MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus equi subsp. equi 4047

Total Repeats: 38017

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
31001	NC_012471	AT	3	6	1837598	1837603	50 %	50 %	0 %	0 %	225871113
31002	NC_012471	CTC	2	6	1837741	1837746	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225871113
31003	NC_012471	GCT	2	6	1837881	1837886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871113
31004	NC_012471	GCT	2	6	1837895	1837900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871113
31005	NC_012471	T	7	7	1837940	1837946	0 %	100 %	0 %	0 %	225871113
31006	NC_012471	AG	3	6	1837957	1837962	50 %	0 %	50 %	0 %	225871113
31007	NC_012471	TCA	2	6	1838030	1838035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871113
31008	NC_012471	TA	3	6	1838077	1838082	50 %	50 %	0 %	0 %	225871113
31009	NC_012471	GCC	2	6	1838145	1838150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	225871113
31010	NC_012471	TCA	2	6	1838181	1838186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871113
31011	NC_012471	TGA	2	6	1838285	1838290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225871113
31012	NC_012471	T	6	6	1838307	1838312	0 %	100 %	0 %	0 %	225871113
31013	NC_012471	A	6	6	1838319	1838324	100 %	0 %	0 %	0 %	225871113
31014	NC_012471	A	7	7	1838336	1838342	100 %	0 %	0 %	0 %	225871113
31015	NC_012471	T	8	8	1838398	1838405	0 %	100 %	0 %	0 %	225871113
31016	NC_012471	TG	4	8	1838485	1838492	0 %	50 %	50 %	0 %	225871114
31017	NC_012471	TCAAGA	2	12	1838625	1838636	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	225871114
31018	NC_012471	TC	3	6	1838644	1838649	0 %	50 %	0 %	50 %	225871114
31019	NC_012471	GCTT	2	8	1838760	1838767	0 %	50 %	25 %	25 %	225871114
31020	NC_012471	AACTG	2	10	1838798	1838807	40 %	20 %	20 %	20 %	225871114
31021	NC_012471	CCA	2	6	1838821	1838826	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225871114
31022	NC_012471	TGC	2	6	1838874	1838879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871114
31023	NC_012471	CTT	2	6	1838880	1838885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225871114
31024	NC_012471	AGC	3	9	1838898	1838906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871114
31025	NC_012471	TGAC	2	8	1838931	1838938	25 %	25 %	25 %	25 %	225871114
31026	NC_012471	TCT	2	6	1838959	1838964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225871114
31027	NC_012471	CT	3	6	1838987	1838992	0 %	50 %	0 %	50 %	225871114
31028	NC_012471	GTT	2	6	1838994	1838999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225871114
31029	NC_012471	GTT	2	6	1839054	1839059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225871114
31030	NC_012471	TTA	2	6	1839088	1839093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225871114
31031	NC_012471	CAA	2	6	1839478	1839483	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225871115
31032	NC_012471	CAAT	2	8	1839489	1839496	50 %	25 %	0 %	25 %	225871115
31033	NC_012471	TCA	2	6	1839498	1839503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871115
31034	NC_012471	TTC	2	6	1839560	1839565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225871115
31035	NC_012471	GTA	2	6	1839617	1839622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225871115
31036	NC_012471	TCA	2	6	1839637	1839642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871115
31037	NC_012471	CTG	2	6	1839692	1839697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871115
31038	NC_012471	CTTTT	2	10	1839719	1839728	0 %	80 %	0 %	20 %	225871116
31039	NC_012471	TCG	2	6	1839835	1839840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871116
31040	NC_012471	CCT	2	6	1839847	1839852	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225871116
31041	NC_012471	TGA	2	6	1839915	1839920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225871116
31042	NC_012471	CTC	2	6	1839998	1840003	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225871116
31043	NC_012471	GCT	2	6	1840079	1840084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871116
31044	NC_012471	GCT	2	6	1840105	1840110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871116
31045	NC_012471	TTC	2	6	1840136	1840141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225871116
31046	NC_012471	CT	3	6	1840257	1840262	0 %	50 %	0 %	50 %	225871117
31047	NC_012471	AGCT	2	8	1840264	1840271	25 %	25 %	25 %	25 %	225871117
31048	NC_012471	ATT	2	6	1840273	1840278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225871117
31049	NC_012471	TCA	2	6	1840289	1840294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871117
31050	NC_012471	TCT	2	6	1840316	1840321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225871117
31051	NC_012471	AAT	2	6	1840332	1840337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225871117
31052	NC_012471	TTTG	2	8	1840359	1840366	0 %	75 %	25 %	0 %	225871117
31053	NC_012471	TAA	2	6	1840420	1840425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225871117
31054	NC_012471	CAG	2	6	1840431	1840436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871117
31055	NC_012471	CTG	2	6	1840453	1840458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871117
31056	NC_012471	ACC	2	6	1840462	1840467	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225871117
31057	NC_012471	AT	3	6	1840496	1840501	50 %	50 %	0 %	0 %	225871117
31058	NC_012471	TGA	2	6	1840540	1840545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225871117
31059	NC_012471	AGC	2	6	1840567	1840572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871117
31060	NC_012471	TAA	2	6	1840605	1840610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225871117
31061	NC_012471	CAA	2	6	1840623	1840628	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225871117
31062	NC_012471	CCT	2	6	1840652	1840657	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225871117
31063	NC_012471	TGT	2	6	1840689	1840694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225871117
31064	NC_012471	ATA	2	6	1840769	1840774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225871117
31065	NC_012471	TCA	2	6	1841155	1841160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871118
31066	NC_012471	CCT	2	6	1841195	1841200	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225871118
31067	NC_012471	TGC	2	6	1841223	1841228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871118
31068	NC_012471	AC	3	6	1841235	1841240	50 %	0 %	0 %	50 %	225871118
31069	NC_012471	AGC	2	6	1841253	1841258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871118
31070	NC_012471	GCC	2	6	1841298	1841303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	225871118
31071	NC_012471	CAA	2	6	1841321	1841326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225871118
31072	NC_012471	ATAC	2	8	1841403	1841410	50 %	25 %	0 %	25 %	225871118
31073	NC_012471	CCA	2	6	1841456	1841461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225871118
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31075	NC_012471	CT	3	6	1841619	1841624	0 %	50 %	0 %	50 %	225871118
31076	NC_012471	GAC	2	6	1841648	1841653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871118
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31080	NC_012471	AATT	2	8	1841903	1841910	50 %	50 %	0 %	0 %	225871119
31081	NC_012471	CCA	2	6	1841964	1841969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225871119
31082	NC_012471	TAG	2	6	1842041	1842046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225871119
31083	NC_012471	GCA	2	6	1842100	1842105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871119
31084	NC_012471	GAC	2	6	1842136	1842141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871119
31085	NC_012471	GATA	2	8	1842151	1842158	50 %	25 %	25 %	0 %	225871119
31086	NC_012471	AGAT	2	8	1842210	1842217	50 %	25 %	25 %	0 %	225871119
31087	NC_012471	ATA	2	6	1842263	1842268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225871119
31088	NC_012471	GCA	2	6	1842298	1842303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871119
31089	NC_012471	A	6	6	1842310	1842315	100 %	0 %	0 %	0 %	225871119
31090	NC_012471	CAA	2	6	1842355	1842360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225871119
31091	NC_012471	CTA	2	6	1842384	1842389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871119
31092	NC_012471	A	6	6	1842394	1842399	100 %	0 %	0 %	0 %	225871119
31093	NC_012471	CAG	2	6	1842458	1842463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871119
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31099	NC_012471	ATA	2	6	1842836	1842841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225871119
31100	NC_012471	AGC	2	6	1842878	1842883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871119
31101	NC_012471	ATG	2	6	1842933	1842938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225871119
31102	NC_012471	GTT	2	6	1842945	1842950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225871119
31103	NC_012471	GCT	2	6	1842976	1842981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871119
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31105	NC_012471	AAAAAC	2	12	1843058	1843069	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	225871119
31106	NC_012471	TCA	2	6	1843107	1843112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871119
31107	NC_012471	TGT	2	6	1843283	1843288	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225871119
31108	NC_012471	CAA	2	6	1843295	1843300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225871119
31109	NC_012471	A	6	6	1843299	1843304	100 %	0 %	0 %	0 %	225871119
31110	NC_012471	CCAT	2	8	1843363	1843370	25 %	25 %	0 %	50 %	225871119
31111	NC_012471	AAT	2	6	1843382	1843387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225871119
31112	NC_012471	AT	3	6	1843386	1843391	50 %	50 %	0 %	0 %	225871119
31113	NC_012471	TAA	2	6	1843411	1843416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225871119
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31117	NC_012471	A	6	6	1843610	1843615	100 %	0 %	0 %	0 %	225871120
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31119	NC_012471	T	6	6	1843728	1843733	0 %	100 %	0 %	0 %	225871120
31120	NC_012471	CTG	2	6	1843948	1843953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871120
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31230	NC_012471	TC	3	6	1848800	1848805	0 %	50 %	0 %	50 %	225871124
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31345	NC_012471	CCA	2	6	1855809	1855814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225871131
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31461	NC_012471	A	6	6	1862384	1862389	100 %	0 %	0 %	0 %	225871140
31462	NC_012471	GAT	2	6	1862493	1862498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225871140
31463	NC_012471	AAT	2	6	1862526	1862531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225871140
31464	NC_012471	TCA	2	6	1862558	1862563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871140
31465	NC_012471	TGA	2	6	1862583	1862588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225871140
31466	NC_012471	TGG	2	6	1862604	1862609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225871140
31467	NC_012471	CAC	2	6	1862665	1862670	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225871140
31468	NC_012471	T	6	6	1862891	1862896	0 %	100 %	0 %	0 %	225871141
31469	NC_012471	T	6	6	1862912	1862917	0 %	100 %	0 %	0 %	225871141
31470	NC_012471	TCT	2	6	1862965	1862970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225871141
31471	NC_012471	AGGA	2	8	1863089	1863096	50 %	0 %	50 %	0 %	225871141
31472	NC_012471	AT	3	6	1863112	1863117	50 %	50 %	0 %	0 %	225871141
31473	NC_012471	ATG	2	6	1863179	1863184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225871142
31474	NC_012471	GCTG	2	8	1863187	1863194	0 %	25 %	50 %	25 %	225871142
31475	NC_012471	CTT	2	6	1863196	1863201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225871142
31476	NC_012471	T	6	6	1863200	1863205	0 %	100 %	0 %	0 %	225871142
31477	NC_012471	TGA	3	9	1863318	1863326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225871142
31478	NC_012471	CAA	2	6	1863349	1863354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225871142
31479	NC_012471	AAT	2	6	1863383	1863388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225871142
31480	NC_012471	T	7	7	1863409	1863415	0 %	100 %	0 %	0 %	225871142
31481	NC_012471	CTTT	2	8	1863453	1863460	0 %	75 %	0 %	25 %	225871142
31482	NC_012471	CAT	2	6	1863541	1863546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871142
31483	NC_012471	TAA	2	6	1863557	1863562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225871142
31484	NC_012471	GCA	2	6	1863619	1863624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871142
31485	NC_012471	AATC	2	8	1863625	1863632	50 %	25 %	0 %	25 %	225871142
31486	NC_012471	ATC	2	6	1863650	1863655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871142
31487	NC_012471	TTG	2	6	1863684	1863689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225871142
31488	NC_012471	ATA	2	6	1863695	1863700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225871142
31489	NC_012471	CAA	2	6	1863739	1863744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225871142
31490	NC_012471	AGT	2	6	1863761	1863766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225871142
31491	NC_012471	ACG	2	6	1863833	1863838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871142
31492	NC_012471	AGA	2	6	1864153	1864158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225871143
31493	NC_012471	TGAT	2	8	1864181	1864188	25 %	50 %	25 %	0 %	225871143
31494	NC_012471	TGT	2	6	1864213	1864218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225871143
31495	NC_012471	AACCA	2	10	1864267	1864276	60 %	0 %	0 %	40 %	225871143
31496	NC_012471	CAC	2	6	1864299	1864304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225871143
31497	NC_012471	GCT	2	6	1864350	1864355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871143
31498	NC_012471	CAA	2	6	1864362	1864367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225871143
31499	NC_012471	TCAA	2	8	1864484	1864491	50 %	25 %	0 %	25 %	225871143
31500	NC_012471	GCT	3	9	1864542	1864550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871143

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