MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sulfolobus islandicus M.16.27 chromosome

Total Repeats: 49592

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_012632	TC	3	6	219666	219671	0 %	50 %	0 %	50 %	229583825
4502	NC_012632	TTTACC	2	12	219684	219695	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	229583825
4503	NC_012632	TCT	2	6	219710	219715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229583825
4504	NC_012632	TCC	2	6	219720	219725	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229583825
4505	NC_012632	TA	3	6	219731	219736	50 %	50 %	0 %	0 %	229583825
4506	NC_012632	AATT	2	8	219765	219772	50 %	50 %	0 %	0 %	229583825
4507	NC_012632	CTT	2	6	219855	219860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229583826
4508	NC_012632	TCCT	2	8	219870	219877	0 %	50 %	0 %	50 %	229583826
4509	NC_012632	T	6	6	219887	219892	0 %	100 %	0 %	0 %	229583826
4510	NC_012632	ATA	2	6	219950	219955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229583826
4511	NC_012632	CCTT	2	8	219982	219989	0 %	50 %	0 %	50 %	229583826
4512	NC_012632	AAT	2	6	220015	220020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229583826
4513	NC_012632	TCCT	2	8	220035	220042	0 %	50 %	0 %	50 %	229583826
4514	NC_012632	ATT	2	6	220051	220056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229583826
4515	NC_012632	TCT	2	6	220069	220074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229583826
4516	NC_012632	ATA	2	6	220161	220166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229583826
4517	NC_012632	T	6	6	220167	220172	0 %	100 %	0 %	0 %	229583826
4518	NC_012632	AAAT	2	8	220185	220192	75 %	25 %	0 %	0 %	229583826
4519	NC_012632	TATTTT	2	12	220248	220259	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	229583826
4520	NC_012632	TGT	2	6	220268	220273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229583826
4521	NC_012632	T	6	6	220432	220437	0 %	100 %	0 %	0 %	229583827
4522	NC_012632	CTT	2	6	220439	220444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229583827
4523	NC_012632	TAT	2	6	220456	220461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229583827
4524	NC_012632	TTC	2	6	220496	220501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229583827
4525	NC_012632	AT	4	8	220537	220544	50 %	50 %	0 %	0 %	229583827
4526	NC_012632	AGT	2	6	220547	220552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229583827
4527	NC_012632	TA	3	6	220594	220599	50 %	50 %	0 %	0 %	229583827
4528	NC_012632	CTC	2	6	220618	220623	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229583827
4529	NC_012632	ATA	2	6	220715	220720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229583827
4530	NC_012632	TGG	2	6	220721	220726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229583827
4531	NC_012632	TCT	2	6	220881	220886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229583827
4532	NC_012632	CAG	2	6	220909	220914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229583827
4533	NC_012632	TG	3	6	220967	220972	0 %	50 %	50 %	0 %	229583827
4534	NC_012632	TTA	2	6	220989	220994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229583827
4535	NC_012632	AAG	2	6	221001	221006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229583827
4536	NC_012632	AGT	2	6	221059	221064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229583827
4537	NC_012632	TTTC	2	8	221068	221075	0 %	75 %	0 %	25 %	229583827
4538	NC_012632	AAT	2	6	221096	221101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229583827
4539	NC_012632	CTTT	2	8	221105	221112	0 %	75 %	0 %	25 %	229583827
4540	NC_012632	CTT	2	6	221116	221121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229583827
4541	NC_012632	ATGG	2	8	221124	221131	25 %	25 %	50 %	0 %	229583827
4542	NC_012632	CTT	2	6	221140	221145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229583827
4543	NC_012632	CTT	2	6	221163	221168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229583827
4544	NC_012632	AGC	2	6	221255	221260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229583827
4545	NC_012632	CTGCC	2	10	221278	221287	0 %	20 %	20 %	60 %	229583827
4546	NC_012632	CTT	2	6	221313	221318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229583827
4547	NC_012632	CCT	2	6	221379	221384	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229583827
4548	NC_012632	ATC	2	6	221499	221504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229583827
4549	NC_012632	TTCC	2	8	221506	221513	0 %	50 %	0 %	50 %	229583827
4550	NC_012632	CAGAAG	2	12	221539	221550	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	229583827
4551	NC_012632	G	6	6	221743	221748	0 %	0 %	100 %	0 %	229583827
4552	NC_012632	TTA	2	6	221853	221858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229583827
4553	NC_012632	TAAA	2	8	222300	222307	75 %	25 %	0 %	0 %	229583828
4554	NC_012632	TTCC	2	8	222308	222315	0 %	50 %	0 %	50 %	229583828
4555	NC_012632	CAT	2	6	222345	222350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229583828
4556	NC_012632	TAC	2	6	222381	222386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229583828
4557	NC_012632	TGC	2	6	222411	222416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229583828
4558	NC_012632	ATA	2	6	222460	222465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229583828
4559	NC_012632	TA	3	6	222567	222572	50 %	50 %	0 %	0 %	229583828
4560	NC_012632	TCA	2	6	222739	222744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229583828
4561	NC_012632	GCTGGA	2	12	222808	222819	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	229583828
4562	NC_012632	TAA	2	6	223044	223049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229583828
4563	NC_012632	TCT	2	6	223284	223289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229583828
4564	NC_012632	TAA	2	6	223290	223295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229583828
4565	NC_012632	AGA	2	6	223451	223456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229583828
4566	NC_012632	AT	3	6	223513	223518	50 %	50 %	0 %	0 %	229583828
4567	NC_012632	AT	3	6	223602	223607	50 %	50 %	0 %	0 %	229583828
4568	NC_012632	AT	3	6	223616	223621	50 %	50 %	0 %	0 %	229583828
4569	NC_012632	TAC	2	6	223626	223631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229583828
4570	NC_012632	AT	3	6	223672	223677	50 %	50 %	0 %	0 %	229583828
4571	NC_012632	CCA	2	6	223678	223683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229583828
4572	NC_012632	TA	3	6	223688	223693	50 %	50 %	0 %	0 %	229583828
4573	NC_012632	AAC	2	6	223707	223712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229583828
4574	NC_012632	TA	3	6	223797	223802	50 %	50 %	0 %	0 %	229583828
4575	NC_012632	ACC	2	6	223811	223816	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229583828
4576	NC_012632	ATT	2	6	223822	223827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229583828
4577	NC_012632	ATG	2	6	223859	223864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229583828
4578	NC_012632	AG	3	6	223867	223872	50 %	0 %	50 %	0 %	229583828
4579	NC_012632	TCAT	2	8	223894	223901	25 %	50 %	0 %	25 %	229583828
4580	NC_012632	TAT	2	6	223902	223907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229583829
4581	NC_012632	TCCC	2	8	223908	223915	0 %	25 %	0 %	75 %	229583829
4582	NC_012632	ACT	2	6	224069	224074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229583829
4583	NC_012632	GTA	2	6	224114	224119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229583829
4584	NC_012632	CTT	2	6	224145	224150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229583829
4585	NC_012632	AGC	2	6	224221	224226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229583829
4586	NC_012632	GCTATT	2	12	224237	224248	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	229583829
4587	NC_012632	TCC	2	6	224260	224265	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229583829
4588	NC_012632	CTA	2	6	224307	224312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229583829
4589	NC_012632	TCT	4	12	224339	224350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229583829
4590	NC_012632	T	6	6	224465	224470	0 %	100 %	0 %	0 %	229583829
4591	NC_012632	TAA	2	6	224473	224478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229583829
4592	NC_012632	CTA	2	6	224556	224561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229583829
4593	NC_012632	TTC	2	6	224775	224780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229583830
4594	NC_012632	TAT	2	6	224800	224805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229583830
4595	NC_012632	TAA	2	6	224806	224811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229583830
4596	NC_012632	CAAA	2	8	224827	224834	75 %	0 %	0 %	25 %	229583830
4597	NC_012632	ACA	2	6	224840	224845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229583830
4598	NC_012632	ATA	2	6	224957	224962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229583830
4599	NC_012632	TCT	2	6	225030	225035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229583831
4600	NC_012632	ATT	2	6	225047	225052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229583831
4601	NC_012632	TTA	2	6	225110	225115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229583831
4602	NC_012632	CCAA	2	8	225116	225123	50 %	0 %	0 %	50 %	229583831
4603	NC_012632	ATCT	2	8	225166	225173	25 %	50 %	0 %	25 %	229583831
4604	NC_012632	ATT	2	6	225211	225216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229583831
4605	NC_012632	ACT	2	6	225257	225262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229583831
4606	NC_012632	CAG	2	6	225273	225278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229583831
4607	NC_012632	TAT	2	6	225340	225345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229583831
4608	NC_012632	GTGCT	2	10	225397	225406	0 %	40 %	40 %	20 %	229583831
4609	NC_012632	ATT	2	6	225446	225451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229583831
4610	NC_012632	TAT	2	6	225496	225501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229583831
4611	NC_012632	GCA	2	6	225551	225556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229583832
4612	NC_012632	TTG	2	6	225624	225629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229583832
4613	NC_012632	ACC	2	6	225667	225672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229583832
4614	NC_012632	TA	3	6	225730	225735	50 %	50 %	0 %	0 %	229583832
4615	NC_012632	CCT	2	6	225750	225755	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229583832
4616	NC_012632	CTT	2	6	225802	225807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229583832
4617	NC_012632	ATT	2	6	225815	225820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229583832
4618	NC_012632	AGC	2	6	225823	225828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229583832
4619	NC_012632	AGC	2	6	225937	225942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229583832
4620	NC_012632	TCA	2	6	225980	225985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229583832
4621	NC_012632	CATT	2	8	226092	226099	25 %	50 %	0 %	25 %	229583832
4622	NC_012632	ACT	2	6	226268	226273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229583832
4623	NC_012632	ACT	2	6	226289	226294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229583832
4624	NC_012632	TTA	2	6	226311	226316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229583832
4625	NC_012632	TG	3	6	226381	226386	0 %	50 %	50 %	0 %	229583832
4626	NC_012632	GCT	2	6	226394	226399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229583832
4627	NC_012632	TA	3	6	226507	226512	50 %	50 %	0 %	0 %	229583832
4628	NC_012632	CTA	2	6	226656	226661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229583832
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4630	NC_012632	CTA	2	6	226904	226909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229583833
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4644	NC_012632	CT	4	8	227552	227559	0 %	50 %	0 %	50 %	229583833
4645	NC_012632	TTAAT	2	10	227561	227570	40 %	60 %	0 %	0 %	229583833
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4664	NC_012632	TAG	2	6	228822	228827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229583834
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4681	NC_012632	AT	3	6	230018	230023	50 %	50 %	0 %	0 %	229583834
4682	NC_012632	TAAA	2	8	230050	230057	75 %	25 %	0 %	0 %	229583834
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4684	NC_012632	TAA	2	6	230205	230210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229583835
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4731	NC_012632	TTC	2	6	232289	232294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229583839
4732	NC_012632	AGAT	2	8	232402	232409	50 %	25 %	25 %	0 %	229583839
4733	NC_012632	GCT	2	6	232427	232432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229583839
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4736	NC_012632	TAG	2	6	232485	232490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229583839
4737	NC_012632	AGTC	2	8	232497	232504	25 %	25 %	25 %	25 %	229583839
4738	NC_012632	GAT	2	6	232510	232515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229583839
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4740	NC_012632	TGC	2	6	232615	232620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229583839
4741	NC_012632	GTAATC	2	12	232670	232681	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	229583839
4742	NC_012632	TCAC	2	8	232704	232711	25 %	25 %	0 %	50 %	229583839
4743	NC_012632	TAC	2	6	232753	232758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229583839
4744	NC_012632	GAT	2	6	232859	232864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229583839
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4746	NC_012632	ATA	2	6	232922	232927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229583839
4747	NC_012632	ATT	2	6	232930	232935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229583839
4748	NC_012632	TAA	2	6	233013	233018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229583839
4749	NC_012632	GCT	2	6	233039	233044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229583839
4750	NC_012632	CTA	2	6	233054	233059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229583839
4751	NC_012632	TGG	2	6	233071	233076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229583839
4752	NC_012632	AAT	2	6	233092	233097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229583839
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4774	NC_012632	GGA	2	6	234274	234279	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229583840
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4853	NC_012632	AGA	2	6	239107	239112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229583846
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4855	NC_012632	GAG	2	6	239182	239187	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229583846
4856	NC_012632	TAC	2	6	239221	239226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229583846
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4859	NC_012632	ATA	2	6	239309	239314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229583846
4860	NC_012632	GAA	2	6	239378	239383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229583846
4861	NC_012632	CAAAC	2	10	239416	239425	60 %	0 %	0 %	40 %	229583846
4862	NC_012632	CCA	2	6	239429	239434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229583846
4863	NC_012632	AG	3	6	239448	239453	50 %	0 %	50 %	0 %	229583846
4864	NC_012632	TAT	2	6	239454	239459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229583846
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4866	NC_012632	TAG	2	6	239508	239513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229583846
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4991	NC_012632	GAG	2	6	245925	245930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229583854
4992	NC_012632	CAA	2	6	245931	245936	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229583854
4993	NC_012632	AAT	2	6	245980	245985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229583854
4994	NC_012632	AAAT	2	8	246343	246350	75 %	25 %	0 %	0 %	229583854
4995	NC_012632	TAC	2	6	246442	246447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229583854
4996	NC_012632	TTCA	2	8	246479	246486	25 %	50 %	0 %	25 %	229583854
4997	NC_012632	AGA	2	6	246547	246552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229583854
4998	NC_012632	TAAG	2	8	246775	246782	50 %	25 %	25 %	0 %	229583855
4999	NC_012632	T	6	6	246793	246798	0 %	100 %	0 %	0 %	229583855
5000	NC_012632	AGA	2	6	246812	246817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229583855

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