MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sulfolobus islandicus M.16.4 chromosome

Total Repeats: 49114

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
42501	NC_012726	TAAT	2	8	2238459	2238466	50 %	50 %	0 %	0 %	238620854
42502	NC_012726	TTG	2	6	2238561	2238566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	238620854
42503	NC_012726	CTG	2	6	2238582	2238587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238620854
42504	NC_012726	ATA	2	6	2238599	2238604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238620854
42505	NC_012726	GTGCTG	2	12	2238645	2238656	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	238620854
42506	NC_012726	GGA	2	6	2238683	2238688	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	238620854
42507	NC_012726	TGG	2	6	2238748	2238753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	238620854
42508	NC_012726	AG	3	6	2238772	2238777	50 %	0 %	50 %	0 %	238620854
42509	NC_012726	GTAA	2	8	2238818	2238825	50 %	25 %	25 %	0 %	238620854
42510	NC_012726	GTTA	2	8	2238871	2238878	25 %	50 %	25 %	0 %	238620854
42511	NC_012726	GAG	2	6	2238962	2238967	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	238620854
42512	NC_012726	ATT	2	6	2239006	2239011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238620854
42513	NC_012726	ATT	2	6	2239024	2239029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238620854
42514	NC_012726	AG	3	6	2239078	2239083	50 %	0 %	50 %	0 %	238620854
42515	NC_012726	ACT	2	6	2239137	2239142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238620854
42516	NC_012726	GAG	2	6	2239232	2239237	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	238620854
42517	NC_012726	TGA	2	6	2239263	2239268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238620854
42518	NC_012726	AAG	2	6	2239313	2239318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238620854
42519	NC_012726	TGAT	2	8	2239386	2239393	25 %	50 %	25 %	0 %	238620854
42520	NC_012726	GAG	2	6	2239427	2239432	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	238620854
42521	NC_012726	AAT	2	6	2239465	2239470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238620854
42522	NC_012726	GAT	2	6	2239523	2239528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238620854
42523	NC_012726	AAT	2	6	2239531	2239536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238620854
42524	NC_012726	GA	3	6	2239543	2239548	50 %	0 %	50 %	0 %	238620854
42525	NC_012726	AAT	2	6	2239563	2239568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238620855
42526	NC_012726	AGA	2	6	2239776	2239781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238620855
42527	NC_012726	TA	3	6	2239810	2239815	50 %	50 %	0 %	0 %	238620855
42528	NC_012726	TGT	2	6	2239884	2239889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	238620855
42529	NC_012726	GAG	2	6	2239963	2239968	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	238620855
42530	NC_012726	TGA	2	6	2239994	2239999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238620855
42531	NC_012726	ATAA	2	8	2240011	2240018	75 %	25 %	0 %	0 %	238620855
42532	NC_012726	ATT	2	6	2240023	2240028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238620855
42533	NC_012726	GAA	2	6	2240190	2240195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238620855
42534	NC_012726	ATT	2	6	2240249	2240254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238620855
42535	NC_012726	TGA	2	6	2240265	2240270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238620855
42536	NC_012726	TGA	2	6	2240301	2240306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238620855
42537	NC_012726	CTA	2	6	2240432	2240437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238620855
42538	NC_012726	TAAT	2	8	2240456	2240463	50 %	50 %	0 %	0 %	238620855
42539	NC_012726	CAG	3	9	2240504	2240512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238620855
42540	NC_012726	TGG	3	9	2240514	2240522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	238620855
42541	NC_012726	GCT	2	6	2240593	2240598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238620855
42542	NC_012726	ATG	2	6	2240611	2240616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238620855
42543	NC_012726	ATG	2	6	2240623	2240628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238620855
42544	NC_012726	GGT	3	9	2240674	2240682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	238620855
42545	NC_012726	TAT	2	6	2240773	2240778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238620855
42546	NC_012726	AAT	2	6	2240781	2240786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238620855
42547	NC_012726	TAC	2	6	2240790	2240795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238620855
42548	NC_012726	GTG	3	9	2240816	2240824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	238620855
42549	NC_012726	GTG	2	6	2240840	2240845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	238620855
42550	NC_012726	AGACT	2	10	2240879	2240888	40 %	20 %	20 %	20 %	238620855
42551	NC_012726	AAT	2	6	2240892	2240897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238620855
42552	NC_012726	GA	3	6	2240902	2240907	50 %	0 %	50 %	0 %	238620855
42553	NC_012726	GGT	2	6	2240935	2240940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	238620855
42554	NC_012726	AAT	2	6	2240967	2240972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238620855
42555	NC_012726	AGG	2	6	2240990	2240995	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	238620855
42556	NC_012726	CAA	2	6	2241014	2241019	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	238620855
42557	NC_012726	TGA	2	6	2241033	2241038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238620855
42558	NC_012726	GGA	2	6	2241064	2241069	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	238620855
42559	NC_012726	TAT	2	6	2241070	2241075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238620855
42560	NC_012726	CAT	2	6	2241697	2241702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238620856
42561	NC_012726	TCC	2	6	2241763	2241768	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	238620856
42562	NC_012726	CTT	2	6	2241772	2241777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238620856
42563	NC_012726	AAT	2	6	2241830	2241835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238620856
42564	NC_012726	CTTAC	2	10	2241843	2241852	20 %	40 %	0 %	40 %	238620856
42565	NC_012726	TA	3	6	2241937	2241942	50 %	50 %	0 %	0 %	238620856
42566	NC_012726	CTT	2	6	2242007	2242012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238620857
42567	NC_012726	AAG	2	6	2242024	2242029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238620857
42568	NC_012726	ATT	2	6	2242246	2242251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238620857
42569	NC_012726	AATT	2	8	2242287	2242294	50 %	50 %	0 %	0 %	238620857
42570	NC_012726	ATC	2	6	2242314	2242319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238620857
42571	NC_012726	TTAT	2	8	2242451	2242458	25 %	75 %	0 %	0 %	238620857
42572	NC_012726	CTTT	2	8	2242466	2242473	0 %	75 %	0 %	25 %	238620857
42573	NC_012726	AATC	2	8	2242736	2242743	50 %	25 %	0 %	25 %	238620858
42574	NC_012726	TCT	2	6	2242754	2242759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238620858
42575	NC_012726	TAC	2	6	2242806	2242811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238620858
42576	NC_012726	CAT	2	6	2242832	2242837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238620858
42577	NC_012726	TCT	2	6	2242908	2242913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238620858
42578	NC_012726	TCC	2	6	2242918	2242923	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	238620858
42579	NC_012726	ACT	2	6	2242948	2242953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238620858
42580	NC_012726	TTA	2	6	2242970	2242975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238620858
42581	NC_012726	CTG	2	6	2242976	2242981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238620858
42582	NC_012726	ATA	2	6	2242998	2243003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238620858
42583	NC_012726	CT	3	6	2243059	2243064	0 %	50 %	0 %	50 %	238620858
42584	NC_012726	CTT	2	6	2243099	2243104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238620858
42585	NC_012726	TAT	2	6	2243124	2243129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238620858
42586	NC_012726	GGT	2	6	2243140	2243145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	238620858
42587	NC_012726	ATACA	2	10	2243166	2243175	60 %	20 %	0 %	20 %	238620858
42588	NC_012726	CAG	2	6	2243243	2243248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238620858
42589	NC_012726	T	6	6	2243391	2243396	0 %	100 %	0 %	0 %	238620858
42590	NC_012726	TAACA	2	10	2243415	2243424	60 %	20 %	0 %	20 %	238620858
42591	NC_012726	TTC	2	6	2243637	2243642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238620859
42592	NC_012726	GAA	2	6	2243724	2243729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238620859
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42594	NC_012726	TCCC	2	8	2243806	2243813	0 %	25 %	0 %	75 %	238620859
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42598	NC_012726	TTC	2	6	2243933	2243938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238620860
42599	NC_012726	CAA	2	6	2244167	2244172	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	238620860
42600	NC_012726	GTC	2	6	2244173	2244178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238620860
42601	NC_012726	TGT	2	6	2244187	2244192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	238620860
42602	NC_012726	AAT	3	9	2244220	2244228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238620860
42603	NC_012726	ATG	2	6	2244260	2244265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238620860
42604	NC_012726	CTTA	2	8	2244365	2244372	25 %	50 %	0 %	25 %	238620860
42605	NC_012726	TTCTC	2	10	2244436	2244445	0 %	60 %	0 %	40 %	238620860
42606	NC_012726	ACA	2	6	2244453	2244458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	238620860
42607	NC_012726	T	7	7	2244580	2244586	0 %	100 %	0 %	0 %	238620860
42608	NC_012726	CTT	2	6	2244593	2244598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238620860
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42611	NC_012726	ATT	2	6	2244891	2244896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238620860
42612	NC_012726	ATA	2	6	2244907	2244912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238620860
42613	NC_012726	CGT	2	6	2244913	2244918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238620860
42614	NC_012726	A	6	6	2244987	2244992	100 %	0 %	0 %	0 %	238620860
42615	NC_012726	TACT	2	8	2245003	2245010	25 %	50 %	0 %	25 %	238620860
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42617	NC_012726	T	6	6	2245042	2245047	0 %	100 %	0 %	0 %	238620860
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42970	NC_012726	ATC	2	6	2265742	2265747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238620883
42971	NC_012726	TTG	2	6	2265776	2265781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	238620883
42972	NC_012726	AGT	2	6	2265783	2265788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238620883
42973	NC_012726	TAC	2	6	2265980	2265985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238620883
42974	NC_012726	TA	3	6	2266024	2266029	50 %	50 %	0 %	0 %	238620883
42975	NC_012726	CTT	2	6	2266068	2266073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238620883
42976	NC_012726	ATG	2	6	2266084	2266089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238620883
42977	NC_012726	ACT	2	6	2266147	2266152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238620883
42978	NC_012726	TAG	2	6	2266154	2266159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238620883
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42980	NC_012726	CTT	2	6	2266309	2266314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238620884
42981	NC_012726	AAT	2	6	2266315	2266320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238620884
42982	NC_012726	AGA	2	6	2266422	2266427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238620884
42983	NC_012726	CTT	2	6	2266472	2266477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238620884
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42985	NC_012726	GA	3	6	2266577	2266582	50 %	0 %	50 %	0 %	238620884
42986	NC_012726	TCAA	2	8	2266596	2266603	50 %	25 %	0 %	25 %	238620884
42987	NC_012726	TAA	2	6	2266614	2266619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238620884
42988	NC_012726	AGTG	2	8	2266638	2266645	25 %	25 %	50 %	0 %	238620885
42989	NC_012726	T	6	6	2266688	2266693	0 %	100 %	0 %	0 %	238620885
42990	NC_012726	TA	3	6	2266850	2266855	50 %	50 %	0 %	0 %	238620885
42991	NC_012726	AAT	2	6	2266872	2266877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238620885
42992	NC_012726	GA	3	6	2266942	2266947	50 %	0 %	50 %	0 %	238620885
42993	NC_012726	CAAC	2	8	2267056	2267063	50 %	0 %	0 %	50 %	238620886
42994	NC_012726	GCA	2	6	2267113	2267118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238620886
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42997	NC_012726	AAT	2	6	2267187	2267192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238620886
42998	NC_012726	A	6	6	2267320	2267325	100 %	0 %	0 %	0 %	238620886
42999	NC_012726	TAC	2	6	2267327	2267332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238620886
43000	NC_012726	T	6	6	2267364	2267369	0 %	100 %	0 %	0 %	238620887

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