MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sinorhizobium fredii NGR234 chromosome

Total Repeats: 84121

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012587	GGTC	2	8	252	259	0 %	25 %	50 %	25 %	227820588
2	NC_012587	CGT	2	6	315	320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227820588
3	NC_012587	CGA	2	6	335	340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227820588
4	NC_012587	CAA	2	6	360	365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227820588
5	NC_012587	CAG	2	6	397	402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227820588
6	NC_012587	CGG	2	6	464	469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227820588
7	NC_012587	TGC	2	6	486	491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227820588
8	NC_012587	CGG	3	9	503	511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227820588
9	NC_012587	CCG	2	6	522	527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227820588
10	NC_012587	CGC	2	6	549	554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227820588
11	NC_012587	GCC	3	9	556	564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227820588
12	NC_012587	CGC	2	6	611	616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227820588
13	NC_012587	TCG	2	6	644	649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227820588
14	NC_012587	GCC	2	6	676	681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227820588
15	NC_012587	GCCGGC	2	12	700	711	0 %	0 %	50 %	50 %	227820588
16	NC_012587	TTCA	2	8	733	740	25 %	50 %	0 %	25 %	227820588
17	NC_012587	CTG	2	6	769	774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227820588
18	NC_012587	TGC	2	6	789	794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227820588
19	NC_012587	CG	3	6	815	820	0 %	0 %	50 %	50 %	227820588
20	NC_012587	ACG	2	6	878	883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227820588
21	NC_012587	TCT	2	6	918	923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227820588
22	NC_012587	CGA	2	6	930	935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227820588
23	NC_012587	TGC	2	6	992	997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227820588
24	NC_012587	GGT	2	6	1014	1019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227820588
25	NC_012587	GGC	2	6	1023	1028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227820588
26	NC_012587	CGTT	2	8	1068	1075	0 %	50 %	25 %	25 %	227820588
27	NC_012587	GCG	2	6	1088	1093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227820588
28	NC_012587	GCC	2	6	1148	1153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227820588
29	NC_012587	GAC	2	6	1171	1176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227820588
30	NC_012587	CTCG	2	8	1179	1186	0 %	25 %	25 %	50 %	227820588
31	NC_012587	TC	3	6	1203	1208	0 %	50 %	0 %	50 %	227820588
32	NC_012587	CGA	2	6	1314	1319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227820588
33	NC_012587	CCGCG	2	10	1351	1360	0 %	0 %	40 %	60 %	227820588
34	NC_012587	CCG	2	6	1431	1436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227820588
35	NC_012587	CGC	2	6	1493	1498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227820588
36	NC_012587	CGC	2	6	1519	1524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227820588
37	NC_012587	CGG	2	6	1527	1532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227820588
38	NC_012587	ACG	2	6	1543	1548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227820588
39	NC_012587	GAG	2	6	1573	1578	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227820588
40	NC_012587	GCT	2	6	1617	1622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227820588
41	NC_012587	CCG	2	6	1895	1900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227820589
42	NC_012587	CGA	2	6	1955	1960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227820589
43	NC_012587	CCG	2	6	1961	1966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227820589
44	NC_012587	CGA	2	6	1967	1972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227820589
45	NC_012587	CGT	2	6	1998	2003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227820589
46	NC_012587	CGA	2	6	2073	2078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227820589
47	NC_012587	GCC	2	6	2107	2112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227820589
48	NC_012587	CTG	2	6	2241	2246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227820590
49	NC_012587	GGA	2	6	2273	2278	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227820590
50	NC_012587	AGG	2	6	2287	2292	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227820590
51	NC_012587	GCC	2	6	2330	2335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227820590
52	NC_012587	TCG	2	6	2362	2367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227820590
53	NC_012587	GCG	2	6	2393	2398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227820590
54	NC_012587	CG	3	6	2404	2409	0 %	0 %	50 %	50 %	227820590
55	NC_012587	GCC	2	6	2420	2425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227820590
56	NC_012587	GCT	2	6	2432	2437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227820590
57	NC_012587	CGA	2	6	2498	2503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227820590
58	NC_012587	GCT	2	6	2513	2518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227820590
59	NC_012587	GCA	2	6	2527	2532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227820590
60	NC_012587	CAG	2	6	2553	2558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227820590
61	NC_012587	CCTT	2	8	2614	2621	0 %	50 %	0 %	50 %	227820590
62	NC_012587	GGC	2	6	2630	2635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227820590
63	NC_012587	AGC	2	6	2641	2646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227820590
64	NC_012587	CGG	2	6	2674	2679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227820590
65	NC_012587	GC	3	6	2714	2719	0 %	0 %	50 %	50 %	227820590
66	NC_012587	CGG	2	6	2731	2736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227820590
67	NC_012587	ATG	2	6	2742	2747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227820590
68	NC_012587	ATCT	2	8	2748	2755	25 %	50 %	0 %	25 %	227820590
69	NC_012587	CCG	2	6	2803	2808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227820590
70	NC_012587	CGA	2	6	2816	2821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227820590
71	NC_012587	GCT	3	9	2840	2848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227820590
72	NC_012587	CGG	2	6	2860	2865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227820590
73	NC_012587	GC	4	8	2916	2923	0 %	0 %	50 %	50 %	227820590
74	NC_012587	GAT	2	6	2990	2995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227820590
75	NC_012587	GAT	2	6	3011	3016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227820590
76	NC_012587	CCG	2	6	3035	3040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227820590
77	NC_012587	GGC	2	6	3062	3067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227820590
78	NC_012587	TGCA	2	8	3079	3086	25 %	25 %	25 %	25 %	227820590
79	NC_012587	GGA	2	6	3116	3121	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227820590
80	NC_012587	GCT	2	6	3128	3133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227820590
81	NC_012587	CGT	2	6	3167	3172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227820590
82	NC_012587	GGCCGT	2	12	3185	3196	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	227820590
83	NC_012587	GGC	2	6	3218	3223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227820590
84	NC_012587	CTATTT	2	12	3263	3274	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	227820590
85	NC_012587	GCG	2	6	3286	3291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227820590
86	NC_012587	GC	3	6	3324	3329	0 %	0 %	50 %	50 %	227820590
87	NC_012587	CCA	2	6	3358	3363	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227820590
88	NC_012587	GCG	2	6	3366	3371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227820590
89	NC_012587	GCC	2	6	3375	3380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227820590
90	NC_012587	AGC	2	6	3391	3396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227820590
91	NC_012587	ACC	2	6	3400	3405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227820590
92	NC_012587	AGGC	2	8	3415	3422	25 %	0 %	50 %	25 %	227820590
93	NC_012587	A	6	6	3451	3456	100 %	0 %	0 %	0 %	227820590
94	NC_012587	GCA	2	6	3533	3538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227820591
95	NC_012587	CGA	2	6	3556	3561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227820591
96	NC_012587	CG	3	6	3597	3602	0 %	0 %	50 %	50 %	227820591
97	NC_012587	GGC	2	6	3701	3706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227820591
98	NC_012587	TGA	2	6	3795	3800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227820591
99	NC_012587	GAG	3	9	3866	3874	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227820591
100	NC_012587	GGC	2	6	3875	3880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227820591
101	NC_012587	CCGC	2	8	3894	3901	0 %	0 %	25 %	75 %	227820591
102	NC_012587	CGC	2	6	3985	3990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227820591
103	NC_012587	TCG	2	6	3993	3998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227820591
104	NC_012587	CCA	2	6	4028	4033	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227820592
105	NC_012587	GGC	2	6	4065	4070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227820592
106	NC_012587	GCG	2	6	4095	4100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227820592
107	NC_012587	CCG	2	6	4162	4167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227820592
108	NC_012587	CGG	2	6	4191	4196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227820592
109	NC_012587	CGG	2	6	4266	4271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227820592
110	NC_012587	TC	3	6	4302	4307	0 %	50 %	0 %	50 %	227820592
111	NC_012587	CCA	2	6	4395	4400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227820592
112	NC_012587	GGC	2	6	4440	4445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227820592
113	NC_012587	GATC	2	8	4446	4453	25 %	25 %	25 %	25 %	227820592
114	NC_012587	CCG	2	6	4495	4500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227820592
115	NC_012587	GAG	2	6	4582	4587	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227820592
116	NC_012587	CGG	2	6	4644	4649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227820592
117	NC_012587	GCC	2	6	4698	4703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227820592
118	NC_012587	TCG	2	6	4727	4732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227820592
119	NC_012587	ACG	2	6	4733	4738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227820592
120	NC_012587	TGG	2	6	4747	4752	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227820592
121	NC_012587	CGA	2	6	4781	4786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227820592
122	NC_012587	GAA	2	6	4872	4877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227820592
123	NC_012587	CTA	2	6	5028	5033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227820593
124	NC_012587	GTC	2	6	5107	5112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227820593
125	NC_012587	CAC	2	6	5113	5118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227820593
126	NC_012587	GAC	2	6	5143	5148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227820593
127	NC_012587	CTG	2	6	5185	5190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227820593
128	NC_012587	GCCGA	2	10	5200	5209	20 %	0 %	40 %	40 %	227820593
129	NC_012587	GGCG	2	8	5294	5301	0 %	0 %	75 %	25 %	227820593
130	NC_012587	CGC	2	6	5368	5373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227820593
131	NC_012587	GAAGA	2	10	5413	5422	60 %	0 %	40 %	0 %	227820593
132	NC_012587	ACG	2	6	5449	5454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227820593
133	NC_012587	TTC	2	6	5456	5461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227820593
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137	NC_012587	GCAGC	2	10	5933	5942	20 %	0 %	40 %	40 %	227820594
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140	NC_012587	CGA	2	6	6142	6147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227820594
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150	NC_012587	CGCC	2	8	6679	6686	0 %	0 %	25 %	75 %	227820594
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153	NC_012587	GAAG	2	8	6898	6905	50 %	0 %	50 %	0 %	227820594
154	NC_012587	GCG	2	6	6906	6911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227820594
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255	NC_012587	GCGCA	2	10	12357	12366	20 %	0 %	40 %	40 %	227820600
256	NC_012587	GGCC	2	8	12373	12380	0 %	0 %	50 %	50 %	227820600
257	NC_012587	GC	3	6	12427	12432	0 %	0 %	50 %	50 %	227820600
258	NC_012587	GACG	2	8	12439	12446	25 %	0 %	50 %	25 %	227820600
259	NC_012587	ACC	2	6	12482	12487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227820600
260	NC_012587	CCG	2	6	12517	12522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227820601
261	NC_012587	CGA	2	6	12535	12540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227820601
262	NC_012587	GTGC	2	8	12545	12552	0 %	25 %	50 %	25 %	227820601
263	NC_012587	TCG	2	6	12570	12575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227820601
264	NC_012587	CTG	2	6	12629	12634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227820601
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266	NC_012587	CGC	2	6	12644	12649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227820601
267	NC_012587	CGA	2	6	12682	12687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227820601
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291	NC_012587	GGA	2	6	13783	13788	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227820602
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382	NC_012587	TGT	2	6	17723	17728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227820606
383	NC_012587	TCG	2	6	17768	17773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227820606
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385	NC_012587	CGT	3	9	17820	17828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227820606
386	NC_012587	CGG	2	6	18002	18007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227820606
387	NC_012587	GATC	2	8	18178	18185	25 %	25 %	25 %	25 %	227820607
388	NC_012587	ATT	2	6	18277	18282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227820607
389	NC_012587	TGA	2	6	18411	18416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227820607
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392	NC_012587	GCCG	2	8	18610	18617	0 %	0 %	50 %	50 %	227820607
393	NC_012587	CG	3	6	18650	18655	0 %	0 %	50 %	50 %	227820607
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498	NC_012587	GC	3	6	23478	23483	0 %	0 %	50 %	50 %	227820613
499	NC_012587	GC	3	6	23486	23491	0 %	0 %	50 %	50 %	227820613
500	NC_012587	CAT	2	6	23542	23547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227820613

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