MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sinorhizobium fredii NGR234 plasmid pNGR234b

Total Repeats: 49917

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012586	ATG	2	6	242	247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227818259
2	NC_012586	CCCT	2	8	290	297	0 %	25 %	0 %	75 %	227818259
3	NC_012586	AGA	2	6	345	350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227818259
4	NC_012586	TCT	2	6	354	359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227818259
5	NC_012586	AGA	2	6	372	377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227818259
6	NC_012586	CGG	2	6	396	401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227818259
7	NC_012586	GGC	2	6	403	408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227818259
8	NC_012586	CGGC	2	8	484	491	0 %	0 %	50 %	50 %	227818259
9	NC_012586	CGAA	2	8	514	521	50 %	0 %	25 %	25 %	227818259
10	NC_012586	CCG	2	6	523	528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227818259
11	NC_012586	CGA	2	6	535	540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227818259
12	NC_012586	CCG	2	6	571	576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227818259
13	NC_012586	TGA	2	6	606	611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227818259
14	NC_012586	GGGT	2	8	619	626	0 %	25 %	75 %	0 %	227818259
15	NC_012586	GAC	3	9	634	642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227818259
16	NC_012586	CGAT	2	8	693	700	25 %	25 %	25 %	25 %	227818259
17	NC_012586	CGG	2	6	910	915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227818259
18	NC_012586	CG	3	6	937	942	0 %	0 %	50 %	50 %	227818259
19	NC_012586	TCG	2	6	984	989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818259
20	NC_012586	CGC	2	6	1002	1007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227818259
21	NC_012586	CCAC	2	8	1066	1073	25 %	0 %	0 %	75 %	227818259
22	NC_012586	ATGTC	2	10	1083	1092	20 %	40 %	20 %	20 %	227818259
23	NC_012586	CGT	2	6	1132	1137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818259
24	NC_012586	CGG	2	6	1147	1152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227818259
25	NC_012586	TGC	2	6	1260	1265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818259
26	NC_012586	GAT	2	6	1411	1416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227818259
27	NC_012586	GAAG	2	8	1431	1438	50 %	0 %	50 %	0 %	227818259
28	NC_012586	GCT	2	6	1484	1489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818260
29	NC_012586	CGGC	2	8	1505	1512	0 %	0 %	50 %	50 %	227818260
30	NC_012586	CGG	2	6	1567	1572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227818260
31	NC_012586	GAG	2	6	1619	1624	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227818260
32	NC_012586	TCA	2	6	1692	1697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227818260
33	NC_012586	ACA	2	6	1762	1767	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227818260
34	NC_012586	GGC	2	6	1833	1838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227818260
35	NC_012586	GGC	2	6	1840	1845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227818260
36	NC_012586	CGG	2	6	1858	1863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227818260
37	NC_012586	CGA	2	6	1894	1899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227818260
38	NC_012586	AAC	2	6	1928	1933	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227818260
39	NC_012586	TC	3	6	1945	1950	0 %	50 %	0 %	50 %	227818260
40	NC_012586	CAT	2	6	2011	2016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227818260
41	NC_012586	GGC	2	6	2038	2043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227818260
42	NC_012586	GAT	2	6	2053	2058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227818260
43	NC_012586	CGT	2	6	2062	2067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818260
44	NC_012586	GCC	2	6	2070	2075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227818260
45	NC_012586	ATC	2	6	2087	2092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227818260
46	NC_012586	CCT	2	6	2112	2117	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227818260
47	NC_012586	GCC	2	6	2121	2126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227818260
48	NC_012586	TGGA	2	8	2132	2139	25 %	25 %	50 %	0 %	227818260
49	NC_012586	GACG	2	8	2162	2169	25 %	0 %	50 %	25 %	227818260
50	NC_012586	TCG	2	6	2247	2252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818260
51	NC_012586	GGGC	2	8	2270	2277	0 %	0 %	75 %	25 %	227818260
52	NC_012586	CTGG	2	8	2290	2297	0 %	25 %	50 %	25 %	227818260
53	NC_012586	GAC	2	6	2344	2349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227818260
54	NC_012586	GGC	3	9	2365	2373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227818260
55	NC_012586	TC	3	6	2411	2416	0 %	50 %	0 %	50 %	227818260
56	NC_012586	GAC	2	6	2623	2628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227818261
57	NC_012586	CCG	2	6	2693	2698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227818261
58	NC_012586	GTCG	2	8	2704	2711	0 %	25 %	50 %	25 %	227818261
59	NC_012586	TCGC	2	8	2770	2777	0 %	25 %	25 %	50 %	227818261
60	NC_012586	TCG	2	6	2841	2846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818261
61	NC_012586	TTCGC	2	10	2869	2878	0 %	40 %	20 %	40 %	227818261
62	NC_012586	GCC	2	6	2907	2912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227818261
63	NC_012586	GCCT	2	8	2918	2925	0 %	25 %	25 %	50 %	227818261
64	NC_012586	CGC	2	6	2948	2953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227818261
65	NC_012586	GGC	2	6	3061	3066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227818261
66	NC_012586	GCC	2	6	3080	3085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227818261
67	NC_012586	AGC	2	6	3090	3095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227818261
68	NC_012586	GCT	2	6	3148	3153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818261
69	NC_012586	CTC	2	6	3266	3271	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227818261
70	NC_012586	AGC	2	6	3294	3299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227818261
71	NC_012586	A	6	6	3333	3338	100 %	0 %	0 %	0 %	227818261
72	NC_012586	CCA	2	6	3342	3347	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227818261
73	NC_012586	GAT	2	6	3446	3451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227818261
74	NC_012586	GCCG	2	8	3470	3477	0 %	0 %	50 %	50 %	227818261
75	NC_012586	TCA	2	6	3490	3495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227818261
76	NC_012586	CCCCG	2	10	3541	3550	0 %	0 %	20 %	80 %	227818261
77	NC_012586	CGC	2	6	3566	3571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227818261
78	NC_012586	TTC	2	6	3591	3596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227818261
79	NC_012586	TGA	2	6	3657	3662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227818261
80	NC_012586	GTG	2	6	3674	3679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227818261
81	NC_012586	GGC	2	6	3800	3805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227818261
82	NC_012586	GCA	2	6	3835	3840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227818261
83	NC_012586	AGG	2	6	3884	3889	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227818261
84	NC_012586	CAT	2	6	4207	4212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227818262
85	NC_012586	CGG	2	6	4216	4221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227818262
86	NC_012586	CCA	2	6	4224	4229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227818262
87	NC_012586	GCAG	3	12	4257	4268	25 %	0 %	50 %	25 %	227818262
88	NC_012586	CGA	2	6	4294	4299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227818262
89	NC_012586	GAA	2	6	4396	4401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227818262
90	NC_012586	CTG	2	6	4436	4441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818262
91	NC_012586	GAG	2	6	4454	4459	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227818262
92	NC_012586	CGT	2	6	4462	4467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818262
93	NC_012586	TC	3	6	4492	4497	0 %	50 %	0 %	50 %	227818262
94	NC_012586	TCT	2	6	4506	4511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227818262
95	NC_012586	TTC	2	6	4559	4564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227818262
96	NC_012586	GCA	2	6	4634	4639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227818262
97	NC_012586	GAC	2	6	4645	4650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227818262
98	NC_012586	CGC	2	6	4694	4699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227818262
99	NC_012586	GAG	2	6	4724	4729	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227818262
100	NC_012586	ACCG	2	8	4822	4829	25 %	0 %	25 %	50 %	227818262
101	NC_012586	CTT	2	6	4879	4884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227818262
102	NC_012586	GCT	2	6	4975	4980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818262
103	NC_012586	CGA	2	6	4981	4986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227818262
104	NC_012586	TTG	2	6	5008	5013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227818262
105	NC_012586	GCTG	2	8	5022	5029	0 %	25 %	50 %	25 %	227818262
106	NC_012586	ACG	2	6	5045	5050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227818262
107	NC_012586	GC	3	6	5063	5068	0 %	0 %	50 %	50 %	227818262
108	NC_012586	TCA	2	6	5073	5078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227818262
109	NC_012586	CGC	2	6	5113	5118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227818262
110	NC_012586	TCA	3	9	5145	5153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227818262
111	NC_012586	GCA	2	6	5154	5159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227818262
112	NC_012586	GCC	2	6	5171	5176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227818262
113	NC_012586	ACG	2	6	5190	5195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227818262
114	NC_012586	GAC	2	6	5258	5263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227818262
115	NC_012586	GC	3	6	5289	5294	0 %	0 %	50 %	50 %	227818262
116	NC_012586	TTG	2	6	5438	5443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227818263
117	NC_012586	GTC	2	6	5485	5490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818263
118	NC_012586	TTC	2	6	5569	5574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227818263
119	NC_012586	T	6	6	5596	5601	0 %	100 %	0 %	0 %	227818263
120	NC_012586	CGG	2	6	5649	5654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227818263
121	NC_012586	GCAC	2	8	5671	5678	25 %	0 %	25 %	50 %	227818263
122	NC_012586	GGC	2	6	5727	5732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227818263
123	NC_012586	TTC	2	6	5758	5763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227818263
124	NC_012586	GCT	2	6	5814	5819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818263
125	NC_012586	TTTC	2	8	5834	5841	0 %	75 %	0 %	25 %	227818263
126	NC_012586	GCC	2	6	5845	5850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227818263
127	NC_012586	TGA	2	6	5903	5908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227818263
128	NC_012586	AGGATC	2	12	5972	5983	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	227818263
129	NC_012586	TGC	2	6	6033	6038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818263
130	NC_012586	CCT	2	6	6173	6178	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227818263
131	NC_012586	ATC	2	6	6196	6201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227818263
132	NC_012586	CGT	2	6	6225	6230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818263
133	NC_012586	TCT	2	6	6260	6265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227818263
134	NC_012586	GCG	2	6	6272	6277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227818263
135	NC_012586	CG	3	6	6311	6316	0 %	0 %	50 %	50 %	227818263
136	NC_012586	GGA	2	6	6324	6329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227818263
137	NC_012586	ATC	2	6	6350	6355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227818263
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139	NC_012586	TC	4	8	7052	7059	0 %	50 %	0 %	50 %	227818264
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144	NC_012586	CGGC	2	8	7186	7193	0 %	0 %	50 %	50 %	227818264
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255	NC_012586	CG	3	6	12316	12321	0 %	0 %	50 %	50 %	227818268
256	NC_012586	CCG	2	6	12382	12387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227818268
257	NC_012586	CGGC	2	8	12643	12650	0 %	0 %	50 %	50 %	227818268
258	NC_012586	GCC	2	6	12725	12730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227818268
259	NC_012586	GCA	2	6	12796	12801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227818269
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261	NC_012586	CGT	2	6	12818	12823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227818269
262	NC_012586	CG	3	6	12829	12834	0 %	0 %	50 %	50 %	227818269
263	NC_012586	CGG	2	6	12853	12858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227818269
264	NC_012586	GC	3	6	12944	12949	0 %	0 %	50 %	50 %	227818269
265	NC_012586	CAGGG	2	10	13103	13112	20 %	0 %	60 %	20 %	227818269
266	NC_012586	AGCGC	2	10	13189	13198	20 %	0 %	40 %	40 %	227818269
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273	NC_012586	GAC	2	6	13649	13654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227818269
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285	NC_012586	CCTG	2	8	14136	14143	0 %	25 %	25 %	50 %	227818270
286	NC_012586	GGT	2	6	14182	14187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227818270
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383	NC_012586	CGG	2	6	17770	17775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227818274
384	NC_012586	ATCC	2	8	17788	17795	25 %	25 %	0 %	50 %	227818274
385	NC_012586	AAGG	2	8	17796	17803	50 %	0 %	50 %	0 %	227818274
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499	NC_012586	GAC	2	6	22861	22866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227818278
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