MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae JJA

Total Repeats: 35738

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012466	GAAA	2	8	199	206	75 %	0 %	25 %	0 %	225853612
2	NC_012466	AAGA	2	8	240	247	75 %	0 %	25 %	0 %	225853612
3	NC_012466	TCA	2	6	291	296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225853612
4	NC_012466	GAAATG	2	12	338	349	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	225853612
5	NC_012466	AAC	2	6	360	365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225853612
6	NC_012466	ATT	2	6	374	379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225853612
7	NC_012466	GTA	2	6	380	385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853612
8	NC_012466	GAA	2	6	467	472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853612
9	NC_012466	AAAAG	2	10	541	550	80 %	0 %	20 %	0 %	225853612
10	NC_012466	GGA	2	6	659	664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225853612
11	NC_012466	TTA	2	6	686	691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225853612
12	NC_012466	GAAAT	2	10	702	711	60 %	20 %	20 %	0 %	225853612
13	NC_012466	A	6	6	715	720	100 %	0 %	0 %	0 %	225853612
14	NC_012466	AT	3	6	742	747	50 %	50 %	0 %	0 %	225853612
15	NC_012466	TTA	2	6	762	767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225853612
16	NC_012466	GAT	2	6	848	853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853612
17	NC_012466	A	7	7	871	877	100 %	0 %	0 %	0 %	225853612
18	NC_012466	GAA	2	6	890	895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853612
19	NC_012466	GAG	2	6	983	988	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225853612
20	NC_012466	A	8	8	1195	1202	100 %	0 %	0 %	0 %	225853612
21	NC_012466	TGC	2	6	1225	1230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225853612
22	NC_012466	ATA	2	6	1413	1418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225853612
23	NC_012466	GGAA	2	8	1434	1441	50 %	0 %	50 %	0 %	225853612
24	NC_012466	TCAT	2	8	1467	1474	25 %	50 %	0 %	25 %	225853612
25	NC_012466	AAAAT	2	10	1484	1493	80 %	20 %	0 %	0 %	225853612
26	NC_012466	TGAT	2	8	1497	1504	25 %	50 %	25 %	0 %	225853612
27	NC_012466	AATC	2	8	1533	1540	50 %	25 %	0 %	25 %	225853612
28	NC_012466	AAT	2	6	1554	1559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225853612
29	NC_012466	TAA	2	6	1734	1739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225853613
30	NC_012466	ATTT	2	8	1742	1749	25 %	75 %	0 %	0 %	225853613
31	NC_012466	TAC	2	6	1764	1769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225853613
32	NC_012466	AG	3	6	1772	1777	50 %	0 %	50 %	0 %	225853613
33	NC_012466	A	7	7	1895	1901	100 %	0 %	0 %	0 %	225853613
34	NC_012466	CTT	2	6	1925	1930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225853613
35	NC_012466	CTT	2	6	1942	1947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225853613
36	NC_012466	CTT	2	6	1952	1957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225853613
37	NC_012466	GTA	2	6	1969	1974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853613
38	NC_012466	AGCA	2	8	2106	2113	50 %	0 %	25 %	25 %	225853613
39	NC_012466	ATT	2	6	2149	2154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225853613
40	NC_012466	TGC	2	6	2169	2174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225853613
41	NC_012466	AG	3	6	2184	2189	50 %	0 %	50 %	0 %	225853613
42	NC_012466	A	6	6	2278	2283	100 %	0 %	0 %	0 %	225853613
43	NC_012466	A	7	7	2294	2300	100 %	0 %	0 %	0 %	225853613
44	NC_012466	TGA	2	6	2304	2309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853613
45	NC_012466	GAT	2	6	2365	2370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853613
46	NC_012466	ACT	2	6	2500	2505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225853613
47	NC_012466	GTT	2	6	2608	2613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225853613
48	NC_012466	GTAAA	2	10	2642	2651	60 %	20 %	20 %	0 %	225853613
49	NC_012466	GAA	2	6	2653	2658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853613
50	NC_012466	ACTT	2	8	2710	2717	25 %	50 %	0 %	25 %	225853613
51	NC_012466	GATT	2	8	2718	2725	25 %	50 %	25 %	0 %	225853613
52	NC_012466	CAG	2	6	2798	2803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225853613
53	NC_012466	TTG	2	6	2937	2942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225853614
54	NC_012466	A	6	6	2948	2953	100 %	0 %	0 %	0 %	225853614
55	NC_012466	AAAAT	2	10	3029	3038	80 %	20 %	0 %	0 %	225853614
56	NC_012466	TGT	2	6	3055	3060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225853614
57	NC_012466	ATG	2	6	3062	3067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853614
58	NC_012466	ATT	2	6	3101	3106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225853614
59	NC_012466	CAG	2	6	3206	3211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225853615
60	NC_012466	ATT	2	6	3246	3251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225853615
61	NC_012466	GCA	2	6	3280	3285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225853615
62	NC_012466	TGG	2	6	3323	3328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225853615
63	NC_012466	AACT	2	8	3353	3360	50 %	25 %	0 %	25 %	225853615
64	NC_012466	TGA	3	9	3516	3524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853615
65	NC_012466	TTC	2	6	3701	3706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225853615
66	NC_012466	AGA	2	6	3726	3731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853615
67	NC_012466	GAC	2	6	3801	3806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225853615
68	NC_012466	CAAA	2	8	3876	3883	75 %	0 %	0 %	25 %	225853615
69	NC_012466	AGT	2	6	3915	3920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853615
70	NC_012466	GAA	2	6	3943	3948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853615
71	NC_012466	GAT	2	6	3961	3966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853615
72	NC_012466	A	6	6	3973	3978	100 %	0 %	0 %	0 %	225853615
73	NC_012466	CTTG	2	8	4044	4051	0 %	50 %	25 %	25 %	225853615
74	NC_012466	ACTT	2	8	4060	4067	25 %	50 %	0 %	25 %	225853615
75	NC_012466	AAG	2	6	4082	4087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853615
76	NC_012466	CTC	2	6	4121	4126	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225853615
77	NC_012466	AGC	2	6	4128	4133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225853615
78	NC_012466	TAT	2	6	4137	4142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225853615
79	NC_012466	AAG	2	6	4229	4234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853615
80	NC_012466	GAA	2	6	4249	4254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853615
81	NC_012466	AT	3	6	4263	4268	50 %	50 %	0 %	0 %	225853615
82	NC_012466	AAAT	2	8	4377	4384	75 %	25 %	0 %	0 %	225853616
83	NC_012466	AAACA	2	10	4432	4441	80 %	0 %	0 %	20 %	225853616
84	NC_012466	TTGA	2	8	4458	4465	25 %	50 %	25 %	0 %	225853616
85	NC_012466	GAA	2	6	4475	4480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853616
86	NC_012466	AC	3	6	4497	4502	50 %	0 %	0 %	50 %	225853616
87	NC_012466	A	6	6	4549	4554	100 %	0 %	0 %	0 %	225853616
88	NC_012466	ATGA	2	8	4581	4588	50 %	25 %	25 %	0 %	225853616
89	NC_012466	TTA	2	6	4611	4616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225853616
90	NC_012466	GAT	2	6	4659	4664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853616
91	NC_012466	CAG	2	6	4708	4713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225853616
92	NC_012466	TAT	2	6	4736	4741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225853616
93	NC_012466	ATTGGA	2	12	4779	4790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853616
94	NC_012466	GTT	2	6	4812	4817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225853616
95	NC_012466	CAT	2	6	4818	4823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225853616
96	NC_012466	GAT	2	6	4845	4850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853616
97	NC_012466	ACT	2	6	4897	4902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225853616
98	NC_012466	TTA	2	6	4962	4967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225853617
99	NC_012466	A	6	6	4995	5000	100 %	0 %	0 %	0 %	225853617
100	NC_012466	CTA	2	6	5056	5061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225853617
101	NC_012466	TTGCAA	2	12	5068	5079	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	225853617
102	NC_012466	AGA	2	6	5093	5098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853617
103	NC_012466	TATC	2	8	5158	5165	25 %	50 %	0 %	25 %	225853617
104	NC_012466	GAT	2	6	5199	5204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853617
105	NC_012466	TGG	2	6	5212	5217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225853617
106	NC_012466	A	6	6	5239	5244	100 %	0 %	0 %	0 %	225853617
107	NC_012466	T	6	6	5270	5275	0 %	100 %	0 %	0 %	225853617
108	NC_012466	GATT	2	8	5326	5333	25 %	50 %	25 %	0 %	225853617
109	NC_012466	GAA	2	6	5385	5390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853617
110	NC_012466	GAG	2	6	5479	5484	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225853617
111	NC_012466	T	6	6	5535	5540	0 %	100 %	0 %	0 %	225853617
112	NC_012466	TGA	2	6	5543	5548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853617
113	NC_012466	GAAA	2	8	5591	5598	75 %	0 %	25 %	0 %	225853617
114	NC_012466	GA	3	6	5642	5647	50 %	0 %	50 %	0 %	225853617
115	NC_012466	AGA	2	6	5726	5731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853617
116	NC_012466	TGA	2	6	5852	5857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853617
117	NC_012466	TGA	2	6	5869	5874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853617
118	NC_012466	AGA	2	6	5918	5923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853617
119	NC_012466	A	6	6	5985	5990	100 %	0 %	0 %	0 %	225853617
120	NC_012466	TCAAT	2	10	6059	6068	40 %	40 %	0 %	20 %	225853617
121	NC_012466	TTTTC	2	10	6099	6108	0 %	80 %	0 %	20 %	225853617
122	NC_012466	AGA	2	6	6113	6118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853617
123	NC_012466	A	7	7	6132	6138	100 %	0 %	0 %	0 %	225853617
124	NC_012466	ATT	2	6	6150	6155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225853617
125	NC_012466	GGA	2	6	6191	6196	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225853617
126	NC_012466	CGT	2	6	6360	6365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225853617
127	NC_012466	ACA	2	6	6374	6379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225853617
128	NC_012466	AG	3	6	6392	6397	50 %	0 %	50 %	0 %	225853617
129	NC_012466	TGT	2	6	6434	6439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225853617
130	NC_012466	CAT	2	6	6441	6446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225853617
131	NC_012466	AT	3	6	6581	6586	50 %	50 %	0 %	0 %	225853617
132	NC_012466	TAAAT	2	10	6617	6626	60 %	40 %	0 %	0 %	225853617
133	NC_012466	TGA	2	6	6683	6688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853617
134	NC_012466	ACTCT	2	10	6698	6707	20 %	40 %	0 %	40 %	225853617
135	NC_012466	TGA	4	12	6743	6754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853617
136	NC_012466	TGA	2	6	6767	6772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853617
137	NC_012466	GAT	2	6	6795	6800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853617
138	NC_012466	GTA	2	6	6808	6813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853617
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141	NC_012466	TGT	2	6	7139	7144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225853617
142	NC_012466	TGA	2	6	7162	7167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853617
143	NC_012466	TGA	2	6	7172	7177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853617
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150	NC_012466	TTTA	2	8	7634	7641	25 %	75 %	0 %	0 %	225853617
151	NC_012466	GTCG	2	8	7695	7702	0 %	25 %	50 %	25 %	225853617
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158	NC_012466	TTGGT	2	10	8170	8179	0 %	60 %	40 %	0 %	225853617
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262	NC_012466	AGG	2	6	12475	12480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225853624
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264	NC_012466	AAG	2	6	12609	12614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853624
265	NC_012466	TTC	2	6	12675	12680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225853624
266	NC_012466	TAC	2	6	12688	12693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225853624
267	NC_012466	ATTCT	2	10	12806	12815	20 %	60 %	0 %	20 %	225853624
268	NC_012466	ATG	2	6	12830	12835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853624
269	NC_012466	GAG	2	6	12846	12851	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225853624
270	NC_012466	GTA	2	6	12882	12887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853624
271	NC_012466	AGC	2	6	12895	12900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225853624
272	NC_012466	AGA	2	6	12907	12912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853624
273	NC_012466	GAA	2	6	12950	12955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853624
274	NC_012466	GTT	2	6	12974	12979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225853624
275	NC_012466	CAG	2	6	13029	13034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225853624
276	NC_012466	TGCT	2	8	13074	13081	0 %	50 %	25 %	25 %	225853624
277	NC_012466	CT	3	6	13177	13182	0 %	50 %	0 %	50 %	225853624
278	NC_012466	A	6	6	13196	13201	100 %	0 %	0 %	0 %	225853624
279	NC_012466	GCA	2	6	13202	13207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225853624
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283	NC_012466	TTGG	2	8	13427	13434	0 %	50 %	50 %	0 %	225853624
284	NC_012466	AGA	2	6	13498	13503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853624
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288	NC_012466	TGC	2	6	13588	13593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225853624
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290	NC_012466	TGA	2	6	13630	13635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853624
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292	NC_012466	AAGA	2	8	13667	13674	75 %	0 %	25 %	0 %	225853624
293	NC_012466	TTG	2	6	13734	13739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225853624
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299	NC_012466	AACA	2	8	14076	14083	75 %	0 %	0 %	25 %	225853624
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302	NC_012466	ATT	2	6	14113	14118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225853624
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362	NC_012466	CAAG	2	8	23596	23603	50 %	0 %	25 %	25 %	225853632
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378	NC_012466	TAT	2	6	24323	24328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225853633
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382	NC_012466	GA	3	6	24367	24372	50 %	0 %	50 %	0 %	225853633
383	NC_012466	TG	3	6	24413	24418	0 %	50 %	50 %	0 %	225853633
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386	NC_012466	TGAG	2	8	24522	24529	25 %	25 %	50 %	0 %	225853633
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