MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae P1031

Total Repeats: 35131

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012467	GAAA	2	8	199	206	75 %	0 %	25 %	0 %	225855736
2	NC_012467	AAGA	2	8	240	247	75 %	0 %	25 %	0 %	225855736
3	NC_012467	GAAATG	2	12	338	349	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	225855736
4	NC_012467	AAC	2	6	360	365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225855736
5	NC_012467	ATT	2	6	374	379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225855736
6	NC_012467	GTA	2	6	380	385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225855736
7	NC_012467	GAA	2	6	467	472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225855736
8	NC_012467	AAAAG	2	10	541	550	80 %	0 %	20 %	0 %	225855736
9	NC_012467	GGA	2	6	659	664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225855736
10	NC_012467	TTA	2	6	686	691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225855736
11	NC_012467	GAAAT	2	10	702	711	60 %	20 %	20 %	0 %	225855736
12	NC_012467	A	6	6	715	720	100 %	0 %	0 %	0 %	225855736
13	NC_012467	AT	3	6	742	747	50 %	50 %	0 %	0 %	225855736
14	NC_012467	TTA	2	6	762	767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225855736
15	NC_012467	GAT	2	6	848	853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225855736
16	NC_012467	A	7	7	871	877	100 %	0 %	0 %	0 %	225855736
17	NC_012467	GAA	2	6	890	895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225855736
18	NC_012467	GAG	2	6	983	988	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225855736
19	NC_012467	A	8	8	1195	1202	100 %	0 %	0 %	0 %	225855736
20	NC_012467	TGC	2	6	1225	1230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225855736
21	NC_012467	ATA	2	6	1413	1418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225855736
22	NC_012467	GGAA	2	8	1434	1441	50 %	0 %	50 %	0 %	225855736
23	NC_012467	TCAT	2	8	1467	1474	25 %	50 %	0 %	25 %	225855736
24	NC_012467	AAAAT	2	10	1484	1493	80 %	20 %	0 %	0 %	225855736
25	NC_012467	TGAT	2	8	1497	1504	25 %	50 %	25 %	0 %	225855736
26	NC_012467	AATC	2	8	1533	1540	50 %	25 %	0 %	25 %	225855736
27	NC_012467	AAT	2	6	1554	1559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225855736
28	NC_012467	TAA	2	6	1734	1739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225855737
29	NC_012467	ATTT	2	8	1742	1749	25 %	75 %	0 %	0 %	225855737
30	NC_012467	TAC	2	6	1764	1769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225855737
31	NC_012467	AG	3	6	1772	1777	50 %	0 %	50 %	0 %	225855737
32	NC_012467	A	7	7	1895	1901	100 %	0 %	0 %	0 %	225855737
33	NC_012467	TTG	2	6	1915	1920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225855737
34	NC_012467	CTT	2	6	1925	1930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225855737
35	NC_012467	CTT	2	6	1942	1947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225855737
36	NC_012467	CTT	2	6	1952	1957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225855737
37	NC_012467	GTA	2	6	1969	1974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225855737
38	NC_012467	AGCA	2	8	2106	2113	50 %	0 %	25 %	25 %	225855737
39	NC_012467	ATT	2	6	2149	2154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225855737
40	NC_012467	TGC	2	6	2169	2174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225855737
41	NC_012467	AG	3	6	2184	2189	50 %	0 %	50 %	0 %	225855737
42	NC_012467	A	6	6	2278	2283	100 %	0 %	0 %	0 %	225855737
43	NC_012467	A	7	7	2294	2300	100 %	0 %	0 %	0 %	225855737
44	NC_012467	TGA	2	6	2304	2309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225855737
45	NC_012467	GAT	2	6	2365	2370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225855737
46	NC_012467	ACT	2	6	2500	2505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225855737
47	NC_012467	GTT	2	6	2608	2613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225855737
48	NC_012467	GTAAA	2	10	2642	2651	60 %	20 %	20 %	0 %	225855737
49	NC_012467	GAA	2	6	2653	2658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225855737
50	NC_012467	ACTT	2	8	2710	2717	25 %	50 %	0 %	25 %	225855737
51	NC_012467	GATT	2	8	2718	2725	25 %	50 %	25 %	0 %	225855737
52	NC_012467	CAG	2	6	2798	2803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225855737
53	NC_012467	TTG	2	6	2937	2942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225855738
54	NC_012467	A	6	6	2948	2953	100 %	0 %	0 %	0 %	225855738
55	NC_012467	AAAAT	2	10	3029	3038	80 %	20 %	0 %	0 %	225855738
56	NC_012467	TGT	2	6	3055	3060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225855738
57	NC_012467	ATG	2	6	3062	3067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225855738
58	NC_012467	ATT	2	6	3101	3106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225855738
59	NC_012467	CAG	2	6	3206	3211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225855739
60	NC_012467	GCA	2	6	3280	3285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225855739
61	NC_012467	CGA	2	6	3299	3304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225855739
62	NC_012467	TGG	2	6	3323	3328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225855739
63	NC_012467	AACT	2	8	3353	3360	50 %	25 %	0 %	25 %	225855739
64	NC_012467	TGA	3	9	3516	3524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225855739
65	NC_012467	TTC	2	6	3701	3706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225855739
66	NC_012467	AGA	2	6	3726	3731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225855739
67	NC_012467	GAC	2	6	3801	3806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225855739
68	NC_012467	CAAA	2	8	3876	3883	75 %	0 %	0 %	25 %	225855739
69	NC_012467	AGT	2	6	3915	3920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225855739
70	NC_012467	GAA	2	6	3943	3948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225855739
71	NC_012467	GAT	2	6	3961	3966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225855739
72	NC_012467	A	6	6	3973	3978	100 %	0 %	0 %	0 %	225855739
73	NC_012467	CTTG	2	8	4044	4051	0 %	50 %	25 %	25 %	225855739
74	NC_012467	ACTT	2	8	4060	4067	25 %	50 %	0 %	25 %	225855739
75	NC_012467	AAG	2	6	4082	4087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225855739
76	NC_012467	CTC	2	6	4121	4126	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225855739
77	NC_012467	AGC	2	6	4128	4133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225855739
78	NC_012467	TAT	2	6	4137	4142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225855739
79	NC_012467	AAG	2	6	4229	4234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225855739
80	NC_012467	GAA	2	6	4249	4254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225855739
81	NC_012467	AT	3	6	4263	4268	50 %	50 %	0 %	0 %	225855739
82	NC_012467	AAAT	2	8	4376	4383	75 %	25 %	0 %	0 %	225855740
83	NC_012467	AAACA	2	10	4431	4440	80 %	0 %	0 %	20 %	225855740
84	NC_012467	TTGA	2	8	4457	4464	25 %	50 %	25 %	0 %	225855740
85	NC_012467	GAA	2	6	4474	4479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225855740
86	NC_012467	AC	3	6	4496	4501	50 %	0 %	0 %	50 %	225855740
87	NC_012467	A	6	6	4548	4553	100 %	0 %	0 %	0 %	225855740
88	NC_012467	ATGA	2	8	4580	4587	50 %	25 %	25 %	0 %	225855740
89	NC_012467	TTA	2	6	4610	4615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225855740
90	NC_012467	GAT	2	6	4658	4663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225855740
91	NC_012467	CAG	2	6	4707	4712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225855740
92	NC_012467	TAT	2	6	4735	4740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225855740
93	NC_012467	ATTGGA	2	12	4778	4789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225855740
94	NC_012467	GTT	2	6	4811	4816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225855740
95	NC_012467	CAT	2	6	4817	4822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225855740
96	NC_012467	GAT	2	6	4844	4849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225855740
97	NC_012467	ACT	2	6	4896	4901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225855740
98	NC_012467	TTA	2	6	4961	4966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225855741
99	NC_012467	A	6	6	4994	4999	100 %	0 %	0 %	0 %	225855741
100	NC_012467	CTA	2	6	5055	5060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225855741
101	NC_012467	TTGCAA	2	12	5067	5078	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	225855741
102	NC_012467	AGA	2	6	5092	5097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225855741
103	NC_012467	GAT	2	6	5198	5203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225855741
104	NC_012467	TGG	2	6	5211	5216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225855741
105	NC_012467	A	6	6	5238	5243	100 %	0 %	0 %	0 %	225855741
106	NC_012467	T	6	6	5269	5274	0 %	100 %	0 %	0 %	225855741
107	NC_012467	GCA	2	6	5315	5320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225855741
108	NC_012467	GATT	2	8	5325	5332	25 %	50 %	25 %	0 %	225855741
109	NC_012467	GAA	2	6	5384	5389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225855741
110	NC_012467	GAG	2	6	5478	5483	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225855741
111	NC_012467	T	6	6	5534	5539	0 %	100 %	0 %	0 %	225855741
112	NC_012467	TGA	2	6	5542	5547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225855741
113	NC_012467	GAAA	2	8	5590	5597	75 %	0 %	25 %	0 %	225855741
114	NC_012467	GA	3	6	5641	5646	50 %	0 %	50 %	0 %	225855741
115	NC_012467	AGA	2	6	5725	5730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225855741
116	NC_012467	TCA	2	6	5746	5751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225855741
117	NC_012467	TGA	2	6	5851	5856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225855741
118	NC_012467	TGA	2	6	5868	5873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225855741
119	NC_012467	AGA	2	6	5917	5922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225855741
120	NC_012467	A	6	6	5984	5989	100 %	0 %	0 %	0 %	225855741
121	NC_012467	TCAAT	2	10	6058	6067	40 %	40 %	0 %	20 %	225855741
122	NC_012467	TTTTC	2	10	6098	6107	0 %	80 %	0 %	20 %	225855741
123	NC_012467	AGA	2	6	6112	6117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225855741
124	NC_012467	A	7	7	6131	6137	100 %	0 %	0 %	0 %	225855741
125	NC_012467	ATT	2	6	6149	6154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225855741
126	NC_012467	GGA	2	6	6190	6195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225855741
127	NC_012467	CGT	2	6	6359	6364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225855741
128	NC_012467	ACA	2	6	6373	6378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225855741
129	NC_012467	AG	3	6	6391	6396	50 %	0 %	50 %	0 %	225855741
130	NC_012467	TGT	2	6	6433	6438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225855741
131	NC_012467	CAT	2	6	6440	6445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225855741
132	NC_012467	AT	3	6	6580	6585	50 %	50 %	0 %	0 %	225855741
133	NC_012467	TAAAT	2	10	6616	6625	60 %	40 %	0 %	0 %	225855741
134	NC_012467	TGA	2	6	6682	6687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225855741
135	NC_012467	ACTCT	2	10	6697	6706	20 %	40 %	0 %	40 %	225855741
136	NC_012467	TGA	4	12	6742	6753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225855741
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138	NC_012467	GTA	2	6	6807	6812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225855741
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143	NC_012467	TGA	2	6	7171	7176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225855741
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267	NC_012467	ATG	2	6	12829	12834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225855748
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