MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus equi subsp. equi 4047

Total Repeats: 38017

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
31501	NC_012471	CTT	2	6	1864605	1864610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225871143
31502	NC_012471	CAA	2	6	1864709	1864714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225871144
31503	NC_012471	GAT	2	6	1864769	1864774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225871144
31504	NC_012471	CAT	2	6	1864842	1864847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871144
31505	NC_012471	ATC	2	6	1864863	1864868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871144
31506	NC_012471	A	6	6	1865009	1865014	100 %	0 %	0 %	0 %	225871144
31507	NC_012471	GCTG	2	8	1865033	1865040	0 %	25 %	50 %	25 %	225871144
31508	NC_012471	TTC	2	6	1865076	1865081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225871144
31509	NC_012471	TCC	2	6	1865110	1865115	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225871144
31510	NC_012471	TCA	2	6	1865116	1865121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871144
31511	NC_012471	GCA	2	6	1865144	1865149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871144
31512	NC_012471	GTC	2	6	1865150	1865155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871144
31513	NC_012471	TGA	2	6	1865162	1865167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225871144
31514	NC_012471	CTTTTA	2	12	1865342	1865353	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	225871144
31515	NC_012471	CAG	2	6	1865405	1865410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871145
31516	NC_012471	ATG	2	6	1865424	1865429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225871145
31517	NC_012471	GCT	2	6	1865439	1865444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871145
31518	NC_012471	CT	3	6	1865465	1865470	0 %	50 %	0 %	50 %	225871145
31519	NC_012471	CT	3	6	1865505	1865510	0 %	50 %	0 %	50 %	225871145
31520	NC_012471	A	6	6	1865511	1865516	100 %	0 %	0 %	0 %	225871145
31521	NC_012471	A	6	6	1865531	1865536	100 %	0 %	0 %	0 %	225871145
31522	NC_012471	GCT	2	6	1865581	1865586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871145
31523	NC_012471	GCA	2	6	1865614	1865619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871145
31524	NC_012471	TCA	2	6	1865635	1865640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871145
31525	NC_012471	CAG	2	6	1865747	1865752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871145
31526	NC_012471	CTATC	2	10	1865845	1865854	20 %	40 %	0 %	40 %	225871145
31527	NC_012471	CTG	2	6	1865885	1865890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871145
31528	NC_012471	GCT	2	6	1865940	1865945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871145
31529	NC_012471	CTG	2	6	1866011	1866016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871145
31530	NC_012471	GCTG	2	8	1866049	1866056	0 %	25 %	50 %	25 %	225871145
31531	NC_012471	TTA	2	6	1866057	1866062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225871145
31532	NC_012471	TGCT	2	8	1866073	1866080	0 %	50 %	25 %	25 %	225871145
31533	NC_012471	T	7	7	1866106	1866112	0 %	100 %	0 %	0 %	225871145
31534	NC_012471	TCA	2	6	1866125	1866130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871146
31535	NC_012471	TAA	2	6	1866180	1866185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225871146
31536	NC_012471	TCA	2	6	1866203	1866208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871146
31537	NC_012471	AAC	2	6	1866211	1866216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225871146
31538	NC_012471	CATGA	2	10	1866454	1866463	40 %	20 %	20 %	20 %	225871146
31539	NC_012471	CTC	2	6	1866496	1866501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225871146
31540	NC_012471	ATC	2	6	1866560	1866565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871146
31541	NC_012471	GCT	2	6	1866634	1866639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871147
31542	NC_012471	CG	3	6	1866652	1866657	0 %	0 %	50 %	50 %	225871147
31543	NC_012471	TCACC	2	10	1866671	1866680	20 %	20 %	0 %	60 %	225871147
31544	NC_012471	AGC	2	6	1866735	1866740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871147
31545	NC_012471	ACAA	2	8	1866761	1866768	75 %	0 %	0 %	25 %	225871147
31546	NC_012471	AAT	2	6	1866794	1866799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225871147
31547	NC_012471	AGG	2	6	1866869	1866874	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225871147
31548	NC_012471	TGCC	2	8	1866914	1866921	0 %	25 %	25 %	50 %	225871147
31549	NC_012471	ACA	2	6	1866922	1866927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225871147
31550	NC_012471	TCA	2	6	1867055	1867060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871147
31551	NC_012471	TTGC	2	8	1867072	1867079	0 %	50 %	25 %	25 %	225871148
31552	NC_012471	T	7	7	1867137	1867143	0 %	100 %	0 %	0 %	225871148
31553	NC_012471	CAG	2	6	1867147	1867152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871148
31554	NC_012471	CTG	2	6	1867159	1867164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871148
31555	NC_012471	GCA	2	6	1867287	1867292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871148
31556	NC_012471	ACC	2	6	1867293	1867298	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225871148
31557	NC_012471	ATT	2	6	1867370	1867375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225871148
31558	NC_012471	TCA	2	6	1867380	1867385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871148
31559	NC_012471	ATC	2	6	1867460	1867465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871148
31560	NC_012471	AAG	2	6	1867692	1867697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225871148
31561	NC_012471	CAT	2	6	1867714	1867719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871148
31562	NC_012471	AGCA	2	8	1867733	1867740	50 %	0 %	25 %	25 %	225871148
31563	NC_012471	AAC	2	6	1867781	1867786	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225871148
31564	NC_012471	TGAT	2	8	1867809	1867816	25 %	50 %	25 %	0 %	225871148
31565	NC_012471	CAA	3	9	1867822	1867830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225871148
31566	NC_012471	CAT	2	6	1867873	1867878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871148
31567	NC_012471	ACCG	2	8	1867880	1867887	25 %	0 %	25 %	50 %	225871148
31568	NC_012471	C	6	6	1867960	1867965	0 %	0 %	0 %	100 %	225871148
31569	NC_012471	AGCC	2	8	1867966	1867973	25 %	0 %	25 %	50 %	225871148
31570	NC_012471	ATG	2	6	1868134	1868139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225871149
31571	NC_012471	TCA	2	6	1868150	1868155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871149
31572	NC_012471	AAT	2	6	1868178	1868183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225871149
31573	NC_012471	CA	3	6	1868206	1868211	50 %	0 %	0 %	50 %	225871149
31574	NC_012471	ATCA	2	8	1868224	1868231	50 %	25 %	0 %	25 %	225871149
31575	NC_012471	AAG	2	6	1868272	1868277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225871149
31576	NC_012471	TATC	2	8	1868307	1868314	25 %	50 %	0 %	25 %	225871149
31577	NC_012471	AGGCT	2	10	1868409	1868418	20 %	20 %	40 %	20 %	225871149
31578	NC_012471	GAA	2	6	1868471	1868476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225871149
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31580	NC_012471	TAG	2	6	1868517	1868522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225871149
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31582	NC_012471	CCT	2	6	1868589	1868594	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225871149
31583	NC_012471	ATC	2	6	1868633	1868638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871149
31584	NC_012471	TAA	2	6	1868653	1868658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225871149
31585	NC_012471	A	6	6	1868657	1868662	100 %	0 %	0 %	0 %	225871149
31586	NC_012471	CAG	2	6	1868697	1868702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871149
31587	NC_012471	T	6	6	1868748	1868753	0 %	100 %	0 %	0 %	225871149
31588	NC_012471	AAC	2	6	1868782	1868787	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225871149
31589	NC_012471	CCT	2	6	1868795	1868800	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225871149
31590	NC_012471	A	6	6	1868813	1868818	100 %	0 %	0 %	0 %	225871149
31591	NC_012471	T	6	6	1869021	1869026	0 %	100 %	0 %	0 %	225871150
31592	NC_012471	TTG	2	6	1869075	1869080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225871150
31593	NC_012471	TCA	2	6	1869116	1869121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871150
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31596	NC_012471	CAA	2	6	1869224	1869229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225871150
31597	NC_012471	TAA	2	6	1869234	1869239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225871150
31598	NC_012471	TTC	2	6	1869662	1869667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225871151
31599	NC_012471	CAGCC	2	10	1869734	1869743	20 %	0 %	20 %	60 %	225871151
31600	NC_012471	ATC	2	6	1869784	1869789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871151
31601	NC_012471	TCA	2	6	1869851	1869856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871151
31602	NC_012471	CTTAAC	2	12	1869948	1869959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871151
31603	NC_012471	GTT	2	6	1870018	1870023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225871151
31604	NC_012471	AAT	2	6	1870038	1870043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225871151
31605	NC_012471	GCT	2	6	1870096	1870101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871151
31606	NC_012471	GCA	2	6	1870117	1870122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871151
31607	NC_012471	CAA	2	6	1870130	1870135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225871151
31608	NC_012471	CAA	2	6	1870151	1870156	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225871151
31609	NC_012471	GCC	2	6	1870159	1870164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	225871151
31610	NC_012471	ATA	2	6	1870167	1870172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225871151
31611	NC_012471	GAT	2	6	1870181	1870186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225871151
31612	NC_012471	ACCA	2	8	1870266	1870273	50 %	0 %	0 %	50 %	225871151
31613	NC_012471	A	7	7	1870290	1870296	100 %	0 %	0 %	0 %	225871151
31614	NC_012471	TG	3	6	1870318	1870323	0 %	50 %	50 %	0 %	225871151
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31616	NC_012471	GCG	2	6	1870427	1870432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	225871152
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31734	NC_012471	TGG	2	6	1878798	1878803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225871159
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31967	NC_012471	CT	3	6	1889938	1889943	0 %	50 %	0 %	50 %	225871168
31968	NC_012471	ATA	2	6	1890016	1890021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225871168
31969	NC_012471	AAT	2	6	1890100	1890105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225871168
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31986	NC_012471	CAA	2	6	1890846	1890851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225871168
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31993	NC_012471	CAA	2	6	1891079	1891084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225871169
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31996	NC_012471	TCA	2	6	1891213	1891218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871169
31997	NC_012471	GAC	2	6	1891307	1891312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871169
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31999	NC_012471	ATA	2	6	1891408	1891413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225871169
32000	NC_012471	TCA	3	9	1891427	1891435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871169

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