MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus equi subsp. equi 4047

Total Repeats: 38017

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
37001	NC_012471	TGCTA	2	10	2195107	2195116	20 %	40 %	20 %	20 %	225871439
37002	NC_012471	TGA	2	6	2195124	2195129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225871439
37003	NC_012471	T	7	7	2195232	2195238	0 %	100 %	0 %	0 %	225871439
37004	NC_012471	CAA	2	6	2195266	2195271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225871439
37005	NC_012471	AG	3	6	2195300	2195305	50 %	0 %	50 %	0 %	225871439
37006	NC_012471	ATT	2	6	2195345	2195350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225871439
37007	NC_012471	A	7	7	2195357	2195363	100 %	0 %	0 %	0 %	225871439
37008	NC_012471	A	6	6	2195389	2195394	100 %	0 %	0 %	0 %	225871439
37009	NC_012471	GCT	2	6	2195396	2195401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871439
37010	NC_012471	TGA	2	6	2195413	2195418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225871439
37011	NC_012471	AG	3	6	2195435	2195440	50 %	0 %	50 %	0 %	225871439
37012	NC_012471	TGA	2	6	2195463	2195468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225871439
37013	NC_012471	A	8	8	2195520	2195527	100 %	0 %	0 %	0 %	225871439
37014	NC_012471	TAA	2	6	2195587	2195592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225871439
37015	NC_012471	TAA	2	6	2195623	2195628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225871439
37016	NC_012471	TTC	2	6	2195634	2195639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225871439
37017	NC_012471	TTG	2	6	2195703	2195708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225871439
37018	NC_012471	CAGA	2	8	2195735	2195742	50 %	0 %	25 %	25 %	225871439
37019	NC_012471	GGT	2	6	2195792	2195797	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225871439
37020	NC_012471	TTG	2	6	2195805	2195810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225871439
37021	NC_012471	GAC	2	6	2195883	2195888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871439
37022	NC_012471	A	6	6	2195924	2195929	100 %	0 %	0 %	0 %	225871440
37023	NC_012471	ATT	2	6	2196015	2196020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225871440
37024	NC_012471	CAG	2	6	2196069	2196074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871440
37025	NC_012471	TGC	2	6	2196127	2196132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871440
37026	NC_012471	TTC	2	6	2196166	2196171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225871440
37027	NC_012471	ACG	2	6	2196187	2196192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871440
37028	NC_012471	AATT	2	8	2196193	2196200	50 %	50 %	0 %	0 %	225871440
37029	NC_012471	TGC	2	6	2196250	2196255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871440
37030	NC_012471	GAA	2	6	2196261	2196266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225871440
37031	NC_012471	CGAA	2	8	2196325	2196332	50 %	0 %	25 %	25 %	225871440
37032	NC_012471	A	6	6	2196331	2196336	100 %	0 %	0 %	0 %	225871440
37033	NC_012471	CAG	2	6	2196356	2196361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871440
37034	NC_012471	AT	3	6	2196388	2196393	50 %	50 %	0 %	0 %	225871440
37035	NC_012471	GT	3	6	2196696	2196701	0 %	50 %	50 %	0 %	225871441
37036	NC_012471	AAAT	2	8	2196706	2196713	75 %	25 %	0 %	0 %	225871441
37037	NC_012471	AGC	2	6	2196772	2196777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871441
37038	NC_012471	TTTA	2	8	2196819	2196826	25 %	75 %	0 %	0 %	225871441
37039	NC_012471	CAGG	2	8	2196846	2196853	25 %	0 %	50 %	25 %	225871441
37040	NC_012471	TTG	2	6	2196885	2196890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225871441
37041	NC_012471	A	6	6	2196894	2196899	100 %	0 %	0 %	0 %	225871441
37042	NC_012471	ACA	2	6	2196996	2197001	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225871441
37043	NC_012471	ATC	2	6	2197035	2197040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871441
37044	NC_012471	CAT	2	6	2197055	2197060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871441
37045	NC_012471	T	6	6	2197113	2197118	0 %	100 %	0 %	0 %	225871441
37046	NC_012471	TAA	2	6	2197126	2197131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225871441
37047	NC_012471	AGC	2	6	2197181	2197186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871441
37048	NC_012471	TTA	2	6	2197193	2197198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225871441
37049	NC_012471	ATT	2	6	2197208	2197213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225871441
37050	NC_012471	TGA	2	6	2197249	2197254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225871441
37051	NC_012471	AGA	2	6	2197262	2197267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225871441
37052	NC_012471	AC	3	6	2197419	2197424	50 %	0 %	0 %	50 %	225871441
37053	NC_012471	TAA	2	6	2197493	2197498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225871441
37054	NC_012471	GCTTT	2	10	2197940	2197949	0 %	60 %	20 %	20 %	225871442
37055	NC_012471	TGT	3	9	2197958	2197966	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225871442
37056	NC_012471	A	6	6	2197970	2197975	100 %	0 %	0 %	0 %	225871442
37057	NC_012471	AAG	2	6	2198062	2198067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225871442
37058	NC_012471	CAT	2	6	2198073	2198078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871442
37059	NC_012471	A	6	6	2198137	2198142	100 %	0 %	0 %	0 %	225871442
37060	NC_012471	TGA	2	6	2198143	2198148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225871442
37061	NC_012471	AAT	2	6	2198280	2198285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225871442
37062	NC_012471	TGT	2	6	2198291	2198296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225871442
37063	NC_012471	TAAA	2	8	2198316	2198323	75 %	25 %	0 %	0 %	225871442
37064	NC_012471	GTT	2	6	2198334	2198339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225871442
37065	NC_012471	AGC	2	6	2198388	2198393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871442
37066	NC_012471	CTT	2	6	2198424	2198429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225871442
37067	NC_012471	ACG	2	6	2198466	2198471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871442
37068	NC_012471	AGC	2	6	2198478	2198483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871442
37069	NC_012471	ATCTC	2	10	2198486	2198495	20 %	40 %	0 %	40 %	225871442
37070	NC_012471	TCA	2	6	2198498	2198503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871442
37071	NC_012471	AATG	2	8	2198555	2198562	50 %	25 %	25 %	0 %	225871442
37072	NC_012471	CTC	2	6	2198589	2198594	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225871442
37073	NC_012471	CTTGA	2	10	2198652	2198661	20 %	40 %	20 %	20 %	225871442
37074	NC_012471	TAA	2	6	2198662	2198667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225871442
37075	NC_012471	AGG	2	6	2198701	2198706	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225871442
37076	NC_012471	CTT	2	6	2198720	2198725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225871442
37077	NC_012471	TC	3	6	2198732	2198737	0 %	50 %	0 %	50 %	225871442
37078	NC_012471	T	6	6	2198796	2198801	0 %	100 %	0 %	0 %	225871443
37079	NC_012471	TTC	2	6	2198864	2198869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225871443
37080	NC_012471	AG	3	6	2199000	2199005	50 %	0 %	50 %	0 %	225871443
37081	NC_012471	ACAG	2	8	2199006	2199013	50 %	0 %	25 %	25 %	225871443
37082	NC_012471	AAG	2	6	2199029	2199034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225871443
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37084	NC_012471	GGA	2	6	2199066	2199071	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225871443
37085	NC_012471	T	6	6	2199195	2199200	0 %	100 %	0 %	0 %	225871443
37086	NC_012471	AT	3	6	2199209	2199214	50 %	50 %	0 %	0 %	225871443
37087	NC_012471	ATC	2	6	2199224	2199229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871443
37088	NC_012471	GAT	2	6	2199712	2199717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225871444
37089	NC_012471	GGA	2	6	2199866	2199871	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225871444
37090	NC_012471	GCAA	2	8	2199881	2199888	50 %	0 %	25 %	25 %	225871444
37091	NC_012471	CGC	2	6	2200030	2200035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	225871444
37092	NC_012471	TTG	2	6	2200070	2200075	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225871444
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37094	NC_012471	ATT	2	6	2200180	2200185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225871444
37095	NC_012471	TGA	2	6	2200192	2200197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225871444
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37097	NC_012471	AGGACG	2	12	2200263	2200274	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	225871444
37098	NC_012471	ATT	2	6	2200328	2200333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225871444
37099	NC_012471	CAT	2	6	2200440	2200445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871445
37100	NC_012471	GCA	2	6	2200448	2200453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871445
37101	NC_012471	TTA	2	6	2200479	2200484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225871445
37102	NC_012471	TTG	2	6	2200498	2200503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225871445
37103	NC_012471	A	6	6	2200531	2200536	100 %	0 %	0 %	0 %	225871445
37104	NC_012471	TA	3	6	2200548	2200553	50 %	50 %	0 %	0 %	225871445
37105	NC_012471	CTA	2	6	2200588	2200593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871445
37106	NC_012471	A	6	6	2200615	2200620	100 %	0 %	0 %	0 %	225871445
37107	NC_012471	CTG	2	6	2200669	2200674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871445
37108	NC_012471	ACC	2	6	2200825	2200830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225871445
37109	NC_012471	TCAA	2	8	2200868	2200875	50 %	25 %	0 %	25 %	225871445
37110	NC_012471	CAG	2	6	2200906	2200911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871445
37111	NC_012471	TA	3	6	2200941	2200946	50 %	50 %	0 %	0 %	225871445
37112	NC_012471	A	6	6	2200985	2200990	100 %	0 %	0 %	0 %	225871445
37113	NC_012471	ATA	2	6	2201026	2201031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225871445
37114	NC_012471	GAC	2	6	2201067	2201072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871445
37115	NC_012471	TTA	2	6	2201105	2201110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225871445
37116	NC_012471	AAC	2	6	2201117	2201122	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225871445
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37118	NC_012471	CAAA	2	8	2201253	2201260	75 %	0 %	0 %	25 %	225871445
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37236	NC_012471	ATT	2	6	2209079	2209084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225871450
37237	NC_012471	ATT	2	6	2209162	2209167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225871451
37238	NC_012471	GCT	2	6	2209173	2209178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871451
37239	NC_012471	ACG	2	6	2209204	2209209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871451
37240	NC_012471	AGA	2	6	2209250	2209255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225871451
37241	NC_012471	GACTAT	2	12	2209260	2209271	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	225871451
37242	NC_012471	GGC	2	6	2209332	2209337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	225871451
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37244	NC_012471	AGCTC	2	10	2209411	2209420	20 %	20 %	20 %	40 %	225871451
37245	NC_012471	GCA	2	6	2209452	2209457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871451
37246	NC_012471	TCAA	2	8	2209498	2209505	50 %	25 %	0 %	25 %	225871451
37247	NC_012471	AGC	2	6	2209576	2209581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871452
37248	NC_012471	A	6	6	2209741	2209746	100 %	0 %	0 %	0 %	225871452
37249	NC_012471	ACA	2	6	2209780	2209785	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225871452
37250	NC_012471	AAGC	2	8	2209798	2209805	50 %	0 %	25 %	25 %	225871452
37251	NC_012471	CTG	2	6	2209873	2209878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871452
37252	NC_012471	CTA	2	6	2209891	2209896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871452
37253	NC_012471	GAT	2	6	2209905	2209910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225871452
37254	NC_012471	CAG	2	6	2209966	2209971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871452
37255	NC_012471	ACAA	2	8	2209973	2209980	75 %	0 %	0 %	25 %	225871452
37256	NC_012471	ACC	3	9	2210053	2210061	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225871452
37257	NC_012471	A	7	7	2210064	2210070	100 %	0 %	0 %	0 %	225871452
37258	NC_012471	ACA	2	6	2210086	2210091	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225871452
37259	NC_012471	AGC	2	6	2210193	2210198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871452
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37262	NC_012471	AACAAT	2	12	2210307	2210318	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	225871452
37263	NC_012471	GCA	2	6	2210390	2210395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871452
37264	NC_012471	ATC	2	6	2210421	2210426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871452
37265	NC_012471	CTA	2	6	2210474	2210479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871452
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37269	NC_012471	AAT	3	9	2210571	2210579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225871452
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37272	NC_012471	GCA	2	6	2210915	2210920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871453
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37274	NC_012471	CAG	2	6	2211067	2211072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871453
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37303	NC_012471	ACT	2	6	2212940	2212945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871453
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37305	NC_012471	ATT	2	6	2212985	2212990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225871453
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37321	NC_012471	TGT	2	6	2213869	2213874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225871455
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37323	NC_012471	ATG	2	6	2214076	2214081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225871455
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37327	NC_012471	GAC	2	6	2214187	2214192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871455
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37330	NC_012471	CCATA	2	10	2214280	2214289	40 %	20 %	0 %	40 %	225871455
37331	NC_012471	GTT	2	6	2214350	2214355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225871455
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37333	NC_012471	GAC	2	6	2214427	2214432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871455
37334	NC_012471	ATG	2	6	2214445	2214450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225871455
37335	NC_012471	TCAA	2	8	2214993	2215000	50 %	25 %	0 %	25 %	225871456
37336	NC_012471	T	6	6	2215016	2215021	0 %	100 %	0 %	0 %	225871456
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37338	NC_012471	ATAA	2	8	2215108	2215115	75 %	25 %	0 %	0 %	225871456
37339	NC_012471	T	7	7	2215150	2215156	0 %	100 %	0 %	0 %	225871456
37340	NC_012471	CAAC	2	8	2215187	2215194	50 %	0 %	0 %	50 %	225871456
37341	NC_012471	T	7	7	2215226	2215232	0 %	100 %	0 %	0 %	225871456
37342	NC_012471	TAT	2	6	2215395	2215400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225871457
37343	NC_012471	CTTT	2	8	2215427	2215434	0 %	75 %	0 %	25 %	225871457
37344	NC_012471	ATA	2	6	2215438	2215443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225871457
37345	NC_012471	ATC	2	6	2215444	2215449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871457
37346	NC_012471	CAA	2	6	2215464	2215469	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225871457
37347	NC_012471	CCTC	2	8	2215700	2215707	0 %	25 %	0 %	75 %	225871457
37348	NC_012471	CCT	2	6	2215710	2215715	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225871457
37349	NC_012471	ATC	2	6	2215768	2215773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871457
37350	NC_012471	ATAG	2	8	2215777	2215784	50 %	25 %	25 %	0 %	225871457
37351	NC_012471	ATT	2	6	2215819	2215824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225871457
37352	NC_012471	CAA	2	6	2215899	2215904	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225871457
37353	NC_012471	CT	3	6	2215944	2215949	0 %	50 %	0 %	50 %	225871457
37354	NC_012471	GCT	2	6	2216015	2216020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871457
37355	NC_012471	AAT	2	6	2216023	2216028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225871457
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37357	NC_012471	GAAC	2	8	2216114	2216121	50 %	0 %	25 %	25 %	225871457
37358	NC_012471	TAAT	2	8	2216135	2216142	50 %	50 %	0 %	0 %	225871457
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37384	NC_012471	CTG	2	6	2217379	2217384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871459
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37460	NC_012471	AAT	2	6	2221804	2221809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225871462
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37462	NC_012471	CAT	2	6	2221833	2221838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871462
37463	NC_012471	A	6	6	2221839	2221844	100 %	0 %	0 %	0 %	225871462
37464	NC_012471	AAC	2	6	2221888	2221893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225871462
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