MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus suis BM407 chromosome

Total Repeats: 35943

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19002	NC_012926	T	6	6	1127580	1127585	0 %	100 %	0 %	0 %	253755648
19003	NC_012926	T	6	6	1127589	1127594	0 %	100 %	0 %	0 %	253755648
19004	NC_012926	TGCTT	2	10	1127597	1127606	0 %	60 %	20 %	20 %	253755648
19005	NC_012926	CAG	2	6	1127622	1127627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253755648
19006	NC_012926	CTG	2	6	1127649	1127654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253755648
19007	NC_012926	GTT	2	6	1127661	1127666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253755648
19008	NC_012926	GTTTT	2	10	1127679	1127688	0 %	80 %	20 %	0 %	253755648
19009	NC_012926	TAG	2	6	1127763	1127768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253755648
19010	NC_012926	GATTG	2	10	1127778	1127787	20 %	40 %	40 %	0 %	253755648
19011	NC_012926	T	6	6	1127827	1127832	0 %	100 %	0 %	0 %	253755648
19012	NC_012926	CTT	2	6	1127844	1127849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253755648
19013	NC_012926	CTA	2	6	1127850	1127855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253755648
19014	NC_012926	AGTT	2	8	1127866	1127873	25 %	50 %	25 %	0 %	253755648
19015	NC_012926	T	6	6	1127959	1127964	0 %	100 %	0 %	0 %	253755648
19016	NC_012926	T	6	6	1127996	1128001	0 %	100 %	0 %	0 %	253755648
19017	NC_012926	TCCT	2	8	1128010	1128017	0 %	50 %	0 %	50 %	253755648
19018	NC_012926	TCT	2	6	1128023	1128028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253755648
19019	NC_012926	T	6	6	1128110	1128115	0 %	100 %	0 %	0 %	253755648
19020	NC_012926	TGT	2	6	1128155	1128160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253755648
19021	NC_012926	T	7	7	1128175	1128181	0 %	100 %	0 %	0 %	253755648
19022	NC_012926	CAG	2	6	1128189	1128194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253755648
19023	NC_012926	TGT	2	6	1128217	1128222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253755648
19024	NC_012926	CCA	2	6	1128233	1128238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253755648
19025	NC_012926	CTG	2	6	1128246	1128251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253755648
19026	NC_012926	T	6	6	1128277	1128282	0 %	100 %	0 %	0 %	253755648
19027	NC_012926	T	6	6	1128313	1128318	0 %	100 %	0 %	0 %	253755648
19028	NC_012926	AT	3	6	1128458	1128463	50 %	50 %	0 %	0 %	253755649
19029	NC_012926	TTTG	2	8	1128482	1128489	0 %	75 %	25 %	0 %	253755649
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19032	NC_012926	GGT	2	6	1128539	1128544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253755649
19033	NC_012926	AAG	2	6	1128568	1128573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253755649
19034	NC_012926	TCA	2	6	1128586	1128591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253755649
19035	NC_012926	CTA	2	6	1128611	1128616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253755649
19036	NC_012926	TGAAA	2	10	1128626	1128635	60 %	20 %	20 %	0 %	253755649
19037	NC_012926	CTT	2	6	1128738	1128743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253755650
19038	NC_012926	T	6	6	1128778	1128783	0 %	100 %	0 %	0 %	253755650
19039	NC_012926	CAC	2	6	1128828	1128833	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253755650
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19043	NC_012926	GAG	2	6	1129036	1129041	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	253755650
19044	NC_012926	GAC	2	6	1129115	1129120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253755650
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19049	NC_012926	CCGT	2	8	1129364	1129371	0 %	25 %	25 %	50 %	253755650
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19052	NC_012926	TTG	2	6	1129583	1129588	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253755650
19053	NC_012926	GATA	2	8	1129599	1129606	50 %	25 %	25 %	0 %	253755650
19054	NC_012926	AAT	2	6	1129752	1129757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253755650
19055	NC_012926	TCA	2	6	1129821	1129826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253755650
19056	NC_012926	GGA	2	6	1129875	1129880	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	253755650
19057	NC_012926	CTG	3	9	1130085	1130093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253755650
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19059	NC_012926	CCA	2	6	1130193	1130198	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253755650
19060	NC_012926	AACG	2	8	1130225	1130232	50 %	0 %	25 %	25 %	253755650
19061	NC_012926	GT	3	6	1130265	1130270	0 %	50 %	50 %	0 %	253755650
19062	NC_012926	ATGT	2	8	1130285	1130292	25 %	50 %	25 %	0 %	253755650
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19075	NC_012926	TAAT	2	8	1131221	1131228	50 %	50 %	0 %	0 %	253755651
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19089	NC_012926	AT	3	6	1131803	1131808	50 %	50 %	0 %	0 %	253755652
19090	NC_012926	GAA	2	6	1131823	1131828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253755652
19091	NC_012926	TGA	3	9	1131972	1131980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253755652
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19101	NC_012926	GTC	2	6	1132296	1132301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253755653
19102	NC_012926	GC	3	6	1132332	1132337	0 %	0 %	50 %	50 %	253755653
19103	NC_012926	ATC	2	6	1132394	1132399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253755653
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19107	NC_012926	T	6	6	1132458	1132463	0 %	100 %	0 %	0 %	253755653
19108	NC_012926	AGA	2	6	1132470	1132475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253755653
19109	NC_012926	TG	3	6	1132590	1132595	0 %	50 %	50 %	0 %	253755653
19110	NC_012926	T	7	7	1132657	1132663	0 %	100 %	0 %	0 %	253755654
19111	NC_012926	CTG	2	6	1132700	1132705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253755654
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19115	NC_012926	TTC	2	6	1132915	1132920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253755654
19116	NC_012926	TGT	2	6	1132950	1132955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253755654
19117	NC_012926	TCA	2	6	1133062	1133067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253755654
19118	NC_012926	ATT	2	6	1133076	1133081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253755654
19119	NC_012926	GAT	2	6	1133094	1133099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253755654
19120	NC_012926	T	6	6	1133099	1133104	0 %	100 %	0 %	0 %	253755654
19121	NC_012926	TTC	2	6	1133127	1133132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253755654
19122	NC_012926	TGG	2	6	1133223	1133228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253755654
19123	NC_012926	T	6	6	1133319	1133324	0 %	100 %	0 %	0 %	253755654
19124	NC_012926	GAG	2	6	1133406	1133411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	253755654
19125	NC_012926	TCA	2	6	1133581	1133586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253755654
19126	NC_012926	GTT	2	6	1133673	1133678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253755654
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19128	NC_012926	T	7	7	1133816	1133822	0 %	100 %	0 %	0 %	253755654
19129	NC_012926	CTT	3	9	1133825	1133833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253755654
19130	NC_012926	T	6	6	1133836	1133841	0 %	100 %	0 %	0 %	253755654
19131	NC_012926	TAAA	2	8	1133915	1133922	75 %	25 %	0 %	0 %	253755655
19132	NC_012926	AAAAT	2	10	1133975	1133984	80 %	20 %	0 %	0 %	253755655
19133	NC_012926	TTC	2	6	1134001	1134006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253755655
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19135	NC_012926	TC	3	6	1134075	1134080	0 %	50 %	0 %	50 %	253755655
19136	NC_012926	TCT	2	6	1134095	1134100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253755656
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19141	NC_012926	T	7	7	1134490	1134496	0 %	100 %	0 %	0 %	253755656
19142	NC_012926	CAAT	2	8	1134547	1134554	50 %	25 %	0 %	25 %	253755656
19143	NC_012926	CAA	2	6	1134580	1134585	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253755656
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19146	NC_012926	TTC	2	6	1135034	1135039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253755657
19147	NC_012926	TTG	2	6	1135074	1135079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253755657
19148	NC_012926	ATC	3	9	1135125	1135133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253755657
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19151	NC_012926	ATG	2	6	1135368	1135373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253755657
19152	NC_012926	AGAC	2	8	1135471	1135478	50 %	0 %	25 %	25 %	253755657
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19165	NC_012926	A	6	6	1136292	1136297	100 %	0 %	0 %	0 %	253755659
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19217	NC_012926	GTC	2	6	1139623	1139628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253755662
19218	NC_012926	AAT	2	6	1139649	1139654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253755662
19219	NC_012926	GATG	2	8	1139672	1139679	25 %	25 %	50 %	0 %	253755662
19220	NC_012926	AGAT	2	8	1139685	1139692	50 %	25 %	25 %	0 %	253755662
19221	NC_012926	AGT	2	6	1139840	1139845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253755663
19222	NC_012926	TCA	2	6	1139883	1139888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253755663
19223	NC_012926	TCC	2	6	1139893	1139898	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	253755663
19224	NC_012926	ACA	2	6	1139903	1139908	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253755663
19225	NC_012926	TGC	2	6	1139956	1139961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253755663
19226	NC_012926	TGA	2	6	1139987	1139992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253755663
19227	NC_012926	T	6	6	1140127	1140132	0 %	100 %	0 %	0 %	253755663
19228	NC_012926	AGGA	2	8	1140134	1140141	50 %	0 %	50 %	0 %	253755663
19229	NC_012926	TCA	2	6	1140245	1140250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253755663
19230	NC_012926	AATC	2	8	1140291	1140298	50 %	25 %	0 %	25 %	253755663
19231	NC_012926	GC	3	6	1140302	1140307	0 %	0 %	50 %	50 %	253755663
19232	NC_012926	T	6	6	1140375	1140380	0 %	100 %	0 %	0 %	253755663
19233	NC_012926	GCGGT	2	10	1140387	1140396	0 %	20 %	60 %	20 %	253755663
19234	NC_012926	GTC	2	6	1140416	1140421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253755663
19235	NC_012926	AGTC	2	8	1140537	1140544	25 %	25 %	25 %	25 %	253755663
19236	NC_012926	CTC	3	9	1140679	1140687	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	253755663
19237	NC_012926	ACCGT	2	10	1140737	1140746	20 %	20 %	20 %	40 %	253755663
19238	NC_012926	GTTTC	2	10	1140783	1140792	0 %	60 %	20 %	20 %	253755663
19239	NC_012926	CCA	2	6	1140863	1140868	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253755663
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19241	NC_012926	CCT	2	6	1140921	1140926	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	253755663
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19254	NC_012926	TGC	2	6	1141641	1141646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253755664
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19265	NC_012926	TCA	2	6	1142265	1142270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253755665
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19334	NC_012926	CAAT	2	8	1145700	1145707	50 %	25 %	0 %	25 %	253755668
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19337	NC_012926	TCG	2	6	1145822	1145827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253755668
19338	NC_012926	TCT	2	6	1145861	1145866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253755668
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19341	NC_012926	CAA	2	6	1145952	1145957	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253755669
19342	NC_012926	CTTT	2	8	1146058	1146065	0 %	75 %	0 %	25 %	253755669
19343	NC_012926	CTT	2	6	1146098	1146103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253755669
19344	NC_012926	ACC	2	6	1146234	1146239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253755669
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19346	NC_012926	CTG	2	6	1146318	1146323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253755669
19347	NC_012926	AATC	2	8	1146329	1146336	50 %	25 %	0 %	25 %	253755669
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19349	NC_012926	A	7	7	1146364	1146370	100 %	0 %	0 %	0 %	253755669
19350	NC_012926	AGC	2	6	1146396	1146401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253755669
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19466	NC_012926	TAA	2	6	1159907	1159912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253755676
19467	NC_012926	GTA	2	6	1159932	1159937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253755676
19468	NC_012926	GAG	2	6	1159965	1159970	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	253755676
19469	NC_012926	TGA	2	6	1160191	1160196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253755676
19470	NC_012926	TCC	2	6	1160203	1160208	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	253755676
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19488	NC_012926	TGC	2	6	1161245	1161250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253755677
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19497	NC_012926	A	6	6	1161911	1161916	100 %	0 %	0 %	0 %	253755677
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19499	NC_012926	ATA	2	6	1161964	1161969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253755678
19500	NC_012926	ATG	2	6	1162154	1162159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253755678

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