MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae JJA

Total Repeats: 35738

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3002	NC_012466	AATC	2	8	183253	183260	50 %	25 %	0 %	25 %	225853796
3003	NC_012466	AAG	2	6	183287	183292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853796
3004	NC_012466	TGA	2	6	183327	183332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853796
3005	NC_012466	ATC	2	6	183350	183355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225853796
3006	NC_012466	TCA	2	6	183365	183370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225853796
3007	NC_012466	CTC	2	6	183475	183480	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225853796
3008	NC_012466	TGA	2	6	183543	183548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853796
3009	NC_012466	TTG	2	6	183550	183555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225853796
3010	NC_012466	T	6	6	183639	183644	0 %	100 %	0 %	0 %	225853797
3011	NC_012466	AG	3	6	183656	183661	50 %	0 %	50 %	0 %	225853797
3012	NC_012466	ATG	2	6	183820	183825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853797
3013	NC_012466	GTT	2	6	183834	183839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225853797
3014	NC_012466	GAGG	2	8	184020	184027	25 %	0 %	75 %	0 %	225853797
3015	NC_012466	T	6	6	184046	184051	0 %	100 %	0 %	0 %	225853797
3016	NC_012466	TCAA	2	8	184066	184073	50 %	25 %	0 %	25 %	225853797
3017	NC_012466	TTC	2	6	184074	184079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225853797
3018	NC_012466	TTGA	2	8	184088	184095	25 %	50 %	25 %	0 %	225853797
3019	NC_012466	TGA	2	6	184292	184297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853797
3020	NC_012466	GTA	2	6	184320	184325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853797
3021	NC_012466	TTTC	2	8	184336	184343	0 %	75 %	0 %	25 %	225853797
3022	NC_012466	TTC	2	6	184407	184412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225853797
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3025	NC_012466	AG	3	6	184554	184559	50 %	0 %	50 %	0 %	225853797
3026	NC_012466	TCAT	2	8	184722	184729	25 %	50 %	0 %	25 %	225853798
3027	NC_012466	A	6	6	184750	184755	100 %	0 %	0 %	0 %	225853798
3028	NC_012466	GTTG	2	8	184783	184790	0 %	50 %	50 %	0 %	225853798
3029	NC_012466	AG	3	6	184870	184875	50 %	0 %	50 %	0 %	225853798
3030	NC_012466	CTCG	2	8	184989	184996	0 %	25 %	25 %	50 %	225853798
3031	NC_012466	ACG	2	6	185006	185011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225853798
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3033	NC_012466	A	6	6	185180	185185	100 %	0 %	0 %	0 %	225853798
3034	NC_012466	ATG	2	6	185259	185264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853798
3035	NC_012466	AGCA	2	8	185291	185298	50 %	0 %	25 %	25 %	225853798
3036	NC_012466	AGG	2	6	185337	185342	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225853798
3037	NC_012466	TCTCT	2	10	185497	185506	0 %	60 %	0 %	40 %	225853798
3038	NC_012466	AGTG	2	8	185531	185538	25 %	25 %	50 %	0 %	225853798
3039	NC_012466	ACT	2	6	185646	185651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225853798
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3042	NC_012466	GAAT	2	8	185785	185792	50 %	25 %	25 %	0 %	225853798
3043	NC_012466	GTC	2	6	185831	185836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225853798
3044	NC_012466	CGT	2	6	185849	185854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225853798
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3046	NC_012466	TGTC	2	8	185958	185965	0 %	50 %	25 %	25 %	225853798
3047	NC_012466	GGC	2	6	185972	185977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	225853798
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3049	NC_012466	CAT	2	6	186070	186075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225853798
3050	NC_012466	CCTT	2	8	186114	186121	0 %	50 %	0 %	50 %	225853798
3051	NC_012466	AAT	2	6	186122	186127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225853798
3052	NC_012466	CAG	2	6	186159	186164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225853798
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3054	NC_012466	ACG	2	6	186348	186353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225853798
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3056	NC_012466	TTG	2	6	186423	186428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225853798
3057	NC_012466	CAG	2	6	186429	186434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225853798
3058	NC_012466	AGA	2	6	186514	186519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853798
3059	NC_012466	AAC	2	6	186569	186574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225853798
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3061	NC_012466	A	6	6	186671	186676	100 %	0 %	0 %	0 %	225853798
3062	NC_012466	TGAT	2	8	186759	186766	25 %	50 %	25 %	0 %	225853798
3063	NC_012466	CGGA	2	8	186784	186791	25 %	0 %	50 %	25 %	225853798
3064	NC_012466	AAG	2	6	186884	186889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853798
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3067	NC_012466	CAGC	2	8	187178	187185	25 %	0 %	25 %	50 %	225853798
3068	NC_012466	TAGC	2	8	187224	187231	25 %	25 %	25 %	25 %	225853798
3069	NC_012466	CGA	2	6	187281	187286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225853798
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3084	NC_012466	GCAG	2	8	188237	188244	25 %	0 %	50 %	25 %	225853799
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3092	NC_012466	AGTTA	2	10	188793	188802	40 %	40 %	20 %	0 %	225853800
3093	NC_012466	AAG	2	6	188823	188828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853800
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3096	NC_012466	A	7	7	189190	189196	100 %	0 %	0 %	0 %	225853801
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3103	NC_012466	TTAC	2	8	189395	189402	25 %	50 %	0 %	25 %	225853801
3104	NC_012466	T	6	6	189414	189419	0 %	100 %	0 %	0 %	225853801
3105	NC_012466	CAA	2	6	189433	189438	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225853801
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3108	NC_012466	CTT	2	6	189508	189513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225853801
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3115	NC_012466	GAA	2	6	189855	189860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853802
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3154	NC_012466	A	6	6	191726	191731	100 %	0 %	0 %	0 %	225853805
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3230	NC_012466	CTAT	2	8	196112	196119	25 %	50 %	0 %	25 %	225853808
3231	NC_012466	GAT	2	6	196126	196131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853808
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3234	NC_012466	AAC	2	6	196247	196252	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225853808
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3239	NC_012466	A	6	6	196510	196515	100 %	0 %	0 %	0 %	225853809
3240	NC_012466	CT	3	6	196531	196536	0 %	50 %	0 %	50 %	225853809
3241	NC_012466	TCG	2	6	196537	196542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225853809
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3243	NC_012466	CTGA	2	8	196659	196666	25 %	25 %	25 %	25 %	225853809
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3487	NC_012466	CT	3	6	209336	209341	0 %	50 %	0 %	50 %	225853831
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3490	NC_012466	AAG	2	6	209454	209459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853831
3491	NC_012466	GTG	2	6	209543	209548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225853831
3492	NC_012466	AGA	2	6	209676	209681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853832
3493	NC_012466	GTT	2	6	209713	209718	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225853832
3494	NC_012466	CGT	2	6	209728	209733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225853832
3495	NC_012466	TTG	4	12	209750	209761	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225853832
3496	NC_012466	AAG	2	6	209804	209809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225853832
3497	NC_012466	GAT	2	6	209836	209841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225853832
3498	NC_012466	AAC	2	6	209877	209882	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225853832
3499	NC_012466	TTG	2	6	209926	209931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225853832
3500	NC_012466	CTG	2	6	209936	209941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225853832

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