MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus equi subsp. zooepidemicus

Total Repeats: 36889

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19501	NC_012470	ATC	2	6	1147619	1147624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225868608
19502	NC_012470	TCA	2	6	1147683	1147688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225868608
19503	NC_012470	TTG	2	6	1147726	1147731	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225868608
19504	NC_012470	CAA	2	6	1147759	1147764	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225868608
19505	NC_012470	GCA	2	6	1147803	1147808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225868608
19506	NC_012470	CCT	2	6	1147861	1147866	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225868608
19507	NC_012470	AATT	2	8	1147868	1147875	50 %	50 %	0 %	0 %	225868608
19508	NC_012470	TG	3	6	1147913	1147918	0 %	50 %	50 %	0 %	225868608
19509	NC_012470	TTA	2	6	1147929	1147934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225868608
19510	NC_012470	T	7	7	1148014	1148020	0 %	100 %	0 %	0 %	225868609
19511	NC_012470	CTT	2	6	1148106	1148111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225868609
19512	NC_012470	TCT	2	6	1148227	1148232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225868609
19513	NC_012470	GCC	2	6	1148257	1148262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	225868609
19514	NC_012470	CCT	2	6	1148293	1148298	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225868609
19515	NC_012470	AAC	2	6	1148304	1148309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225868609
19516	NC_012470	TCT	2	6	1148314	1148319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225868609
19517	NC_012470	T	6	6	1148322	1148327	0 %	100 %	0 %	0 %	225868609
19518	NC_012470	GCT	2	6	1148332	1148337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225868609
19519	NC_012470	CCAA	2	8	1148341	1148348	50 %	0 %	0 %	50 %	225868609
19520	NC_012470	ATG	2	6	1148349	1148354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225868609
19521	NC_012470	AG	3	6	1148368	1148373	50 %	0 %	50 %	0 %	225868609
19522	NC_012470	AGCT	2	8	1148406	1148413	25 %	25 %	25 %	25 %	225868609
19523	NC_012470	CCT	2	6	1148552	1148557	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225868609
19524	NC_012470	CAG	2	6	1148660	1148665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225868609
19525	NC_012470	AGC	2	6	1148743	1148748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225868609
19526	NC_012470	ACC	2	6	1148976	1148981	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225868609
19527	NC_012470	AATC	2	8	1149023	1149030	50 %	25 %	0 %	25 %	225868609
19528	NC_012470	T	7	7	1149205	1149211	0 %	100 %	0 %	0 %	225868609
19529	NC_012470	TCA	2	6	1149230	1149235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225868609
19530	NC_012470	TTCCT	2	10	1149336	1149345	0 %	60 %	0 %	40 %	225868610
19531	NC_012470	CTT	2	6	1149351	1149356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225868610
19532	NC_012470	GTA	2	6	1149362	1149367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225868610
19533	NC_012470	CTT	2	6	1149443	1149448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225868610
19534	NC_012470	A	6	6	1149483	1149488	100 %	0 %	0 %	0 %	225868610
19535	NC_012470	AAT	2	6	1149503	1149508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225868610
19536	NC_012470	T	6	6	1149521	1149526	0 %	100 %	0 %	0 %	225868610
19537	NC_012470	ATG	2	6	1149552	1149557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225868610
19538	NC_012470	TTGA	2	8	1149592	1149599	25 %	50 %	25 %	0 %	225868610
19539	NC_012470	GAT	2	6	1149658	1149663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225868610
19540	NC_012470	CTA	2	6	1149670	1149675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225868610
19541	NC_012470	CTT	2	6	1149757	1149762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225868610
19542	NC_012470	A	6	6	1149837	1149842	100 %	0 %	0 %	0 %	225868610
19543	NC_012470	TCA	2	6	1149906	1149911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225868610
19544	NC_012470	T	6	6	1149942	1149947	0 %	100 %	0 %	0 %	225868610
19545	NC_012470	TTA	2	6	1150208	1150213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225868611
19546	NC_012470	A	6	6	1150220	1150225	100 %	0 %	0 %	0 %	225868611
19547	NC_012470	A	6	6	1150256	1150261	100 %	0 %	0 %	0 %	225868611
19548	NC_012470	ATA	2	6	1150313	1150318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225868611
19549	NC_012470	ACG	2	6	1150328	1150333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225868611
19550	NC_012470	AAAG	2	8	1150422	1150429	75 %	0 %	25 %	0 %	225868611
19551	NC_012470	TAT	2	6	1150449	1150454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225868611
19552	NC_012470	CTT	2	6	1150510	1150515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225868611
19553	NC_012470	GC	3	6	1150519	1150524	0 %	0 %	50 %	50 %	225868611
19554	NC_012470	AC	3	6	1150525	1150530	50 %	0 %	0 %	50 %	225868611
19555	NC_012470	T	6	6	1150566	1150571	0 %	100 %	0 %	0 %	225868611
19556	NC_012470	AGG	2	6	1150674	1150679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225868611
19557	NC_012470	CAG	2	6	1150735	1150740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225868611
19558	NC_012470	TCA	2	6	1150766	1150771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225868611
19559	NC_012470	AAT	2	6	1150804	1150809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225868611
19560	NC_012470	ATT	2	6	1150826	1150831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225868611
19561	NC_012470	CAT	2	6	1150864	1150869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225868611
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19565	NC_012470	GCT	2	6	1151319	1151324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225868612
19566	NC_012470	AAGC	2	8	1151374	1151381	50 %	0 %	25 %	25 %	225868612
19567	NC_012470	TGC	2	6	1151399	1151404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225868612
19568	NC_012470	GCT	2	6	1151639	1151644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225868613
19569	NC_012470	TGC	2	6	1151704	1151709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225868613
19570	NC_012470	GCCT	2	8	1151803	1151810	0 %	25 %	25 %	50 %	225868613
19571	NC_012470	CTTT	2	8	1151857	1151864	0 %	75 %	0 %	25 %	225868613
19572	NC_012470	ATC	2	6	1151895	1151900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225868613
19573	NC_012470	ATC	2	6	1151910	1151915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225868613
19574	NC_012470	TCCTT	2	10	1151924	1151933	0 %	60 %	0 %	40 %	225868614
19575	NC_012470	TGC	2	6	1151992	1151997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225868614
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19577	NC_012470	TGC	2	6	1152024	1152029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225868614
19578	NC_012470	TCA	2	6	1152081	1152086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225868614
19579	NC_012470	CAT	2	6	1152130	1152135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225868614
19580	NC_012470	GCT	2	6	1152149	1152154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225868614
19581	NC_012470	TGC	2	6	1152183	1152188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225868614
19582	NC_012470	GCT	2	6	1152222	1152227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225868614
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19584	NC_012470	CTC	2	6	1152266	1152271	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225868614
19585	NC_012470	CTC	2	6	1152275	1152280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225868614
19586	NC_012470	AGC	2	6	1152296	1152301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225868614
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19588	NC_012470	AGC	2	6	1152355	1152360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225868615
19589	NC_012470	TC	3	6	1152364	1152369	0 %	50 %	0 %	50 %	225868615
19590	NC_012470	CTC	2	6	1152376	1152381	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225868615
19591	NC_012470	GCT	2	6	1152384	1152389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225868615
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19593	NC_012470	CCTG	2	8	1152488	1152495	0 %	25 %	25 %	50 %	225868615
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19596	NC_012470	A	6	6	1152538	1152543	100 %	0 %	0 %	0 %	225868615
19597	NC_012470	TGCCTC	2	12	1152571	1152582	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	225868615
19598	NC_012470	CCT	2	6	1152591	1152596	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225868615
19599	NC_012470	CGA	2	6	1152599	1152604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225868615
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19601	NC_012470	GCT	2	6	1152697	1152702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225868615
19602	NC_012470	AGC	2	6	1152787	1152792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225868615
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19604	NC_012470	AAGT	2	8	1152917	1152924	50 %	25 %	25 %	0 %	225868615
19605	NC_012470	TTG	2	6	1152977	1152982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225868615
19606	NC_012470	CCT	2	6	1153002	1153007	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225868615
19607	NC_012470	TTA	2	6	1153016	1153021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225868615
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19611	NC_012470	CTC	2	6	1153207	1153212	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225868615
19612	NC_012470	ATC	2	6	1153231	1153236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225868615
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19614	NC_012470	T	7	7	1153452	1153458	0 %	100 %	0 %	0 %	225868615
19615	NC_012470	CAT	2	6	1153476	1153481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225868615
19616	NC_012470	TCC	2	6	1153522	1153527	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225868616
19617	NC_012470	TCA	2	6	1153573	1153578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225868616
19618	NC_012470	TTAA	2	8	1153582	1153589	50 %	50 %	0 %	0 %	225868616
19619	NC_012470	TCAT	2	8	1153618	1153625	25 %	50 %	0 %	25 %	225868616
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19624	NC_012470	CTTT	2	8	1153892	1153899	0 %	75 %	0 %	25 %	225868616
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19626	NC_012470	TAT	2	6	1154169	1154174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225868617
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19631	NC_012470	TTA	3	9	1154270	1154278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225868617
19632	NC_012470	TTG	2	6	1154317	1154322	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225868617
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19636	NC_012470	TTA	2	6	1154481	1154486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225868617
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19641	NC_012470	TCT	2	6	1154669	1154674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225868618
19642	NC_012470	TTA	2	6	1154747	1154752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225868618
19643	NC_012470	TCC	2	6	1154821	1154826	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225868619
19644	NC_012470	AATA	2	8	1154837	1154844	75 %	25 %	0 %	0 %	225868619
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19647	NC_012470	A	8	8	1154938	1154945	100 %	0 %	0 %	0 %	225868619
19648	NC_012470	CATT	2	8	1154981	1154988	25 %	50 %	0 %	25 %	225868619
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19652	NC_012470	AAT	2	6	1155165	1155170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225868619
19653	NC_012470	CAT	2	6	1155189	1155194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225868619
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19687	NC_012470	T	7	7	1157000	1157006	0 %	100 %	0 %	0 %	225868623
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19703	NC_012470	TCA	2	6	1158026	1158031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225868624
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19708	NC_012470	ATCAAC	2	12	1158156	1158167	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	225868624
19709	NC_012470	CAT	2	6	1158185	1158190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225868624
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19713	NC_012470	AAAT	2	8	1158427	1158434	75 %	25 %	0 %	0 %	225868624
19714	NC_012470	ATA	2	6	1158478	1158483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225868624
19715	NC_012470	CTG	2	6	1158516	1158521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225868624
19716	NC_012470	CAT	2	6	1158537	1158542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225868624
19717	NC_012470	CTG	2	6	1158551	1158556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225868624
19718	NC_012470	GGTAT	2	10	1158588	1158597	20 %	40 %	40 %	0 %	225868624
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19720	NC_012470	TGT	2	6	1158630	1158635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225868624
19721	NC_012470	TAAA	2	8	1158725	1158732	75 %	25 %	0 %	0 %	225868624
19722	NC_012470	ATA	2	6	1158733	1158738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225868624
19723	NC_012470	GTG	2	6	1158748	1158753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225868624
19724	NC_012470	GAG	2	6	1158754	1158759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225868624
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19726	NC_012470	CTG	2	6	1158892	1158897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225868624
19727	NC_012470	ATG	2	6	1158940	1158945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225868624
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19729	NC_012470	A	7	7	1158987	1158993	100 %	0 %	0 %	0 %	225868624
19730	NC_012470	AAT	2	6	1159012	1159017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225868624
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19732	NC_012470	GAT	2	6	1159077	1159082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225868625
19733	NC_012470	CTT	2	6	1159105	1159110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225868625
19734	NC_012470	ACA	2	6	1159136	1159141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225868625
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19737	NC_012470	TTC	2	6	1159384	1159389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225868625
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19964	NC_012470	TCA	2	6	1171746	1171751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225868637
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19999	NC_012470	GCA	2	6	1173116	1173121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225868639
20000	NC_012470	TGAC	2	8	1173178	1173185	25 %	25 %	25 %	25 %	225868639

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