MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus equi subsp. equi 4047

Total Repeats: 38017

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
33001	NC_012471	TG	3	6	1953863	1953868	0 %	50 %	50 %	0 %	225871221
33002	NC_012471	TATT	2	8	1953958	1953965	25 %	75 %	0 %	0 %	225871221
33003	NC_012471	AGTC	2	8	1954007	1954014	25 %	25 %	25 %	25 %	225871221
33004	NC_012471	CAT	2	6	1954022	1954027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871221
33005	NC_012471	TGA	2	6	1954173	1954178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225871221
33006	NC_012471	TCC	2	6	1954492	1954497	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225871222
33007	NC_012471	TCT	2	6	1954507	1954512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225871222
33008	NC_012471	GAT	2	6	1954639	1954644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225871222
33009	NC_012471	ATCCTC	2	12	1954656	1954667	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	225871222
33010	NC_012471	ATC	2	6	1954671	1954676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871222
33011	NC_012471	TCA	2	6	1954699	1954704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871222
33012	NC_012471	TCT	2	6	1954730	1954735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225871222
33013	NC_012471	TCT	2	6	1954753	1954758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225871222
33014	NC_012471	TCT	2	6	1954762	1954767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225871222
33015	NC_012471	TGA	2	6	1954772	1954777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225871222
33016	NC_012471	TCA	2	6	1954783	1954788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871222
33017	NC_012471	TCA	2	6	1954792	1954797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871222
33018	NC_012471	ATTT	2	8	1954823	1954830	25 %	75 %	0 %	0 %	225871222
33019	NC_012471	A	7	7	1954874	1954880	100 %	0 %	0 %	0 %	225871222
33020	NC_012471	TTTTGC	2	12	1955324	1955335	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	225871223
33021	NC_012471	T	6	6	1955360	1955365	0 %	100 %	0 %	0 %	225871223
33022	NC_012471	TGC	2	6	1955556	1955561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871223
33023	NC_012471	TCT	2	6	1955571	1955576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225871223
33024	NC_012471	AACGG	2	10	1955651	1955660	40 %	0 %	40 %	20 %	225871223
33025	NC_012471	AGC	2	6	1955729	1955734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871223
33026	NC_012471	TCA	2	6	1955748	1955753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871223
33027	NC_012471	GCT	2	6	1955757	1955762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871223
33028	NC_012471	TCA	2	6	1955805	1955810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871223
33029	NC_012471	CTT	2	6	1955866	1955871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225871223
33030	NC_012471	AGC	2	6	1955906	1955911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871223
33031	NC_012471	GCC	2	6	1956059	1956064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	225871223
33032	NC_012471	AAC	2	6	1956104	1956109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225871223
33033	NC_012471	CTG	2	6	1956124	1956129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871223
33034	NC_012471	CTT	3	9	1956130	1956138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225871223
33035	NC_012471	TTG	2	6	1956159	1956164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225871223
33036	NC_012471	CCT	2	6	1956190	1956195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225871223
33037	NC_012471	CCTCAA	2	12	1956217	1956228	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	225871223
33038	NC_012471	CAA	2	6	1956340	1956345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225871223
33039	NC_012471	TCAAGC	2	12	1956348	1956359	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	225871223
33040	NC_012471	GCT	2	6	1956381	1956386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871223
33041	NC_012471	GCA	2	6	1956388	1956393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871223
33042	NC_012471	CCT	2	6	1956406	1956411	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225871223
33043	NC_012471	TTA	2	6	1956504	1956509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225871223
33044	NC_012471	ATG	2	6	1956592	1956597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225871223
33045	NC_012471	TGT	2	6	1957003	1957008	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225871224
33046	NC_012471	GTT	2	6	1957068	1957073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225871224
33047	NC_012471	AGA	2	6	1957076	1957081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225871224
33048	NC_012471	AT	3	6	1957176	1957181	50 %	50 %	0 %	0 %	225871224
33049	NC_012471	CAA	2	6	1957222	1957227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225871224
33050	NC_012471	GCC	2	6	1957298	1957303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	225871224
33051	NC_012471	AGA	2	6	1957324	1957329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225871224
33052	NC_012471	AGC	2	6	1957349	1957354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871224
33053	NC_012471	AAT	2	6	1957355	1957360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225871224
33054	NC_012471	TCA	2	6	1957407	1957412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871224
33055	NC_012471	GCA	2	6	1957698	1957703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871224
33056	NC_012471	CAA	2	6	1957942	1957947	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225871224
33057	NC_012471	CCT	2	6	1957972	1957977	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225871224
33058	NC_012471	ATAGT	2	10	1958025	1958034	40 %	40 %	20 %	0 %	225871224
33059	NC_012471	TAC	2	6	1958074	1958079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871224
33060	NC_012471	CCT	2	6	1958242	1958247	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225871224
33061	NC_012471	CCAAG	2	10	1958296	1958305	40 %	0 %	20 %	40 %	225871224
33062	NC_012471	TTA	2	6	1958897	1958902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225871225
33063	NC_012471	A	7	7	1958924	1958930	100 %	0 %	0 %	0 %	225871225
33064	NC_012471	A	7	7	1958999	1959005	100 %	0 %	0 %	0 %	225871225
33065	NC_012471	TCT	2	6	1959052	1959057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225871225
33066	NC_012471	AGCAGG	2	12	1959106	1959117	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	225871225
33067	NC_012471	CTT	2	6	1959154	1959159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225871225
33068	NC_012471	T	6	6	1959179	1959184	0 %	100 %	0 %	0 %	225871225
33069	NC_012471	GTT	2	6	1959329	1959334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225871225
33070	NC_012471	CAA	2	6	1959337	1959342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225871225
33071	NC_012471	ATC	2	6	1959416	1959421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871225
33072	NC_012471	GCA	2	6	1959547	1959552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871225
33073	NC_012471	AGGG	2	8	1959602	1959609	25 %	0 %	75 %	0 %	225871225
33074	NC_012471	ACC	2	6	1959787	1959792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225871226
33075	NC_012471	AATT	2	8	1959793	1959800	50 %	50 %	0 %	0 %	225871226
33076	NC_012471	CAC	2	6	1959831	1959836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225871226
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33079	NC_012471	GCT	2	6	1959971	1959976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871226
33080	NC_012471	TCC	2	6	1959988	1959993	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225871226
33081	NC_012471	GCA	2	6	1960008	1960013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871226
33082	NC_012471	TTC	2	6	1960036	1960041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225871226
33083	NC_012471	TCT	2	6	1960052	1960057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225871226
33084	NC_012471	TCC	2	6	1960124	1960129	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225871226
33085	NC_012471	ACC	2	6	1960186	1960191	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225871226
33086	NC_012471	T	6	6	1960234	1960239	0 %	100 %	0 %	0 %	225871226
33087	NC_012471	CAAG	2	8	1960263	1960270	50 %	0 %	25 %	25 %	225871226
33088	NC_012471	CTT	2	6	1960281	1960286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225871226
33089	NC_012471	ATC	2	6	1960324	1960329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871227
33090	NC_012471	T	6	6	1960348	1960353	0 %	100 %	0 %	0 %	225871227
33091	NC_012471	CAG	2	6	1960366	1960371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871227
33092	NC_012471	AGC	2	6	1960402	1960407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871227
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33094	NC_012471	CATAC	2	10	1960438	1960447	40 %	20 %	0 %	40 %	225871227
33095	NC_012471	ACCA	2	8	1960474	1960481	50 %	0 %	0 %	50 %	225871227
33096	NC_012471	TGCC	2	8	1960517	1960524	0 %	25 %	25 %	50 %	225871227
33097	NC_012471	CAA	2	6	1960560	1960565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225871227
33098	NC_012471	ATCAA	2	10	1960598	1960607	60 %	20 %	0 %	20 %	225871227
33099	NC_012471	A	6	6	1960610	1960615	100 %	0 %	0 %	0 %	225871227
33100	NC_012471	CAA	2	6	1960629	1960634	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225871227
33101	NC_012471	CCT	2	6	1960641	1960646	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225871227
33102	NC_012471	A	6	6	1960697	1960702	100 %	0 %	0 %	0 %	225871227
33103	NC_012471	AGCT	2	8	1960771	1960778	25 %	25 %	25 %	25 %	225871227
33104	NC_012471	CT	3	6	1960777	1960782	0 %	50 %	0 %	50 %	225871227
33105	NC_012471	AGC	2	6	1960902	1960907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871228
33106	NC_012471	CAGC	2	8	1960927	1960934	25 %	0 %	25 %	50 %	225871228
33107	NC_012471	TGTTT	2	10	1960940	1960949	0 %	80 %	20 %	0 %	225871228
33108	NC_012471	T	6	6	1961074	1961079	0 %	100 %	0 %	0 %	225871228
33109	NC_012471	CTG	2	6	1961159	1961164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871228
33110	NC_012471	AG	3	6	1961176	1961181	50 %	0 %	50 %	0 %	225871228
33111	NC_012471	ACA	2	6	1961251	1961256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225871228
33112	NC_012471	T	6	6	1961266	1961271	0 %	100 %	0 %	0 %	225871228
33113	NC_012471	CTGCT	2	10	1961292	1961301	0 %	40 %	20 %	40 %	225871228
33114	NC_012471	GCT	2	6	1961350	1961355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871228
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33116	NC_012471	ACC	3	9	1961496	1961504	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225871228
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33231	NC_012471	TG	3	6	1980050	1980055	0 %	50 %	50 %	0 %	225871233
33232	NC_012471	GAT	2	6	1980068	1980073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225871233
33233	NC_012471	TCA	2	6	1980098	1980103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871233
33234	NC_012471	CTT	2	6	1980204	1980209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225871233
33235	NC_012471	TCC	2	6	1980287	1980292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225871233
33236	NC_012471	TTC	2	6	1980353	1980358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225871233
33237	NC_012471	ATC	2	6	1980373	1980378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871233
33238	NC_012471	AAAT	2	8	1980412	1980419	75 %	25 %	0 %	0 %	225871233
33239	NC_012471	GCA	2	6	1980434	1980439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871233
33240	NC_012471	GAAT	2	8	1980464	1980471	50 %	25 %	25 %	0 %	225871233
33241	NC_012471	CTGA	2	8	1980480	1980487	25 %	25 %	25 %	25 %	225871233
33242	NC_012471	ATC	2	6	1980488	1980493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871233
33243	NC_012471	TGCT	2	8	1980578	1980585	0 %	50 %	25 %	25 %	225871233
33244	NC_012471	CAA	2	6	1980609	1980614	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225871233
33245	NC_012471	A	6	6	1980621	1980626	100 %	0 %	0 %	0 %	225871233
33246	NC_012471	AGCA	2	8	1980628	1980635	50 %	0 %	25 %	25 %	225871233
33247	NC_012471	TTTTC	2	10	1980655	1980664	0 %	80 %	0 %	20 %	225871233
33248	NC_012471	GCT	2	6	1981075	1981080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871234
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33250	NC_012471	CTT	2	6	1981121	1981126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225871234
33251	NC_012471	TAT	2	6	1981256	1981261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225871234
33252	NC_012471	T	6	6	1981317	1981322	0 %	100 %	0 %	0 %	225871234
33253	NC_012471	TGAT	2	8	1981398	1981405	25 %	50 %	25 %	0 %	225871234
33254	NC_012471	CAT	2	6	1981484	1981489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871234
33255	NC_012471	ACA	2	6	1981522	1981527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225871234
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33257	NC_012471	ACTC	2	8	1981580	1981587	25 %	25 %	0 %	50 %	225871234
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33259	NC_012471	CCT	2	6	1981739	1981744	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225871234
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33261	NC_012471	ACA	2	6	1981783	1981788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225871234
33262	NC_012471	GACTT	2	10	1981811	1981820	20 %	40 %	20 %	20 %	225871234
33263	NC_012471	TCC	2	6	1981825	1981830	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225871234
33264	NC_012471	TGA	2	6	1981866	1981871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225871234
33265	NC_012471	TGA	2	6	1981878	1981883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225871234
33266	NC_012471	TA	3	6	1981929	1981934	50 %	50 %	0 %	0 %	225871234
33267	NC_012471	CAA	2	6	1981971	1981976	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225871234
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33273	NC_012471	GCCAAG	2	12	1982473	1982484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871234
33274	NC_012471	GACT	2	8	1982510	1982517	25 %	25 %	25 %	25 %	225871234
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33303	NC_012471	CAATGC	2	12	1984951	1984962	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	225871236
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33341	NC_012471	GAC	2	6	1987519	1987524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871238
33342	NC_012471	TCG	2	6	1987535	1987540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871238
33343	NC_012471	ACCA	2	8	1987546	1987553	50 %	0 %	0 %	50 %	225871238
33344	NC_012471	ACCAT	2	10	1987562	1987571	40 %	20 %	0 %	40 %	225871238
33345	NC_012471	A	7	7	1987587	1987593	100 %	0 %	0 %	0 %	225871238
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33347	NC_012471	AAGA	2	8	1987693	1987700	75 %	0 %	25 %	0 %	225871238
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33464	NC_012471	CGCTC	2	10	1995826	1995835	0 %	20 %	20 %	60 %	225871244
33465	NC_012471	TAC	2	6	1995846	1995851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871244
33466	NC_012471	CAG	2	6	1995867	1995872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871244
33467	NC_012471	TCA	2	6	1995887	1995892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871244
33468	NC_012471	CTC	2	6	1995913	1995918	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225871244
33469	NC_012471	TGC	2	6	1995922	1995927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871244
33470	NC_012471	AGA	2	6	1995933	1995938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225871244
33471	NC_012471	TTG	2	6	1995973	1995978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225871244
33472	NC_012471	GTA	2	6	1995994	1995999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225871244
33473	NC_012471	GCC	2	6	1996007	1996012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	225871244
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33475	NC_012471	CAG	3	9	1996146	1996154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871244
33476	NC_012471	CAT	2	6	1996206	1996211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871244
33477	NC_012471	CCGA	2	8	1996282	1996289	25 %	0 %	25 %	50 %	225871244
33478	NC_012471	GTC	2	6	1996301	1996306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871244
33479	NC_012471	CTT	2	6	1996366	1996371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225871244
33480	NC_012471	CTTG	2	8	1996443	1996450	0 %	50 %	25 %	25 %	225871244
33481	NC_012471	TCG	2	6	1996503	1996508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871244
33482	NC_012471	CAA	2	6	1996512	1996517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225871244
33483	NC_012471	CGT	2	6	1996723	1996728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871244
33484	NC_012471	GCC	2	6	1996741	1996746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	225871244
33485	NC_012471	CGAA	2	8	1996783	1996790	50 %	0 %	25 %	25 %	225871244
33486	NC_012471	GAT	2	6	1996798	1996803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225871244
33487	NC_012471	GCA	2	6	1996814	1996819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871244
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33489	NC_012471	AGT	2	6	1996869	1996874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225871244
33490	NC_012471	TGA	2	6	1996875	1996880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225871244
33491	NC_012471	CTG	2	6	1996897	1996902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871244
33492	NC_012471	GAA	2	6	1996906	1996911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225871244
33493	NC_012471	ATT	2	6	1996948	1996953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225871244
33494	NC_012471	T	6	6	1996952	1996957	0 %	100 %	0 %	0 %	225871244
33495	NC_012471	TC	3	6	1996992	1996997	0 %	50 %	0 %	50 %	225871244
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33498	NC_012471	CTC	2	6	1997389	1997394	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225871244
33499	NC_012471	A	6	6	1997396	1997401	100 %	0 %	0 %	0 %	225871244
33500	NC_012471	A	6	6	1997421	1997426	100 %	0 %	0 %	0 %	225871244

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