MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae JJA

Total Repeats: 35738

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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31002	NC_012466	GTCT	2	8	1847475	1847482	0 %	50 %	25 %	25 %	225855470
31003	NC_012466	GGA	2	6	1847495	1847500	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225855470
31004	NC_012466	CTT	2	6	1847558	1847563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225855470
31005	NC_012466	CTGG	2	8	1847607	1847614	0 %	25 %	50 %	25 %	225855470
31006	NC_012466	TCC	2	6	1847671	1847676	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225855470
31007	NC_012466	CTTA	2	8	1847682	1847689	25 %	50 %	0 %	25 %	225855470
31008	NC_012466	TAA	2	6	1847751	1847756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225855470
31009	NC_012466	CCT	2	6	1847782	1847787	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225855471
31010	NC_012466	CTAT	2	8	1847843	1847850	25 %	50 %	0 %	25 %	225855471
31011	NC_012466	AT	3	6	1847849	1847854	50 %	50 %	0 %	0 %	225855471
31012	NC_012466	T	6	6	1847872	1847877	0 %	100 %	0 %	0 %	225855471
31013	NC_012466	A	6	6	1847882	1847887	100 %	0 %	0 %	0 %	225855471
31014	NC_012466	CCTGAG	2	12	1848138	1848149	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	225855471
31015	NC_012466	AG	3	6	1848171	1848176	50 %	0 %	50 %	0 %	225855471
31016	NC_012466	ATC	2	6	1848193	1848198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225855471
31017	NC_012466	CTT	2	6	1848255	1848260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225855471
31018	NC_012466	AAG	2	6	1848295	1848300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225855471
31019	NC_012466	TCT	2	6	1848305	1848310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225855471
31020	NC_012466	CAA	2	6	1848342	1848347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225855471
31021	NC_012466	GTT	2	6	1848412	1848417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225855471
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31023	NC_012466	TCA	2	6	1848519	1848524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225855472
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31026	NC_012466	CCA	2	6	1848624	1848629	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225855472
31027	NC_012466	T	6	6	1848748	1848753	0 %	100 %	0 %	0 %	225855472
31028	NC_012466	TGA	2	6	1848796	1848801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225855472
31029	NC_012466	CTGCAC	2	12	1848805	1848816	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	225855472
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31031	NC_012466	CTG	2	6	1849021	1849026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225855472
31032	NC_012466	T	7	7	1849082	1849088	0 %	100 %	0 %	0 %	225855473
31033	NC_012466	T	6	6	1849095	1849100	0 %	100 %	0 %	0 %	225855473
31034	NC_012466	ATGGGT	2	12	1849212	1849223	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	225855473
31035	NC_012466	GCGACC	2	12	1849386	1849397	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	225855473
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31038	NC_012466	GATG	2	8	1849634	1849641	25 %	25 %	50 %	0 %	225855473
31039	NC_012466	TAC	2	6	1849716	1849721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225855473
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31041	NC_012466	CG	4	8	1849870	1849877	0 %	0 %	50 %	50 %	225855473
31042	NC_012466	TAG	2	6	1849909	1849914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225855473
31043	NC_012466	GCCT	2	8	1850035	1850042	0 %	25 %	25 %	50 %	225855474
31044	NC_012466	GCG	2	6	1850122	1850127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	225855474
31045	NC_012466	TCT	2	6	1850171	1850176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225855474
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31047	NC_012466	GAC	2	6	1850196	1850201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225855474
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31051	NC_012466	TCAA	2	8	1850405	1850412	50 %	25 %	0 %	25 %	225855474
31052	NC_012466	CGT	2	6	1850428	1850433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225855474
31053	NC_012466	GTA	2	6	1850437	1850442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225855474
31054	NC_012466	GGT	2	6	1850589	1850594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225855474
31055	NC_012466	ATC	2	6	1850686	1850691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225855474
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31057	NC_012466	A	7	7	1851086	1851092	100 %	0 %	0 %	0 %	225855475
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31060	NC_012466	CAT	2	6	1851148	1851153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225855475
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31062	NC_012466	GAT	2	6	1851271	1851276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225855475
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31064	NC_012466	TCT	2	6	1851303	1851308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225855475
31065	NC_012466	ACC	2	6	1851311	1851316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225855475
31066	NC_012466	T	6	6	1851355	1851360	0 %	100 %	0 %	0 %	225855475
31067	NC_012466	CA	3	6	1851361	1851366	50 %	0 %	0 %	50 %	225855475
31068	NC_012466	TCA	2	6	1851394	1851399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225855476
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31088	NC_012466	A	6	6	1852363	1852368	100 %	0 %	0 %	0 %	225855477
31089	NC_012466	GCG	2	6	1852518	1852523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	225855477
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31098	NC_012466	ATA	2	6	1852931	1852936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225855477
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31100	NC_012466	CTT	2	6	1853007	1853012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225855477
31101	NC_012466	ACCA	2	8	1853031	1853038	50 %	0 %	0 %	50 %	225855477
31102	NC_012466	CT	3	6	1853085	1853090	0 %	50 %	0 %	50 %	225855477
31103	NC_012466	ACC	2	6	1853144	1853149	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225855477
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31234	NC_012466	GAA	2	6	1860786	1860791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225855486
31235	NC_012466	TGA	2	6	1860814	1860819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225855486
31236	NC_012466	ATAC	2	8	1861001	1861008	50 %	25 %	0 %	25 %	225855486
31237	NC_012466	GA	3	6	1861040	1861045	50 %	0 %	50 %	0 %	225855486
31238	NC_012466	A	6	6	1861051	1861056	100 %	0 %	0 %	0 %	225855486
31239	NC_012466	ATTT	2	8	1861104	1861111	25 %	75 %	0 %	0 %	225855487
31240	NC_012466	CT	3	6	1861112	1861117	0 %	50 %	0 %	50 %	225855487
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31244	NC_012466	CTG	2	6	1861413	1861418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225855487
31245	NC_012466	TGA	2	6	1861433	1861438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225855487
31246	NC_012466	TCT	2	6	1861463	1861468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225855487
31247	NC_012466	GCT	2	6	1861481	1861486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225855487
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31249	NC_012466	TTC	2	6	1861504	1861509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225855487
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31252	NC_012466	CAT	2	6	1861582	1861587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225855487
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31263	NC_012466	TCA	2	6	1862004	1862009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225855487
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31302	NC_012466	ATC	2	6	1864807	1864812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225855490
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31335	NC_012466	TA	3	6	1867008	1867013	50 %	50 %	0 %	0 %	225855493
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31339	NC_012466	GACA	2	8	1867185	1867192	50 %	0 %	25 %	25 %	225855493
31340	NC_012466	GTCAAG	2	12	1867216	1867227	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	225855493
31341	NC_012466	CTA	2	6	1867253	1867258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225855493
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31343	NC_012466	AAT	2	6	1867352	1867357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225855493
31344	NC_012466	CAT	2	6	1867362	1867367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225855493
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31346	NC_012466	GTT	2	6	1867434	1867439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225855493
31347	NC_012466	CAT	2	6	1867488	1867493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225855493
31348	NC_012466	GT	3	6	1867550	1867555	0 %	50 %	50 %	0 %	225855493
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31468	NC_012466	GCT	2	6	1880651	1880656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225855503
31469	NC_012466	TCA	2	6	1880675	1880680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225855503
31470	NC_012466	AGTTGG	2	12	1880728	1880739	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	225855503
31471	NC_012466	GCA	2	6	1880804	1880809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225855503
31472	NC_012466	GCA	2	6	1880834	1880839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225855503
31473	NC_012466	CAC	3	9	1880862	1880870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225855503
31474	NC_012466	TAG	2	6	1880916	1880921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225855503
31475	NC_012466	TCA	2	6	1880922	1880927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225855503
31476	NC_012466	CAA	2	6	1880934	1880939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225855503
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31479	NC_012466	CGT	2	6	1881066	1881071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225855503
31480	NC_012466	CCA	2	6	1881074	1881079	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225855503
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31491	NC_012466	GATG	2	8	1881759	1881766	25 %	25 %	50 %	0 %	225855504
31492	NC_012466	CAG	2	6	1881828	1881833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225855504
31493	NC_012466	TAAA	2	8	1881865	1881872	75 %	25 %	0 %	0 %	225855504
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31496	NC_012466	TGA	2	6	1881996	1882001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225855504
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31498	NC_012466	CT	3	6	1882058	1882063	0 %	50 %	0 %	50 %	225855504
31499	NC_012466	CTT	2	6	1882083	1882088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225855504
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