MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae JJA

Total Repeats: 35738

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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30004	NC_012466	CATCCA	2	12	1792523	1792534	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	225855418
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30008	NC_012466	TCTGGA	2	12	1792876	1792887	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	225855418
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30010	NC_012466	GCT	2	6	1792900	1792905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225855418
30011	NC_012466	TCT	2	6	1793900	1793905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225855419
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30013	NC_012466	T	6	6	1793970	1793975	0 %	100 %	0 %	0 %	225855419
30014	NC_012466	CCA	2	6	1793989	1793994	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225855419
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30016	NC_012466	AG	3	6	1794031	1794036	50 %	0 %	50 %	0 %	225855419
30017	NC_012466	TGA	2	6	1794137	1794142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225855419
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30118	NC_012466	TA	3	6	1800791	1800796	50 %	50 %	0 %	0 %	225855429
30119	NC_012466	TCT	2	6	1800844	1800849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225855429
30120	NC_012466	A	6	6	1800922	1800927	100 %	0 %	0 %	0 %	225855429
30121	NC_012466	AAG	2	6	1800929	1800934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225855429
30122	NC_012466	TTTC	2	8	1800949	1800956	0 %	75 %	0 %	25 %	225855429
30123	NC_012466	GACT	2	8	1800986	1800993	25 %	25 %	25 %	25 %	225855429
30124	NC_012466	CTT	2	6	1800999	1801004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225855429
30125	NC_012466	TCA	2	6	1801009	1801014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225855429
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30129	NC_012466	GTA	2	6	1801828	1801833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225855431
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30131	NC_012466	CTT	2	6	1801884	1801889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225855431
30132	NC_012466	AGT	2	6	1801899	1801904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225855431
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30134	NC_012466	TTC	2	6	1801982	1801987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225855431
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30138	NC_012466	AGT	2	6	1802085	1802090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225855431
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30143	NC_012466	CTT	2	6	1802421	1802426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225855431
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30150	NC_012466	TCT	2	6	1803291	1803296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225855432
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30152	NC_012466	CAA	2	6	1803328	1803333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225855432
30153	NC_012466	AAG	2	6	1803419	1803424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225855432
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30155	NC_012466	ACAA	2	8	1803460	1803467	75 %	0 %	0 %	25 %	225855432
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30200	NC_012466	T	7	7	1805887	1805893	0 %	100 %	0 %	0 %	225855433
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30213	NC_012466	TTC	2	6	1806427	1806432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225855434
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30217	NC_012466	TTG	2	6	1806576	1806581	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225855434
30218	NC_012466	GATC	2	8	1806630	1806637	25 %	25 %	25 %	25 %	225855434
30219	NC_012466	GAA	2	6	1806699	1806704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225855434
30220	NC_012466	TCA	2	6	1806729	1806734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225855434
30221	NC_012466	GAC	2	6	1806793	1806798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225855434
30222	NC_012466	TCC	2	6	1806826	1806831	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225855434
30223	NC_012466	A	6	6	1806931	1806936	100 %	0 %	0 %	0 %	225855434
30224	NC_012466	CCTGAG	2	12	1806951	1806962	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	225855434
30225	NC_012466	GTTT	2	8	1807001	1807008	0 %	75 %	25 %	0 %	225855434
30226	NC_012466	GTC	2	6	1807015	1807020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225855434
30227	NC_012466	CTGTC	2	10	1807192	1807201	0 %	40 %	20 %	40 %	225855434
30228	NC_012466	TCA	2	6	1807334	1807339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225855435
30229	NC_012466	AAAT	2	8	1807357	1807364	75 %	25 %	0 %	0 %	225855435
30230	NC_012466	CTT	3	9	1807401	1807409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225855435
30231	NC_012466	TC	3	6	1807491	1807496	0 %	50 %	0 %	50 %	225855435
30232	NC_012466	CTG	2	6	1807510	1807515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225855435
30233	NC_012466	GAC	2	6	1807698	1807703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225855435
30234	NC_012466	CTT	2	6	1807752	1807757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225855435
30235	NC_012466	TTC	2	6	1807804	1807809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225855435
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30237	NC_012466	CCT	2	6	1807859	1807864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225855435
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30350	NC_012466	TTTA	2	8	1813295	1813302	25 %	75 %	0 %	0 %	225855443
30351	NC_012466	AATTT	2	10	1813326	1813335	40 %	60 %	0 %	0 %	225855443
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30475	NC_012466	AATT	2	8	1818560	1818567	50 %	50 %	0 %	0 %	225855446
30476	NC_012466	AGTC	2	8	1818576	1818583	25 %	25 %	25 %	25 %	225855446
30477	NC_012466	A	7	7	1818601	1818607	100 %	0 %	0 %	0 %	225855446
30478	NC_012466	ATT	2	6	1818639	1818644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225855446
30479	NC_012466	TGA	2	6	1818645	1818650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225855446
30480	NC_012466	A	6	6	1818682	1818687	100 %	0 %	0 %	0 %	225855446
30481	NC_012466	TTG	2	6	1818704	1818709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225855446
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30483	NC_012466	TTA	2	6	1818748	1818753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225855446
30484	NC_012466	TTA	2	6	1818757	1818762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225855446
30485	NC_012466	AGA	2	6	1818804	1818809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225855446
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30490	NC_012466	TAA	2	6	1819011	1819016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225855446
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30499	NC_012466	A	9	9	1819347	1819355	100 %	0 %	0 %	0 %	225855447
30500	NC_012466	ATT	2	6	1819373	1819378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225855447

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