MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sulfolobus islandicus M.16.4 chromosome

Total Repeats: 49114

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012726	TATT	2	8	528	535	25 %	75 %	0 %	0 %	238618480
2	NC_012726	TAT	2	6	539	544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238618480
3	NC_012726	TAT	2	6	581	586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238618480
4	NC_012726	ATT	2	6	622	627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238618480
5	NC_012726	GTT	2	6	642	647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	238618480
6	NC_012726	GTT	2	6	650	655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	238618480
7	NC_012726	CTT	2	6	675	680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238618480
8	NC_012726	TTAC	2	8	703	710	25 %	50 %	0 %	25 %	238618480
9	NC_012726	GGT	2	6	869	874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	238618481
10	NC_012726	A	6	6	889	894	100 %	0 %	0 %	0 %	238618481
11	NC_012726	AG	3	6	944	949	50 %	0 %	50 %	0 %	238618481
12	NC_012726	TGC	2	6	964	969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238618481
13	NC_012726	GTAA	2	8	1052	1059	50 %	25 %	25 %	0 %	238618481
14	NC_012726	GAG	2	6	1079	1084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	238618481
15	NC_012726	ATGAGG	2	12	1092	1103	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	238618481
16	NC_012726	TGG	2	6	1147	1152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	238618481
17	NC_012726	TAT	2	6	1167	1172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238618481
18	NC_012726	GATAA	2	10	1241	1250	60 %	20 %	20 %	0 %	238618481
19	NC_012726	ATA	2	6	1277	1282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238618481
20	NC_012726	AGAGG	2	10	1311	1320	40 %	0 %	60 %	0 %	238618481
21	NC_012726	AT	3	6	1362	1367	50 %	50 %	0 %	0 %	238618481
22	NC_012726	TTA	2	6	1371	1376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238618481
23	NC_012726	ATC	2	6	1426	1431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238618481
24	NC_012726	ACG	2	6	1461	1466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238618481
25	NC_012726	AAC	2	6	1470	1475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	238618481
26	NC_012726	TAA	2	6	1512	1517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238618481
27	NC_012726	ATG	2	6	1527	1532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238618481
28	NC_012726	AGC	2	6	1612	1617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238618481
29	NC_012726	AGCT	2	8	1620	1627	25 %	25 %	25 %	25 %	238618481
30	NC_012726	TGG	2	6	1630	1635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	238618481
31	NC_012726	G	6	6	1634	1639	0 %	0 %	100 %	0 %	238618481
32	NC_012726	AG	3	6	1687	1692	50 %	0 %	50 %	0 %	238618481
33	NC_012726	CCTT	2	8	1714	1721	0 %	50 %	0 %	50 %	238618481
34	NC_012726	AAG	2	6	1741	1746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238618481
35	NC_012726	AGA	2	6	1759	1764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238618481
36	NC_012726	TAA	2	6	1801	1806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238618481
37	NC_012726	CAAA	2	8	1810	1817	75 %	0 %	0 %	25 %	238618481
38	NC_012726	AGA	2	6	1832	1837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238618481
39	NC_012726	ATA	2	6	1847	1852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238618481
40	NC_012726	TGG	2	6	1909	1914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	238618481
41	NC_012726	AAG	2	6	1919	1924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238618481
42	NC_012726	GTATTG	2	12	1986	1997	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	238618481
43	NC_012726	TGA	2	6	2008	2013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238618481
44	NC_012726	AGA	2	6	2036	2041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238618482
45	NC_012726	AGA	2	6	2090	2095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238618482
46	NC_012726	CTA	2	6	2141	2146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238618482
47	NC_012726	GGA	2	6	2162	2167	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	238618482
48	NC_012726	AAG	2	6	2177	2182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238618482
49	NC_012726	AT	3	6	2186	2191	50 %	50 %	0 %	0 %	238618482
50	NC_012726	AAG	3	9	2243	2251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238618482
51	NC_012726	GAA	2	6	2271	2276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238618482
52	NC_012726	AAG	2	6	2277	2282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238618482
53	NC_012726	ATT	2	6	2292	2297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238618482
54	NC_012726	ATT	2	6	2313	2318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238618482
55	NC_012726	ATT	2	6	2323	2328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238618482
56	NC_012726	ATA	2	6	2412	2417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238618483
57	NC_012726	TAT	2	6	2468	2473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238618483
58	NC_012726	TAA	2	6	2503	2508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238618483
59	NC_012726	TAA	2	6	2512	2517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238618483
60	NC_012726	TA	3	6	2523	2528	50 %	50 %	0 %	0 %	238618483
61	NC_012726	TAGG	2	8	2566	2573	25 %	25 %	50 %	0 %	238618483
62	NC_012726	AGA	2	6	2582	2587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238618483
63	NC_012726	CTTT	2	8	2664	2671	0 %	75 %	0 %	25 %	238618483
64	NC_012726	AGC	2	6	2684	2689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238618483
65	NC_012726	ATT	2	6	2716	2721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238618483
66	NC_012726	GAT	2	6	2823	2828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238618483
67	NC_012726	TAA	2	6	2830	2835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238618483
68	NC_012726	TGC	2	6	2870	2875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238618483
69	NC_012726	AAT	2	6	2876	2881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238618483
70	NC_012726	TGC	2	6	2888	2893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238618483
71	NC_012726	GCA	2	6	2976	2981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238618483
72	NC_012726	TGAT	2	8	2989	2996	25 %	50 %	25 %	0 %	238618483
73	NC_012726	TA	3	6	3069	3074	50 %	50 %	0 %	0 %	238618483
74	NC_012726	TAC	2	6	3079	3084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238618483
75	NC_012726	AATTGC	2	12	3086	3097	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	238618483
76	NC_012726	AAT	2	6	3131	3136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238618483
77	NC_012726	GGTT	2	8	3326	3333	0 %	50 %	50 %	0 %	238618484
78	NC_012726	GAA	2	6	3349	3354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238618484
79	NC_012726	AAG	2	6	3359	3364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238618484
80	NC_012726	TTTAAG	2	12	3368	3379	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	238618484
81	NC_012726	CAAT	2	8	3389	3396	50 %	25 %	0 %	25 %	238618484
82	NC_012726	ATC	3	9	3438	3446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238618484
83	NC_012726	TAT	2	6	3461	3466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238618484
84	NC_012726	AAC	2	6	3487	3492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	238618484
85	NC_012726	GGA	2	6	3503	3508	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	238618484
86	NC_012726	TGA	2	6	3544	3549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238618484
87	NC_012726	AAG	2	6	3650	3655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238618485
88	NC_012726	AGAA	2	8	3658	3665	75 %	0 %	25 %	0 %	238618485
89	NC_012726	CCA	2	6	3682	3687	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	238618485
90	NC_012726	TTTA	2	8	3699	3706	25 %	75 %	0 %	0 %	238618485
91	NC_012726	TCC	2	6	3814	3819	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	238618485
92	NC_012726	TCCTT	2	10	3846	3855	0 %	60 %	0 %	40 %	238618485
93	NC_012726	TTA	2	6	3872	3877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238618485
94	NC_012726	ACTA	2	8	3924	3931	50 %	25 %	0 %	25 %	238618485
95	NC_012726	TTG	2	6	3941	3946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	238618485
96	NC_012726	TAT	3	9	3957	3965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238618485
97	NC_012726	T	6	6	3965	3970	0 %	100 %	0 %	0 %	238618485
98	NC_012726	A	6	6	3979	3984	100 %	0 %	0 %	0 %	238618485
99	NC_012726	TAA	2	6	4048	4053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238618485
100	NC_012726	TAG	2	6	4069	4074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238618485
101	NC_012726	A	6	6	4075	4080	100 %	0 %	0 %	0 %	238618485
102	NC_012726	CGTTA	2	10	4089	4098	20 %	40 %	20 %	20 %	238618485
103	NC_012726	T	6	6	4145	4150	0 %	100 %	0 %	0 %	238618485
104	NC_012726	TCC	2	6	4162	4167	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	238618485
105	NC_012726	CTT	2	6	4207	4212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238618485
106	NC_012726	CATT	2	8	4224	4231	25 %	50 %	0 %	25 %	238618485
107	NC_012726	TC	3	6	4277	4282	0 %	50 %	0 %	50 %	238618486
108	NC_012726	TC	3	6	4313	4318	0 %	50 %	0 %	50 %	238618486
109	NC_012726	CCTCTG	2	12	4504	4515	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	238618486
110	NC_012726	CTGTG	2	10	4520	4529	0 %	40 %	40 %	20 %	238618486
111	NC_012726	AAG	2	6	4536	4541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238618486
112	NC_012726	CCA	2	6	4606	4611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	238618486
113	NC_012726	GTAAT	2	10	4666	4675	40 %	40 %	20 %	0 %	238618486
114	NC_012726	AAT	2	6	4708	4713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238618486
115	NC_012726	GTTTT	2	10	4740	4749	0 %	80 %	20 %	0 %	238618486
116	NC_012726	TC	3	6	4783	4788	0 %	50 %	0 %	50 %	238618486
117	NC_012726	AGG	2	6	4791	4796	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	238618486
118	NC_012726	TCT	2	6	4950	4955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238618487
119	NC_012726	TACG	2	8	4988	4995	25 %	25 %	25 %	25 %	238618487
120	NC_012726	TA	3	6	5002	5007	50 %	50 %	0 %	0 %	238618487
121	NC_012726	ATTGAT	2	12	5012	5023	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	238618487
122	NC_012726	CTT	2	6	5047	5052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238618487
123	NC_012726	TAA	2	6	5054	5059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238618487
124	NC_012726	CTAAA	2	10	5083	5092	60 %	20 %	0 %	20 %	238618487
125	NC_012726	CCT	2	6	5149	5154	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	238618487
126	NC_012726	CAT	2	6	5251	5256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238618487
127	NC_012726	CTTAT	2	10	5289	5298	20 %	60 %	0 %	20 %	238618487
128	NC_012726	AT	3	6	5297	5302	50 %	50 %	0 %	0 %	238618487
129	NC_012726	TCT	2	6	5316	5321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238618487
130	NC_012726	TAGTCT	2	12	5323	5334	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	238618487
131	NC_012726	TAAA	2	8	5366	5373	75 %	25 %	0 %	0 %	238618487
132	NC_012726	ATC	2	6	5408	5413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238618487
133	NC_012726	TAA	2	6	5594	5599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238618487
134	NC_012726	AT	3	6	5671	5676	50 %	50 %	0 %	0 %	238618487
135	NC_012726	TCA	2	6	6235	6240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238618488
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