MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus equi subsp. zooepidemicus

Total Repeats: 36889

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19001	NC_012470	TCTTT	2	10	1119311	1119320	0 %	80 %	0 %	20 %	225868583
19002	NC_012470	TTG	2	6	1119390	1119395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225868583
19003	NC_012470	TTC	2	6	1119480	1119485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225868584
19004	NC_012470	A	6	6	1119497	1119502	100 %	0 %	0 %	0 %	225868584
19005	NC_012470	T	6	6	1119535	1119540	0 %	100 %	0 %	0 %	225868584
19006	NC_012470	GCA	2	6	1119549	1119554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225868584
19007	NC_012470	CTG	2	6	1119639	1119644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225868584
19008	NC_012470	TCA	2	6	1119746	1119751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225868584
19009	NC_012470	ACC	2	6	1119784	1119789	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225868584
19010	NC_012470	GCA	2	6	1119833	1119838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225868584
19011	NC_012470	TAA	2	6	1119867	1119872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225868584
19012	NC_012470	TAT	2	6	1119885	1119890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225868584
19013	NC_012470	CTG	2	6	1120002	1120007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225868584
19014	NC_012470	ACC	2	6	1120132	1120137	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225868584
19015	NC_012470	TTTC	2	8	1120150	1120157	0 %	75 %	0 %	25 %	225868584
19016	NC_012470	CTT	2	6	1120185	1120190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225868584
19017	NC_012470	TCAA	2	8	1120536	1120543	50 %	25 %	0 %	25 %	225868585
19018	NC_012470	CA	3	6	1120546	1120551	50 %	0 %	0 %	50 %	225868585
19019	NC_012470	ACTG	2	8	1120579	1120586	25 %	25 %	25 %	25 %	225868585
19020	NC_012470	A	6	6	1120640	1120645	100 %	0 %	0 %	0 %	225868585
19021	NC_012470	A	7	7	1120650	1120656	100 %	0 %	0 %	0 %	225868585
19022	NC_012470	AGC	2	6	1120741	1120746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225868585
19023	NC_012470	AAT	2	6	1120790	1120795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225868585
19024	NC_012470	ATT	2	6	1120820	1120825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225868585
19025	NC_012470	AC	3	6	1120858	1120863	50 %	0 %	0 %	50 %	225868585
19026	NC_012470	GGA	2	6	1120885	1120890	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225868585
19027	NC_012470	AC	3	6	1120962	1120967	50 %	0 %	0 %	50 %	225868586
19028	NC_012470	AGC	2	6	1120976	1120981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225868586
19029	NC_012470	GCT	2	6	1121043	1121048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225868586
19030	NC_012470	ATC	2	6	1121067	1121072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225868586
19031	NC_012470	ATC	2	6	1121093	1121098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225868586
19032	NC_012470	AAC	2	6	1121126	1121131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225868586
19033	NC_012470	TATTGC	2	12	1121174	1121185	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	225868586
19034	NC_012470	TTG	2	6	1121226	1121231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225868586
19035	NC_012470	ATT	2	6	1121334	1121339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225868586
19036	NC_012470	TGGT	2	8	1121346	1121353	0 %	50 %	50 %	0 %	225868586
19037	NC_012470	TGC	2	6	1121410	1121415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225868586
19038	NC_012470	AAG	2	6	1121460	1121465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225868586
19039	NC_012470	TAT	2	6	1121469	1121474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225868586
19040	NC_012470	ATT	2	6	1121529	1121534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225868586
19041	NC_012470	T	6	6	1121676	1121681	0 %	100 %	0 %	0 %	225868587
19042	NC_012470	ATT	2	6	1121774	1121779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225868587
19043	NC_012470	A	6	6	1121785	1121790	100 %	0 %	0 %	0 %	225868587
19044	NC_012470	A	6	6	1121816	1121821	100 %	0 %	0 %	0 %	225868587
19045	NC_012470	TAA	2	6	1121875	1121880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225868587
19046	NC_012470	ATT	2	6	1121882	1121887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225868587
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19048	NC_012470	A	6	6	1122023	1122028	100 %	0 %	0 %	0 %	225868587
19049	NC_012470	TGCT	2	8	1122084	1122091	0 %	50 %	25 %	25 %	225868587
19050	NC_012470	AGA	2	6	1122115	1122120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225868587
19051	NC_012470	CAT	3	9	1122209	1122217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225868587
19052	NC_012470	TTC	2	6	1122219	1122224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225868587
19053	NC_012470	G	6	6	1122384	1122389	0 %	0 %	100 %	0 %	225868587
19054	NC_012470	TGA	2	6	1122502	1122507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225868587
19055	NC_012470	TTGAA	2	10	1122516	1122525	40 %	40 %	20 %	0 %	225868587
19056	NC_012470	ATT	2	6	1122548	1122553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225868587
19057	NC_012470	A	6	6	1122564	1122569	100 %	0 %	0 %	0 %	225868587
19058	NC_012470	CTT	2	6	1122932	1122937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225868588
19059	NC_012470	GCT	2	6	1122961	1122966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225868588
19060	NC_012470	TAC	2	6	1122971	1122976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225868588
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19062	NC_012470	GTT	2	6	1123031	1123036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225868588
19063	NC_012470	CCTT	2	8	1123084	1123091	0 %	50 %	0 %	50 %	225868588
19064	NC_012470	CTT	2	6	1123101	1123106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225868588
19065	NC_012470	GCT	2	6	1123144	1123149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225868588
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19067	NC_012470	CAT	2	6	1123191	1123196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225868588
19068	NC_012470	CCTT	2	8	1123215	1123222	0 %	50 %	0 %	50 %	225868589
19069	NC_012470	T	7	7	1123228	1123234	0 %	100 %	0 %	0 %	225868589
19070	NC_012470	TAC	2	6	1123253	1123258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225868589
19071	NC_012470	T	6	6	1123304	1123309	0 %	100 %	0 %	0 %	225868589
19072	NC_012470	ATG	2	6	1123619	1123624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225868590
19073	NC_012470	ATTG	2	8	1123631	1123638	25 %	50 %	25 %	0 %	225868590
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19077	NC_012470	TTGG	2	8	1123762	1123769	0 %	50 %	50 %	0 %	225868590
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19083	NC_012470	T	6	6	1124111	1124116	0 %	100 %	0 %	0 %	225868590
19084	NC_012470	GCTTG	2	10	1124235	1124244	0 %	40 %	40 %	20 %	225868590
19085	NC_012470	CTT	2	6	1124286	1124291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225868590
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19090	NC_012470	CAG	2	6	1124613	1124618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225868590
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19097	NC_012470	T	6	6	1125867	1125872	0 %	100 %	0 %	0 %	225868591
19098	NC_012470	CTGC	2	8	1125874	1125881	0 %	25 %	25 %	50 %	225868591
19099	NC_012470	AG	3	6	1125907	1125912	50 %	0 %	50 %	0 %	225868591
19100	NC_012470	CCA	2	6	1125951	1125956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225868591
19101	NC_012470	TGC	2	6	1125968	1125973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225868591
19102	NC_012470	TGC	4	12	1126052	1126063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225868591
19103	NC_012470	AAT	2	6	1126082	1126087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225868591
19104	NC_012470	CCA	2	6	1126228	1126233	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225868591
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19106	NC_012470	GCA	2	6	1126321	1126326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225868591
19107	NC_012470	AGC	2	6	1126349	1126354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225868591
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19109	NC_012470	AAT	2	6	1126411	1126416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225868592
19110	NC_012470	TAA	2	6	1126523	1126528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225868592
19111	NC_012470	CAA	2	6	1126536	1126541	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225868592
19112	NC_012470	TCA	2	6	1126543	1126548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225868592
19113	NC_012470	CCCT	2	8	1126649	1126656	0 %	25 %	0 %	75 %	225868592
19114	NC_012470	ATA	2	6	1126668	1126673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225868592
19115	NC_012470	ATC	2	6	1126692	1126697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225868592
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19117	NC_012470	CT	3	6	1126770	1126775	0 %	50 %	0 %	50 %	225868592
19118	NC_012470	TC	3	6	1126784	1126789	0 %	50 %	0 %	50 %	225868592
19119	NC_012470	CAAG	2	8	1126812	1126819	50 %	0 %	25 %	25 %	225868592
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19229	NC_012470	GTC	2	6	1132631	1132636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225868597
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19231	NC_012470	TGC	2	6	1132724	1132729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225868597
19232	NC_012470	TCAACC	2	12	1132734	1132745	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	225868597
19233	NC_012470	AGT	2	6	1132813	1132818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225868597
19234	NC_012470	CAC	2	6	1132820	1132825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225868597
19235	NC_012470	AAG	2	6	1132933	1132938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225868597
19236	NC_012470	AACAC	2	10	1133115	1133124	60 %	0 %	0 %	40 %	225868597
19237	NC_012470	TGA	2	6	1133181	1133186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225868597
19238	NC_012470	CTT	2	6	1133217	1133222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225868597
19239	NC_012470	CAT	3	9	1133260	1133268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225868597
19240	NC_012470	AAG	2	6	1133280	1133285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225868597
19241	NC_012470	ATA	2	6	1133346	1133351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225868597
19242	NC_012470	CCATT	2	10	1133383	1133392	20 %	40 %	0 %	40 %	225868597
19243	NC_012470	T	6	6	1133391	1133396	0 %	100 %	0 %	0 %	225868597
19244	NC_012470	CTGAC	2	10	1133421	1133430	20 %	20 %	20 %	40 %	225868597
19245	NC_012470	TCA	2	6	1133599	1133604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225868597
19246	NC_012470	TTC	2	6	1133606	1133611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225868597
19247	NC_012470	CAG	2	6	1133686	1133691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225868597
19248	NC_012470	TGC	2	6	1133724	1133729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225868597
19249	NC_012470	TGA	2	6	1133818	1133823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225868597
19250	NC_012470	GATT	2	8	1133917	1133924	25 %	50 %	25 %	0 %	225868597
19251	NC_012470	GCTG	2	8	1133957	1133964	0 %	25 %	50 %	25 %	225868597
19252	NC_012470	CTG	2	6	1133999	1134004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225868597
19253	NC_012470	TCA	2	6	1134058	1134063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225868597
19254	NC_012470	CTG	2	6	1134265	1134270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225868597
19255	NC_012470	TGA	2	6	1134292	1134297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225868597
19256	NC_012470	CCA	2	6	1134303	1134308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225868597
19257	NC_012470	T	6	6	1134322	1134327	0 %	100 %	0 %	0 %	225868597
19258	NC_012470	TTA	2	6	1134336	1134341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225868597
19259	NC_012470	T	6	6	1134359	1134364	0 %	100 %	0 %	0 %	225868597
19260	NC_012470	ATA	2	6	1134474	1134479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225868597
19261	NC_012470	CAG	2	6	1134484	1134489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225868597
19262	NC_012470	TCAA	2	8	1134546	1134553	50 %	25 %	0 %	25 %	225868597
19263	NC_012470	GA	3	6	1134589	1134594	50 %	0 %	50 %	0 %	225868597
19264	NC_012470	TGC	2	6	1134800	1134805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225868597
19265	NC_012470	CCA	2	6	1134856	1134861	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225868597
19266	NC_012470	TCA	2	6	1135045	1135050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225868597
19267	NC_012470	CTG	2	6	1135099	1135104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225868597
19268	NC_012470	CTG	2	6	1135120	1135125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225868597
19269	NC_012470	GCC	2	6	1135169	1135174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	225868597
19270	NC_012470	ATC	2	6	1135178	1135183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225868597
19271	NC_012470	T	6	6	1135216	1135221	0 %	100 %	0 %	0 %	225868597
19272	NC_012470	T	6	6	1135302	1135307	0 %	100 %	0 %	0 %	225868597
19273	NC_012470	CCGCT	2	10	1135372	1135381	0 %	20 %	20 %	60 %	225868597
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19280	NC_012470	CTC	2	6	1135619	1135624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225868597
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19288	NC_012470	CCA	2	6	1136332	1136337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225868598
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19292	NC_012470	CA	3	6	1136516	1136521	50 %	0 %	0 %	50 %	225868598
19293	NC_012470	ACA	2	6	1136578	1136583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225868598
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19304	NC_012470	GCA	2	6	1137379	1137384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225868598
19305	NC_012470	AG	3	6	1137412	1137417	50 %	0 %	50 %	0 %	225868598
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19320	NC_012470	A	8	8	1138312	1138319	100 %	0 %	0 %	0 %	225868599
19321	NC_012470	TA	3	6	1138454	1138459	50 %	50 %	0 %	0 %	225868599
19322	NC_012470	TCTGC	2	10	1138527	1138536	0 %	40 %	20 %	40 %	225868599
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19334	NC_012470	GCCCTA	2	12	1138908	1138919	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	225868600
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19338	NC_012470	TGA	2	6	1139090	1139095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225868600
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19341	NC_012470	TC	3	6	1139213	1139218	0 %	50 %	0 %	50 %	225868601
19342	NC_012470	T	6	6	1139230	1139235	0 %	100 %	0 %	0 %	225868601
19343	NC_012470	AGC	2	6	1139263	1139268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225868601
19344	NC_012470	T	7	7	1139272	1139278	0 %	100 %	0 %	0 %	225868601
19345	NC_012470	TTG	2	6	1139327	1139332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225868601
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19349	NC_012470	TTA	2	6	1139517	1139522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225868601
19350	NC_012470	TTG	2	6	1139570	1139575	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225868601
19351	NC_012470	TC	3	6	1139601	1139606	0 %	50 %	0 %	50 %	225868601
19352	NC_012470	TGG	2	6	1139637	1139642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225868601
19353	NC_012470	A	6	6	1139749	1139754	100 %	0 %	0 %	0 %	225868601
19354	NC_012470	ATA	2	6	1139757	1139762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225868601
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19376	NC_012470	TGC	2	6	1141225	1141230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225868602
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19383	NC_012470	TGA	2	6	1141513	1141518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225868602
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19387	NC_012470	T	7	7	1142082	1142088	0 %	100 %	0 %	0 %	225868603
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19463	NC_012470	CTT	2	6	1145808	1145813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225868606
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19467	NC_012470	CTG	2	6	1145916	1145921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225868606
19468	NC_012470	TAG	2	6	1145964	1145969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225868606
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19492	NC_012470	A	6	6	1147003	1147008	100 %	0 %	0 %	0 %	225868607
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