MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus equi subsp. equi 4047

Total Repeats: 38017

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18501	NC_012471	CAGTCT	2	12	1111939	1111950	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	225870483
18502	NC_012471	ACTAG	2	10	1111971	1111980	40 %	20 %	20 %	20 %	225870483
18503	NC_012471	TAA	2	6	1112030	1112035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225870483
18504	NC_012471	CTA	2	6	1112046	1112051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870483
18505	NC_012471	AGC	2	6	1112092	1112097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870483
18506	NC_012471	GATA	2	8	1112111	1112118	50 %	25 %	25 %	0 %	225870483
18507	NC_012471	TGA	2	6	1112137	1112142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870483
18508	NC_012471	ATGAG	2	10	1112149	1112158	40 %	20 %	40 %	0 %	225870483
18509	NC_012471	GCTT	3	12	1112168	1112179	0 %	50 %	25 %	25 %	225870483
18510	NC_012471	CTA	2	6	1112187	1112192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870483
18511	NC_012471	ATC	2	6	1112197	1112202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870483
18512	NC_012471	AGA	2	6	1112343	1112348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225870484
18513	NC_012471	ATG	2	6	1112393	1112398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870484
18514	NC_012471	ACTT	2	8	1112405	1112412	25 %	50 %	0 %	25 %	225870484
18515	NC_012471	TCC	2	6	1112503	1112508	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225870484
18516	NC_012471	GAC	2	6	1112566	1112571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870484
18517	NC_012471	CAT	2	6	1112679	1112684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870484
18518	NC_012471	CTTT	2	8	1112701	1112708	0 %	75 %	0 %	25 %	225870484
18519	NC_012471	GTTT	2	8	1112710	1112717	0 %	75 %	25 %	0 %	225870484
18520	NC_012471	AGC	2	6	1112768	1112773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870484
18521	NC_012471	GCAG	2	8	1112784	1112791	25 %	0 %	50 %	25 %	225870484
18522	NC_012471	GCT	2	6	1112794	1112799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870484
18523	NC_012471	AG	3	6	1112911	1112916	50 %	0 %	50 %	0 %	225870484
18524	NC_012471	GCA	2	6	1112938	1112943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870484
18525	NC_012471	TAT	2	6	1112988	1112993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225870484
18526	NC_012471	A	7	7	1113013	1113019	100 %	0 %	0 %	0 %	225870484
18527	NC_012471	AGC	2	6	1113041	1113046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870484
18528	NC_012471	TGTCT	2	10	1113097	1113106	0 %	60 %	20 %	20 %	225870484
18529	NC_012471	AGC	2	6	1113361	1113366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870485
18530	NC_012471	GAT	2	6	1113536	1113541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870485
18531	NC_012471	GCT	2	6	1113564	1113569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870485
18532	NC_012471	TAT	2	6	1113695	1113700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225870485
18533	NC_012471	G	6	6	1113714	1113719	0 %	0 %	100 %	0 %	225870485
18534	NC_012471	ATC	2	6	1113781	1113786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870485
18535	NC_012471	GTG	2	6	1113847	1113852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225870485
18536	NC_012471	A	7	7	1113902	1113908	100 %	0 %	0 %	0 %	225870485
18537	NC_012471	AGC	2	6	1113913	1113918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870485
18538	NC_012471	GGT	2	6	1113972	1113977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225870485
18539	NC_012471	TTA	2	6	1114117	1114122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225870485
18540	NC_012471	AGC	2	6	1114137	1114142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870485
18541	NC_012471	TTGG	2	8	1114145	1114152	0 %	50 %	50 %	0 %	225870485
18542	NC_012471	TTG	2	6	1114164	1114169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225870485
18543	NC_012471	TGA	2	6	1114180	1114185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870485
18544	NC_012471	ATA	2	6	1114198	1114203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225870485
18545	NC_012471	GCC	2	6	1114215	1114220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	225870485
18546	NC_012471	TGAT	2	8	1114222	1114229	25 %	50 %	25 %	0 %	225870485
18547	NC_012471	ATC	2	6	1114235	1114240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870485
18548	NC_012471	TGC	2	6	1114306	1114311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870485
18549	NC_012471	AGCA	2	8	1114438	1114445	50 %	0 %	25 %	25 %	225870485
18550	NC_012471	GCT	2	6	1114446	1114451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870485
18551	NC_012471	GAT	2	6	1114452	1114457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870485
18552	NC_012471	T	6	6	1114457	1114462	0 %	100 %	0 %	0 %	225870485
18553	NC_012471	CT	3	6	1114475	1114480	0 %	50 %	0 %	50 %	225870485
18554	NC_012471	TCA	2	6	1114550	1114555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870486
18555	NC_012471	CAAT	2	8	1114593	1114600	50 %	25 %	0 %	25 %	225870486
18556	NC_012471	A	8	8	1114602	1114609	100 %	0 %	0 %	0 %	225870486
18557	NC_012471	CTAT	2	8	1114620	1114627	25 %	50 %	0 %	25 %	225870486
18558	NC_012471	ATT	2	6	1114630	1114635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225870486
18559	NC_012471	ACG	2	6	1114773	1114778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870486
18560	NC_012471	TG	3	6	1114815	1114820	0 %	50 %	50 %	0 %	225870486
18561	NC_012471	TTG	2	6	1114977	1114982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225870486
18562	NC_012471	TAG	2	6	1115107	1115112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870486
18563	NC_012471	GAC	2	6	1115114	1115119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870486
18564	NC_012471	ATT	2	6	1115176	1115181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225870487
18565	NC_012471	TAT	2	6	1115201	1115206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225870487
18566	NC_012471	TGG	2	6	1115243	1115248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225870487
18567	NC_012471	A	6	6	1115287	1115292	100 %	0 %	0 %	0 %	225870487
18568	NC_012471	AGA	3	9	1115366	1115374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225870487
18569	NC_012471	GTT	2	6	1115385	1115390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225870487
18570	NC_012471	A	6	6	1115409	1115414	100 %	0 %	0 %	0 %	225870487
18571	NC_012471	ATG	2	6	1115419	1115424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870487
18572	NC_012471	TTA	2	6	1115428	1115433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225870487
18573	NC_012471	ATG	2	6	1115497	1115502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870487
18574	NC_012471	GCC	2	6	1115541	1115546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	225870487
18575	NC_012471	ACG	2	6	1115551	1115556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870487
18576	NC_012471	AGC	2	6	1115639	1115644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870487
18577	NC_012471	A	6	6	1115667	1115672	100 %	0 %	0 %	0 %	225870487
18578	NC_012471	TTA	2	6	1115733	1115738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225870487
18579	NC_012471	TGG	2	6	1115819	1115824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225870487
18580	NC_012471	GCC	2	6	1115859	1115864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	225870487
18581	NC_012471	TAA	2	6	1115882	1115887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225870487
18582	NC_012471	ATG	2	6	1115967	1115972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870488
18583	NC_012471	AGG	2	6	1116025	1116030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225870488
18584	NC_012471	CT	3	6	1116092	1116097	0 %	50 %	0 %	50 %	225870488
18585	NC_012471	TTG	2	6	1116157	1116162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225870488
18586	NC_012471	A	6	6	1116261	1116266	100 %	0 %	0 %	0 %	225870488
18587	NC_012471	GA	3	6	1116315	1116320	50 %	0 %	50 %	0 %	225870488
18588	NC_012471	TTTA	2	8	1116336	1116343	25 %	75 %	0 %	0 %	225870489
18589	NC_012471	CTAC	2	8	1116376	1116383	25 %	25 %	0 %	50 %	225870489
18590	NC_012471	GCA	2	6	1116386	1116391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870489
18591	NC_012471	CTAT	2	8	1116441	1116448	25 %	50 %	0 %	25 %	225870489
18592	NC_012471	CAG	2	6	1116453	1116458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870489
18593	NC_012471	TGA	2	6	1116631	1116636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870489
18594	NC_012471	ATCA	2	8	1116642	1116649	50 %	25 %	0 %	25 %	225870489
18595	NC_012471	TTA	2	6	1116707	1116712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225870489
18596	NC_012471	GA	3	6	1116959	1116964	50 %	0 %	50 %	0 %	225870490
18597	NC_012471	CAG	2	6	1117007	1117012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870490
18598	NC_012471	TTG	2	6	1117055	1117060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225870490
18599	NC_012471	AATCAT	2	12	1117069	1117080	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	225870490
18600	NC_012471	GGT	2	6	1117129	1117134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225870490
18601	NC_012471	GAGGCA	2	12	1117198	1117209	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	225870490
18602	NC_012471	ACA	2	6	1117228	1117233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225870490
18603	NC_012471	TGG	2	6	1117329	1117334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225870490
18604	NC_012471	T	7	7	1117349	1117355	0 %	100 %	0 %	0 %	225870490
18605	NC_012471	A	6	6	1117389	1117394	100 %	0 %	0 %	0 %	225870490
18606	NC_012471	AG	3	6	1117405	1117410	50 %	0 %	50 %	0 %	225870490
18607	NC_012471	ACC	2	6	1117529	1117534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225870490
18608	NC_012471	AGC	2	6	1117547	1117552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870490
18609	NC_012471	TCC	2	6	1117590	1117595	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225870490
18610	NC_012471	TAT	2	6	1117794	1117799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225870490
18611	NC_012471	GAG	2	6	1117951	1117956	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225870491
18612	NC_012471	GGCTG	2	10	1118019	1118028	0 %	20 %	60 %	20 %	225870491
18613	NC_012471	GTG	2	6	1118042	1118047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225870491
18614	NC_012471	ATTT	2	8	1118050	1118057	25 %	75 %	0 %	0 %	225870491
18615	NC_012471	GGT	2	6	1118278	1118283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225870491
18616	NC_012471	CAGCGT	2	12	1118284	1118295	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	225870491
18617	NC_012471	ATCA	2	8	1118317	1118324	50 %	25 %	0 %	25 %	225870491
18618	NC_012471	GCA	2	6	1118409	1118414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870491
18619	NC_012471	TTTGTT	2	12	1118431	1118442	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	225870491
18620	NC_012471	GAA	2	6	1118455	1118460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225870491
18621	NC_012471	ATGA	2	8	1118491	1118498	50 %	25 %	25 %	0 %	225870491
18622	NC_012471	TAGC	2	8	1118561	1118568	25 %	25 %	25 %	25 %	225870491
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18624	NC_012471	GAT	2	6	1118601	1118606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870491
18625	NC_012471	TGG	2	6	1118655	1118660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225870491
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18629	NC_012471	GTG	2	6	1118768	1118773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225870491
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18967	NC_012471	TCT	2	6	1139544	1139549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225870511
18968	NC_012471	AGG	2	6	1139554	1139559	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225870511
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18972	NC_012471	GCT	2	6	1139826	1139831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870511
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18992	NC_012471	TCAT	2	8	1140813	1140820	25 %	50 %	0 %	25 %	225870512
18993	NC_012471	TGA	2	6	1140977	1140982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870512
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19000	NC_012471	AAT	2	6	1142255	1142260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225870513

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