MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus equi subsp. equi 4047

Total Repeats: 38017

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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30002	NC_012471	TTC	2	6	1777154	1777159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225871058
30003	NC_012471	TAA	2	6	1777171	1777176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225871058
30004	NC_012471	TCA	2	6	1777263	1777268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871058
30005	NC_012471	CAA	2	6	1777309	1777314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225871058
30006	NC_012471	GCT	2	6	1777393	1777398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871058
30007	NC_012471	CAT	2	6	1777462	1777467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871058
30008	NC_012471	ATC	2	6	1777530	1777535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871058
30009	NC_012471	TGCCA	2	10	1777571	1777580	20 %	20 %	20 %	40 %	225871058
30010	NC_012471	T	6	6	1777607	1777612	0 %	100 %	0 %	0 %	225871058
30011	NC_012471	ACA	2	6	1777620	1777625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225871058
30012	NC_012471	CTG	2	6	1777630	1777635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871058
30013	NC_012471	T	7	7	1777659	1777665	0 %	100 %	0 %	0 %	225871058
30014	NC_012471	AAT	2	6	1777702	1777707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225871058
30015	NC_012471	CCT	2	6	1777726	1777731	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225871058
30016	NC_012471	T	6	6	1777781	1777786	0 %	100 %	0 %	0 %	225871058
30017	NC_012471	ATC	2	6	1777853	1777858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871058
30018	NC_012471	TCC	2	6	1777920	1777925	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225871058
30019	NC_012471	ATC	2	6	1777954	1777959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871059
30020	NC_012471	ATG	2	6	1777972	1777977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225871059
30021	NC_012471	ACA	2	6	1777991	1777996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225871059
30022	NC_012471	ATC	2	6	1778008	1778013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871059
30023	NC_012471	TCA	2	6	1778078	1778083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871059
30024	NC_012471	GCT	2	6	1778166	1778171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871059
30025	NC_012471	TCT	2	6	1778187	1778192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225871059
30026	NC_012471	T	6	6	1778316	1778321	0 %	100 %	0 %	0 %	225871059
30027	NC_012471	AGG	2	6	1778334	1778339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225871059
30028	NC_012471	AACACC	2	12	1778342	1778353	50 %	0 %	0 %	50 %	225871059
30029	NC_012471	CTTC	2	8	1778358	1778365	0 %	50 %	0 %	50 %	225871059
30030	NC_012471	CCT	2	6	1778399	1778404	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225871059
30031	NC_012471	TGC	2	6	1778510	1778515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871059
30032	NC_012471	AAG	2	6	1778522	1778527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225871059
30033	NC_012471	TCA	2	6	1778558	1778563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871059
30034	NC_012471	TCATCT	2	12	1778586	1778597	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	225871059
30035	NC_012471	CCTTT	2	10	1778635	1778644	0 %	60 %	0 %	40 %	225871060
30036	NC_012471	CCAG	2	8	1778667	1778674	25 %	0 %	25 %	50 %	225871060
30037	NC_012471	AACC	2	8	1778740	1778747	50 %	0 %	0 %	50 %	225871060
30038	NC_012471	GGC	2	6	1778806	1778811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	225871060
30039	NC_012471	AGTT	2	8	1778936	1778943	25 %	50 %	25 %	0 %	225871060
30040	NC_012471	ATC	2	6	1778952	1778957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871060
30041	NC_012471	AAT	2	6	1779009	1779014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225871060
30042	NC_012471	GCA	2	6	1779043	1779048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871060
30043	NC_012471	TTG	2	6	1779068	1779073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225871060
30044	NC_012471	GCT	2	6	1779079	1779084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871060
30045	NC_012471	ATC	2	6	1779126	1779131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871060
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30047	NC_012471	T	6	6	1779236	1779241	0 %	100 %	0 %	0 %	225871060
30048	NC_012471	GTT	2	6	1779252	1779257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225871060
30049	NC_012471	TCC	2	6	1779312	1779317	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225871060
30050	NC_012471	TTG	2	6	1779333	1779338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225871060
30051	NC_012471	TAT	2	6	1779376	1779381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225871060
30052	NC_012471	AAT	2	6	1779389	1779394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225871060
30053	NC_012471	CAA	2	6	1779398	1779403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225871060
30054	NC_012471	GAT	2	6	1779425	1779430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225871060
30055	NC_012471	AGC	2	6	1779432	1779437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871060
30056	NC_012471	AGT	2	6	1779484	1779489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225871060
30057	NC_012471	CAA	2	6	1779517	1779522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225871060
30058	NC_012471	ATA	2	6	1779569	1779574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225871060
30059	NC_012471	T	7	7	1779577	1779583	0 %	100 %	0 %	0 %	225871060
30060	NC_012471	CTT	2	6	1779637	1779642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225871061
30061	NC_012471	CTG	2	6	1779647	1779652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871061
30062	NC_012471	A	7	7	1779709	1779715	100 %	0 %	0 %	0 %	225871061
30063	NC_012471	ATAG	2	8	1779727	1779734	50 %	25 %	25 %	0 %	225871061
30064	NC_012471	ATG	2	6	1779806	1779811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225871061
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30066	NC_012471	AAT	3	9	1779897	1779905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225871061
30067	NC_012471	T	6	6	1779960	1779965	0 %	100 %	0 %	0 %	225871061
30068	NC_012471	TTC	2	6	1779995	1780000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225871061
30069	NC_012471	T	6	6	1780001	1780006	0 %	100 %	0 %	0 %	225871061
30070	NC_012471	TGAT	2	8	1780019	1780026	25 %	50 %	25 %	0 %	225871061
30071	NC_012471	ATA	3	9	1780058	1780066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225871061
30072	NC_012471	CAG	2	6	1780231	1780236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871061
30073	NC_012471	CAA	2	6	1780245	1780250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225871061
30074	NC_012471	AGAA	2	8	1780253	1780260	75 %	0 %	25 %	0 %	225871061
30075	NC_012471	T	6	6	1780267	1780272	0 %	100 %	0 %	0 %	225871061
30076	NC_012471	TTTACG	2	12	1780401	1780412	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	225871062
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30078	NC_012471	GCT	2	6	1780513	1780518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871062
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30080	NC_012471	GTAGAG	2	12	1780540	1780551	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	225871062
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30082	NC_012471	CTGCAT	2	12	1780728	1780739	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	225871062
30083	NC_012471	ATG	2	6	1780763	1780768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225871062
30084	NC_012471	TAA	2	6	1780851	1780856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225871062
30085	NC_012471	TCAG	2	8	1780928	1780935	25 %	25 %	25 %	25 %	225871062
30086	NC_012471	TCA	2	6	1780941	1780946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871062
30087	NC_012471	AAAGGT	2	12	1781004	1781015	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	225871062
30088	NC_012471	ACC	2	6	1781066	1781071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225871062
30089	NC_012471	CCT	2	6	1781130	1781135	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225871062
30090	NC_012471	GCA	2	6	1781150	1781155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871062
30091	NC_012471	CAA	3	9	1781235	1781243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225871062
30092	NC_012471	A	6	6	1781242	1781247	100 %	0 %	0 %	0 %	225871062
30093	NC_012471	T	8	8	1781288	1781295	0 %	100 %	0 %	0 %	225871062
30094	NC_012471	T	7	7	1781297	1781303	0 %	100 %	0 %	0 %	225871062
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30099	NC_012471	TGC	2	6	1781633	1781638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871062
30100	NC_012471	CAT	2	6	1781664	1781669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871062
30101	NC_012471	TCG	2	6	1781733	1781738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871062
30102	NC_012471	AAC	2	6	1781854	1781859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225871062
30103	NC_012471	TGG	2	6	1781918	1781923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225871062
30104	NC_012471	AGAA	2	8	1781938	1781945	75 %	0 %	25 %	0 %	225871062
30105	NC_012471	CAC	2	6	1781962	1781967	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225871062
30106	NC_012471	T	6	6	1782004	1782009	0 %	100 %	0 %	0 %	225871062
30107	NC_012471	CAA	2	6	1782081	1782086	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225871062
30108	NC_012471	TAAA	2	8	1782220	1782227	75 %	25 %	0 %	0 %	225871062
30109	NC_012471	ACC	2	6	1782238	1782243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225871062
30110	NC_012471	TGT	2	6	1782344	1782349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225871063
30111	NC_012471	CCT	2	6	1782355	1782360	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225871063
30112	NC_012471	TCAA	2	8	1782376	1782383	50 %	25 %	0 %	25 %	225871063
30113	NC_012471	TCA	2	6	1782397	1782402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871063
30114	NC_012471	ATA	2	6	1782419	1782424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225871063
30115	NC_012471	CAA	2	6	1782428	1782433	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225871063
30116	NC_012471	TG	3	6	1782550	1782555	0 %	50 %	50 %	0 %	225871063
30117	NC_012471	T	7	7	1782562	1782568	0 %	100 %	0 %	0 %	225871063
30118	NC_012471	GTGG	2	8	1782569	1782576	0 %	25 %	75 %	0 %	225871063
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30220	NC_012471	TGT	2	6	1788197	1788202	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225871068
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30222	NC_012471	TCG	2	6	1788297	1788302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871068
30223	NC_012471	CTGT	2	8	1788384	1788391	0 %	50 %	25 %	25 %	225871068
30224	NC_012471	ACCA	2	8	1788398	1788405	50 %	0 %	0 %	50 %	225871068
30225	NC_012471	GGC	2	6	1788432	1788437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	225871068
30226	NC_012471	T	6	6	1788606	1788611	0 %	100 %	0 %	0 %	225871068
30227	NC_012471	TTC	2	6	1788626	1788631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225871068
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30229	NC_012471	GTC	2	6	1788687	1788692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871068
30230	NC_012471	A	6	6	1788730	1788735	100 %	0 %	0 %	0 %	225871068
30231	NC_012471	TG	3	6	1789065	1789070	0 %	50 %	50 %	0 %	225871069
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30233	NC_012471	ATG	2	6	1789115	1789120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225871069
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30466	NC_012471	GC	3	6	1802344	1802349	0 %	0 %	50 %	50 %	225871080
30467	NC_012471	AGCT	2	8	1802370	1802377	25 %	25 %	25 %	25 %	225871080
30468	NC_012471	ACC	2	6	1802400	1802405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225871080
30469	NC_012471	A	6	6	1802431	1802436	100 %	0 %	0 %	0 %	225871080
30470	NC_012471	A	6	6	1802461	1802466	100 %	0 %	0 %	0 %	225871080
30471	NC_012471	TGC	2	6	1802643	1802648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871081
30472	NC_012471	CTA	2	6	1802764	1802769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871081
30473	NC_012471	TTA	2	6	1802802	1802807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225871081
30474	NC_012471	ATT	2	6	1802960	1802965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225871081
30475	NC_012471	CTGC	2	8	1802998	1803005	0 %	25 %	25 %	50 %	225871081
30476	NC_012471	GCA	2	6	1803174	1803179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871081
30477	NC_012471	GCT	2	6	1803184	1803189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871081
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30486	NC_012471	CT	3	6	1803884	1803889	0 %	50 %	0 %	50 %	225871081
30487	NC_012471	CAT	2	6	1803950	1803955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225871081
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30491	NC_012471	A	6	6	1804408	1804413	100 %	0 %	0 %	0 %	225871082
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30496	NC_012471	TGC	2	6	1804765	1804770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225871082
30497	NC_012471	ATTA	2	8	1804789	1804796	50 %	50 %	0 %	0 %	225871082
30498	NC_012471	AGC	3	9	1804798	1804806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225871082
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30500	NC_012471	A	6	6	1804911	1804916	100 %	0 %	0 %	0 %	225871082

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