MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus equi subsp. zooepidemicus

Total Repeats: 36889

< Previous12...62636465666768697071727374Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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32003	NC_012470	ATT	2	6	1860853	1860858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869227
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32005	NC_012470	TAA	2	6	1860911	1860916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225869227
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32009	NC_012470	AGCAAA	2	12	1861210	1861221	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	225869227
32010	NC_012470	AT	3	6	1861228	1861233	50 %	50 %	0 %	0 %	225869227
32011	NC_012470	AGG	2	6	1861247	1861252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225869227
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32013	NC_012470	CTT	2	6	1861318	1861323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225869227
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32015	NC_012470	GAG	2	6	1861413	1861418	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225869227
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32024	NC_012470	TGG	2	6	1861718	1861723	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225869227
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32055	NC_012470	GCT	3	9	1863172	1863180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869228
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32100	NC_012470	TAGG	2	8	1866135	1866142	25 %	25 %	50 %	0 %	225869232
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32102	NC_012470	CAAGG	2	10	1866371	1866380	40 %	0 %	40 %	20 %	225869232
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32112	NC_012470	GTC	2	6	1866936	1866941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869233
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32116	NC_012470	TC	3	6	1867080	1867085	0 %	50 %	0 %	50 %	225869233
32117	NC_012470	TCA	2	6	1867093	1867098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869233
32118	NC_012470	TGC	2	6	1867140	1867145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869233
32119	NC_012470	CAA	2	6	1867199	1867204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225869233
32120	NC_012470	GCA	2	6	1867216	1867221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869233
32121	NC_012470	TCA	2	6	1867228	1867233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869233
32122	NC_012470	CAG	2	6	1867304	1867309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869233
32123	NC_012470	CCT	2	6	1867337	1867342	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225869233
32124	NC_012470	AT	3	6	1867423	1867428	50 %	50 %	0 %	0 %	225869233
32125	NC_012470	TTC	2	6	1867445	1867450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225869233
32126	NC_012470	A	6	6	1867512	1867517	100 %	0 %	0 %	0 %	225869234
32127	NC_012470	T	6	6	1867520	1867525	0 %	100 %	0 %	0 %	225869234
32128	NC_012470	TCAGCC	2	12	1867572	1867583	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	225869234
32129	NC_012470	GCT	4	12	1867642	1867653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869234
32130	NC_012470	GCT	2	6	1867660	1867665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869234
32131	NC_012470	AGC	2	6	1867715	1867720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869234
32132	NC_012470	GCT	2	6	1867744	1867749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869234
32133	NC_012470	T	7	7	1867773	1867779	0 %	100 %	0 %	0 %	225869234
32134	NC_012470	GCT	2	6	1867807	1867812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869234
32135	NC_012470	TCA	3	9	1867833	1867841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869234
32136	NC_012470	TCC	2	6	1867863	1867868	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225869234
32137	NC_012470	AAC	2	6	1867892	1867897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225869234
32138	NC_012470	TCC	2	6	1867926	1867931	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225869234
32139	NC_012470	ATT	2	6	1867952	1867957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869234
32140	NC_012470	TTA	2	6	1868031	1868036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869234
32141	NC_012470	TTA	2	6	1868053	1868058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869234
32142	NC_012470	ATACG	2	10	1868154	1868163	40 %	20 %	20 %	20 %	225869235
32143	NC_012470	ATT	3	9	1868164	1868172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869235
32144	NC_012470	GGT	2	6	1868176	1868181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225869235
32145	NC_012470	CTG	2	6	1868183	1868188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869235
32146	NC_012470	ATG	2	6	1868191	1868196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869235
32147	NC_012470	AGC	2	6	1868209	1868214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869235
32148	NC_012470	AGCT	2	8	1868267	1868274	25 %	25 %	25 %	25 %	225869235
32149	NC_012470	GGA	3	9	1868281	1868289	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225869235
32150	NC_012470	TGA	2	6	1868319	1868324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869235
32151	NC_012470	CAT	2	6	1868394	1868399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869235
32152	NC_012470	T	6	6	1868404	1868409	0 %	100 %	0 %	0 %	225869235
32153	NC_012470	AGA	2	6	1868433	1868438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225869235
32154	NC_012470	ATCA	2	8	1868468	1868475	50 %	25 %	0 %	25 %	225869235
32155	NC_012470	ATT	2	6	1868482	1868487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869235
32156	NC_012470	A	6	6	1868501	1868506	100 %	0 %	0 %	0 %	225869235
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32178	NC_012470	ATC	2	6	1870194	1870199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869237
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32194	NC_012470	CTG	2	6	1870848	1870853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869237
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32198	NC_012470	TGA	2	6	1870927	1870932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869237
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32202	NC_012470	GTC	2	6	1871100	1871105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869237
32203	NC_012470	AGCT	2	8	1871110	1871117	25 %	25 %	25 %	25 %	225869237
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32205	NC_012470	CTG	2	6	1871228	1871233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869238
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32217	NC_012470	TCA	2	6	1871757	1871762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869238
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32220	NC_012470	AG	3	6	1871836	1871841	50 %	0 %	50 %	0 %	225869238
32221	NC_012470	GCC	2	6	1871877	1871882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	225869238
32222	NC_012470	GCT	3	9	1871949	1871957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869238
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32224	NC_012470	AACCGC	2	12	1871999	1872010	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	225869238
32225	NC_012470	AGTCA	2	10	1872011	1872020	40 %	20 %	20 %	20 %	225869238
32226	NC_012470	CCT	2	6	1872037	1872042	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225869238
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32230	NC_012470	AAT	2	6	1872146	1872151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225869238
32231	NC_012470	T	6	6	1872174	1872179	0 %	100 %	0 %	0 %	225869238
32232	NC_012470	TCA	2	6	1872198	1872203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869238
32233	NC_012470	AT	3	6	1872225	1872230	50 %	50 %	0 %	0 %	225869238
32234	NC_012470	TTCC	2	8	1872245	1872252	0 %	50 %	0 %	50 %	225869239
32235	NC_012470	GCT	2	6	1872268	1872273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869239
32236	NC_012470	ATA	2	6	1872288	1872293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225869239
32237	NC_012470	GCT	2	6	1872338	1872343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869239
32238	NC_012470	A	6	6	1872499	1872504	100 %	0 %	0 %	0 %	225869239
32239	NC_012470	TGA	2	6	1872520	1872525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869239
32240	NC_012470	AAT	2	6	1872536	1872541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225869239
32241	NC_012470	CTG	2	6	1872552	1872557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869239
32242	NC_012470	GCT	3	9	1872628	1872636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869239
32243	NC_012470	CAT	2	6	1872651	1872656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869239
32244	NC_012470	TCA	2	6	1872684	1872689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869240
32245	NC_012470	GCA	2	6	1872693	1872698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869240
32246	NC_012470	GCT	2	6	1872756	1872761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869240
32247	NC_012470	GCT	2	6	1872779	1872784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869240
32248	NC_012470	AACC	2	8	1872793	1872800	50 %	0 %	0 %	50 %	225869240
32249	NC_012470	CAA	2	6	1872883	1872888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225869240
32250	NC_012470	ATA	2	6	1872974	1872979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225869240
32251	NC_012470	CGT	2	6	1872996	1873001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869240
32252	NC_012470	ATCA	2	8	1873007	1873014	50 %	25 %	0 %	25 %	225869240
32253	NC_012470	AAGC	2	8	1873108	1873115	50 %	0 %	25 %	25 %	225869240
32254	NC_012470	GTAGCA	2	12	1873125	1873136	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	225869240
32255	NC_012470	CTA	2	6	1873171	1873176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869240
32256	NC_012470	CGATC	2	10	1873177	1873186	20 %	20 %	20 %	40 %	225869240
32257	NC_012470	A	6	6	1873221	1873226	100 %	0 %	0 %	0 %	225869240
32258	NC_012470	TTC	2	6	1873257	1873262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225869240
32259	NC_012470	AAT	2	6	1873287	1873292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225869240
32260	NC_012470	CGT	2	6	1873688	1873693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869241
32261	NC_012470	AC	3	6	1873698	1873703	50 %	0 %	0 %	50 %	225869241
32262	NC_012470	GCT	2	6	1873807	1873812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869241
32263	NC_012470	TGG	2	6	1873922	1873927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225869242
32264	NC_012470	GA	3	6	1873933	1873938	50 %	0 %	50 %	0 %	225869242
32265	NC_012470	ATC	2	6	1873977	1873982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869242
32266	NC_012470	TTG	2	6	1874059	1874064	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225869242
32267	NC_012470	T	6	6	1874132	1874137	0 %	100 %	0 %	0 %	225869242
32268	NC_012470	AAGC	2	8	1874142	1874149	50 %	0 %	25 %	25 %	225869242
32269	NC_012470	TA	3	6	1874159	1874164	50 %	50 %	0 %	0 %	225869242
32270	NC_012470	TAGCTC	2	12	1874176	1874187	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	225869242
32271	NC_012470	GGA	2	6	1874204	1874209	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225869242
32272	NC_012470	CTT	2	6	1874288	1874293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225869242
32273	NC_012470	ACTC	2	8	1874301	1874308	25 %	25 %	0 %	50 %	225869242
32274	NC_012470	GCT	2	6	1874424	1874429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869242
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32285	NC_012470	ATGGCA	2	12	1875208	1875219	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	225869242
32286	NC_012470	TTC	2	6	1875241	1875246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225869242
32287	NC_012470	TCG	2	6	1875251	1875256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869242
32288	NC_012470	GAT	2	6	1875314	1875319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869242
32289	NC_012470	TCA	2	6	1875379	1875384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869242
32290	NC_012470	GA	3	6	1875385	1875390	50 %	0 %	50 %	0 %	225869242
32291	NC_012470	CCTT	2	8	1875487	1875494	0 %	50 %	0 %	50 %	225869242
32292	NC_012470	TACGCT	2	12	1876270	1876281	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	225869243
32293	NC_012470	TCA	2	6	1876356	1876361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869243
32294	NC_012470	T	7	7	1876470	1876476	0 %	100 %	0 %	0 %	225869243
32295	NC_012470	TGC	2	6	1876482	1876487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869243
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32299	NC_012470	AAT	2	6	1876862	1876867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225869243
32300	NC_012470	TGT	2	6	1876913	1876918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225869243
32301	NC_012470	GCCTGA	2	12	1876922	1876933	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	225869243
32302	NC_012470	CAA	2	6	1876939	1876944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225869243
32303	NC_012470	TTC	2	6	1877007	1877012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225869243
32304	NC_012470	T	6	6	1877054	1877059	0 %	100 %	0 %	0 %	225869243
32305	NC_012470	CT	3	6	1877084	1877089	0 %	50 %	0 %	50 %	225869244
32306	NC_012470	GC	3	6	1877150	1877155	0 %	0 %	50 %	50 %	225869244
32307	NC_012470	AGC	2	6	1877162	1877167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869244
32308	NC_012470	GCA	2	6	1877252	1877257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869244
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32310	NC_012470	TGG	2	6	1877290	1877295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225869244
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32312	NC_012470	TGT	2	6	1877335	1877340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225869244
32313	NC_012470	TGC	2	6	1877375	1877380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869244
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32317	NC_012470	CAA	2	6	1877463	1877468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225869244
32318	NC_012470	TAA	2	6	1877484	1877489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225869244
32319	NC_012470	GAT	2	6	1877498	1877503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869244
32320	NC_012470	TCA	2	6	1877526	1877531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869244
32321	NC_012470	TGT	2	6	1877569	1877574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225869244
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32323	NC_012470	TGA	2	6	1877756	1877761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225869244
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32325	NC_012470	ATC	2	6	1877834	1877839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869244
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32328	NC_012470	TC	3	6	1878009	1878014	0 %	50 %	0 %	50 %	225869244
32329	NC_012470	T	6	6	1878017	1878022	0 %	100 %	0 %	0 %	225869244
32330	NC_012470	TCA	2	6	1878137	1878142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869245
32331	NC_012470	GCA	3	9	1878225	1878233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869245
32332	NC_012470	ATA	2	6	1878244	1878249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225869245
32333	NC_012470	TCA	2	6	1878363	1878368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869245
32334	NC_012470	AAT	3	9	1878379	1878387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225869245
32335	NC_012470	ATA	2	6	1878542	1878547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225869245
32336	NC_012470	CCA	2	6	1878656	1878661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225869245
32337	NC_012470	ATCA	2	8	1878703	1878710	50 %	25 %	0 %	25 %	225869245
32338	NC_012470	AAG	2	6	1878800	1878805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225869245
32339	NC_012470	GCT	3	9	1878895	1878903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869245
32340	NC_012470	GGC	2	6	1878911	1878916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	225869245
32341	NC_012470	CCT	2	6	1878936	1878941	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225869245
32342	NC_012470	CAT	2	6	1878960	1878965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869245
32343	NC_012470	ACA	2	6	1878974	1878979	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225869245
32344	NC_012470	AGC	2	6	1879004	1879009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869245
32345	NC_012470	GAA	2	6	1879074	1879079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225869245
32346	NC_012470	T	6	6	1879101	1879106	0 %	100 %	0 %	0 %	225869245
32347	NC_012470	CAA	2	6	1879131	1879136	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225869245
32348	NC_012470	TCT	2	6	1879154	1879159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225869245
32349	NC_012470	GTT	2	6	1879262	1879267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225869246
32350	NC_012470	TGG	2	6	1879290	1879295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225869246
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32355	NC_012470	ATC	2	6	1879409	1879414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869246
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32450	NC_012470	CTTCA	2	10	1885267	1885276	20 %	40 %	0 %	40 %	225869251
32451	NC_012470	AAG	2	6	1885345	1885350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225869251
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32454	NC_012470	AAG	2	6	1885582	1885587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225869251
32455	NC_012470	AGCC	2	8	1885590	1885597	25 %	0 %	25 %	50 %	225869251
32456	NC_012470	CAT	2	6	1885665	1885670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869251
32457	NC_012470	AGC	2	6	1885807	1885812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869251
32458	NC_012470	TGC	2	6	1885833	1885838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869251
32459	NC_012470	CCTT	2	8	1885904	1885911	0 %	50 %	0 %	50 %	225869251
32460	NC_012470	CCA	2	6	1885961	1885966	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225869251
32461	NC_012470	AAT	2	6	1885972	1885977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225869251
32462	NC_012470	TTG	2	6	1885986	1885991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225869251
32463	NC_012470	TGC	2	6	1885996	1886001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869251
32464	NC_012470	TAA	2	6	1886022	1886027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225869251
32465	NC_012470	T	6	6	1886071	1886076	0 %	100 %	0 %	0 %	225869251
32466	NC_012470	ATT	2	6	1887720	1887725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869252
32467	NC_012470	GCA	2	6	1887932	1887937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869252
32468	NC_012470	GCA	2	6	1887947	1887952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869252
32469	NC_012470	CTT	2	6	1887972	1887977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225869252
32470	NC_012470	TGGAAC	2	12	1888015	1888026	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	225869252
32471	NC_012470	GCA	2	6	1888034	1888039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869252
32472	NC_012470	GCA	2	6	1888088	1888093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869252
32473	NC_012470	GCA	2	6	1888124	1888129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869252
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32481	NC_012470	CTT	2	6	1888381	1888386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225869252
32482	NC_012470	GAA	2	6	1888432	1888437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225869252
32483	NC_012470	CTT	2	6	1888464	1888469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225869252
32484	NC_012470	CAG	2	6	1888503	1888508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869252
32485	NC_012470	CGTTAA	2	12	1888527	1888538	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	225869252
32486	NC_012470	CTA	2	6	1888548	1888553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869252
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32488	NC_012470	TCC	2	6	1888740	1888745	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225869252
32489	NC_012470	ATT	2	6	1889110	1889115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225869253
32490	NC_012470	TCT	2	6	1889139	1889144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225869253
32491	NC_012470	CAT	2	6	1889183	1889188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869253
32492	NC_012470	GAA	2	6	1889218	1889223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225869253
32493	NC_012470	ACG	2	6	1889312	1889317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225869253
32494	NC_012470	CAT	2	6	1889378	1889383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225869253
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32498	NC_012470	AGCTT	2	10	1889496	1889505	20 %	40 %	20 %	20 %	225869253
32499	NC_012470	TCAA	2	8	1889553	1889560	50 %	25 %	0 %	25 %	225869253
32500	NC_012470	CTG	2	6	1889572	1889577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225869253

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