MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus equi subsp. equi 4047

Total Repeats: 38017

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012471	T	6	6	20	25	0 %	100 %	0 %	0 %	225869488
2	NC_012471	AGCT	2	8	41	48	25 %	25 %	25 %	25 %	225869488
3	NC_012471	T	6	6	79	84	0 %	100 %	0 %	0 %	225869488
4	NC_012471	ATG	2	6	89	94	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869488
5	NC_012471	CAA	2	6	125	130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225869488
6	NC_012471	T	7	7	131	137	0 %	100 %	0 %	0 %	225869488
7	NC_012471	A	7	7	164	170	100 %	0 %	0 %	0 %	225869488
8	NC_012471	CAG	2	6	191	196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869488
9	NC_012471	TGA	2	6	251	256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869488
10	NC_012471	CAG	2	6	314	319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869488
11	NC_012471	TGA	2	6	369	374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869488
12	NC_012471	TGC	2	6	390	395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869488
13	NC_012471	AAC	2	6	423	428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225869488
14	NC_012471	TTTA	2	8	438	445	25 %	75 %	0 %	0 %	225869488
15	NC_012471	TTA	2	6	554	559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869488
16	NC_012471	TGT	2	6	567	572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225869488
17	NC_012471	TCC	2	6	629	634	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225869488
18	NC_012471	TGA	2	6	639	644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869488
19	NC_012471	A	7	7	661	667	100 %	0 %	0 %	0 %	225869488
20	NC_012471	ATAACA	2	12	716	727	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	225869488
21	NC_012471	AGA	2	6	777	782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225869488
22	NC_012471	AGC	2	6	1020	1025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869488
23	NC_012471	GAA	2	6	1081	1086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225869488
24	NC_012471	CA	3	6	1149	1154	50 %	0 %	0 %	50 %	225869488
25	NC_012471	TGCT	2	8	1163	1170	0 %	50 %	25 %	25 %	225869488
26	NC_012471	GGA	2	6	1240	1245	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225869488
27	NC_012471	AATTGA	2	12	1317	1328	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	225869488
28	NC_012471	TTCA	2	8	1540	1547	25 %	50 %	0 %	25 %	225869489
29	NC_012471	CAG	2	6	1575	1580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869489
30	NC_012471	TTG	2	6	1708	1713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225869489
31	NC_012471	T	6	6	1750	1755	0 %	100 %	0 %	0 %	225869489
32	NC_012471	GGT	2	6	1818	1823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225869489
33	NC_012471	TGC	2	6	1962	1967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869489
34	NC_012471	GTC	2	6	1982	1987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869489
35	NC_012471	GA	3	6	2133	2138	50 %	0 %	50 %	0 %	225869489
36	NC_012471	GAT	2	6	2158	2163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869489
37	NC_012471	TGA	2	6	2276	2281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869489
38	NC_012471	AC	3	6	2309	2314	50 %	0 %	0 %	50 %	225869489
39	NC_012471	GTG	2	6	2458	2463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225869489
40	NC_012471	GAT	2	6	2596	2601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869489
41	NC_012471	AG	3	6	2604	2609	50 %	0 %	50 %	0 %	225869489
42	NC_012471	TGAAA	2	10	2747	2756	60 %	20 %	20 %	0 %	225869490
43	NC_012471	A	6	6	2789	2794	100 %	0 %	0 %	0 %	225869490
44	NC_012471	GTC	2	6	2875	2880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869490
45	NC_012471	GAA	2	6	2900	2905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225869490
46	NC_012471	ATG	2	6	3042	3047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869491
47	NC_012471	AAG	2	6	3069	3074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225869491
48	NC_012471	TTA	2	6	3259	3264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869491
49	NC_012471	TCT	2	6	3338	3343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225869491
50	NC_012471	TAT	2	6	3349	3354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869491
51	NC_012471	GT	3	6	3376	3381	0 %	50 %	50 %	0 %	225869491
52	NC_012471	CAG	2	6	3501	3506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869492
53	NC_012471	GCT	2	6	3575	3580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869492
54	NC_012471	TGGTA	2	10	3613	3622	20 %	40 %	40 %	0 %	225869492
55	NC_012471	A	7	7	3671	3677	100 %	0 %	0 %	0 %	225869492
56	NC_012471	TGA	3	9	3811	3819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869492
57	NC_012471	AATT	2	8	3894	3901	50 %	50 %	0 %	0 %	225869492
58	NC_012471	AATC	2	8	3915	3922	50 %	25 %	0 %	25 %	225869492
59	NC_012471	A	6	6	3945	3950	100 %	0 %	0 %	0 %	225869492
60	NC_012471	A	6	6	4002	4007	100 %	0 %	0 %	0 %	225869492
61	NC_012471	GAA	2	6	4022	4027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225869492
62	NC_012471	GAT	2	6	4058	4063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869492
63	NC_012471	A	6	6	4068	4073	100 %	0 %	0 %	0 %	225869492
64	NC_012471	TTA	2	6	4091	4096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869492
65	NC_012471	TGA	2	6	4129	4134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869492
66	NC_012471	GCA	2	6	4190	4195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869492
67	NC_012471	GTT	2	6	4211	4216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225869492
68	NC_012471	AGA	3	9	4234	4242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225869492
69	NC_012471	GAT	2	6	4256	4261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869492
70	NC_012471	ACTTGG	2	12	4342	4353	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	225869492
71	NC_012471	GTGC	2	8	4382	4389	0 %	25 %	50 %	25 %	225869492
72	NC_012471	CAC	2	6	4416	4421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225869492
73	NC_012471	AGC	2	6	4423	4428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869492
74	NC_012471	ATG	2	6	4485	4490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869492
75	NC_012471	GTC	2	6	4533	4538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869492
76	NC_012471	AGGA	2	8	4545	4552	50 %	0 %	50 %	0 %	225869492
77	NC_012471	AT	3	6	4558	4563	50 %	50 %	0 %	0 %	225869492
78	NC_012471	CAAA	2	8	4813	4820	75 %	0 %	0 %	25 %	225869493
79	NC_012471	AGA	2	6	4881	4886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225869493
80	NC_012471	ATCA	2	8	4921	4928	50 %	25 %	0 %	25 %	225869493
81	NC_012471	ATTT	2	8	4936	4943	25 %	75 %	0 %	0 %	225869493
82	NC_012471	AAT	2	6	4966	4971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225869493
83	NC_012471	ATG	2	6	5039	5044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869493
84	NC_012471	ATT	2	6	5119	5124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869493
85	NC_012471	TTA	2	6	5195	5200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869493
86	NC_012471	GAT	2	6	5227	5232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869493
87	NC_012471	CAAT	2	8	5240	5247	50 %	25 %	0 %	25 %	225869493
88	NC_012471	TAT	2	6	5281	5286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869493
89	NC_012471	A	6	6	5294	5299	100 %	0 %	0 %	0 %	225869493
90	NC_012471	GCA	2	6	5316	5321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869493
91	NC_012471	ATT	2	6	5351	5356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869494
92	NC_012471	AGC	3	9	5444	5452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869494
93	NC_012471	GTG	2	6	5493	5498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225869494
94	NC_012471	CTTG	2	8	5546	5553	0 %	50 %	25 %	25 %	225869494
95	NC_012471	T	6	6	5574	5579	0 %	100 %	0 %	0 %	225869494
96	NC_012471	GAT	2	6	5583	5588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869494
97	NC_012471	CTG	2	6	5590	5595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869494
98	NC_012471	T	6	6	5654	5659	0 %	100 %	0 %	0 %	225869494
99	NC_012471	TTAGC	2	10	5692	5701	20 %	40 %	20 %	20 %	225869494
100	NC_012471	CAG	2	6	5739	5744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869494
101	NC_012471	AAG	2	6	5796	5801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225869494
102	NC_012471	T	6	6	5919	5924	0 %	100 %	0 %	0 %	225869494
103	NC_012471	TGA	2	6	5927	5932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869494
104	NC_012471	TC	3	6	5973	5978	0 %	50 %	0 %	50 %	225869494
105	NC_012471	AAG	2	6	5982	5987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225869494
106	NC_012471	GGA	2	6	6032	6037	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225869494
107	NC_012471	AGC	2	6	6067	6072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869494
108	NC_012471	GGA	2	6	6107	6112	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225869494
109	NC_012471	AAG	2	6	6130	6135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225869494
110	NC_012471	AATG	2	8	6183	6190	50 %	25 %	25 %	0 %	225869494
111	NC_012471	T	6	6	6228	6233	0 %	100 %	0 %	0 %	225869494
112	NC_012471	GAT	2	6	6234	6239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869494
113	NC_012471	AGTT	2	8	6247	6254	25 %	50 %	25 %	0 %	225869494
114	NC_012471	TTG	2	6	6291	6296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225869494
115	NC_012471	GAT	2	6	6300	6305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869494
116	NC_012471	ATT	2	6	6337	6342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869494
117	NC_012471	CTT	2	6	6386	6391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225869494
118	NC_012471	TCAA	2	8	6472	6479	50 %	25 %	0 %	25 %	225869494
119	NC_012471	TGA	2	6	6494	6499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869494
120	NC_012471	TCA	2	6	6551	6556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869494
121	NC_012471	CTG	2	6	6616	6621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869494
122	NC_012471	ATT	2	6	6651	6656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869494
123	NC_012471	TGA	2	6	6686	6691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869494
124	NC_012471	AT	3	6	6720	6725	50 %	50 %	0 %	0 %	225869494
125	NC_012471	CGT	2	6	6741	6746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869494
126	NC_012471	TCG	2	6	6749	6754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869494
127	NC_012471	T	6	6	6845	6850	0 %	100 %	0 %	0 %	225869494
128	NC_012471	CAG	2	6	6909	6914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869494
129	NC_012471	CAG	2	6	6970	6975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869494
130	NC_012471	TAA	2	6	6995	7000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225869494
131	NC_012471	AGCAA	2	10	7025	7034	60 %	0 %	20 %	20 %	225869494
132	NC_012471	GAT	2	6	7125	7130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869494
133	NC_012471	GAG	2	6	7149	7154	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225869494
134	NC_012471	TTG	2	6	7165	7170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225869494
135	NC_012471	TGA	2	6	7175	7180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869494
136	NC_012471	A	6	6	7206	7211	100 %	0 %	0 %	0 %	225869494
137	NC_012471	GCT	2	6	7290	7295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869494
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139	NC_012471	CAG	2	6	7356	7361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869494
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141	NC_012471	A	6	6	7466	7471	100 %	0 %	0 %	0 %	225869494
142	NC_012471	ATT	3	9	7485	7493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869494
143	NC_012471	T	6	6	7525	7530	0 %	100 %	0 %	0 %	225869494
144	NC_012471	TGA	2	6	7553	7558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869494
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149	NC_012471	TAT	2	6	7772	7777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869494
150	NC_012471	GTG	2	6	7792	7797	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225869494
151	NC_012471	AAG	2	6	7839	7844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225869494
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153	NC_012471	CAA	2	6	7969	7974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225869494
154	NC_012471	TAT	2	6	7976	7981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869494
155	NC_012471	TTAT	2	8	8016	8023	25 %	75 %	0 %	0 %	225869494
156	NC_012471	A	6	6	8149	8154	100 %	0 %	0 %	0 %	225869494
157	NC_012471	AT	3	6	8239	8244	50 %	50 %	0 %	0 %	225869494
158	NC_012471	GCT	2	6	8300	8305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869494
159	NC_012471	GCAA	3	12	8319	8330	50 %	0 %	25 %	25 %	225869494
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168	NC_012471	TCT	2	6	8847	8852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225869495
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172	NC_012471	CAA	2	6	8947	8952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225869495
173	NC_012471	TAT	2	6	8970	8975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869495
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180	NC_012471	TTTA	2	8	9335	9342	25 %	75 %	0 %	0 %	225869495
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224	NC_012471	TGA	2	6	11026	11031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869498
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249	NC_012471	GCA	3	9	12137	12145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869499
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251	NC_012471	ATT	2	6	12182	12187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869499
252	NC_012471	TGA	2	6	12211	12216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869499
253	NC_012471	A	6	6	12229	12234	100 %	0 %	0 %	0 %	225869499
254	NC_012471	ATG	2	6	12285	12290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869499
255	NC_012471	TTATC	2	10	12318	12327	20 %	60 %	0 %	20 %	225869499
256	NC_012471	GAC	2	6	12353	12358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869499
257	NC_012471	CAT	2	6	12420	12425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869500
258	NC_012471	A	6	6	12426	12431	100 %	0 %	0 %	0 %	225869500
259	NC_012471	TCA	2	6	12450	12455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869500
260	NC_012471	TGG	2	6	12477	12482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225869500
261	NC_012471	TGC	2	6	12500	12505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869500
262	NC_012471	CTAT	2	8	12635	12642	25 %	50 %	0 %	25 %	225869500
263	NC_012471	TGC	2	6	12675	12680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869500
264	NC_012471	T	6	6	12700	12705	0 %	100 %	0 %	0 %	225869500
265	NC_012471	GCA	2	6	12717	12722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869500
266	NC_012471	ATT	2	6	12728	12733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869500
267	NC_012471	CAT	2	6	12751	12756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869500
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269	NC_012471	TGA	2	6	12782	12787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869500
270	NC_012471	AG	3	6	12829	12834	50 %	0 %	50 %	0 %	225869500
271	NC_012471	TCA	2	6	12963	12968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869500
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273	NC_012471	CTG	2	6	13042	13047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869500
274	NC_012471	TGA	2	6	13059	13064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869500
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291	NC_012471	A	6	6	13704	13709	100 %	0 %	0 %	0 %	225869501
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299	NC_012471	TG	3	6	14113	14118	0 %	50 %	50 %	0 %	225869501
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379	NC_012471	TAT	2	6	17640	17645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869503
380	NC_012471	ATGC	2	8	17729	17736	25 %	25 %	25 %	25 %	225869503
381	NC_012471	AAGA	2	8	17756	17763	75 %	0 %	25 %	0 %	225869503
382	NC_012471	T	7	7	24867	24873	0 %	100 %	0 %	0 %	225869504
383	NC_012471	CAT	2	6	24880	24885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869504
384	NC_012471	TTC	2	6	24910	24915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225869504
385	NC_012471	AGG	2	6	25012	25017	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225869504
386	NC_012471	A	6	6	25070	25075	100 %	0 %	0 %	0 %	225869504
387	NC_012471	TGC	2	6	25184	25189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869504
388	NC_012471	GAA	2	6	25355	25360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225869504
389	NC_012471	GATAAG	2	12	25386	25397	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	225869504
390	NC_012471	TGC	2	6	25565	25570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869504
391	NC_012471	CGT	2	6	25584	25589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869504
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393	NC_012471	TTG	3	9	25636	25644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225869504
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