MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sulfolobus islandicus M.16.27 chromosome

Total Repeats: 49592

< Previous12...888990919293949596979899100Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
49501	NC_012632	AAGA	2	8	2687427	2687434	75 %	0 %	25 %	0 %	229586227
49502	NC_012632	AT	3	6	2687595	2687600	50 %	50 %	0 %	0 %	229586227
49503	NC_012632	AAAGAC	2	12	2687612	2687623	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	229586227
49504	NC_012632	AGGA	2	8	2687624	2687631	50 %	0 %	50 %	0 %	229586227
49505	NC_012632	ATCT	2	8	2687637	2687644	25 %	50 %	0 %	25 %	229586227
49506	NC_012632	TTTC	2	8	2687710	2687717	0 %	75 %	0 %	25 %	229586228
49507	NC_012632	TTA	2	6	2687727	2687732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586228
49508	NC_012632	AACAC	2	10	2687762	2687771	60 %	0 %	0 %	40 %	229586228
49509	NC_012632	ATT	2	6	2687788	2687793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586228
49510	NC_012632	ATT	2	6	2687824	2687829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586228
49511	NC_012632	TTG	2	6	2687835	2687840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229586228
49512	NC_012632	TAC	2	6	2687856	2687861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229586228
49513	NC_012632	TATTTA	2	12	2687871	2687882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586228
49514	NC_012632	TAT	2	6	2687965	2687970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586228
49515	NC_012632	GAA	2	6	2688230	2688235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229586228
49516	NC_012632	AAG	2	6	2688336	2688341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229586228
49517	NC_012632	AAT	3	9	2688343	2688351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586228
49518	NC_012632	TAT	2	6	2688451	2688456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586228
49519	NC_012632	TAT	2	6	2688534	2688539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586228
49520	NC_012632	ATA	2	6	2688559	2688564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586228
49521	NC_012632	TA	4	8	2688601	2688608	50 %	50 %	0 %	0 %	229586228
49522	NC_012632	TCA	2	6	2688656	2688661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229586228
49523	NC_012632	AT	3	6	2688666	2688671	50 %	50 %	0 %	0 %	229586228
49524	NC_012632	GGA	2	6	2688773	2688778	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229586228
49525	NC_012632	AT	4	8	2688794	2688801	50 %	50 %	0 %	0 %	229586228
49526	NC_012632	TAA	2	6	2688843	2688848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586228
49527	NC_012632	TAT	2	6	2688984	2688989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586228
49528	NC_012632	GGA	2	6	2689028	2689033	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229586228
49529	NC_012632	TTC	2	6	2689034	2689039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229586228
49530	NC_012632	ATAA	2	8	2689057	2689064	75 %	25 %	0 %	0 %	229586228
49531	NC_012632	ACT	2	6	2689070	2689075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229586228
49532	NC_012632	ACT	2	6	2689184	2689189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229586228
49533	NC_012632	TCT	2	6	2689190	2689195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229586228
49534	NC_012632	CTTC	2	8	2689202	2689209	0 %	50 %	0 %	50 %	229586228
49535	NC_012632	CTG	2	6	2689258	2689263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229586228
49536	NC_012632	AAC	2	6	2689264	2689269	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229586228
49537	NC_012632	ACT	2	6	2689331	2689336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229586228
49538	NC_012632	TAT	2	6	2689365	2689370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586228
49539	NC_012632	CAA	3	9	2689377	2689385	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229586228
49540	NC_012632	TAA	2	6	2689411	2689416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586228
49541	NC_012632	TAA	2	6	2689484	2689489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586228
49542	NC_012632	TAT	2	6	2689494	2689499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586228
49543	NC_012632	ATG	2	6	2689626	2689631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229586228
49544	NC_012632	TAGG	2	8	2689642	2689649	25 %	25 %	50 %	0 %	229586228
49545	NC_012632	GTA	2	6	2689657	2689662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229586228
49546	NC_012632	ACA	2	6	2689703	2689708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229586228
49547	NC_012632	CCA	2	6	2689772	2689777	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229586228
49548	NC_012632	TA	3	6	2689837	2689842	50 %	50 %	0 %	0 %	229586228
49549	NC_012632	AGA	2	6	2689846	2689851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229586228
49550	NC_012632	ACC	2	6	2689852	2689857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229586228
49551	NC_012632	GAG	2	6	2689905	2689910	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229586228
49552	NC_012632	AAG	2	6	2689913	2689918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229586228
49553	NC_012632	CCGC	2	8	2689934	2689941	0 %	0 %	25 %	75 %	229586228
49554	NC_012632	TGC	2	6	2689951	2689956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229586228
49555	NC_012632	ATA	2	6	2690073	2690078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586228
49556	NC_012632	TTG	2	6	2690092	2690097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229586228
49557	NC_012632	TA	3	6	2690101	2690106	50 %	50 %	0 %	0 %	229586228
49558	NC_012632	CAT	2	6	2690232	2690237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229586228
49559	NC_012632	GGA	2	6	2690276	2690281	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229586228
49560	NC_012632	TGTA	2	8	2690324	2690331	25 %	50 %	25 %	0 %	229586228
49561	NC_012632	TAT	2	6	2690382	2690387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586228
49562	NC_012632	TGT	2	6	2690476	2690481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229586228
49563	NC_012632	CT	4	8	2690610	2690617	0 %	50 %	0 %	50 %	229586228
49564	NC_012632	AT	3	6	2690670	2690675	50 %	50 %	0 %	0 %	229586228
49565	NC_012632	TTG	2	6	2690776	2690781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229586228
49566	NC_012632	TTAT	2	8	2690861	2690868	25 %	75 %	0 %	0 %	229586228
49567	NC_012632	AGA	2	6	2691170	2691175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229586229
49568	NC_012632	A	6	6	2691218	2691223	100 %	0 %	0 %	0 %	229586229
49569	NC_012632	AAT	2	6	2691227	2691232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586229
49570	NC_012632	TGC	2	6	2691275	2691280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229586229
49571	NC_012632	TTA	2	6	2691432	2691437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586229
49572	NC_012632	TGA	2	6	2691608	2691613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229586229
49573	NC_012632	GAA	2	6	2691656	2691661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229586229
49574	NC_012632	GGA	2	6	2691701	2691706	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229586229
49575	NC_012632	GAAA	2	8	2691796	2691803	75 %	0 %	25 %	0 %	229586229
49576	NC_012632	AAT	2	6	2691809	2691814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586229
49577	NC_012632	TGA	2	6	2691829	2691834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229586229
49578	NC_012632	CAA	2	6	2691877	2691882	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229586229
49579	NC_012632	GAA	2	6	2691909	2691914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229586229
49580	NC_012632	CCT	2	6	2691942	2691947	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229586229
49581	NC_012632	TAA	2	6	2691961	2691966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586229
49582	NC_012632	GATAG	2	10	2691969	2691978	40 %	20 %	40 %	0 %	229586229
49583	NC_012632	ATA	2	6	2691982	2691987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586229
49584	NC_012632	CAGAC	2	10	2692007	2692016	40 %	0 %	20 %	40 %	229586229
49585	NC_012632	ATA	2	6	2692026	2692031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586229
49586	NC_012632	GGT	2	6	2692104	2692109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229586229
49587	NC_012632	AAT	2	6	2692199	2692204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586229
49588	NC_012632	ATGGG	2	10	2692233	2692242	20 %	20 %	60 %	0 %	229586229
49589	NC_012632	AGC	2	6	2692247	2692252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229586229
49590	NC_012632	AAG	2	6	2692293	2692298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229586229
49591	NC_012632	CAA	2	6	2692342	2692347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229586229
49592	NC_012632	TGA	2	6	2692358	2692363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229586229

< Previous12...888990919293949596979899100Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.