MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus equi subsp. equi 4047

Total Repeats: 38017

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_012471	GGT	2	6	608669	608674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225870035
10002	NC_012471	TGA	2	6	608708	608713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870035
10003	NC_012471	CGT	2	6	608772	608777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870035
10004	NC_012471	GAA	2	6	608781	608786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225870035
10005	NC_012471	ACTTA	2	10	609176	609185	40 %	40 %	0 %	20 %	225870036
10006	NC_012471	CAA	2	6	609221	609226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225870036
10007	NC_012471	A	6	6	609270	609275	100 %	0 %	0 %	0 %	225870036
10008	NC_012471	GCCT	2	8	609299	609306	0 %	25 %	25 %	50 %	225870036
10009	NC_012471	ATT	2	6	609384	609389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225870036
10010	NC_012471	GTC	2	6	609529	609534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870036
10011	NC_012471	GAC	2	6	609567	609572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870036
10012	NC_012471	CTG	2	6	609592	609597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870036
10013	NC_012471	TGT	2	6	609836	609841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225870036
10014	NC_012471	GAC	2	6	609848	609853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870036
10015	NC_012471	GTT	2	6	609915	609920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225870036
10016	NC_012471	TGG	2	6	609949	609954	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225870036
10017	NC_012471	GCT	2	6	609978	609983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870036
10018	NC_012471	TGA	2	6	610076	610081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870036
10019	NC_012471	CAGGTA	2	12	610117	610128	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	225870036
10020	NC_012471	TGA	2	6	610208	610213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870036
10021	NC_012471	TGA	2	6	610222	610227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870036
10022	NC_012471	TTGC	2	8	610308	610315	0 %	50 %	25 %	25 %	225870036
10023	NC_012471	AAG	2	6	610318	610323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225870036
10024	NC_012471	A	6	6	610359	610364	100 %	0 %	0 %	0 %	225870036
10025	NC_012471	ATT	2	6	610368	610373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225870036
10026	NC_012471	ACA	2	6	610446	610451	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225870036
10027	NC_012471	TC	3	6	610516	610521	0 %	50 %	0 %	50 %	225870036
10028	NC_012471	AGG	2	6	610588	610593	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225870036
10029	NC_012471	ATT	2	6	610635	610640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225870036
10030	NC_012471	TGG	2	6	610641	610646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225870036
10031	NC_012471	CA	3	6	610682	610687	50 %	0 %	0 %	50 %	225870036
10032	NC_012471	TCT	2	6	610755	610760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225870036
10033	NC_012471	TGA	2	6	610771	610776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870036
10034	NC_012471	ATC	2	6	610786	610791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870036
10035	NC_012471	TGGT	2	8	610838	610845	0 %	50 %	50 %	0 %	225870036
10036	NC_012471	TCA	2	6	610851	610856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870036
10037	NC_012471	CTATC	2	10	610900	610909	20 %	40 %	0 %	40 %	225870036
10038	NC_012471	A	6	6	610939	610944	100 %	0 %	0 %	0 %	225870036
10039	NC_012471	TCTAAA	2	12	610947	610958	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	225870036
10040	NC_012471	ATG	2	6	610978	610983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870036
10041	NC_012471	ATG	2	6	611044	611049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870036
10042	NC_012471	GT	3	6	611053	611058	0 %	50 %	50 %	0 %	225870036
10043	NC_012471	CGCTT	2	10	611110	611119	0 %	40 %	20 %	40 %	225870036
10044	NC_012471	CTTG	2	8	611120	611127	0 %	50 %	25 %	25 %	225870036
10045	NC_012471	TGC	2	6	611180	611185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870036
10046	NC_012471	TAG	2	6	611221	611226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870036
10047	NC_012471	GCT	2	6	611352	611357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870036
10048	NC_012471	CGT	3	9	611370	611378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870036
10049	NC_012471	AGA	2	6	611483	611488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225870036
10050	NC_012471	GGA	2	6	611600	611605	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225870036
10051	NC_012471	ATT	2	6	611622	611627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225870036
10052	NC_012471	ATTG	2	8	611717	611724	25 %	50 %	25 %	0 %	225870036
10053	NC_012471	TC	3	6	611725	611730	0 %	50 %	0 %	50 %	225870036
10054	NC_012471	GAG	2	6	611745	611750	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225870036
10055	NC_012471	TGA	2	6	611777	611782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870036
10056	NC_012471	CGT	2	6	611832	611837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870036
10057	NC_012471	TTTG	2	8	611874	611881	0 %	75 %	25 %	0 %	225870036
10058	NC_012471	GAA	2	6	611904	611909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225870036
10059	NC_012471	GCT	2	6	611946	611951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870036
10060	NC_012471	AGAC	2	8	612437	612444	50 %	0 %	25 %	25 %	225870037
10061	NC_012471	GGAA	2	8	612449	612456	50 %	0 %	50 %	0 %	225870037
10062	NC_012471	TCAA	2	8	612460	612467	50 %	25 %	0 %	25 %	225870037
10063	NC_012471	ATT	2	6	612468	612473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225870037
10064	NC_012471	ATTT	2	8	612581	612588	25 %	75 %	0 %	0 %	225870037
10065	NC_012471	CTG	2	6	612712	612717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870037
10066	NC_012471	TAA	2	6	612725	612730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225870037
10067	NC_012471	TTC	2	6	612820	612825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225870038
10068	NC_012471	GAA	2	6	612879	612884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225870038
10069	NC_012471	ATG	2	6	612933	612938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870038
10070	NC_012471	TAG	3	9	612965	612973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870038
10071	NC_012471	ATA	3	9	613015	613023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225870038
10072	NC_012471	CAG	2	6	613032	613037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870038
10073	NC_012471	CTC	2	6	613048	613053	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225870038
10074	NC_012471	TCC	2	6	613105	613110	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225870038
10075	NC_012471	ATCT	2	8	613216	613223	25 %	50 %	0 %	25 %	225870038
10076	NC_012471	CTG	2	6	613494	613499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870039
10077	NC_012471	GCG	2	6	613552	613557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	225870039
10078	NC_012471	GGT	2	6	613656	613661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225870039
10079	NC_012471	CAT	2	6	613665	613670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870039
10080	NC_012471	AAT	2	6	613726	613731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225870039
10081	NC_012471	AGC	2	6	613810	613815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870039
10082	NC_012471	TGCCAG	2	12	613842	613853	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	225870039
10083	NC_012471	ATG	2	6	613865	613870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870039
10084	NC_012471	ATA	2	6	613871	613876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225870039
10085	NC_012471	CGTC	2	8	613919	613926	0 %	25 %	25 %	50 %	225870039
10086	NC_012471	GCG	2	6	614008	614013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	225870039
10087	NC_012471	CCT	2	6	614037	614042	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225870039
10088	NC_012471	CAG	2	6	614133	614138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870039
10089	NC_012471	CAA	2	6	614199	614204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225870039
10090	NC_012471	AGGA	2	8	614207	614214	50 %	0 %	50 %	0 %	225870039
10091	NC_012471	ACG	2	6	614254	614259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870039
10092	NC_012471	CGG	2	6	614319	614324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	225870039
10093	NC_012471	TTCCTT	2	12	614347	614358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225870039
10094	NC_012471	T	6	6	614382	614387	0 %	100 %	0 %	0 %	225870039
10095	NC_012471	TGA	2	6	614418	614423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870039
10096	NC_012471	GCT	2	6	614495	614500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870039
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10098	NC_012471	TCAA	2	8	614549	614556	50 %	25 %	0 %	25 %	225870039
10099	NC_012471	CAA	2	6	614580	614585	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225870039
10100	NC_012471	AAG	2	6	614648	614653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225870039
10101	NC_012471	AGC	2	6	614683	614688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870039
10102	NC_012471	TTC	2	6	614770	614775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225870039
10103	NC_012471	GAT	2	6	614836	614841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870039
10104	NC_012471	CAC	2	6	614883	614888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225870039
10105	NC_012471	TGC	2	6	614925	614930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870039
10106	NC_012471	TCA	2	6	614969	614974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870039
10107	NC_012471	TCC	2	6	615008	615013	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225870039
10108	NC_012471	T	6	6	615135	615140	0 %	100 %	0 %	0 %	225870039
10109	NC_012471	CAG	2	6	615159	615164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870039
10110	NC_012471	ACG	2	6	615211	615216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870039
10111	NC_012471	CAC	2	6	615276	615281	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225870039
10112	NC_012471	GCTG	2	8	615344	615351	0 %	25 %	50 %	25 %	225870039
10113	NC_012471	TG	4	8	615350	615357	0 %	50 %	50 %	0 %	225870039
10114	NC_012471	GCC	2	6	615394	615399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	225870039
10115	NC_012471	GGT	2	6	615410	615415	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225870039
10116	NC_012471	A	6	6	615460	615465	100 %	0 %	0 %	0 %	225870039
10117	NC_012471	TCA	2	6	615467	615472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870039
10118	NC_012471	GCT	2	6	615492	615497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870039
10119	NC_012471	CCT	2	6	615521	615526	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225870039
10120	NC_012471	ATC	2	6	615963	615968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870040
10121	NC_012471	GTT	3	9	616032	616040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225870040
10122	NC_012471	CTTTT	2	10	616658	616667	0 %	80 %	0 %	20 %	225870041
10123	NC_012471	TTTAGG	2	12	616670	616681	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	225870041
10124	NC_012471	TGA	2	6	616695	616700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870041
10125	NC_012471	GAA	2	6	616720	616725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225870041
10126	NC_012471	GCT	2	6	616769	616774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870041
10127	NC_012471	GCTGA	2	10	616803	616812	20 %	20 %	40 %	20 %	225870041
10128	NC_012471	CGC	2	6	616914	616919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	225870041
10129	NC_012471	CGC	2	6	616941	616946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	225870041
10130	NC_012471	CGC	2	6	617157	617162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	225870041
10131	NC_012471	CGC	2	6	617184	617189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	225870041
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10134	NC_012471	ATGT	2	8	617406	617413	25 %	50 %	25 %	0 %	225870041
10135	NC_012471	GTCC	2	8	617442	617449	0 %	25 %	25 %	50 %	225870041
10136	NC_012471	CTGGAT	2	12	617463	617474	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	225870041
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10138	NC_012471	GCT	2	6	617552	617557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870041
10139	NC_012471	T	7	7	617583	617589	0 %	100 %	0 %	0 %	225870041
10140	NC_012471	ATG	2	6	617994	617999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870042
10141	NC_012471	TGT	2	6	618011	618016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225870042
10142	NC_012471	T	6	6	618018	618023	0 %	100 %	0 %	0 %	225870042
10143	NC_012471	TGG	2	6	618127	618132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225870042
10144	NC_012471	TTGCTT	2	12	618145	618156	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	225870042
10145	NC_012471	GT	3	6	618193	618198	0 %	50 %	50 %	0 %	225870042
10146	NC_012471	TGGATT	2	12	618199	618210	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	225870042
10147	NC_012471	TAT	4	12	618230	618241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225870042
10148	NC_012471	GCT	2	6	618318	618323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870042
10149	NC_012471	CT	3	6	618326	618331	0 %	50 %	0 %	50 %	225870042
10150	NC_012471	TGA	2	6	618547	618552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870042
10151	NC_012471	AAC	2	6	618554	618559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225870042
10152	NC_012471	ATT	2	6	618572	618577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225870042
10153	NC_012471	GCT	2	6	618580	618585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870042
10154	NC_012471	AGGG	2	8	618604	618611	25 %	0 %	75 %	0 %	225870042
10155	NC_012471	ATT	2	6	618724	618729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225870043
10156	NC_012471	CAA	2	6	618788	618793	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225870043
10157	NC_012471	CAG	2	6	618880	618885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870043
10158	NC_012471	CAAAA	2	10	618939	618948	80 %	0 %	0 %	20 %	225870043
10159	NC_012471	AG	3	6	618974	618979	50 %	0 %	50 %	0 %	225870043
10160	NC_012471	GCT	2	6	618987	618992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870043
10161	NC_012471	GA	3	6	619008	619013	50 %	0 %	50 %	0 %	225870043
10162	NC_012471	GCT	2	6	619018	619023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870043
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10167	NC_012471	TGC	2	6	619100	619105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870043
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10174	NC_012471	GAA	2	6	619851	619856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225870044
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10184	NC_012471	AAG	2	6	620671	620676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225870044
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10193	NC_012471	GTCA	2	8	621106	621113	25 %	25 %	25 %	25 %	225870044
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10221	NC_012471	GTG	2	6	622605	622610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225870046
10222	NC_012471	TGC	2	6	622648	622653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870046
10223	NC_012471	GAT	2	6	622694	622699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870046
10224	NC_012471	AGCAG	2	10	622769	622778	40 %	0 %	40 %	20 %	225870046
10225	NC_012471	ATC	2	6	622815	622820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870046
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10228	NC_012471	ATG	2	6	622962	622967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870046
10229	NC_012471	CCAA	2	8	622971	622978	50 %	0 %	0 %	50 %	225870046
10230	NC_012471	GGT	2	6	623096	623101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225870046
10231	NC_012471	TGG	2	6	623163	623168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225870046
10232	NC_012471	TGA	2	6	623209	623214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870046
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10235	NC_012471	AGC	2	6	623926	623931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225870047
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10237	NC_012471	CTT	2	6	623957	623962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225870047
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10358	NC_012471	GTC	2	6	629347	629352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870053
10359	NC_012471	GAAG	2	8	629365	629372	50 %	0 %	50 %	0 %	225870053
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10363	NC_012471	TTA	2	6	629517	629522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225870053
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10479	NC_012471	ATA	2	6	635384	635389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225870060
10480	NC_012471	GC	3	6	635390	635395	0 %	0 %	50 %	50 %	225870060
10481	NC_012471	GTA	2	6	635483	635488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870060
10482	NC_012471	TTTCC	2	10	635506	635515	0 %	60 %	0 %	40 %	225870060
10483	NC_012471	TAA	2	6	635525	635530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225870060
10484	NC_012471	TCA	2	6	635619	635624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225870060
10485	NC_012471	GCT	2	6	635752	635757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870060
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10487	NC_012471	CTGT	2	8	635821	635828	0 %	50 %	25 %	25 %	225870060
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10490	NC_012471	TGC	2	6	636004	636009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225870060
10491	NC_012471	TGA	2	6	636027	636032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225870060
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