MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus equi subsp. equi 4047

Total Repeats: 38017

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
33501	NC_012471	AG	3	6	1997469	1997474	50 %	0 %	50 %	0 %	225871244
33502	NC_012471	GTC	2	6	1997483	1997488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871244
33503	NC_012471	TTG	2	6	1997492	1997497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225871244
33504	NC_012471	CTG	2	6	1997512	1997517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871244
33505	NC_012471	GAT	2	6	1997641	1997646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225871244
33506	NC_012471	TAGT	2	8	1997655	1997662	25 %	50 %	25 %	0 %	225871244
33507	NC_012471	TAAA	2	8	1997696	1997703	75 %	25 %	0 %	0 %	225871245
33508	NC_012471	TAT	2	6	1997762	1997767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225871245
33509	NC_012471	ATCA	2	8	1997778	1997785	50 %	25 %	0 %	25 %	225871245
33510	NC_012471	T	6	6	1997888	1997893	0 %	100 %	0 %	0 %	225871245
33511	NC_012471	TTC	2	6	1997961	1997966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225871245
33512	NC_012471	TC	3	6	1997965	1997970	0 %	50 %	0 %	50 %	225871245
33513	NC_012471	GAT	2	6	1997978	1997983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225871245
33514	NC_012471	CAA	2	6	1998015	1998020	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225871245
33515	NC_012471	TCA	2	6	1998049	1998054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871245
33516	NC_012471	A	6	6	1998071	1998076	100 %	0 %	0 %	0 %	225871245
33517	NC_012471	TTC	2	6	1998089	1998094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225871245
33518	NC_012471	AAT	2	6	1998130	1998135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225871245
33519	NC_012471	TGA	2	6	1998139	1998144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225871245
33520	NC_012471	GAC	2	6	1998150	1998155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871245
33521	NC_012471	AAAT	2	8	1998199	1998206	75 %	25 %	0 %	0 %	225871245
33522	NC_012471	GCA	2	6	1998208	1998213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871245
33523	NC_012471	TAA	2	6	1998215	1998220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225871245
33524	NC_012471	ATC	2	6	1998228	1998233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871245
33525	NC_012471	AGA	2	6	1998237	1998242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225871245
33526	NC_012471	ATATAG	2	12	1998256	1998267	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	225871245
33527	NC_012471	CAG	2	6	1998293	1998298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871245
33528	NC_012471	AAT	3	9	1998315	1998323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225871245
33529	NC_012471	CAAA	2	8	1998349	1998356	75 %	0 %	0 %	25 %	225871245
33530	NC_012471	CT	3	6	1998361	1998366	0 %	50 %	0 %	50 %	225871245
33531	NC_012471	TTA	2	6	1998421	1998426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225871245
33532	NC_012471	TAT	2	6	1998449	1998454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225871245
33533	NC_012471	TCAATA	2	12	1998508	1998519	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	225871245
33534	NC_012471	GTT	2	6	1998566	1998571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225871245
33535	NC_012471	TCC	2	6	1998664	1998669	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225871245
33536	NC_012471	TTA	2	6	1998802	1998807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225871245
33537	NC_012471	ATA	2	6	1998814	1998819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225871245
33538	NC_012471	AGT	2	6	1998894	1998899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225871246
33539	NC_012471	TTTC	2	8	1998940	1998947	0 %	75 %	0 %	25 %	225871246
33540	NC_012471	AAT	3	9	1999034	1999042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225871246
33541	NC_012471	CTTTTG	2	12	1999103	1999114	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	225871246
33542	NC_012471	ATA	2	6	1999133	1999138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225871246
33543	NC_012471	CCA	2	6	1999185	1999190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225871246
33544	NC_012471	AGT	2	6	1999253	1999258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225871246
33545	NC_012471	ATCAC	2	10	1999266	1999275	40 %	20 %	0 %	40 %	225871246
33546	NC_012471	T	6	6	1999286	1999291	0 %	100 %	0 %	0 %	225871246
33547	NC_012471	CTT	2	6	1999406	1999411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225871246
33548	NC_012471	CAC	2	6	1999430	1999435	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225871246
33549	NC_012471	CTGTA	3	15	1999506	1999520	20 %	40 %	20 %	20 %	225871246
33550	NC_012471	CGG	2	6	1999540	1999545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	225871246
33551	NC_012471	TGA	2	6	1999587	1999592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225871246
33552	NC_012471	ACG	2	6	1999667	1999672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871246
33553	NC_012471	AGG	2	6	1999685	1999690	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225871246
33554	NC_012471	TTGTT	2	10	1999718	1999727	0 %	80 %	20 %	0 %	225871246
33555	NC_012471	CTT	2	6	1999813	1999818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225871246
33556	NC_012471	CAT	2	6	1999861	1999866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871246
33557	NC_012471	T	7	7	1999966	1999972	0 %	100 %	0 %	0 %	225871246
33558	NC_012471	TCA	2	6	1999998	2000003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871246
33559	NC_012471	TCT	2	6	2000037	2000042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225871246
33560	NC_012471	CCA	2	6	2000043	2000048	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225871246
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33562	NC_012471	TCA	3	9	2000163	2000171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871246
33563	NC_012471	CGTG	2	8	2000355	2000362	0 %	25 %	50 %	25 %	225871246
33564	NC_012471	GT	3	6	2000371	2000376	0 %	50 %	50 %	0 %	225871246
33565	NC_012471	CAT	2	6	2000419	2000424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871246
33566	NC_012471	AG	3	6	2000444	2000449	50 %	0 %	50 %	0 %	225871246
33567	NC_012471	CCAC	2	8	2000488	2000495	25 %	0 %	0 %	75 %	225871246
33568	NC_012471	ATA	2	6	2000523	2000528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225871246
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33570	NC_012471	TGGAA	2	10	2000612	2000621	40 %	20 %	40 %	0 %	225871246
33571	NC_012471	ATC	2	6	2000624	2000629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871246
33572	NC_012471	TTG	2	6	2000659	2000664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225871246
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33574	NC_012471	ATC	2	6	2000730	2000735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871246
33575	NC_012471	TCA	2	6	2000736	2000741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871246
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33581	NC_012471	TGAGC	2	10	2000933	2000942	20 %	20 %	40 %	20 %	225871247
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33585	NC_012471	CTG	2	6	2001036	2001041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871247
33586	NC_012471	TGT	2	6	2001066	2001071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225871247
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33588	NC_012471	A	6	6	2001212	2001217	100 %	0 %	0 %	0 %	225871247
33589	NC_012471	TCA	2	6	2001337	2001342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871247
33590	NC_012471	TTGA	2	8	2001376	2001383	25 %	50 %	25 %	0 %	225871247
33591	NC_012471	CAG	2	6	2001441	2001446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871247
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33594	NC_012471	T	6	6	2001582	2001587	0 %	100 %	0 %	0 %	225871247
33595	NC_012471	AG	3	6	2001599	2001604	50 %	0 %	50 %	0 %	225871247
33596	NC_012471	TTA	2	6	2001883	2001888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225871247
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33599	NC_012471	A	6	6	2002031	2002036	100 %	0 %	0 %	0 %	225871247
33600	NC_012471	ATA	2	6	2002048	2002053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225871247
33601	NC_012471	CAT	2	6	2002076	2002081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871247
33602	NC_012471	CAC	2	6	2002136	2002141	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225871247
33603	NC_012471	A	6	6	2002181	2002186	100 %	0 %	0 %	0 %	225871247
33604	NC_012471	AT	3	6	2002198	2002203	50 %	50 %	0 %	0 %	225871247
33605	NC_012471	CAC	2	6	2002229	2002234	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225871247
33606	NC_012471	CAT	2	6	2002238	2002243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871247
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33608	NC_012471	CTTC	2	8	2002668	2002675	0 %	50 %	0 %	50 %	225871248
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33615	NC_012471	ATT	2	6	2003151	2003156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225871249
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33967	NC_012471	CAGGT	2	10	2020453	2020462	20 %	20 %	40 %	20 %	225871269
33968	NC_012471	CAG	3	9	2020467	2020475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871269
33969	NC_012471	CTG	3	9	2020481	2020489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871269
33970	NC_012471	T	6	6	2020503	2020508	0 %	100 %	0 %	0 %	225871269
33971	NC_012471	TC	3	6	2020527	2020532	0 %	50 %	0 %	50 %	225871269
33972	NC_012471	CATTT	2	10	2020533	2020542	20 %	60 %	0 %	20 %	225871269
33973	NC_012471	ATTA	2	8	2020917	2020924	50 %	50 %	0 %	0 %	225871270
33974	NC_012471	ATGA	2	8	2020945	2020952	50 %	25 %	25 %	0 %	225871270
33975	NC_012471	TAT	2	6	2020953	2020958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225871270
33976	NC_012471	AGG	2	6	2020994	2020999	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225871270
33977	NC_012471	TGA	3	9	2021016	2021024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225871270
33978	NC_012471	CAT	2	6	2021025	2021030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871270
33979	NC_012471	A	6	6	2021039	2021044	100 %	0 %	0 %	0 %	225871270
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33981	NC_012471	ATC	2	6	2021149	2021154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871270
33982	NC_012471	AGG	2	6	2021201	2021206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225871270
33983	NC_012471	GGA	2	6	2021217	2021222	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225871270
33984	NC_012471	GCT	2	6	2021266	2021271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871270
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33986	NC_012471	GTC	2	6	2021323	2021328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871270
33987	NC_012471	TTAA	2	8	2021507	2021514	50 %	50 %	0 %	0 %	225871270
33988	NC_012471	AAG	2	6	2021708	2021713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225871271
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33990	NC_012471	ACT	2	6	2021817	2021822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871271
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33995	NC_012471	ATTG	2	8	2021915	2021922	25 %	50 %	25 %	0 %	225871271
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33997	NC_012471	CTG	2	6	2022037	2022042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871271
33998	NC_012471	TGCT	2	8	2022082	2022089	0 %	50 %	25 %	25 %	225871271
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34000	NC_012471	GCT	2	6	2022160	2022165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871271

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