MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sulfolobus islandicus Y.N.15.51 plasmid pYN01

Total Repeats: 858

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012624	TGA	2	6	21	26	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	228288720
2	NC_012624	A	6	6	32	37	100 %	0 %	0 %	0 %	228288720
3	NC_012624	CAT	2	6	90	95	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	228288720
4	NC_012624	T	6	6	95	100	0 %	100 %	0 %	0 %	228288720
5	NC_012624	CTA	2	6	143	148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	228288720
6	NC_012624	AGT	2	6	172	177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	228288720
7	NC_012624	TTC	2	6	197	202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	228288720
8	NC_012624	CAT	2	6	211	216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	228288720
9	NC_012624	ATA	2	6	266	271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	228288720
10	NC_012624	AAC	2	6	347	352	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	228288720
11	NC_012624	GGAT	2	8	389	396	25 %	25 %	50 %	0 %	228288720
12	NC_012624	AT	3	6	403	408	50 %	50 %	0 %	0 %	228288720
13	NC_012624	ACA	2	6	416	421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	228288720
14	NC_012624	CAG	2	6	451	456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	228288720
15	NC_012624	ATA	3	9	458	466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	228288720
16	NC_012624	AGA	2	6	488	493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	228288720
17	NC_012624	AAAATC	2	12	506	517	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	228288720
18	NC_012624	ATA	2	6	545	550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	228288720
19	NC_012624	AAT	2	6	589	594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	228288720
20	NC_012624	CA	4	8	615	622	50 %	0 %	0 %	50 %	228288720
21	NC_012624	TATAC	2	10	665	674	40 %	40 %	0 %	20 %	228288720
22	NC_012624	AAT	2	6	679	684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	228288720
23	NC_012624	AGCA	2	8	685	692	50 %	0 %	25 %	25 %	228288720
24	NC_012624	CAT	2	6	712	717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	228288720
25	NC_012624	AAC	2	6	721	726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	228288720
26	NC_012624	AAC	2	6	751	756	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	228288720
27	NC_012624	TAA	2	6	762	767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	228288720
28	NC_012624	ACTAGG	2	12	796	807	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	228288720
29	NC_012624	AAC	2	6	835	840	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	228288720
30	NC_012624	AGG	2	6	892	897	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	228288720
31	NC_012624	TAA	2	6	900	905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	228288720
32	NC_012624	AAT	2	6	922	927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	228288720
33	NC_012624	ATA	2	6	953	958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	228288720
34	NC_012624	AAT	2	6	964	969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	228288720
35	NC_012624	A	6	6	984	989	100 %	0 %	0 %	0 %	228288720
36	NC_012624	TTC	2	6	1062	1067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	228288721
37	NC_012624	TTC	3	9	1088	1096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	228288721
38	NC_012624	CTAGT	2	10	1167	1176	20 %	40 %	20 %	20 %	228288721
39	NC_012624	GGT	2	6	1187	1192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	228288721
40	NC_012624	TAT	2	6	1197	1202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	228288721
41	NC_012624	ATTT	2	8	1208	1215	25 %	75 %	0 %	0 %	228288721
42	NC_012624	AGA	2	6	1308	1313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	228288722
43	NC_012624	ATC	2	6	1322	1327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	228288722
44	NC_012624	GAA	2	6	1359	1364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	228288722
45	NC_012624	GATA	2	8	1372	1379	50 %	25 %	25 %	0 %	228288722
46	NC_012624	GAA	2	6	1451	1456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	228288722
47	NC_012624	TAA	2	6	1462	1467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	228288723
48	NC_012624	TTTCA	2	10	1508	1517	20 %	60 %	0 %	20 %	228288723
49	NC_012624	ATT	2	6	1532	1537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	228288723
50	NC_012624	AT	3	6	1577	1582	50 %	50 %	0 %	0 %	228288723
51	NC_012624	AAC	2	6	1587	1592	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	228288723
52	NC_012624	AAT	2	6	1604	1609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	228288723
53	NC_012624	ATA	2	6	1696	1701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	228288723
54	NC_012624	GAG	2	6	1811	1816	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	228288723
55	NC_012624	TGA	2	6	1821	1826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	228288723
56	NC_012624	TCT	2	6	1845	1850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	228288724
57	NC_012624	TAC	2	6	1901	1906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	228288724
58	NC_012624	TTGA	2	8	1949	1956	25 %	50 %	25 %	0 %	228288724
59	NC_012624	TAT	3	9	2090	2098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	228288724
60	NC_012624	GGT	2	6	2140	2145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	228288724
61	NC_012624	GTT	2	6	2146	2151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	228288724
62	NC_012624	GTT	2	6	2171	2176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	228288724
63	NC_012624	AT	3	6	2219	2224	50 %	50 %	0 %	0 %	228288724
64	NC_012624	GGA	2	6	2244	2249	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	228288724
65	NC_012624	TGC	2	6	2322	2327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	228288724
66	NC_012624	AGC	2	6	2329	2334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	228288724
67	NC_012624	ATT	2	6	2355	2360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	228288724
68	NC_012624	TAT	2	6	2366	2371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	228288724
69	NC_012624	AATT	2	8	3244	3251	50 %	50 %	0 %	0 %	228288725
70	NC_012624	ATGGCT	2	12	3255	3266	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	228288725
71	NC_012624	GCT	2	6	3280	3285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	228288725
72	NC_012624	AAG	2	6	3324	3329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	228288725
73	NC_012624	GCT	2	6	3332	3337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	228288725
74	NC_012624	AAT	2	6	3368	3373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	228288725
75	NC_012624	AG	3	6	3407	3412	50 %	0 %	50 %	0 %	228288725
76	NC_012624	AGG	2	6	3433	3438	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	228288725
77	NC_012624	TCAG	2	8	3553	3560	25 %	25 %	25 %	25 %	228288726
78	NC_012624	TTA	2	6	3645	3650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	228288726
79	NC_012624	TAG	2	6	3676	3681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	228288726
80	NC_012624	AG	3	6	3730	3735	50 %	0 %	50 %	0 %	228288726
81	NC_012624	AAAG	2	8	3793	3800	75 %	0 %	25 %	0 %	228288726
82	NC_012624	A	6	6	3826	3831	100 %	0 %	0 %	0 %	228288726
83	NC_012624	ATA	2	6	3900	3905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	228288726
84	NC_012624	TAT	2	6	3939	3944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	228288726
85	NC_012624	TAA	2	6	4012	4017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	228288726
86	NC_012624	A	6	6	4055	4060	100 %	0 %	0 %	0 %	228288726
87	NC_012624	TAG	2	6	4099	4104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	228288726
88	NC_012624	TAG	2	6	4110	4115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	228288726
89	NC_012624	ATT	2	6	4118	4123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	228288726
90	NC_012624	TA	3	6	4176	4181	50 %	50 %	0 %	0 %	228288726
91	NC_012624	AAAT	2	8	4230	4237	75 %	25 %	0 %	0 %	228288726
92	NC_012624	TAA	2	6	4282	4287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	228288726
93	NC_012624	TAA	2	6	4320	4325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	228288726
94	NC_012624	TAC	2	6	4470	4475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	228288726
95	NC_012624	A	7	7	4476	4482	100 %	0 %	0 %	0 %	228288726
96	NC_012624	ATA	2	6	4496	4501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	228288726
97	NC_012624	TAAA	2	8	4509	4516	75 %	25 %	0 %	0 %	228288726
98	NC_012624	AT	3	6	4904	4909	50 %	50 %	0 %	0 %	228288727
99	NC_012624	CAA	2	6	4938	4943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	228288727
100	NC_012624	ATT	2	6	4953	4958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	228288727
101	NC_012624	AAG	2	6	4959	4964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	228288727
102	NC_012624	TAG	2	6	4966	4971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	228288727
103	NC_012624	TA	3	6	5026	5031	50 %	50 %	0 %	0 %	228288727
104	NC_012624	AGT	2	6	5132	5137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	228288727
105	NC_012624	TAC	2	6	5150	5155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	228288727
106	NC_012624	GTT	2	6	5169	5174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	228288727
107	NC_012624	TTTCG	2	10	5207	5216	0 %	60 %	20 %	20 %	228288727
108	NC_012624	GAA	2	6	5246	5251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	228288727
109	NC_012624	ATC	2	6	5255	5260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	228288727
110	NC_012624	ACAT	2	8	5262	5269	50 %	25 %	0 %	25 %	228288727
111	NC_012624	GAA	2	6	5277	5282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	228288727
112	NC_012624	GAA	2	6	5288	5293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	228288727
113	NC_012624	ATGAGG	2	12	5337	5348	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	228288727
114	NC_012624	AGC	2	6	5433	5438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	228288727
115	NC_012624	AGT	2	6	5486	5491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	228288727
116	NC_012624	GAA	2	6	5498	5503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	228288727
117	NC_012624	TA	3	6	5524	5529	50 %	50 %	0 %	0 %	228288727
118	NC_012624	CTAAGT	2	12	5545	5556	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	228288727
119	NC_012624	AAG	2	6	5594	5599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	228288727
120	NC_012624	ATA	2	6	5608	5613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	228288727
121	NC_012624	TCT	2	6	5638	5643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	228288727
122	NC_012624	ATA	2	6	5721	5726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	228288727
123	NC_012624	TGA	2	6	5731	5736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	228288727
124	NC_012624	AAG	2	6	5800	5805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	228288727
125	NC_012624	AAG	2	6	5935	5940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	228288727
126	NC_012624	GAG	2	6	5984	5989	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	228288727
127	NC_012624	CTT	2	6	5990	5995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	228288727
128	NC_012624	GAT	2	6	6029	6034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	228288727
129	NC_012624	TAC	2	6	6079	6084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	228288727
130	NC_012624	ATT	2	6	6091	6096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	228288727
131	NC_012624	TGA	2	6	6100	6105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	228288727
132	NC_012624	GAA	2	6	6119	6124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	228288727
133	NC_012624	TGA	2	6	6131	6136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	228288727
134	NC_012624	GCT	2	6	6149	6154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	228288727
135	NC_012624	GGGTA	2	10	6217	6226	20 %	20 %	60 %	0 %	228288728
136	NC_012624	AGT	2	6	6234	6239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	228288728
137	NC_012624	TA	3	6	6249	6254	50 %	50 %	0 %	0 %	228288728
138	NC_012624	TAAA	2	8	6346	6353	75 %	25 %	0 %	0 %	228288728
139	NC_012624	TAA	2	6	6356	6361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	228288728
140	NC_012624	CTT	2	6	6367	6372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	228288728
141	NC_012624	CTC	2	6	6377	6382	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	228288728
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145	NC_012624	TCT	2	6	6564	6569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	228288729
146	NC_012624	TC	3	6	6623	6628	0 %	50 %	0 %	50 %	228288729
147	NC_012624	CT	3	6	6649	6654	0 %	50 %	0 %	50 %	228288729
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149	NC_012624	TTC	2	6	6708	6713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	228288729
150	NC_012624	TC	3	6	7068	7073	0 %	50 %	0 %	50 %	228288730
151	NC_012624	TTA	2	6	7081	7086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	228288730
152	NC_012624	GCT	2	6	7103	7108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	228288730
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156	NC_012624	CTG	2	6	7208	7213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	228288731
157	NC_012624	TAATC	2	10	7287	7296	40 %	40 %	0 %	20 %	228288731
158	NC_012624	TC	3	6	7295	7300	0 %	50 %	0 %	50 %	228288731
159	NC_012624	AGC	2	6	7310	7315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	228288731
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161	NC_012624	GAA	2	6	7334	7339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	228288731
162	NC_012624	AAT	2	6	7368	7373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	228288731
163	NC_012624	CTT	2	6	7381	7386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	228288731
164	NC_012624	ATTT	2	8	7403	7410	25 %	75 %	0 %	0 %	228288731
165	NC_012624	CAT	2	6	7414	7419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	228288731
166	NC_012624	ACTTTC	2	12	7437	7448	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	228288731
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168	NC_012624	TCT	3	9	7544	7552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	228288732
169	NC_012624	ATC	2	6	7573	7578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	228288732
170	NC_012624	GAA	2	6	7594	7599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	228288732
171	NC_012624	GCT	2	6	7611	7616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	228288732
172	NC_012624	TGT	2	6	7641	7646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	228288732
173	NC_012624	CAA	2	6	7667	7672	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	228288732
174	NC_012624	TCAT	2	8	7691	7698	25 %	50 %	0 %	25 %	228288732
175	NC_012624	TCT	2	6	7699	7704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	228288733
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252	NC_012624	ATA	2	6	11571	11576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	228288739
253	NC_012624	ATG	2	6	11637	11642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	228288739
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256	NC_012624	CTGA	2	8	11881	11888	25 %	25 %	25 %	25 %	228288740
257	NC_012624	ATT	2	6	11922	11927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	228288740
258	NC_012624	TA	3	6	11993	11998	50 %	50 %	0 %	0 %	228288740
259	NC_012624	TAA	2	6	12030	12035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	228288740
260	NC_012624	TAG	2	6	12092	12097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	228288740
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267	NC_012624	TA	3	6	12239	12244	50 %	50 %	0 %	0 %	228288740
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396	NC_012624	TAA	2	6	18996	19001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	228288747
397	NC_012624	TTC	2	6	19055	19060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	228288747
398	NC_012624	ATTC	2	8	19113	19120	25 %	50 %	0 %	25 %	228288747
399	NC_012624	T	6	6	19138	19143	0 %	100 %	0 %	0 %	228288747
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403	NC_012624	ATA	2	6	19390	19395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	228288747
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405	NC_012624	CAC	2	6	19521	19526	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	228288747
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427	NC_012624	TTC	2	6	22281	22286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	228288748
428	NC_012624	TGT	2	6	22294	22299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	228288748
429	NC_012624	TCTT	2	8	22306	22313	0 %	75 %	0 %	25 %	228288748
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