MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus suis P1/7

Total Repeats: 34104

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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21002	NC_012925	CTA	2	6	1229231	1229236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253753919
21003	NC_012925	TGT	2	6	1229241	1229246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253753919
21004	NC_012925	ATC	2	6	1229276	1229281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253753919
21005	NC_012925	CAT	2	6	1229301	1229306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253753919
21006	NC_012925	ACT	2	6	1229398	1229403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253753919
21007	NC_012925	GAT	2	6	1229443	1229448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253753919
21008	NC_012925	AT	3	6	1229605	1229610	50 %	50 %	0 %	0 %	253753919
21009	NC_012925	GAA	2	6	1229633	1229638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253753919
21010	NC_012925	TGA	2	6	1229679	1229684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253753919
21011	NC_012925	CTT	2	6	1229738	1229743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253753919
21012	NC_012925	ATT	2	6	1229747	1229752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253753919
21013	NC_012925	CTGG	2	8	1229762	1229769	0 %	25 %	50 %	25 %	253753919
21014	NC_012925	TATG	2	8	1229774	1229781	25 %	50 %	25 %	0 %	253753919
21015	NC_012925	TGC	2	6	1229794	1229799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253753919
21016	NC_012925	GAA	2	6	1229816	1229821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253753919
21017	NC_012925	GAT	2	6	1229828	1229833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253753919
21018	NC_012925	TTA	2	6	1230153	1230158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253753920
21019	NC_012925	TTTCA	2	10	1230168	1230177	20 %	60 %	0 %	20 %	253753920
21020	NC_012925	CCTG	2	8	1230223	1230230	0 %	25 %	25 %	50 %	253753920
21021	NC_012925	CTT	2	6	1230248	1230253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253753920
21022	NC_012925	ACT	2	6	1230384	1230389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253753920
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21025	NC_012925	TCT	2	6	1230496	1230501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253753920
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21027	NC_012925	ATT	2	6	1230712	1230717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253753921
21028	NC_012925	T	6	6	1230716	1230721	0 %	100 %	0 %	0 %	253753921
21029	NC_012925	ACA	2	6	1230735	1230740	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253753921
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21032	NC_012925	TCA	2	6	1230834	1230839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253753921
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21038	NC_012925	CAT	2	6	1231156	1231161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253753921
21039	NC_012925	ATT	2	6	1231214	1231219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253753921
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21043	NC_012925	GTA	2	6	1231320	1231325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253753921
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21052	NC_012925	GTTC	2	8	1231744	1231751	0 %	50 %	25 %	25 %	253753922
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21108	NC_012925	CCAA	2	8	1235873	1235880	50 %	0 %	0 %	50 %	253753924
21109	NC_012925	CT	3	6	1235932	1235937	0 %	50 %	0 %	50 %	253753924
21110	NC_012925	TGG	2	6	1235961	1235966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253753924
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21112	NC_012925	CTG	2	6	1236132	1236137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253753924
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21114	NC_012925	TCT	2	6	1236219	1236224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253753924
21115	NC_012925	GTA	2	6	1236244	1236249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253753924
21116	NC_012925	CTGA	2	8	1236305	1236312	25 %	25 %	25 %	25 %	253753924
21117	NC_012925	GACT	2	8	1236441	1236448	25 %	25 %	25 %	25 %	253753924
21118	NC_012925	TTCT	2	8	1236497	1236504	0 %	75 %	0 %	25 %	253753924
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21121	NC_012925	CTGA	2	8	1236573	1236580	25 %	25 %	25 %	25 %	253753924
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21233	NC_012925	TTC	2	6	1242818	1242823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253753928
21234	NC_012925	CCTG	2	8	1242882	1242889	0 %	25 %	25 %	50 %	253753928
21235	NC_012925	CTT	2	6	1242976	1242981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253753928
21236	NC_012925	TCA	2	6	1243140	1243145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253753928
21237	NC_012925	CTT	2	6	1243186	1243191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253753928
21238	NC_012925	GCTT	2	8	1243268	1243275	0 %	50 %	25 %	25 %	253753928
21239	NC_012925	TATT	2	8	1243610	1243617	25 %	75 %	0 %	0 %	253753929
21240	NC_012925	T	7	7	1243628	1243634	0 %	100 %	0 %	0 %	253753929
21241	NC_012925	GAA	2	6	1243639	1243644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253753929
21242	NC_012925	CCA	2	6	1243678	1243683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253753929
21243	NC_012925	T	6	6	1243730	1243735	0 %	100 %	0 %	0 %	253753929
21244	NC_012925	ACT	2	6	1243767	1243772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253753929
21245	NC_012925	TGA	2	6	1243781	1243786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253753929
21246	NC_012925	CTC	2	6	1243801	1243806	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	253753929
21247	NC_012925	GACT	2	8	1243827	1243834	25 %	25 %	25 %	25 %	253753929
21248	NC_012925	TGA	2	6	1243862	1243867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253753929
21249	NC_012925	TAC	2	6	1243894	1243899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253753929
21250	NC_012925	TGA	2	6	1243901	1243906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253753929
21251	NC_012925	GTT	2	6	1243911	1243916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253753929
21252	NC_012925	GCT	2	6	1243917	1243922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253753929
21253	NC_012925	CAT	2	6	1243934	1243939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253753929
21254	NC_012925	CTG	2	6	1243975	1243980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253753929
21255	NC_012925	TCT	2	6	1244031	1244036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253753929
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21258	NC_012925	TACCT	2	10	1244429	1244438	20 %	40 %	0 %	40 %	253753929
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21260	NC_012925	CAT	2	6	1244684	1244689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253753929
21261	NC_012925	CTT	2	6	1244713	1244718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253753929
21262	NC_012925	AGTA	2	8	1244776	1244783	50 %	25 %	25 %	0 %	253753929
21263	NC_012925	TCT	2	6	1244805	1244810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253753929
21264	NC_012925	TCA	2	6	1244913	1244918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253753929
21265	NC_012925	AATT	2	8	1244930	1244937	50 %	50 %	0 %	0 %	253753929
21266	NC_012925	GAA	2	6	1244968	1244973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253753929
21267	NC_012925	TCAA	2	8	1244979	1244986	50 %	25 %	0 %	25 %	253753929
21268	NC_012925	C	6	6	1245003	1245008	0 %	0 %	0 %	100 %	253753929
21269	NC_012925	T	6	6	1245038	1245043	0 %	100 %	0 %	0 %	253753929
21270	NC_012925	AC	3	6	1245076	1245081	50 %	0 %	0 %	50 %	253753929
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21314	NC_012925	CAG	2	6	1248381	1248386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253753933
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21331	NC_012925	GGT	2	6	1249519	1249524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253753933
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21334	NC_012925	GCA	2	6	1249653	1249658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253753933
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21336	NC_012925	CGGT	2	8	1249670	1249677	0 %	25 %	50 %	25 %	253753933
21337	NC_012925	TAG	2	6	1249739	1249744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253753933
21338	NC_012925	GCT	2	6	1249791	1249796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253753933
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21341	NC_012925	CAT	2	6	1249995	1250000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253753933
21342	NC_012925	CAC	2	6	1250011	1250016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253753933
21343	NC_012925	CAA	2	6	1250031	1250036	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253753933
21344	NC_012925	TTCCG	2	10	1250086	1250095	0 %	40 %	20 %	40 %	253753933
21345	NC_012925	CTT	2	6	1250113	1250118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253753933
21346	NC_012925	TCT	2	6	1250127	1250132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253753933
21347	NC_012925	CTTCCG	2	12	1250244	1250255	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	253753933
21348	NC_012925	ATC	2	6	1250353	1250358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253753933
21349	NC_012925	TCA	2	6	1250366	1250371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253753933
21350	NC_012925	GAC	2	6	1250490	1250495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253753933
21351	NC_012925	CTT	2	6	1250595	1250600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253753933
21352	NC_012925	TACT	2	8	1251061	1251068	25 %	50 %	0 %	25 %	253753934
21353	NC_012925	AGA	2	6	1251186	1251191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253753934
21354	NC_012925	T	6	6	1251214	1251219	0 %	100 %	0 %	0 %	253753934
21355	NC_012925	GCTG	2	8	1251220	1251227	0 %	25 %	50 %	25 %	253753934
21356	NC_012925	TAA	2	6	1251276	1251281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253753934
21357	NC_012925	TC	3	6	1251370	1251375	0 %	50 %	0 %	50 %	253753935
21358	NC_012925	AGT	2	6	1251438	1251443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253753935
21359	NC_012925	TAC	2	6	1251447	1251452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253753935
21360	NC_012925	AGC	2	6	1251597	1251602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253753936
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21364	NC_012925	GTTG	2	8	1251653	1251660	0 %	50 %	50 %	0 %	253753936
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21368	NC_012925	TCTG	2	8	1251952	1251959	0 %	50 %	25 %	25 %	253753936
21369	NC_012925	AAC	2	6	1251993	1251998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253753936
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21373	NC_012925	AAG	2	6	1252167	1252172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253753936
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21377	NC_012925	A	6	6	1252385	1252390	100 %	0 %	0 %	0 %	253753936
21378	NC_012925	ACC	2	6	1252410	1252415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253753936
21379	NC_012925	CAT	2	6	1252449	1252454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253753936
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21382	NC_012925	ACT	2	6	1252677	1252682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253753936
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21384	NC_012925	TCC	2	6	1252703	1252708	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	253753937
21385	NC_012925	CCGCT	2	10	1252743	1252752	0 %	20 %	20 %	60 %	253753937
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21387	NC_012925	AAAG	2	8	1252793	1252800	75 %	0 %	25 %	0 %	253753937
21388	NC_012925	AGC	2	6	1252804	1252809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253753937
21389	NC_012925	CTG	2	6	1252867	1252872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253753937
21390	NC_012925	CCTG	2	8	1253001	1253008	0 %	25 %	25 %	50 %	253753937
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21394	NC_012925	TCTG	2	8	1253346	1253353	0 %	50 %	25 %	25 %	253753938
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21410	NC_012925	ACG	2	6	1254836	1254841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253753939
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21448	NC_012925	A	7	7	1256892	1256898	100 %	0 %	0 %	0 %	253753942
21449	NC_012925	AGA	2	6	1256961	1256966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253753942
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21451	NC_012925	AAATC	2	10	1257041	1257050	60 %	20 %	0 %	20 %	253753942
21452	NC_012925	TGA	2	6	1257090	1257095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253753942
21453	NC_012925	GAT	2	6	1257127	1257132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253753942
21454	NC_012925	TCTG	2	8	1257156	1257163	0 %	50 %	25 %	25 %	253753942
21455	NC_012925	CAGA	2	8	1257166	1257173	50 %	0 %	25 %	25 %	253753942
21456	NC_012925	GCTG	2	8	1257195	1257202	0 %	25 %	50 %	25 %	253753942
21457	NC_012925	AAC	2	6	1257231	1257236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253753942
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21459	NC_012925	T	6	6	1257363	1257368	0 %	100 %	0 %	0 %	253753942
21460	NC_012925	A	6	6	1257385	1257390	100 %	0 %	0 %	0 %	253753942
21461	NC_012925	AAT	2	6	1257419	1257424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253753942
21462	NC_012925	TTC	2	6	1257530	1257535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253753943
21463	NC_012925	TGAT	2	8	1257549	1257556	25 %	50 %	25 %	0 %	253753943
21464	NC_012925	TCC	2	6	1257602	1257607	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	253753943
21465	NC_012925	CCA	2	6	1257732	1257737	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253753943
21466	NC_012925	GAT	2	6	1257746	1257751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253753943
21467	NC_012925	ATA	2	6	1257878	1257883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253753943
21468	NC_012925	CTG	2	6	1257886	1257891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253753943
21469	NC_012925	AAGC	2	8	1257896	1257903	50 %	0 %	25 %	25 %	253753943
21470	NC_012925	CCA	2	6	1257978	1257983	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253753943
21471	NC_012925	AAC	2	6	1258055	1258060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253753943
21472	NC_012925	CAA	2	6	1258075	1258080	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253753943
21473	NC_012925	AAGA	2	8	1258083	1258090	75 %	0 %	25 %	0 %	253753943
21474	NC_012925	ACT	2	6	1258136	1258141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253753943
21475	NC_012925	CTT	2	6	1258160	1258165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253753943
21476	NC_012925	ATC	2	6	1258224	1258229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253753943
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21480	NC_012925	ATGGT	2	10	1258389	1258398	20 %	40 %	40 %	0 %	253753943
21481	NC_012925	AAG	2	6	1258440	1258445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253753943
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21483	NC_012925	TA	3	6	1258517	1258522	50 %	50 %	0 %	0 %	253753943
21484	NC_012925	A	6	6	1258522	1258527	100 %	0 %	0 %	0 %	253753943
21485	NC_012925	TGC	2	6	1258544	1258549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253753943
21486	NC_012925	ATG	2	6	1258552	1258557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253753943
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21488	NC_012925	GAA	2	6	1258586	1258591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253753943
21489	NC_012925	TGCT	2	8	1258687	1258694	0 %	50 %	25 %	25 %	253753943
21490	NC_012925	TAG	2	6	1258729	1258734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253753943
21491	NC_012925	CAG	2	6	1258759	1258764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253753943
21492	NC_012925	CAG	2	6	1258771	1258776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253753943
21493	NC_012925	GCA	2	6	1258990	1258995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253753943
21494	NC_012925	CTT	2	6	1259021	1259026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253753943
21495	NC_012925	TATT	2	8	1259057	1259064	25 %	75 %	0 %	0 %	253753944
21496	NC_012925	TAA	2	6	1259080	1259085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253753944
21497	NC_012925	ACA	2	6	1259127	1259132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253753944
21498	NC_012925	AAT	2	6	1259156	1259161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253753944
21499	NC_012925	TTCC	2	8	1259188	1259195	0 %	50 %	0 %	50 %	253753944
21500	NC_012925	CTC	2	6	1259252	1259257	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	253753944

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