MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae 70585

Total Repeats: 36924

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012468	GAAA	2	8	199	206	75 %	0 %	25 %	0 %	225857810
2	NC_012468	AAGA	2	8	240	247	75 %	0 %	25 %	0 %	225857810
3	NC_012468	TCA	2	6	291	296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225857810
4	NC_012468	GAAATG	2	12	338	349	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	225857810
5	NC_012468	AAC	2	6	360	365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225857810
6	NC_012468	ATT	2	6	374	379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225857810
7	NC_012468	GTA	2	6	380	385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225857810
8	NC_012468	GAA	2	6	467	472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225857810
9	NC_012468	AAAAG	2	10	541	550	80 %	0 %	20 %	0 %	225857810
10	NC_012468	GGA	2	6	659	664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225857810
11	NC_012468	TTA	2	6	686	691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225857810
12	NC_012468	GAAAT	2	10	702	711	60 %	20 %	20 %	0 %	225857810
13	NC_012468	A	6	6	715	720	100 %	0 %	0 %	0 %	225857810
14	NC_012468	AT	3	6	742	747	50 %	50 %	0 %	0 %	225857810
15	NC_012468	TTA	2	6	762	767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225857810
16	NC_012468	GAT	2	6	848	853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225857810
17	NC_012468	A	7	7	871	877	100 %	0 %	0 %	0 %	225857810
18	NC_012468	GAA	2	6	890	895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225857810
19	NC_012468	GAG	2	6	983	988	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225857810
20	NC_012468	A	8	8	1195	1202	100 %	0 %	0 %	0 %	225857810
21	NC_012468	TGC	2	6	1225	1230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225857810
22	NC_012468	ATA	2	6	1413	1418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225857810
23	NC_012468	GGAA	2	8	1434	1441	50 %	0 %	50 %	0 %	225857810
24	NC_012468	TCAT	2	8	1467	1474	25 %	50 %	0 %	25 %	225857810
25	NC_012468	AAAAT	2	10	1484	1493	80 %	20 %	0 %	0 %	225857810
26	NC_012468	TGAT	2	8	1497	1504	25 %	50 %	25 %	0 %	225857810
27	NC_012468	AATC	2	8	1533	1540	50 %	25 %	0 %	25 %	225857810
28	NC_012468	AAT	2	6	1554	1559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225857810
29	NC_012468	TAA	2	6	1734	1739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225857811
30	NC_012468	ATTT	2	8	1742	1749	25 %	75 %	0 %	0 %	225857811
31	NC_012468	TAC	2	6	1764	1769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225857811
32	NC_012468	AG	3	6	1772	1777	50 %	0 %	50 %	0 %	225857811
33	NC_012468	A	7	7	1895	1901	100 %	0 %	0 %	0 %	225857811
34	NC_012468	CTT	2	6	1925	1930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225857811
35	NC_012468	CTT	2	6	1942	1947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225857811
36	NC_012468	CTT	2	6	1952	1957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225857811
37	NC_012468	GTA	2	6	1969	1974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225857811
38	NC_012468	AGCA	2	8	2106	2113	50 %	0 %	25 %	25 %	225857811
39	NC_012468	ATT	2	6	2149	2154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225857811
40	NC_012468	TGC	2	6	2169	2174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225857811
41	NC_012468	AG	3	6	2184	2189	50 %	0 %	50 %	0 %	225857811
42	NC_012468	A	6	6	2278	2283	100 %	0 %	0 %	0 %	225857811
43	NC_012468	A	7	7	2294	2300	100 %	0 %	0 %	0 %	225857811
44	NC_012468	TGA	2	6	2304	2309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225857811
45	NC_012468	GAT	2	6	2365	2370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225857811
46	NC_012468	ACT	2	6	2500	2505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225857811
47	NC_012468	GTT	2	6	2608	2613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225857811
48	NC_012468	GTAAA	2	10	2642	2651	60 %	20 %	20 %	0 %	225857811
49	NC_012468	GAA	2	6	2653	2658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225857811
50	NC_012468	ACTT	2	8	2710	2717	25 %	50 %	0 %	25 %	225857811
51	NC_012468	GATT	2	8	2718	2725	25 %	50 %	25 %	0 %	225857811
52	NC_012468	CAG	2	6	2798	2803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225857811
53	NC_012468	TTG	2	6	2937	2942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225857812
54	NC_012468	A	6	6	2948	2953	100 %	0 %	0 %	0 %	225857812
55	NC_012468	AAAAT	2	10	3029	3038	80 %	20 %	0 %	0 %	225857812
56	NC_012468	TGT	2	6	3055	3060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225857812
57	NC_012468	ATG	2	6	3062	3067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225857812
58	NC_012468	ATT	2	6	3101	3106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225857812
59	NC_012468	CAG	2	6	3206	3211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225857813
60	NC_012468	GCA	2	6	3280	3285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225857813
61	NC_012468	CGA	2	6	3299	3304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225857813
62	NC_012468	TGG	2	6	3323	3328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225857813
63	NC_012468	AACT	2	8	3353	3360	50 %	25 %	0 %	25 %	225857813
64	NC_012468	A	7	7	3376	3382	100 %	0 %	0 %	0 %	225857813
65	NC_012468	TGA	3	9	3516	3524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225857813
66	NC_012468	AATT	2	8	3599	3606	50 %	50 %	0 %	0 %	225857813
67	NC_012468	TTC	2	6	3701	3706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225857813
68	NC_012468	AGA	2	6	3726	3731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225857813
69	NC_012468	GAC	2	6	3801	3806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225857813
70	NC_012468	CAAA	2	8	3876	3883	75 %	0 %	0 %	25 %	225857813
71	NC_012468	AGT	2	6	3915	3920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225857813
72	NC_012468	GAA	2	6	3943	3948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225857813
73	NC_012468	TGAAT	2	10	3954	3963	40 %	40 %	20 %	0 %	225857813
74	NC_012468	A	6	6	3973	3978	100 %	0 %	0 %	0 %	225857813
75	NC_012468	CTTG	2	8	4044	4051	0 %	50 %	25 %	25 %	225857813
76	NC_012468	ACTT	2	8	4060	4067	25 %	50 %	0 %	25 %	225857813
77	NC_012468	AAG	2	6	4082	4087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225857813
78	NC_012468	CTC	2	6	4121	4126	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225857813
79	NC_012468	AGC	2	6	4128	4133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225857813
80	NC_012468	TAT	2	6	4137	4142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225857813
81	NC_012468	AAG	2	6	4229	4234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225857813
82	NC_012468	GAA	2	6	4249	4254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225857813
83	NC_012468	AT	3	6	4263	4268	50 %	50 %	0 %	0 %	225857813
84	NC_012468	AAAT	2	8	4376	4383	75 %	25 %	0 %	0 %	225857814
85	NC_012468	AAACA	2	10	4431	4440	80 %	0 %	0 %	20 %	225857814
86	NC_012468	TTGA	2	8	4457	4464	25 %	50 %	25 %	0 %	225857814
87	NC_012468	GAA	2	6	4474	4479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225857814
88	NC_012468	AC	3	6	4496	4501	50 %	0 %	0 %	50 %	225857814
89	NC_012468	A	6	6	4548	4553	100 %	0 %	0 %	0 %	225857814
90	NC_012468	ATGA	2	8	4580	4587	50 %	25 %	25 %	0 %	225857814
91	NC_012468	TTA	2	6	4610	4615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225857814
92	NC_012468	GAT	2	6	4658	4663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225857814
93	NC_012468	CAG	2	6	4707	4712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225857814
94	NC_012468	TAT	2	6	4735	4740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225857814
95	NC_012468	ATTGGA	2	12	4778	4789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225857814
96	NC_012468	GTT	2	6	4811	4816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225857814
97	NC_012468	CAT	2	6	4817	4822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225857814
98	NC_012468	GAT	2	6	4844	4849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225857814
99	NC_012468	ACT	2	6	4896	4901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225857814
100	NC_012468	TTA	2	6	4961	4966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225857815
101	NC_012468	A	6	6	4994	4999	100 %	0 %	0 %	0 %	225857815
102	NC_012468	CTA	2	6	5055	5060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225857815
103	NC_012468	TTGCAA	2	12	5067	5078	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	225857815
104	NC_012468	AGA	2	6	5092	5097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225857815
105	NC_012468	GAT	2	6	5198	5203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225857815
106	NC_012468	TGG	2	6	5211	5216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225857815
107	NC_012468	A	6	6	5238	5243	100 %	0 %	0 %	0 %	225857815
108	NC_012468	T	6	6	5269	5274	0 %	100 %	0 %	0 %	225857815
109	NC_012468	GCA	2	6	5315	5320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225857815
110	NC_012468	GATT	2	8	5325	5332	25 %	50 %	25 %	0 %	225857815
111	NC_012468	GAA	2	6	5384	5389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225857815
112	NC_012468	GAG	2	6	5478	5483	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225857815
113	NC_012468	T	6	6	5534	5539	0 %	100 %	0 %	0 %	225857815
114	NC_012468	TGA	2	6	5542	5547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225857815
115	NC_012468	GAAA	2	8	5590	5597	75 %	0 %	25 %	0 %	225857815
116	NC_012468	GA	3	6	5641	5646	50 %	0 %	50 %	0 %	225857815
117	NC_012468	AGA	2	6	5725	5730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225857815
118	NC_012468	TGA	2	6	5851	5856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225857815
119	NC_012468	TGA	2	6	5868	5873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225857815
120	NC_012468	AGA	2	6	5917	5922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225857815
121	NC_012468	A	6	6	5984	5989	100 %	0 %	0 %	0 %	225857815
122	NC_012468	TCAAT	2	10	6058	6067	40 %	40 %	0 %	20 %	225857815
123	NC_012468	TTTTC	2	10	6098	6107	0 %	80 %	0 %	20 %	225857815
124	NC_012468	AGA	2	6	6112	6117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225857815
125	NC_012468	A	7	7	6131	6137	100 %	0 %	0 %	0 %	225857815
126	NC_012468	ATT	2	6	6149	6154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225857815
127	NC_012468	GGA	2	6	6190	6195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225857815
128	NC_012468	CGT	2	6	6359	6364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225857815
129	NC_012468	ACA	2	6	6373	6378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225857815
130	NC_012468	AG	3	6	6391	6396	50 %	0 %	50 %	0 %	225857815
131	NC_012468	TGT	2	6	6433	6438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225857815
132	NC_012468	CAT	2	6	6440	6445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225857815
133	NC_012468	AT	3	6	6580	6585	50 %	50 %	0 %	0 %	225857815
134	NC_012468	TAAAT	2	10	6616	6625	60 %	40 %	0 %	0 %	225857815
135	NC_012468	TGA	2	6	6682	6687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225857815
136	NC_012468	ACTCT	2	10	6697	6706	20 %	40 %	0 %	40 %	225857815
137	NC_012468	TGA	4	12	6742	6753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225857815
138	NC_012468	TGA	2	6	6766	6771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225857815
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145	NC_012468	TGA	2	6	7171	7176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225857815
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152	NC_012468	TTTA	2	8	7633	7640	25 %	75 %	0 %	0 %	225857815
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264	NC_012468	AAG	2	6	12608	12613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225857822
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266	NC_012468	TAC	2	6	12687	12692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225857822
267	NC_012468	ATTCT	2	10	12805	12814	20 %	60 %	0 %	20 %	225857822
268	NC_012468	ATG	2	6	12829	12834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225857822
269	NC_012468	GAG	2	6	12845	12850	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225857822
270	NC_012468	GTA	2	6	12881	12886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225857822
271	NC_012468	AGC	2	6	12894	12899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225857822
272	NC_012468	AGA	2	6	12906	12911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225857822
273	NC_012468	GAA	2	6	12949	12954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225857822
274	NC_012468	GTT	2	6	12973	12978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225857822
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277	NC_012468	CT	3	6	13176	13181	0 %	50 %	0 %	50 %	225857822
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283	NC_012468	TTGG	2	8	13426	13433	0 %	50 %	50 %	0 %	225857822
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288	NC_012468	TGC	2	6	13587	13592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225857822
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290	NC_012468	TGA	2	6	13629	13634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225857822
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293	NC_012468	TTG	2	6	13733	13738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225857822
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392	NC_012468	TA	3	6	25160	25165	50 %	50 %	0 %	0 %	225857830
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