MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus equi subsp. equi 4047

Total Repeats: 38017

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_012471	CTCA	2	8	906575	906582	25 %	25 %	0 %	50 %	225870311
15002	NC_012471	GAA	2	6	906590	906595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225870311
15003	NC_012471	TTG	2	6	906630	906635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225870311
15004	NC_012471	ATT	2	6	906657	906662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225870311
15005	NC_012471	ATC	2	6	906693	906698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870311
15006	NC_012471	TGC	2	6	906744	906749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870311
15007	NC_012471	GAT	2	6	906817	906822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870311
15008	NC_012471	CGT	2	6	906842	906847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870311
15009	NC_012471	GAT	2	6	906854	906859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870311
15010	NC_012471	TCA	2	6	906871	906876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870311
15011	NC_012471	GAT	2	6	906946	906951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870311
15012	NC_012471	TGG	2	6	907054	907059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225870311
15013	NC_012471	A	7	7	907079	907085	100 %	0 %	0 %	0 %	225870311
15014	NC_012471	TGC	2	6	907206	907211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870311
15015	NC_012471	A	6	6	907493	907498	100 %	0 %	0 %	0 %	225870312
15016	NC_012471	AGCT	2	8	907527	907534	25 %	25 %	25 %	25 %	225870312
15017	NC_012471	A	6	6	907536	907541	100 %	0 %	0 %	0 %	225870312
15018	NC_012471	CAA	2	6	907545	907550	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225870312
15019	NC_012471	GTT	2	6	907604	907609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225870312
15020	NC_012471	GCACCT	2	12	907645	907656	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	225870312
15021	NC_012471	GAT	2	6	907676	907681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870312
15022	NC_012471	TTG	2	6	907737	907742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225870312
15023	NC_012471	ATT	2	6	907856	907861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225870312
15024	NC_012471	CAG	4	12	907902	907913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870312
15025	NC_012471	GTG	2	6	908001	908006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225870312
15026	NC_012471	CTAT	2	8	908025	908032	25 %	50 %	0 %	25 %	225870312
15027	NC_012471	AGC	3	9	908080	908088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870312
15028	NC_012471	TTG	2	6	908145	908150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225870312
15029	NC_012471	TCT	2	6	908191	908196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225870312
15030	NC_012471	CAA	2	6	908221	908226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225870312
15031	NC_012471	TGT	2	6	908227	908232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225870312
15032	NC_012471	ATGC	2	8	908273	908280	25 %	25 %	25 %	25 %	225870312
15033	NC_012471	TTA	2	6	908394	908399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225870312
15034	NC_012471	CCAG	2	8	908410	908417	25 %	0 %	25 %	50 %	225870312
15035	NC_012471	TAT	2	6	908431	908436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225870312
15036	NC_012471	CCT	2	6	908463	908468	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225870312
15037	NC_012471	GTG	2	6	908477	908482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225870312
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15039	NC_012471	AATC	2	8	908508	908515	50 %	25 %	0 %	25 %	225870312
15040	NC_012471	TCA	2	6	908555	908560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870312
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15042	NC_012471	GCAG	2	8	908665	908672	25 %	0 %	50 %	25 %	225870312
15043	NC_012471	GGCTT	2	10	908778	908787	0 %	40 %	40 %	20 %	225870312
15044	NC_012471	CTG	2	6	908802	908807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870312
15045	NC_012471	ACG	2	6	908830	908835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870312
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15047	NC_012471	GCT	2	6	908924	908929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870312
15048	NC_012471	TCG	2	6	908965	908970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870312
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15050	NC_012471	AAGCC	2	10	909062	909071	40 %	0 %	20 %	40 %	225870312
15051	NC_012471	CTTTGC	2	12	909262	909273	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	225870312
15052	NC_012471	TAG	2	6	909285	909290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870312
15053	NC_012471	CAAGCG	2	12	909311	909322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870312
15054	NC_012471	CTGT	2	8	909377	909384	0 %	50 %	25 %	25 %	225870312
15055	NC_012471	CAA	2	6	909396	909401	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225870312
15056	NC_012471	TTG	2	6	909468	909473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225870312
15057	NC_012471	GCT	2	6	909491	909496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870312
15058	NC_012471	TCA	2	6	909568	909573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870312
15059	NC_012471	TCA	2	6	909646	909651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870312
15060	NC_012471	ATT	2	6	909731	909736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225870312
15061	NC_012471	A	6	6	909746	909751	100 %	0 %	0 %	0 %	225870312
15062	NC_012471	CTGA	2	8	909794	909801	25 %	25 %	25 %	25 %	225870312
15063	NC_012471	GAG	2	6	909803	909808	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225870312
15064	NC_012471	AAGCT	2	10	910137	910146	40 %	20 %	20 %	20 %	225870313
15065	NC_012471	TAG	2	6	910179	910184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870313
15066	NC_012471	GGCA	2	8	910257	910264	25 %	0 %	50 %	25 %	225870313
15067	NC_012471	TGA	2	6	910348	910353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870313
15068	NC_012471	AGA	3	9	910408	910416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225870313
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15070	NC_012471	T	6	6	910433	910438	0 %	100 %	0 %	0 %	225870313
15071	NC_012471	GA	4	8	910445	910452	50 %	0 %	50 %	0 %	225870313
15072	NC_012471	AAGG	2	8	910479	910486	50 %	0 %	50 %	0 %	225870313
15073	NC_012471	GGT	2	6	910507	910512	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225870313
15074	NC_012471	AGG	2	6	910537	910542	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225870313
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15077	NC_012471	AGCT	2	8	910734	910741	25 %	25 %	25 %	25 %	225870313
15078	NC_012471	CAG	2	6	910763	910768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870313
15079	NC_012471	TCA	2	6	910785	910790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870313
15080	NC_012471	TATG	2	8	910882	910889	25 %	50 %	25 %	0 %	225870313
15081	NC_012471	GCA	2	6	911001	911006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870313
15082	NC_012471	CTA	2	6	911015	911020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870313
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15084	NC_012471	GGT	2	6	911354	911359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225870314
15085	NC_012471	CAG	2	6	911504	911509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870314
15086	NC_012471	CAAGCA	2	12	911533	911544	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	225870314
15087	NC_012471	CAG	2	6	911558	911563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870314
15088	NC_012471	TAA	2	6	911596	911601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225870314
15089	NC_012471	TTGCCA	2	12	911640	911651	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	225870314
15090	NC_012471	AAAG	2	8	911747	911754	75 %	0 %	25 %	0 %	225870314
15091	NC_012471	A	7	7	911760	911766	100 %	0 %	0 %	0 %	225870314
15092	NC_012471	ATC	2	6	911859	911864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870314
15093	NC_012471	TAGC	2	8	911868	911875	25 %	25 %	25 %	25 %	225870314
15094	NC_012471	A	7	7	912243	912249	100 %	0 %	0 %	0 %	225870315
15095	NC_012471	CAG	2	6	912299	912304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870315
15096	NC_012471	TTGG	2	8	912310	912317	0 %	50 %	50 %	0 %	225870315
15097	NC_012471	CAG	2	6	912332	912337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870315
15098	NC_012471	TGC	2	6	912429	912434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870315
15099	NC_012471	AGC	3	9	912447	912455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870315
15100	NC_012471	CTA	2	6	912524	912529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870315
15101	NC_012471	A	6	6	912545	912550	100 %	0 %	0 %	0 %	225870315
15102	NC_012471	A	7	7	912565	912571	100 %	0 %	0 %	0 %	225870315
15103	NC_012471	AAG	2	6	912575	912580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225870315
15104	NC_012471	AAACT	2	10	912589	912598	60 %	20 %	0 %	20 %	225870315
15105	NC_012471	TGA	3	9	912633	912641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870315
15106	NC_012471	AAG	2	6	912710	912715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225870315
15107	NC_012471	GAA	2	6	912751	912756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225870315
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15109	NC_012471	GAA	2	6	912814	912819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225870315
15110	NC_012471	AGC	2	6	912849	912854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870315
15111	NC_012471	GCA	2	6	912859	912864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870315
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15113	NC_012471	AAG	2	6	912922	912927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225870315
15114	NC_012471	CCAGCT	2	12	913183	913194	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	225870315
15115	NC_012471	AAG	2	6	913210	913215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225870315
15116	NC_012471	GAAGA	2	10	913216	913225	60 %	0 %	40 %	0 %	225870315
15117	NC_012471	AGC	2	6	913227	913232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870315
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15119	NC_012471	TTC	2	6	913285	913290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225870315
15120	NC_012471	CAA	2	6	913340	913345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225870315
15121	NC_012471	TTTG	2	8	914181	914188	0 %	75 %	25 %	0 %	225870316
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15151	NC_012471	A	6	6	915474	915479	100 %	0 %	0 %	0 %	225870316
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15224	NC_012471	TGCT	2	8	920139	920146	0 %	50 %	25 %	25 %	225870320
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15238	NC_012471	AGCCAG	2	12	920788	920799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870320
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15240	NC_012471	AGCCAG	2	12	920884	920895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870320
15241	NC_012471	AAACCA	2	12	920901	920912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225870320
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15252	NC_012471	TAGC	2	8	921657	921664	25 %	25 %	25 %	25 %	225870321
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15474	NC_012471	GAT	2	6	933961	933966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870330
15475	NC_012471	CCT	2	6	934112	934117	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225870330
15476	NC_012471	CAG	2	6	934120	934125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870330
15477	NC_012471	AAGAT	2	10	934155	934164	60 %	20 %	20 %	0 %	225870330
15478	NC_012471	T	7	7	934349	934355	0 %	100 %	0 %	0 %	225870331
15479	NC_012471	TTG	2	6	934400	934405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225870331
15480	NC_012471	TGG	2	6	934446	934451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225870331
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