MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus equi subsp. equi 4047

Total Repeats: 38017

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
27501	NC_012471	GCTC	2	8	1625321	1625328	0 %	25 %	25 %	50 %	225870914
27502	NC_012471	TCT	2	6	1625337	1625342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225870914
27503	NC_012471	TAA	3	9	1625351	1625359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225870914
27504	NC_012471	AGA	2	6	1625371	1625376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225870914
27505	NC_012471	AAT	2	6	1625385	1625390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225870914
27506	NC_012471	GGC	2	6	1625452	1625457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	225870914
27507	NC_012471	ACAA	2	8	1625521	1625528	75 %	0 %	0 %	25 %	225870914
27508	NC_012471	AAC	2	6	1625577	1625582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225870914
27509	NC_012471	CTG	2	6	1625658	1625663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870914
27510	NC_012471	CGA	2	6	1625674	1625679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870914
27511	NC_012471	CCG	2	6	1625728	1625733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	225870914
27512	NC_012471	AGAC	2	8	1625756	1625763	50 %	0 %	25 %	25 %	225870914
27513	NC_012471	ATA	2	6	1625842	1625847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225870914
27514	NC_012471	CCA	2	6	1625866	1625871	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225870914
27515	NC_012471	CAC	2	6	1625876	1625881	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225870914
27516	NC_012471	AAG	2	6	1625901	1625906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225870914
27517	NC_012471	AAC	2	6	1625907	1625912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225870914
27518	NC_012471	AAT	2	6	1626039	1626044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225870914
27519	NC_012471	AAT	2	6	1626057	1626062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225870914
27520	NC_012471	GGC	2	6	1626088	1626093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	225870914
27521	NC_012471	CAA	2	6	1626176	1626181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225870914
27522	NC_012471	GCC	2	6	1626186	1626191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	225870914
27523	NC_012471	TGA	2	6	1626192	1626197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870914
27524	NC_012471	AAG	2	6	1626203	1626208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225870914
27525	NC_012471	TAA	2	6	1626299	1626304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225870914
27526	NC_012471	CAG	2	6	1626308	1626313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870914
27527	NC_012471	CCAAG	2	10	1626436	1626445	40 %	0 %	20 %	40 %	225870914
27528	NC_012471	AATCAA	2	12	1626495	1626506	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	225870914
27529	NC_012471	CCT	2	6	1626623	1626628	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225870915
27530	NC_012471	CAA	2	6	1626675	1626680	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225870915
27531	NC_012471	TCA	2	6	1626693	1626698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870915
27532	NC_012471	TAG	2	6	1626721	1626726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870915
27533	NC_012471	ATG	2	6	1626781	1626786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870915
27534	NC_012471	TTGA	2	8	1626832	1626839	25 %	50 %	25 %	0 %	225870915
27535	NC_012471	ACC	2	6	1626892	1626897	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225870915
27536	NC_012471	GCT	2	6	1626927	1626932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870915
27537	NC_012471	ACC	3	9	1626944	1626952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225870916
27538	NC_012471	TCA	2	6	1626957	1626962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870916
27539	NC_012471	TCA	2	6	1626996	1627001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870916
27540	NC_012471	TAA	2	6	1627096	1627101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225870916
27541	NC_012471	CAC	2	6	1627102	1627107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225870916
27542	NC_012471	CAG	2	6	1627188	1627193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870916
27543	NC_012471	T	6	6	1627258	1627263	0 %	100 %	0 %	0 %	225870916
27544	NC_012471	ATG	2	6	1627410	1627415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870917
27545	NC_012471	GTA	2	6	1627465	1627470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870917
27546	NC_012471	CCT	2	6	1627529	1627534	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225870917
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27548	NC_012471	CAG	2	6	1627583	1627588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870917
27549	NC_012471	CCG	2	6	1627623	1627628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	225870917
27550	NC_012471	CAG	2	6	1627664	1627669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870917
27551	NC_012471	AAT	2	6	1627686	1627691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225870917
27552	NC_012471	ATT	2	6	1627740	1627745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225870917
27553	NC_012471	CAAA	2	8	1627777	1627784	75 %	0 %	0 %	25 %	225870917
27554	NC_012471	CTA	2	6	1627841	1627846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870917
27555	NC_012471	GAC	2	6	1627922	1627927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870917
27556	NC_012471	AAATC	2	10	1628003	1628012	60 %	20 %	0 %	20 %	225870917
27557	NC_012471	GCTT	2	8	1628122	1628129	0 %	50 %	25 %	25 %	225870917
27558	NC_012471	CTA	2	6	1628164	1628169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870917
27559	NC_012471	AAT	2	6	1628176	1628181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225870917
27560	NC_012471	ACA	2	6	1628386	1628391	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225870918
27561	NC_012471	GCT	2	6	1628506	1628511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870918
27562	NC_012471	G	7	7	1628518	1628524	0 %	0 %	100 %	0 %	225870918
27563	NC_012471	A	7	7	1628567	1628573	100 %	0 %	0 %	0 %	225870918
27564	NC_012471	CAAC	2	8	1628683	1628690	50 %	0 %	0 %	50 %	225870918
27565	NC_012471	TCC	2	6	1628708	1628713	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225870918
27566	NC_012471	TAC	2	6	1628714	1628719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870918
27567	NC_012471	AGC	2	6	1628760	1628765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870918
27568	NC_012471	ATG	2	6	1628775	1628780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870918
27569	NC_012471	CAA	2	6	1628851	1628856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225870918
27570	NC_012471	GCA	2	6	1628866	1628871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870918
27571	NC_012471	CAA	2	6	1628923	1628928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225870918
27572	NC_012471	ATT	2	6	1628942	1628947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225870918
27573	NC_012471	ATTTT	2	10	1628985	1628994	20 %	80 %	0 %	0 %	225870918
27574	NC_012471	TGT	2	6	1629064	1629069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225870918
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27576	NC_012471	A	6	6	1629170	1629175	100 %	0 %	0 %	0 %	225870918
27577	NC_012471	AAG	2	6	1629214	1629219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225870918
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27583	NC_012471	A	7	7	1629462	1629468	100 %	0 %	0 %	0 %	225870918
27584	NC_012471	TGAT	2	8	1629568	1629575	25 %	50 %	25 %	0 %	225870918
27585	NC_012471	TCTCT	2	10	1629820	1629829	0 %	60 %	0 %	40 %	225870919
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27588	NC_012471	CAG	2	6	1630036	1630041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870919
27589	NC_012471	ACCTT	2	10	1630113	1630122	20 %	40 %	0 %	40 %	225870919
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27599	NC_012471	GA	3	6	1631181	1631186	50 %	0 %	50 %	0 %	225870920
27600	NC_012471	ATC	2	6	1631229	1631234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870920
27601	NC_012471	TAT	3	9	1631301	1631309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225870921
27602	NC_012471	AAG	2	6	1631329	1631334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225870921
27603	NC_012471	ATG	2	6	1631374	1631379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870921
27604	NC_012471	CAT	2	6	1631382	1631387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870921
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27607	NC_012471	TGA	2	6	1631467	1631472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870921
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27612	NC_012471	ATT	2	6	1631679	1631684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225870921
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27967	NC_012471	ACA	2	6	1652580	1652585	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225870944
27968	NC_012471	CCTT	2	8	1652615	1652622	0 %	50 %	0 %	50 %	225870944
27969	NC_012471	AACCA	2	10	1652636	1652645	60 %	0 %	0 %	40 %	225870944
27970	NC_012471	ATAG	2	8	1652658	1652665	50 %	25 %	25 %	0 %	225870944
27971	NC_012471	TAA	2	6	1652759	1652764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225870944
27972	NC_012471	TGC	2	6	1652766	1652771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870944
27973	NC_012471	ACA	2	6	1652857	1652862	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225870944
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27975	NC_012471	GTA	2	6	1652970	1652975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870945
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27982	NC_012471	GCT	2	6	1653316	1653321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870945
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27993	NC_012471	T	6	6	1653935	1653940	0 %	100 %	0 %	0 %	225870946
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27996	NC_012471	CAA	2	6	1654062	1654067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225870946
27997	NC_012471	TCAA	2	8	1654114	1654121	50 %	25 %	0 %	25 %	225870946
27998	NC_012471	CAT	2	6	1654266	1654271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870946
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