MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus equi subsp. zooepidemicus

Total Repeats: 36889

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_012470	TGA	3	9	212725	212733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867793
3502	NC_012470	GGC	2	6	212759	212764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	225867793
3503	NC_012470	A	6	6	212789	212794	100 %	0 %	0 %	0 %	225867793
3504	NC_012470	CTG	2	6	212874	212879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225867793
3505	NC_012470	AGCCTG	2	12	212928	212939	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	225867793
3506	NC_012470	CAA	2	6	212968	212973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225867793
3507	NC_012470	AGC	2	6	212985	212990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225867793
3508	NC_012470	AGGTA	2	10	213031	213040	40 %	20 %	40 %	0 %	225867793
3509	NC_012470	GCG	2	6	213059	213064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	225867793
3510	NC_012470	TC	3	6	213117	213122	0 %	50 %	0 %	50 %	225867793
3511	NC_012470	TGGC	2	8	213161	213168	0 %	25 %	50 %	25 %	225867793
3512	NC_012470	TTA	2	6	213270	213275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225867793
3513	NC_012470	ATC	2	6	213281	213286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225867793
3514	NC_012470	CCA	2	6	213326	213331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225867793
3515	NC_012470	GTT	3	9	213485	213493	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225867793
3516	NC_012470	GGC	2	6	213604	213609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	225867794
3517	NC_012470	TGC	2	6	213622	213627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225867794
3518	NC_012470	ACA	2	6	213693	213698	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225867794
3519	NC_012470	CTG	2	6	213720	213725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225867794
3520	NC_012470	CAG	2	6	213765	213770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225867794
3521	NC_012470	TGT	2	6	213778	213783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225867794
3522	NC_012470	A	7	7	213786	213792	100 %	0 %	0 %	0 %	225867794
3523	NC_012470	CAGC	2	8	213837	213844	25 %	0 %	25 %	50 %	225867794
3524	NC_012470	GCTTA	2	10	213920	213929	20 %	40 %	20 %	20 %	225867794
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3528	NC_012470	TGC	2	6	214594	214599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225867796
3529	NC_012470	A	6	6	214620	214625	100 %	0 %	0 %	0 %	225867796
3530	NC_012470	GCTG	2	8	214628	214635	0 %	25 %	50 %	25 %	225867796
3531	NC_012470	CAA	2	6	214660	214665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225867796
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3533	NC_012470	TTC	2	6	214724	214729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225867796
3534	NC_012470	GTT	2	6	214838	214843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225867796
3535	NC_012470	ATA	2	6	214914	214919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225867796
3536	NC_012470	TGG	2	6	214964	214969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225867796
3537	NC_012470	TGTA	2	8	214982	214989	25 %	50 %	25 %	0 %	225867796
3538	NC_012470	CTTACC	2	12	215024	215035	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	225867796
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3540	NC_012470	AGT	2	6	215192	215197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867796
3541	NC_012470	GCT	2	6	215205	215210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225867796
3542	NC_012470	TG	3	6	215250	215255	0 %	50 %	50 %	0 %	225867796
3543	NC_012470	CTTC	2	8	215383	215390	0 %	50 %	0 %	50 %	225867796
3544	NC_012470	AGA	2	6	215416	215421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225867796
3545	NC_012470	CCT	2	6	215424	215429	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225867796
3546	NC_012470	CAT	2	6	215515	215520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225867796
3547	NC_012470	GCT	2	6	215548	215553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225867796
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3550	NC_012470	ATC	2	6	215951	215956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225867796
3551	NC_012470	ACG	2	6	216041	216046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225867796
3552	NC_012470	TGA	2	6	216073	216078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867796
3553	NC_012470	TCTT	2	8	216080	216087	0 %	75 %	0 %	25 %	225867796
3554	NC_012470	TTC	2	6	216131	216136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225867796
3555	NC_012470	CGTG	2	8	216184	216191	0 %	25 %	50 %	25 %	225867796
3556	NC_012470	CAT	2	6	216226	216231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225867796
3557	NC_012470	CTGAC	2	10	216326	216335	20 %	20 %	20 %	40 %	225867796
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3560	NC_012470	TGA	2	6	216513	216518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867796
3561	NC_012470	GTT	2	6	216549	216554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225867796
3562	NC_012470	CTG	3	9	216700	216708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225867796
3563	NC_012470	AGCT	2	8	216712	216719	25 %	25 %	25 %	25 %	225867796
3564	NC_012470	AGC	2	6	216722	216727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225867796
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3569	NC_012470	T	6	6	216968	216973	0 %	100 %	0 %	0 %	225867796
3570	NC_012470	T	6	6	216995	217000	0 %	100 %	0 %	0 %	225867796
3571	NC_012470	CAG	2	6	217067	217072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225867796
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3583	NC_012470	CTAAG	2	10	218143	218152	40 %	20 %	20 %	20 %	225867797
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3598	NC_012470	A	6	6	218655	218660	100 %	0 %	0 %	0 %	225867798
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3607	NC_012470	AGC	2	6	219133	219138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225867798
3608	NC_012470	GGT	2	6	219224	219229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225867798
3609	NC_012470	TTC	2	6	219232	219237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225867798
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3622	NC_012470	GCAG	2	8	220215	220222	25 %	0 %	50 %	25 %	225867799
3623	NC_012470	TGA	2	6	220247	220252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867799
3624	NC_012470	AGC	2	6	220316	220321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225867799
3625	NC_012470	TGA	2	6	220368	220373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867799
3626	NC_012470	GCTA	2	8	220377	220384	25 %	25 %	25 %	25 %	225867799
3627	NC_012470	TCA	2	6	220400	220405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225867799
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3630	NC_012470	GCT	2	6	220525	220530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225867799
3631	NC_012470	AGCGC	2	10	220546	220555	20 %	0 %	40 %	40 %	225867799
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3633	NC_012470	TCA	2	6	220581	220586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225867799
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3635	NC_012470	CAT	2	6	220927	220932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225867800
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3637	NC_012470	GCA	2	6	221007	221012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225867800
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3639	NC_012470	TGG	2	6	221150	221155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225867800
3640	NC_012470	GGT	2	6	221178	221183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225867800
3641	NC_012470	CTAT	2	8	221233	221240	25 %	50 %	0 %	25 %	225867800
3642	NC_012470	TTC	2	6	221246	221251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225867800
3643	NC_012470	CTGA	2	8	221259	221266	25 %	25 %	25 %	25 %	225867800
3644	NC_012470	GAT	2	6	221303	221308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867800
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3647	NC_012470	TAC	2	6	221412	221417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225867800
3648	NC_012470	CTTT	2	8	221446	221453	0 %	75 %	0 %	25 %	225867800
3649	NC_012470	TTCG	2	8	221488	221495	0 %	50 %	25 %	25 %	225867800
3650	NC_012470	TTG	2	6	221511	221516	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225867800
3651	NC_012470	TGC	2	6	221635	221640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225867800
3652	NC_012470	CAC	2	6	221652	221657	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225867800
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3654	NC_012470	CT	3	6	221752	221757	0 %	50 %	0 %	50 %	225867800
3655	NC_012470	TGT	2	6	221831	221836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225867800
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3862	NC_012470	TGA	2	6	236218	236223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867809
3863	NC_012470	GCA	2	6	236327	236332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225867809
3864	NC_012470	CAGA	2	8	236409	236416	50 %	0 %	25 %	25 %	225867809
3865	NC_012470	T	6	6	236446	236451	0 %	100 %	0 %	0 %	225867809
3866	NC_012470	GTC	2	6	236475	236480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225867809
3867	NC_012470	TA	3	6	236503	236508	50 %	50 %	0 %	0 %	225867809
3868	NC_012470	GGCTAT	2	12	236525	236536	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	225867809
3869	NC_012470	TGC	2	6	236539	236544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225867809
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3871	NC_012470	AGG	2	6	236683	236688	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225867809
3872	NC_012470	GGGT	2	8	236710	236717	0 %	25 %	75 %	0 %	225867809
3873	NC_012470	CAATG	2	10	236737	236746	40 %	20 %	20 %	20 %	225867809
3874	NC_012470	CTG	2	6	236776	236781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225867809
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3877	NC_012470	TTGG	2	8	236903	236910	0 %	50 %	50 %	0 %	225867809
3878	NC_012470	GCT	2	6	236927	236932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225867809
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3880	NC_012470	TTG	3	9	236989	236997	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225867809
3881	NC_012470	T	6	6	237021	237026	0 %	100 %	0 %	0 %	225867809
3882	NC_012470	GAA	2	6	237027	237032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225867809
3883	NC_012470	GCAG	2	8	237074	237081	25 %	0 %	50 %	25 %	225867809
3884	NC_012470	TGA	2	6	237131	237136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867809
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3890	NC_012470	GTC	2	6	237541	237546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225867810
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3896	NC_012470	A	7	7	237798	237804	100 %	0 %	0 %	0 %	225867811
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3901	NC_012470	ATC	2	6	238327	238332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225867812
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3903	NC_012470	A	6	6	238357	238362	100 %	0 %	0 %	0 %	225867812
3904	NC_012470	AGG	2	6	238412	238417	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225867812
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3921	NC_012470	GCT	2	6	239142	239147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225867813
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3982	NC_012470	TCA	2	6	242333	242338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225867815
3983	NC_012470	TTGG	2	8	242383	242390	0 %	50 %	50 %	0 %	225867815
3984	NC_012470	ACC	2	6	242423	242428	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225867815
3985	NC_012470	CTT	2	6	242439	242444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225867815
3986	NC_012470	GAG	3	9	242458	242466	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225867815
3987	NC_012470	CAA	2	6	242583	242588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225867815
3988	NC_012470	GA	3	6	242669	242674	50 %	0 %	50 %	0 %	225867815
3989	NC_012470	GGC	2	6	242766	242771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	225867815
3990	NC_012470	TGA	2	6	242781	242786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867815
3991	NC_012470	GCT	2	6	242816	242821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225867815
3992	NC_012470	AGC	2	6	242861	242866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225867815
3993	NC_012470	AGCT	2	8	242939	242946	25 %	25 %	25 %	25 %	225867815
3994	NC_012470	AGG	2	6	242987	242992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225867815
3995	NC_012470	ATG	2	6	243041	243046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867815
3996	NC_012470	TGA	2	6	243054	243059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225867815
3997	NC_012470	A	6	6	243133	243138	100 %	0 %	0 %	0 %	225867815
3998	NC_012470	TTG	2	6	243152	243157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225867815
3999	NC_012470	ATCAAA	2	12	243160	243171	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	225867815
4000	NC_012470	TTGA	2	8	243208	243215	25 %	50 %	25 %	0 %	225867815

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