6	3164290	3164295	0 %	0 %	50 %	50 %	257065519
60065	NC_013165	ACG	2	6	3164321	3164326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257065519
60066	NC_013165	C	6	6	3164339	3164344	0 %	0 %	0 %	100 %	257065519
60067	NC_013165	CAC	2	6	3164364	3164369	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257065519
60068	NC_013165	CGG	2	6	3164372	3164377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257065519
60069	NC_013165	CCA	2	6	3164399	3164404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257065519
60070	NC_013165	TCA	2	6	3164450	3164455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257065519
60071	NC_013165	ATC	2	6	3164497	3164502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257065519
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60073	NC_013165	TCA	2	6	3164720	3164725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257065519
60074	NC_013165	GAG	2	6	3164740	3164745	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257065519
60075	NC_013165	GCA	2	6	3164761	3164766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257065519
60076	NC_013165	GAA	2	6	3164772	3164777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257065519
60077	NC_013165	CTG	2	6	3164827	3164832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257065519
60078	NC_013165	ACG	2	6	3164837	3164842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257065519
60079	NC_013165	TCGC	2	8	3164901	3164908	0 %	25 %	25 %	50 %	257065519

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.