MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus equi subsp. equi 4047

Total Repeats: 38017

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_012471	AAT	2	6	961300	961305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225870351
16002	NC_012471	TAA	2	6	961426	961431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225870351
16003	NC_012471	TAA	2	6	961465	961470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225870351
16004	NC_012471	TGC	2	6	961524	961529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870351
16005	NC_012471	AAG	2	6	961542	961547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225870351
16006	NC_012471	AGG	2	6	961601	961606	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225870352
16007	NC_012471	A	6	6	961624	961629	100 %	0 %	0 %	0 %	225870352
16008	NC_012471	CAA	2	6	961635	961640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225870352
16009	NC_012471	ATC	2	6	961662	961667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870352
16010	NC_012471	CCA	2	6	961685	961690	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225870352
16011	NC_012471	TTA	2	6	961724	961729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225870352
16012	NC_012471	AGC	2	6	961744	961749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870352
16013	NC_012471	AGC	2	6	961756	961761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870352
16014	NC_012471	GAA	2	6	961818	961823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225870352
16015	NC_012471	AAAAG	2	10	961890	961899	80 %	0 %	20 %	0 %	225870352
16016	NC_012471	TGG	3	9	961925	961933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225870352
16017	NC_012471	CTA	2	6	961971	961976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870352
16018	NC_012471	T	6	6	962013	962018	0 %	100 %	0 %	0 %	225870352
16019	NC_012471	ATGGC	2	10	962064	962073	20 %	20 %	40 %	20 %	225870352
16020	NC_012471	ATT	2	6	962184	962189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225870352
16021	NC_012471	TGC	2	6	962230	962235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870352
16022	NC_012471	AGC	2	6	962248	962253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870352
16023	NC_012471	TGG	2	6	962278	962283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225870352
16024	NC_012471	CTTG	2	8	962300	962307	0 %	50 %	25 %	25 %	225870352
16025	NC_012471	CAT	2	6	962342	962347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870352
16026	NC_012471	GGT	2	6	962496	962501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225870352
16027	NC_012471	ATC	2	6	962535	962540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870352
16028	NC_012471	TGA	2	6	962543	962548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870352
16029	NC_012471	TTGA	2	8	962583	962590	25 %	50 %	25 %	0 %	225870352
16030	NC_012471	AAG	2	6	962617	962622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225870352
16031	NC_012471	TCA	2	6	962627	962632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870352
16032	NC_012471	AG	3	6	962705	962710	50 %	0 %	50 %	0 %	225870352
16033	NC_012471	GCT	2	6	962955	962960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870353
16034	NC_012471	CTA	2	6	962985	962990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870353
16035	NC_012471	ACA	2	6	963032	963037	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225870353
16036	NC_012471	A	7	7	963126	963132	100 %	0 %	0 %	0 %	225870353
16037	NC_012471	AAG	2	6	963142	963147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225870353
16038	NC_012471	TTTA	2	8	963222	963229	25 %	75 %	0 %	0 %	225870353
16039	NC_012471	ATT	2	6	963251	963256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225870353
16040	NC_012471	AGTC	2	8	963268	963275	25 %	25 %	25 %	25 %	225870353
16041	NC_012471	TTA	2	6	963339	963344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225870353
16042	NC_012471	ATC	2	6	963427	963432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870353
16043	NC_012471	ATT	2	6	963490	963495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225870353
16044	NC_012471	T	6	6	963535	963540	0 %	100 %	0 %	0 %	225870353
16045	NC_012471	AAC	2	6	963562	963567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225870353
16046	NC_012471	AGC	2	6	963638	963643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870353
16047	NC_012471	TAT	2	6	963732	963737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225870353
16048	NC_012471	CTG	2	6	963760	963765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870353
16049	NC_012471	A	6	6	963904	963909	100 %	0 %	0 %	0 %	225870353
16050	NC_012471	TCA	2	6	963925	963930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870353
16051	NC_012471	TTTG	2	8	963997	964004	0 %	75 %	25 %	0 %	225870353
16052	NC_012471	ACC	2	6	964018	964023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225870353
16053	NC_012471	GCT	2	6	964096	964101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870353
16054	NC_012471	TA	3	6	964150	964155	50 %	50 %	0 %	0 %	225870353
16055	NC_012471	TGAG	2	8	964157	964164	25 %	25 %	50 %	0 %	225870353
16056	NC_012471	CAT	2	6	964228	964233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870353
16057	NC_012471	GGC	2	6	964279	964284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	225870353
16058	NC_012471	AGGAT	2	10	964421	964430	40 %	20 %	40 %	0 %	225870353
16059	NC_012471	CAA	2	6	964452	964457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225870353
16060	NC_012471	ACA	2	6	964478	964483	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225870353
16061	NC_012471	TGA	2	6	964566	964571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870353
16062	NC_012471	AAG	2	6	964611	964616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225870353
16063	NC_012471	GATGTT	2	12	964675	964686	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	225870353
16064	NC_012471	TTA	2	6	964741	964746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225870353
16065	NC_012471	CAA	2	6	964763	964768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225870353
16066	NC_012471	ATG	2	6	964868	964873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870353
16067	NC_012471	AGG	2	6	964874	964879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225870353
16068	NC_012471	ATT	2	6	964895	964900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225870353
16069	NC_012471	ATC	2	6	964913	964918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870353
16070	NC_012471	CAA	2	6	964923	964928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225870353
16071	NC_012471	TAC	2	6	965005	965010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870353
16072	NC_012471	CAGC	2	8	965052	965059	25 %	0 %	25 %	50 %	225870353
16073	NC_012471	CTG	2	6	965063	965068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870353
16074	NC_012471	GATA	2	8	965168	965175	50 %	25 %	25 %	0 %	225870353
16075	NC_012471	TGG	2	6	965260	965265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225870354
16076	NC_012471	CA	3	6	965283	965288	50 %	0 %	0 %	50 %	225870354
16077	NC_012471	GCT	2	6	965306	965311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870354
16078	NC_012471	GTT	2	6	965321	965326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225870354
16079	NC_012471	GCT	2	6	965366	965371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870354
16080	NC_012471	GCT	2	6	965431	965436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870354
16081	NC_012471	TAC	2	6	965528	965533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870354
16082	NC_012471	AAT	2	6	965537	965542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225870354
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16084	NC_012471	CTC	2	6	965608	965613	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225870354
16085	NC_012471	ATTGT	2	10	965753	965762	20 %	60 %	20 %	0 %	225870354
16086	NC_012471	AAC	2	6	965831	965836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225870354
16087	NC_012471	TGA	2	6	965896	965901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870354
16088	NC_012471	TGT	2	6	965944	965949	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225870354
16089	NC_012471	CTAT	2	8	966005	966012	25 %	50 %	0 %	25 %	225870354
16090	NC_012471	GGT	2	6	966073	966078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225870354
16091	NC_012471	A	6	6	966158	966163	100 %	0 %	0 %	0 %	225870354
16092	NC_012471	AGCA	2	8	966227	966234	50 %	0 %	25 %	25 %	225870354
16093	NC_012471	TTA	2	6	966441	966446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225870355
16094	NC_012471	AGCA	2	8	966491	966498	50 %	0 %	25 %	25 %	225870355
16095	NC_012471	CATT	2	8	966581	966588	25 %	50 %	0 %	25 %	225870355
16096	NC_012471	CAG	2	6	966632	966637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870355
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16099	NC_012471	GTCA	2	8	966751	966758	25 %	25 %	25 %	25 %	225870355
16100	NC_012471	TTG	2	6	966898	966903	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225870355
16101	NC_012471	TGA	2	6	966950	966955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870355
16102	NC_012471	TTGGTG	2	12	966961	966972	0 %	50 %	50 %	0 %	225870355
16103	NC_012471	GCA	2	6	967065	967070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870355
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16105	NC_012471	A	6	6	967192	967197	100 %	0 %	0 %	0 %	225870355
16106	NC_012471	ACC	2	6	967219	967224	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225870355
16107	NC_012471	AGA	2	6	967247	967252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225870355
16108	NC_012471	TAT	2	6	967268	967273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225870355
16109	NC_012471	AGCT	2	8	967324	967331	25 %	25 %	25 %	25 %	225870355
16110	NC_012471	GAG	2	6	967332	967337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225870355
16111	NC_012471	GGA	2	6	967454	967459	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225870355
16112	NC_012471	GTG	2	6	967492	967497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225870355
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16114	NC_012471	ATT	2	6	967702	967707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225870356
16115	NC_012471	TAT	2	6	967750	967755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225870356
16116	NC_012471	AAT	2	6	967901	967906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225870356
16117	NC_012471	TGA	2	6	967953	967958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870356
16118	NC_012471	TTG	2	6	968007	968012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225870356
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16480	NC_012471	TC	3	6	991407	991412	0 %	50 %	0 %	50 %	225870380
16481	NC_012471	AATC	2	8	991422	991429	50 %	25 %	0 %	25 %	225870380
16482	NC_012471	TGCTGA	2	12	991433	991444	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	225870380
16483	NC_012471	ATC	2	6	991453	991458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870380
16484	NC_012471	T	6	6	991487	991492	0 %	100 %	0 %	0 %	225870380
16485	NC_012471	TCA	2	6	991505	991510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870380
16486	NC_012471	ATT	2	6	991573	991578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225870380
16487	NC_012471	AAT	2	6	991579	991584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225870380
16488	NC_012471	TGC	2	6	991606	991611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870380
16489	NC_012471	TCA	2	6	991634	991639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870380
16490	NC_012471	GCTTT	2	10	991650	991659	0 %	60 %	20 %	20 %	225870380
16491	NC_012471	TCA	2	6	991665	991670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870380
16492	NC_012471	A	6	6	991798	991803	100 %	0 %	0 %	0 %	225870380
16493	NC_012471	GTAA	2	8	991854	991861	50 %	25 %	25 %	0 %	225870380
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16495	NC_012471	ATC	2	6	992026	992031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870380
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16498	NC_012471	CTC	2	6	992103	992108	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225870381
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16500	NC_012471	GC	3	6	992214	992219	0 %	0 %	50 %	50 %	225870381

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