MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sulfolobus islandicus Y.G.57.14 chromosome

Total Repeats: 50796

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012622	ACGT	2	8	478	485	25 %	25 %	25 %	25 %	229577819
2	NC_012622	TATT	2	8	524	531	25 %	75 %	0 %	0 %	229577819
3	NC_012622	TAT	2	6	535	540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229577819
4	NC_012622	TAT	2	6	577	582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229577819
5	NC_012622	ATT	2	6	618	623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229577819
6	NC_012622	GTT	2	6	638	643	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229577819
7	NC_012622	GTT	2	6	646	651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229577819
8	NC_012622	CTT	2	6	671	676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229577819
9	NC_012622	TTAC	2	8	699	706	25 %	50 %	0 %	25 %	229577819
10	NC_012622	GGT	2	6	865	870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229577820
11	NC_012622	A	6	6	885	890	100 %	0 %	0 %	0 %	229577820
12	NC_012622	AG	3	6	940	945	50 %	0 %	50 %	0 %	229577820
13	NC_012622	TGC	2	6	960	965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229577820
14	NC_012622	GTAA	2	8	1048	1055	50 %	25 %	25 %	0 %	229577820
15	NC_012622	GAG	2	6	1075	1080	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229577820
16	NC_012622	TGG	2	6	1143	1148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229577820
17	NC_012622	TAT	2	6	1163	1168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229577820
18	NC_012622	GATAA	2	10	1237	1246	60 %	20 %	20 %	0 %	229577820
19	NC_012622	ATA	2	6	1273	1278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229577820
20	NC_012622	AGAGG	2	10	1307	1316	40 %	0 %	60 %	0 %	229577820
21	NC_012622	AT	3	6	1358	1363	50 %	50 %	0 %	0 %	229577820
22	NC_012622	TTA	2	6	1367	1372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229577820
23	NC_012622	ATC	2	6	1422	1427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229577820
24	NC_012622	ACG	2	6	1457	1462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229577820
25	NC_012622	AAC	2	6	1466	1471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229577820
26	NC_012622	TAA	2	6	1508	1513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229577820
27	NC_012622	ATG	2	6	1523	1528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229577820
28	NC_012622	AGC	2	6	1608	1613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229577820
29	NC_012622	AGCT	2	8	1616	1623	25 %	25 %	25 %	25 %	229577820
30	NC_012622	TGG	2	6	1626	1631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229577820
31	NC_012622	G	6	6	1630	1635	0 %	0 %	100 %	0 %	229577820
32	NC_012622	AG	3	6	1683	1688	50 %	0 %	50 %	0 %	229577820
33	NC_012622	CCTT	2	8	1710	1717	0 %	50 %	0 %	50 %	229577820
34	NC_012622	AAG	2	6	1737	1742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229577820
35	NC_012622	AGA	2	6	1755	1760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229577820
36	NC_012622	TAA	2	6	1797	1802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229577820
37	NC_012622	CAAA	2	8	1806	1813	75 %	0 %	0 %	25 %	229577820
38	NC_012622	AGA	2	6	1828	1833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229577820
39	NC_012622	ATA	2	6	1843	1848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229577820
40	NC_012622	TGG	2	6	1905	1910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229577820
41	NC_012622	AAG	2	6	1915	1920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229577820
42	NC_012622	GTATTG	2	12	1982	1993	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	229577820
43	NC_012622	TGA	2	6	2004	2009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229577820
44	NC_012622	AGA	2	6	2032	2037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229577821
45	NC_012622	AGA	2	6	2086	2091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229577821
46	NC_012622	CTA	2	6	2137	2142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229577821
47	NC_012622	GGA	2	6	2158	2163	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229577821
48	NC_012622	AAG	2	6	2173	2178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229577821
49	NC_012622	AT	3	6	2182	2187	50 %	50 %	0 %	0 %	229577821
50	NC_012622	AAG	3	9	2239	2247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229577821
51	NC_012622	GAA	2	6	2267	2272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229577821
52	NC_012622	AAG	2	6	2273	2278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229577821
53	NC_012622	ATT	2	6	2288	2293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229577821
54	NC_012622	ATT	2	6	2309	2314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229577821
55	NC_012622	ATT	2	6	2319	2324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229577821
56	NC_012622	ATA	2	6	2408	2413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229577822
57	NC_012622	TAT	2	6	2464	2469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229577822
58	NC_012622	TAA	2	6	2499	2504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229577822
59	NC_012622	TAA	2	6	2508	2513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229577822
60	NC_012622	TA	3	6	2519	2524	50 %	50 %	0 %	0 %	229577822
61	NC_012622	TAGG	2	8	2562	2569	25 %	25 %	50 %	0 %	229577822
62	NC_012622	AGA	2	6	2578	2583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229577822
63	NC_012622	CTTT	2	8	2660	2667	0 %	75 %	0 %	25 %	229577822
64	NC_012622	AGC	2	6	2680	2685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229577822
65	NC_012622	ATT	2	6	2712	2717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229577822
66	NC_012622	GAT	2	6	2819	2824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229577822
67	NC_012622	TAA	2	6	2826	2831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229577822
68	NC_012622	TGC	2	6	2866	2871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229577822
69	NC_012622	AAT	2	6	2872	2877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229577822
70	NC_012622	TGC	2	6	2884	2889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229577822
71	NC_012622	GCA	2	6	2972	2977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229577822
72	NC_012622	TGAT	2	8	2985	2992	25 %	50 %	25 %	0 %	229577822
73	NC_012622	TA	3	6	3065	3070	50 %	50 %	0 %	0 %	229577822
74	NC_012622	TAC	2	6	3075	3080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229577822
75	NC_012622	AATTGC	2	12	3082	3093	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	229577822
76	NC_012622	ATA	2	6	3128	3133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229577822
77	NC_012622	GGTT	2	8	3322	3329	0 %	50 %	50 %	0 %	229577823
78	NC_012622	GAA	2	6	3345	3350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229577823
79	NC_012622	AAG	2	6	3355	3360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229577823
80	NC_012622	TTTAAG	2	12	3364	3375	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	229577823
81	NC_012622	CAAT	2	8	3385	3392	50 %	25 %	0 %	25 %	229577823
82	NC_012622	ATC	3	9	3434	3442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229577823
83	NC_012622	TAT	2	6	3457	3462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229577823
84	NC_012622	AAC	2	6	3483	3488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229577823
85	NC_012622	GGA	2	6	3499	3504	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229577823
86	NC_012622	TGA	2	6	3540	3545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229577823
87	NC_012622	AAG	2	6	3646	3651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229577824
88	NC_012622	AGAA	2	8	3654	3661	75 %	0 %	25 %	0 %	229577824
89	NC_012622	CCA	2	6	3678	3683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229577824
90	NC_012622	TTTA	2	8	3695	3702	25 %	75 %	0 %	0 %	229577824
91	NC_012622	TCC	2	6	3810	3815	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229577824
92	NC_012622	TCCTT	2	10	3842	3851	0 %	60 %	0 %	40 %	229577824
93	NC_012622	TTA	2	6	3868	3873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229577824
94	NC_012622	ACTA	2	8	3920	3927	50 %	25 %	0 %	25 %	229577824
95	NC_012622	TTG	2	6	3937	3942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229577824
96	NC_012622	TAT	3	9	3953	3961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229577824
97	NC_012622	T	6	6	3961	3966	0 %	100 %	0 %	0 %	229577824
98	NC_012622	A	6	6	3975	3980	100 %	0 %	0 %	0 %	229577824
99	NC_012622	TAA	2	6	4044	4049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229577824
100	NC_012622	TAG	2	6	4065	4070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229577824
101	NC_012622	A	6	6	4071	4076	100 %	0 %	0 %	0 %	229577824
102	NC_012622	CGTTA	2	10	4085	4094	20 %	40 %	20 %	20 %	229577824
103	NC_012622	T	6	6	4141	4146	0 %	100 %	0 %	0 %	229577824
104	NC_012622	TCC	2	6	4158	4163	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229577824
105	NC_012622	CTT	2	6	4203	4208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229577824
106	NC_012622	CATT	2	8	4220	4227	25 %	50 %	0 %	25 %	229577824
107	NC_012622	TC	3	6	4273	4278	0 %	50 %	0 %	50 %	229577825
108	NC_012622	TC	3	6	4309	4314	0 %	50 %	0 %	50 %	229577825
109	NC_012622	CCTCTG	2	12	4500	4511	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	229577825
110	NC_012622	CTGTG	2	10	4516	4525	0 %	40 %	40 %	20 %	229577825
111	NC_012622	AAG	2	6	4532	4537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229577825
112	NC_012622	CCA	2	6	4602	4607	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229577825
113	NC_012622	GTAAT	2	10	4662	4671	40 %	40 %	20 %	0 %	229577825
114	NC_012622	AAT	2	6	4704	4709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229577825
115	NC_012622	GTTTT	2	10	4736	4745	0 %	80 %	20 %	0 %	229577825
116	NC_012622	TC	3	6	4779	4784	0 %	50 %	0 %	50 %	229577825
117	NC_012622	AGG	2	6	4787	4792	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229577825
118	NC_012622	TCT	2	6	4946	4951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229577826
119	NC_012622	TACG	2	8	4984	4991	25 %	25 %	25 %	25 %	229577826
120	NC_012622	TA	3	6	4998	5003	50 %	50 %	0 %	0 %	229577826
121	NC_012622	ATTGAT	2	12	5008	5019	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	229577826
122	NC_012622	CTT	2	6	5043	5048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229577826
123	NC_012622	TAA	2	6	5050	5055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229577826
124	NC_012622	CTAAA	2	10	5079	5088	60 %	20 %	0 %	20 %	229577826
125	NC_012622	CCT	2	6	5145	5150	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229577826
126	NC_012622	CAT	2	6	5247	5252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229577826
127	NC_012622	CTTAT	2	10	5285	5294	20 %	60 %	0 %	20 %	229577826
128	NC_012622	AT	3	6	5293	5298	50 %	50 %	0 %	0 %	229577826
129	NC_012622	TCT	2	6	5312	5317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229577826
130	NC_012622	TAGTCT	2	12	5319	5330	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	229577826
131	NC_012622	TAAA	2	8	5362	5369	75 %	25 %	0 %	0 %	229577826
132	NC_012622	ATC	2	6	5404	5409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229577826
133	NC_012622	CTT	2	6	5502	5507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229577826
134	NC_012622	TAA	2	6	5590	5595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229577826
135	NC_012622	AT	3	6	5667	5672	50 %	50 %	0 %	0 %	229577826
136	NC_012622	TCA	2	6	6231	6236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229577827
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138	NC_012622	ATC	2	6	6326	6331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229577827
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145	NC_012622	TCT	2	6	6693	6698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229577827
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149	NC_012622	TCA	2	6	6843	6848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229577827
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157	NC_012622	TC	3	6	7200	7205	0 %	50 %	0 %	50 %	229577828
158	NC_012622	TCC	2	6	7210	7215	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229577828
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162	NC_012622	T	6	6	7309	7314	0 %	100 %	0 %	0 %	229577828
163	NC_012622	CTG	2	6	7320	7325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229577828
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166	NC_012622	CT	3	6	7370	7375	0 %	50 %	0 %	50 %	229577829
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248	NC_012622	AGTT	2	8	10914	10921	25 %	50 %	25 %	0 %	229577832
249	NC_012622	CT	3	6	10938	10943	0 %	50 %	0 %	50 %	229577832
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251	NC_012622	TAT	2	6	11106	11111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229577833
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258	NC_012622	CT	3	6	11461	11466	0 %	50 %	0 %	50 %	229577833
259	NC_012622	ATTT	2	8	11501	11508	25 %	75 %	0 %	0 %	229577833
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263	NC_012622	TTC	2	6	11689	11694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229577834
264	NC_012622	CCT	2	6	11700	11705	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229577834
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266	NC_012622	ATT	2	6	11815	11820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229577834
267	NC_012622	CTTA	2	8	11836	11843	25 %	50 %	0 %	25 %	229577834
268	NC_012622	ATG	2	6	11844	11849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229577834
269	NC_012622	CTA	2	6	11859	11864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229577834
270	NC_012622	AAT	2	6	11927	11932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229577834
271	NC_012622	GTA	2	6	11969	11974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229577834
272	NC_012622	AGTA	3	12	11971	11982	50 %	25 %	25 %	0 %	229577834
273	NC_012622	AT	3	6	12137	12142	50 %	50 %	0 %	0 %	229577834
274	NC_012622	TCC	2	6	12182	12187	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229577834
275	NC_012622	TC	3	6	12222	12227	0 %	50 %	0 %	50 %	229577834
276	NC_012622	TAA	2	6	12229	12234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229577834
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278	NC_012622	TTC	2	6	12334	12339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229577834
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280	NC_012622	TTTA	2	8	12463	12470	25 %	75 %	0 %	0 %	229577834
281	NC_012622	CAC	2	6	12486	12491	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229577834
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293	NC_012622	AAGT	2	8	12785	12792	50 %	25 %	25 %	0 %	229577834
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310	NC_012622	AT	3	6	13454	13459	50 %	50 %	0 %	0 %	229577834
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391	NC_012622	TTC	2	6	18189	18194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229577838
392	NC_012622	CTATTC	2	12	18255	18266	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	229577838
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395	NC_012622	AAT	2	6	18412	18417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229577838
396	NC_012622	TAT	2	6	18423	18428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229577838
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400	NC_012622	TGG	2	6	18516	18521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229577838
401	NC_012622	CAA	2	6	18560	18565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229577838
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403	NC_012622	TTC	2	6	18593	18598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229577838
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