MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus equi subsp. equi 4047

Total Repeats: 38017

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
36001	NC_012471	AGC	2	6	2138686	2138691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871384
36002	NC_012471	AGA	2	6	2138712	2138717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225871384
36003	NC_012471	TAG	2	6	2138744	2138749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225871384
36004	NC_012471	CTG	2	6	2138752	2138757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871384
36005	NC_012471	TCG	2	6	2138774	2138779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871384
36006	NC_012471	TCG	2	6	2138916	2138921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871384
36007	NC_012471	GAT	2	6	2138978	2138983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225871384
36008	NC_012471	TAT	2	6	2139110	2139115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225871384
36009	NC_012471	ATT	2	6	2139205	2139210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225871384
36010	NC_012471	TGA	2	6	2139233	2139238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225871384
36011	NC_012471	CAG	2	6	2139252	2139257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871384
36012	NC_012471	TCA	2	6	2139332	2139337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871384
36013	NC_012471	CAT	2	6	2139484	2139489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871385
36014	NC_012471	CTTCT	2	10	2139554	2139563	0 %	60 %	0 %	40 %	225871385
36015	NC_012471	CT	3	6	2139562	2139567	0 %	50 %	0 %	50 %	225871385
36016	NC_012471	CCA	2	6	2139574	2139579	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225871385
36017	NC_012471	ATC	2	6	2139648	2139653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871385
36018	NC_012471	CAA	2	6	2139676	2139681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225871385
36019	NC_012471	GCT	2	6	2139682	2139687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871385
36020	NC_012471	CAA	2	6	2139749	2139754	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225871385
36021	NC_012471	CCT	2	6	2139807	2139812	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225871385
36022	NC_012471	CT	3	6	2139893	2139898	0 %	50 %	0 %	50 %	225871385
36023	NC_012471	CGG	2	6	2139936	2139941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	225871385
36024	NC_012471	TTGA	2	8	2140050	2140057	25 %	50 %	25 %	0 %	225871385
36025	NC_012471	CTC	2	6	2140169	2140174	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225871385
36026	NC_012471	ATA	2	6	2140255	2140260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225871385
36027	NC_012471	TCCTA	2	10	2140277	2140286	20 %	40 %	0 %	40 %	225871386
36028	NC_012471	A	6	6	2140359	2140364	100 %	0 %	0 %	0 %	225871386
36029	NC_012471	AAT	2	6	2140411	2140416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225871386
36030	NC_012471	GCCA	2	8	2140458	2140465	25 %	0 %	25 %	50 %	225871386
36031	NC_012471	ATC	2	6	2140481	2140486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871386
36032	NC_012471	AGCC	2	8	2140507	2140514	25 %	0 %	25 %	50 %	225871386
36033	NC_012471	ATT	2	6	2140558	2140563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225871386
36034	NC_012471	CAC	2	6	2140578	2140583	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225871386
36035	NC_012471	ATCTG	2	10	2140628	2140637	20 %	40 %	20 %	20 %	225871386
36036	NC_012471	ATT	2	6	2140666	2140671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225871386
36037	NC_012471	TCA	2	6	2140710	2140715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871386
36038	NC_012471	TAA	2	6	2140723	2140728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225871386
36039	NC_012471	A	7	7	2140727	2140733	100 %	0 %	0 %	0 %	225871386
36040	NC_012471	TAA	2	6	2140828	2140833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225871386
36041	NC_012471	ATA	2	6	2141114	2141119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225871386
36042	NC_012471	TTGA	2	8	2141329	2141336	25 %	50 %	25 %	0 %	225871387
36043	NC_012471	CCA	2	6	2141492	2141497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225871387
36044	NC_012471	TTA	2	6	2141510	2141515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225871387
36045	NC_012471	TAT	2	6	2141559	2141564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225871387
36046	NC_012471	TCA	2	6	2141595	2141600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871387
36047	NC_012471	GCA	2	6	2141606	2141611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871387
36048	NC_012471	CAT	2	6	2141622	2141627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871387
36049	NC_012471	TAA	2	6	2141649	2141654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225871387
36050	NC_012471	AACC	2	8	2141661	2141668	50 %	0 %	0 %	50 %	225871387
36051	NC_012471	TTTGC	2	10	2141781	2141790	0 %	60 %	20 %	20 %	225871387
36052	NC_012471	CCA	2	6	2141825	2141830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225871387
36053	NC_012471	CTG	2	6	2141856	2141861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871387
36054	NC_012471	CTG	2	6	2141877	2141882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871387
36055	NC_012471	TGA	2	6	2141902	2141907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225871387
36056	NC_012471	GCT	2	6	2141973	2141978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871387
36057	NC_012471	CGA	2	6	2142086	2142091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871387
36058	NC_012471	CCA	2	6	2142186	2142191	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225871387
36059	NC_012471	T	6	6	2142232	2142237	0 %	100 %	0 %	0 %	225871387
36060	NC_012471	ATC	2	6	2142324	2142329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871388
36061	NC_012471	TGCT	2	8	2142371	2142378	0 %	50 %	25 %	25 %	225871388
36062	NC_012471	T	6	6	2142381	2142386	0 %	100 %	0 %	0 %	225871388
36063	NC_012471	CTG	2	6	2142408	2142413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871388
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36065	NC_012471	CCT	2	6	2142509	2142514	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225871388
36066	NC_012471	TAG	3	9	2142530	2142538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225871388
36067	NC_012471	TAT	2	6	2142554	2142559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225871388
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36069	NC_012471	CAT	2	6	2142617	2142622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871388
36070	NC_012471	TAG	2	6	2142623	2142628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225871388
36071	NC_012471	T	6	6	2142660	2142665	0 %	100 %	0 %	0 %	225871388
36072	NC_012471	CTT	2	6	2142684	2142689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225871388
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36074	NC_012471	CCA	2	6	2142820	2142825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225871388
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36088	NC_012471	AGC	2	6	2143727	2143732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871389
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36100	NC_012471	T	6	6	2144867	2144872	0 %	100 %	0 %	0 %	225871390
36101	NC_012471	A	7	7	2144898	2144904	100 %	0 %	0 %	0 %	225871390
36102	NC_012471	GCA	2	6	2145248	2145253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871391
36103	NC_012471	AAT	2	6	2145265	2145270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225871391
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36105	NC_012471	TTCC	2	8	2145334	2145341	0 %	50 %	0 %	50 %	225871391
36106	NC_012471	CAT	2	6	2145379	2145384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871391
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36111	NC_012471	GGGCT	2	10	2145549	2145558	0 %	20 %	60 %	20 %	225871391
36112	NC_012471	CTT	2	6	2145582	2145587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225871391
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36114	NC_012471	CAAG	2	8	2145686	2145693	50 %	0 %	25 %	25 %	225871391
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36116	NC_012471	T	6	6	2145763	2145768	0 %	100 %	0 %	0 %	225871391
36117	NC_012471	TAT	2	6	2145810	2145815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225871391
36118	NC_012471	ATC	2	6	2145824	2145829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871391
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36231	NC_012471	ATCA	2	8	2152625	2152632	50 %	25 %	0 %	25 %	225871400
36232	NC_012471	CAT	2	6	2152667	2152672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871400
36233	NC_012471	TCC	2	6	2152674	2152679	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225871400
36234	NC_012471	CTC	2	6	2152835	2152840	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225871400
36235	NC_012471	TGC	2	6	2152883	2152888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871400
36236	NC_012471	AGC	2	6	2152894	2152899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871400
36237	NC_012471	CTCC	2	8	2152945	2152952	0 %	25 %	0 %	75 %	225871400
36238	NC_012471	TTTGG	2	10	2153022	2153031	0 %	60 %	40 %	0 %	225871400
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36244	NC_012471	ACC	2	6	2153468	2153473	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225871401
36245	NC_012471	GAG	2	6	2153479	2153484	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225871401
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36247	NC_012471	A	6	6	2153700	2153705	100 %	0 %	0 %	0 %	225871402
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36258	NC_012471	TCC	2	6	2154216	2154221	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225871402
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36260	NC_012471	AC	3	6	2154310	2154315	50 %	0 %	0 %	50 %	225871402
36261	NC_012471	CCT	2	6	2154385	2154390	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225871402
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36320	NC_012471	AAT	2	6	2157995	2158000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225871405
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36331	NC_012471	AAGC	2	8	2158493	2158500	50 %	0 %	25 %	25 %	225871405
36332	NC_012471	ATG	2	6	2158506	2158511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225871405
36333	NC_012471	TA	3	6	2158534	2158539	50 %	50 %	0 %	0 %	225871405
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36337	NC_012471	GTT	2	6	2159186	2159191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225871406
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36340	NC_012471	TTC	2	6	2159385	2159390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225871406
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36342	NC_012471	TTCGTG	2	12	2159460	2159471	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	225871406
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36344	NC_012471	CAGC	2	8	2159540	2159547	25 %	0 %	25 %	50 %	225871407
36345	NC_012471	T	6	6	2159559	2159564	0 %	100 %	0 %	0 %	225871407
36346	NC_012471	CTGC	2	8	2159585	2159592	0 %	25 %	25 %	50 %	225871407
36347	NC_012471	TCAA	2	8	2159593	2159600	50 %	25 %	0 %	25 %	225871407
36348	NC_012471	CTC	2	6	2159664	2159669	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225871407
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36350	NC_012471	ATT	2	6	2159908	2159913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225871407
36351	NC_012471	ATA	2	6	2159945	2159950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225871408
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36459	NC_012471	CTGA	2	8	2167114	2167121	25 %	25 %	25 %	25 %	225871415
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36465	NC_012471	TGC	2	6	2167429	2167434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871416
36466	NC_012471	TCC	2	6	2167437	2167442	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225871416
36467	NC_012471	T	8	8	2167495	2167502	0 %	100 %	0 %	0 %	225871416
36468	NC_012471	TCA	2	6	2167519	2167524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871416
36469	NC_012471	TAT	2	6	2167540	2167545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225871416
36470	NC_012471	TAT	2	6	2167567	2167572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225871416
36471	NC_012471	GTC	2	6	2167599	2167604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871416
36472	NC_012471	A	7	7	2167635	2167641	100 %	0 %	0 %	0 %	225871416
36473	NC_012471	TTC	2	6	2167649	2167654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225871416
36474	NC_012471	CAG	2	6	2167673	2167678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871416
36475	NC_012471	TCT	2	6	2167686	2167691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225871416
36476	NC_012471	TGA	2	6	2167701	2167706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225871416
36477	NC_012471	AGAT	2	8	2167707	2167714	50 %	25 %	25 %	0 %	225871416
36478	NC_012471	CTG	2	6	2167721	2167726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871416
36479	NC_012471	TAC	2	6	2167849	2167854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871416
36480	NC_012471	TTC	2	6	2167861	2167866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225871417
36481	NC_012471	CA	3	6	2167899	2167904	50 %	0 %	0 %	50 %	225871417
36482	NC_012471	CCTGT	2	10	2167937	2167946	0 %	40 %	20 %	40 %	225871417
36483	NC_012471	CAT	2	6	2168043	2168048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871417
36484	NC_012471	A	6	6	2168127	2168132	100 %	0 %	0 %	0 %	225871417
36485	NC_012471	GTAAAT	2	12	2168137	2168148	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	225871417
36486	NC_012471	ACA	2	6	2168150	2168155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225871417
36487	NC_012471	CCGAT	2	10	2168177	2168186	20 %	20 %	20 %	40 %	225871417
36488	NC_012471	TAA	2	6	2168199	2168204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225871417
36489	NC_012471	TAA	2	6	2168228	2168233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225871417
36490	NC_012471	TCA	2	6	2168237	2168242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871417
36491	NC_012471	TAAA	2	8	2168387	2168394	75 %	25 %	0 %	0 %	225871417
36492	NC_012471	AATACC	2	12	2168466	2168477	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	225871417
36493	NC_012471	TAA	2	6	2168549	2168554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225871417
36494	NC_012471	A	6	6	2168594	2168599	100 %	0 %	0 %	0 %	225871417
36495	NC_012471	TAA	2	6	2168636	2168641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225871417
36496	NC_012471	TAAT	2	8	2168647	2168654	50 %	50 %	0 %	0 %	225871417
36497	NC_012471	CGA	2	6	2168668	2168673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871417
36498	NC_012471	ATC	2	6	2168679	2168684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871417
36499	NC_012471	ATCA	2	8	2168691	2168698	50 %	25 %	0 %	25 %	225871417
36500	NC_012471	AAGC	2	8	2168732	2168739	50 %	0 %	25 %	25 %	225871417

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