MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus equi subsp. equi 4047

Total Repeats: 38017

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
26001	NC_012471	GCTG	2	8	1537901	1537908	0 %	25 %	50 %	25 %	225870847
26002	NC_012471	AGCA	2	8	1537965	1537972	50 %	0 %	25 %	25 %	225870847
26003	NC_012471	TAG	2	6	1538023	1538028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870847
26004	NC_012471	GCC	2	6	1538064	1538069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	225870847
26005	NC_012471	CCA	2	6	1538083	1538088	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225870847
26006	NC_012471	AAT	2	6	1538123	1538128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225870847
26007	NC_012471	ATA	2	6	1538148	1538153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225870847
26008	NC_012471	AAT	2	6	1538166	1538171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225870847
26009	NC_012471	AAAGG	2	10	1538176	1538185	60 %	0 %	40 %	0 %	225870847
26010	NC_012471	AAT	2	6	1538202	1538207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225870847
26011	NC_012471	ATC	2	6	1538208	1538213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870847
26012	NC_012471	T	8	8	1538222	1538229	0 %	100 %	0 %	0 %	225870847
26013	NC_012471	CTT	2	6	1538237	1538242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225870847
26014	NC_012471	CCA	2	6	1538273	1538278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225870847
26015	NC_012471	CTC	2	6	1538348	1538353	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225870848
26016	NC_012471	CTC	2	6	1538381	1538386	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225870848
26017	NC_012471	GCA	2	6	1538436	1538441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870848
26018	NC_012471	CATTGC	2	12	1538527	1538538	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	225870848
26019	NC_012471	AAAT	2	8	1538577	1538584	75 %	25 %	0 %	0 %	225870848
26020	NC_012471	GACAT	2	10	1538634	1538643	40 %	20 %	20 %	20 %	225870848
26021	NC_012471	AAT	2	6	1538645	1538650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225870848
26022	NC_012471	CTG	2	6	1538689	1538694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870848
26023	NC_012471	C	6	6	1538698	1538703	0 %	0 %	0 %	100 %	225870848
26024	NC_012471	GTC	2	6	1538741	1538746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870848
26025	NC_012471	CCA	2	6	1538749	1538754	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225870848
26026	NC_012471	GCT	2	6	1538936	1538941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870848
26027	NC_012471	TCC	2	6	1538958	1538963	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225870848
26028	NC_012471	T	6	6	1539029	1539034	0 %	100 %	0 %	0 %	225870848
26029	NC_012471	TG	3	6	1539064	1539069	0 %	50 %	50 %	0 %	225870848
26030	NC_012471	TGAG	2	8	1539078	1539085	25 %	25 %	50 %	0 %	225870848
26031	NC_012471	TCA	2	6	1539207	1539212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870848
26032	NC_012471	AAG	2	6	1539338	1539343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225870849
26033	NC_012471	A	6	6	1539367	1539372	100 %	0 %	0 %	0 %	225870849
26034	NC_012471	ACAA	2	8	1539428	1539435	75 %	0 %	0 %	25 %	225870849
26035	NC_012471	CTTCAT	2	12	1539563	1539574	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	225870850
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26037	NC_012471	ATAA	2	8	1539672	1539679	75 %	25 %	0 %	0 %	225870850
26038	NC_012471	GGC	2	6	1539711	1539716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	225870850
26039	NC_012471	T	7	7	1539895	1539901	0 %	100 %	0 %	0 %	225870851
26040	NC_012471	AGCCC	2	10	1540091	1540100	20 %	0 %	20 %	60 %	225870851
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26042	NC_012471	A	7	7	1540212	1540218	100 %	0 %	0 %	0 %	225870851
26043	NC_012471	TGT	2	6	1540227	1540232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225870851
26044	NC_012471	GTC	2	6	1540238	1540243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870851
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26047	NC_012471	TCAG	2	8	1540309	1540316	25 %	25 %	25 %	25 %	225870851
26048	NC_012471	GGC	2	6	1540325	1540330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	225870852
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26050	NC_012471	CAA	2	6	1540485	1540490	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225870852
26051	NC_012471	GAA	2	6	1540575	1540580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225870852
26052	NC_012471	TCA	2	6	1540595	1540600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870852
26053	NC_012471	AT	3	6	1540803	1540808	50 %	50 %	0 %	0 %	225870852
26054	NC_012471	AAG	2	6	1540829	1540834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225870852
26055	NC_012471	CTG	2	6	1540836	1540841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870852
26056	NC_012471	TC	3	6	1540902	1540907	0 %	50 %	0 %	50 %	225870852
26057	NC_012471	TTC	2	6	1540912	1540917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225870852
26058	NC_012471	TTTA	2	8	1540948	1540955	25 %	75 %	0 %	0 %	225870852
26059	NC_012471	AAC	2	6	1541017	1541022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225870852
26060	NC_012471	CAT	2	6	1541070	1541075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870852
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26062	NC_012471	AAT	2	6	1541335	1541340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225870852
26063	NC_012471	TGA	2	6	1541358	1541363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870852
26064	NC_012471	GAGCTA	2	12	1541367	1541378	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	225870852
26065	NC_012471	TGC	2	6	1541383	1541388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870852
26066	NC_012471	GATA	2	8	1541421	1541428	50 %	25 %	25 %	0 %	225870852
26067	NC_012471	AGT	2	6	1541434	1541439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870852
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26069	NC_012471	GTG	2	6	1541526	1541531	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225870852
26070	NC_012471	CGT	2	6	1541615	1541620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870852
26071	NC_012471	T	7	7	1541637	1541643	0 %	100 %	0 %	0 %	225870852
26072	NC_012471	TAA	2	6	1541658	1541663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225870852
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26084	NC_012471	GC	3	6	1542328	1542333	0 %	0 %	50 %	50 %	225870852
26085	NC_012471	GGTAAG	2	12	1542361	1542372	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	225870852
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26091	NC_012471	GC	3	6	1542795	1542800	0 %	0 %	50 %	50 %	225870853
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26100	NC_012471	T	6	6	1543539	1543544	0 %	100 %	0 %	0 %	225870854
26101	NC_012471	GCT	2	6	1543572	1543577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870854
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26104	NC_012471	TCAT	2	8	1543803	1543810	25 %	50 %	0 %	25 %	225870854
26105	NC_012471	GCT	2	6	1543939	1543944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870854
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26112	NC_012471	CTT	2	6	1544333	1544338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225870855
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26114	NC_012471	AAT	2	6	1544706	1544711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225870855
26115	NC_012471	TAGT	2	8	1544770	1544777	25 %	50 %	25 %	0 %	225870855
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26117	NC_012471	ATG	2	6	1544819	1544824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870856
26118	NC_012471	CT	3	6	1544866	1544871	0 %	50 %	0 %	50 %	225870856
26119	NC_012471	GTC	2	6	1544912	1544917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870856
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26122	NC_012471	A	6	6	1545030	1545035	100 %	0 %	0 %	0 %	225870856
26123	NC_012471	GCT	2	6	1545047	1545052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870856
26124	NC_012471	AAT	2	6	1545111	1545116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225870856
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26142	NC_012471	TCTT	2	8	1545965	1545972	0 %	75 %	0 %	25 %	225870857
26143	NC_012471	ATA	2	6	1546355	1546360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225870857
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26145	NC_012471	CTG	2	6	1546479	1546484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870857
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26222	NC_012471	GTCG	2	8	1551142	1551149	0 %	25 %	50 %	25 %	225870863
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26224	NC_012471	CTTA	2	8	1551170	1551177	25 %	50 %	0 %	25 %	225870863
26225	NC_012471	CAAT	2	8	1551201	1551208	50 %	25 %	0 %	25 %	225870863
26226	NC_012471	AGG	2	6	1551217	1551222	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225870863
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26230	NC_012471	CCCTC	2	10	1551501	1551510	0 %	20 %	0 %	80 %	225870863
26231	NC_012471	TGA	2	6	1551528	1551533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870863
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26233	NC_012471	TGC	2	6	1551630	1551635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870863
26234	NC_012471	A	6	6	1551641	1551646	100 %	0 %	0 %	0 %	225870863
26235	NC_012471	AATC	2	8	1551806	1551813	50 %	25 %	0 %	25 %	225870863
26236	NC_012471	CTA	2	6	1551841	1551846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870863
26237	NC_012471	CAC	2	6	1551910	1551915	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225870863
26238	NC_012471	AAG	2	6	1552017	1552022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225870863
26239	NC_012471	ACG	2	6	1552031	1552036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870863
26240	NC_012471	TCA	2	6	1552128	1552133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870863
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26245	NC_012471	CAT	2	6	1552506	1552511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870864
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26258	NC_012471	CAC	2	6	1553131	1553136	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225870864
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26261	NC_012471	CTG	2	6	1553283	1553288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870864
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26275	NC_012471	GTA	2	6	1553799	1553804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870864
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26294	NC_012471	TCA	2	6	1554807	1554812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870865
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26300	NC_012471	AGCA	2	8	1554973	1554980	50 %	0 %	25 %	25 %	225870865
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26302	NC_012471	AATA	2	8	1555001	1555008	75 %	25 %	0 %	0 %	225870865
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26315	NC_012471	AGCT	2	8	1556033	1556040	25 %	25 %	25 %	25 %	225870866
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26338	NC_012471	T	6	6	1556907	1556912	0 %	100 %	0 %	0 %	225870866
26339	NC_012471	AAT	2	6	1556928	1556933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225870866
26340	NC_012471	AT	3	6	1556957	1556962	50 %	50 %	0 %	0 %	225870867
26341	NC_012471	CCAAA	2	10	1557159	1557168	60 %	0 %	0 %	40 %	225870867
26342	NC_012471	GAT	2	6	1557202	1557207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870867
26343	NC_012471	GCT	2	6	1557264	1557269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870867
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26347	NC_012471	AAC	2	6	1557643	1557648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225870867
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26466	NC_012471	AGC	2	6	1562526	1562531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870872
26467	NC_012471	AGCA	2	8	1562556	1562563	50 %	0 %	25 %	25 %	225870872
26468	NC_012471	TTG	2	6	1562744	1562749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225870873
26469	NC_012471	A	6	6	1562825	1562830	100 %	0 %	0 %	0 %	225870873
26470	NC_012471	GCA	2	6	1562837	1562842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870873
26471	NC_012471	A	7	7	1562867	1562873	100 %	0 %	0 %	0 %	225870873
26472	NC_012471	TCT	2	6	1562880	1562885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225870873
26473	NC_012471	TCT	2	6	1562920	1562925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225870873
26474	NC_012471	CAT	2	6	1562988	1562993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870873
26475	NC_012471	TCTG	2	8	1563037	1563044	0 %	50 %	25 %	25 %	225870873
26476	NC_012471	AAG	2	6	1563218	1563223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225870874
26477	NC_012471	TAG	2	6	1563244	1563249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870874
26478	NC_012471	TCA	2	6	1563334	1563339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870874
26479	NC_012471	AGC	2	6	1563351	1563356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870874
26480	NC_012471	CTC	2	6	1563408	1563413	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225870874
26481	NC_012471	ACT	2	6	1563417	1563422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870874
26482	NC_012471	T	6	6	1563450	1563455	0 %	100 %	0 %	0 %	225870874
26483	NC_012471	T	6	6	1563481	1563486	0 %	100 %	0 %	0 %	225870874
26484	NC_012471	TCTA	2	8	1563549	1563556	25 %	50 %	0 %	25 %	225870874
26485	NC_012471	ATA	2	6	1563600	1563605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225870874
26486	NC_012471	AGCAT	2	10	1563625	1563634	40 %	20 %	20 %	20 %	225870874
26487	NC_012471	ATC	2	6	1563657	1563662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870874
26488	NC_012471	ATT	2	6	1563714	1563719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225870874
26489	NC_012471	GTT	2	6	1563796	1563801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225870874
26490	NC_012471	GA	3	6	1563849	1563854	50 %	0 %	50 %	0 %	225870874
26491	NC_012471	GTT	2	6	1563865	1563870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225870874
26492	NC_012471	CTTT	2	8	1563888	1563895	0 %	75 %	0 %	25 %	225870874
26493	NC_012471	CCA	2	6	1563955	1563960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225870874
26494	NC_012471	ATC	2	6	1563981	1563986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870874
26495	NC_012471	AGC	2	6	1564003	1564008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870874
26496	NC_012471	GCA	2	6	1564039	1564044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870874
26497	NC_012471	GTT	2	6	1564152	1564157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225870874
26498	NC_012471	CAA	2	6	1564223	1564228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225870874
26499	NC_012471	ACT	2	6	1564299	1564304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870874
26500	NC_012471	TCC	2	6	1564325	1564330	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225870875

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