MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae JJA

Total Repeats: 35738

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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26002	NC_012466	TGT	2	6	1539531	1539536	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225855151
26003	NC_012466	CGA	2	6	1539562	1539567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225855151
26004	NC_012466	CAAG	2	8	1539575	1539582	50 %	0 %	25 %	25 %	225855151
26005	NC_012466	GTC	2	6	1539610	1539615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225855151
26006	NC_012466	GAA	2	6	1539705	1539710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225855151
26007	NC_012466	GTT	3	9	1539742	1539750	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225855151
26008	NC_012466	T	6	6	1539761	1539766	0 %	100 %	0 %	0 %	225855151
26009	NC_012466	TCA	2	6	1539784	1539789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225855151
26010	NC_012466	TTG	2	6	1540095	1540100	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225855152
26011	NC_012466	ATC	2	6	1540102	1540107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225855152
26012	NC_012466	CTTGG	2	10	1540335	1540344	0 %	40 %	40 %	20 %	225855152
26013	NC_012466	ACA	2	6	1540412	1540417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225855152
26014	NC_012466	CGA	2	6	1540422	1540427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225855152
26015	NC_012466	GCT	2	6	1540457	1540462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225855152
26016	NC_012466	CTT	3	9	1540470	1540478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225855152
26017	NC_012466	TTC	2	6	1540480	1540485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225855152
26018	NC_012466	GTAA	2	8	1540546	1540553	50 %	25 %	25 %	0 %	225855152
26019	NC_012466	AAG	2	6	1540588	1540593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225855152
26020	NC_012466	GAT	2	6	1540639	1540644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225855152
26021	NC_012466	TACCAG	2	12	1540656	1540667	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	225855152
26022	NC_012466	CCA	2	6	1540691	1540696	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225855152
26023	NC_012466	CAAT	2	8	1540710	1540717	50 %	25 %	0 %	25 %	225855152
26024	NC_012466	GAA	2	6	1540723	1540728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225855152
26025	NC_012466	AGC	2	6	1540795	1540800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225855152
26026	NC_012466	T	6	6	1540829	1540834	0 %	100 %	0 %	0 %	225855152
26027	NC_012466	AGC	2	6	1540858	1540863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225855152
26028	NC_012466	AGC	2	6	1540879	1540884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225855152
26029	NC_012466	TGA	2	6	1540887	1540892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225855152
26030	NC_012466	CAG	2	6	1540917	1540922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225855152
26031	NC_012466	CAAG	2	8	1540938	1540945	50 %	0 %	25 %	25 %	225855152
26032	NC_012466	ACG	2	6	1540970	1540975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225855152
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26034	NC_012466	ACC	2	6	1541005	1541010	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225855152
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26037	NC_012466	GAT	2	6	1541206	1541211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225855152
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26039	NC_012466	CAA	2	6	1541241	1541246	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225855152
26040	NC_012466	AAG	2	6	1541261	1541266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225855152
26041	NC_012466	CAC	2	6	1541283	1541288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225855152
26042	NC_012466	CAT	2	6	1541332	1541337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225855152
26043	NC_012466	CCA	2	6	1541366	1541371	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225855152
26044	NC_012466	CA	3	6	1541390	1541395	50 %	0 %	0 %	50 %	225855152
26045	NC_012466	GAT	2	6	1541410	1541415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225855152
26046	NC_012466	TG	3	6	1541438	1541443	0 %	50 %	50 %	0 %	225855152
26047	NC_012466	GAT	2	6	1541533	1541538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225855152
26048	NC_012466	GAT	2	6	1541624	1541629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225855152
26049	NC_012466	ACA	2	6	1541645	1541650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225855152
26050	NC_012466	CTGTAC	2	12	1541673	1541684	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	225855152
26051	NC_012466	AAAG	2	8	1541713	1541720	75 %	0 %	25 %	0 %	225855152
26052	NC_012466	CTT	2	6	1541751	1541756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225855152
26053	NC_012466	T	7	7	1541854	1541860	0 %	100 %	0 %	0 %	225855152
26054	NC_012466	GATT	2	8	1542024	1542031	25 %	50 %	25 %	0 %	225855153
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26056	NC_012466	TGAT	2	8	1542130	1542137	25 %	50 %	25 %	0 %	225855153
26057	NC_012466	TATT	2	8	1542144	1542151	25 %	75 %	0 %	0 %	225855153
26058	NC_012466	T	6	6	1542172	1542177	0 %	100 %	0 %	0 %	225855153
26059	NC_012466	T	6	6	1542181	1542186	0 %	100 %	0 %	0 %	225855153
26060	NC_012466	T	6	6	1542204	1542209	0 %	100 %	0 %	0 %	225855153
26061	NC_012466	GAATG	2	10	1542255	1542264	40 %	20 %	40 %	0 %	225855154
26062	NC_012466	CGT	2	6	1542275	1542280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225855154
26063	NC_012466	AAG	2	6	1542306	1542311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225855154
26064	NC_012466	TGA	2	6	1542499	1542504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225855154
26065	NC_012466	AGG	2	6	1542684	1542689	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225855154
26066	NC_012466	TTGA	2	8	1542716	1542723	25 %	50 %	25 %	0 %	225855154
26067	NC_012466	CCAG	2	8	1542724	1542731	25 %	0 %	25 %	50 %	225855154
26068	NC_012466	GTC	2	6	1542794	1542799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225855154
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26070	NC_012466	CGTC	2	8	1542829	1542836	0 %	25 %	25 %	50 %	225855154
26071	NC_012466	ATG	2	6	1542917	1542922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225855154
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26073	NC_012466	ACC	2	6	1543209	1543214	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225855154
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26082	NC_012466	CTA	2	6	1543738	1543743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225855155
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26084	NC_012466	ATCT	2	8	1543774	1543781	25 %	50 %	0 %	25 %	225855155
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26088	NC_012466	CAT	2	6	1544048	1544053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225855155
26089	NC_012466	ATT	2	6	1544106	1544111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225855155
26090	NC_012466	GTC	2	6	1544145	1544150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225855155
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26099	NC_012466	TAC	2	6	1544508	1544513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225855155
26100	NC_012466	CTA	2	6	1544524	1544529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225855155
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26103	NC_012466	CTA	2	6	1544763	1544768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225855156
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26107	NC_012466	TAT	2	6	1545180	1545185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225855156
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26109	NC_012466	TC	3	6	1545249	1545254	0 %	50 %	0 %	50 %	225855156
26110	NC_012466	GGC	2	6	1545270	1545275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	225855156
26111	NC_012466	CTGA	2	8	1545361	1545368	25 %	25 %	25 %	25 %	225855156
26112	NC_012466	TTC	2	6	1545370	1545375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225855156
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26116	NC_012466	ATC	2	6	1545635	1545640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225855156
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26231	NC_012466	TCCCA	2	10	1552196	1552205	20 %	20 %	0 %	60 %	225855164
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26470	NC_012466	TC	4	8	1567276	1567283	0 %	50 %	0 %	50 %	225855182
26471	NC_012466	TCA	2	6	1567288	1567293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225855182
26472	NC_012466	TTTG	2	8	1567343	1567350	0 %	75 %	25 %	0 %	225855182
26473	NC_012466	TAG	2	6	1567480	1567485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225855182
26474	NC_012466	TGA	2	6	1567493	1567498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225855182
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26476	NC_012466	TAG	2	6	1567651	1567656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225855182
26477	NC_012466	T	6	6	1567666	1567671	0 %	100 %	0 %	0 %	225855182
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26480	NC_012466	TCT	2	6	1567798	1567803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225855182
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26495	NC_012466	T	6	6	1570068	1570073	0 %	100 %	0 %	0 %	225855184
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26497	NC_012466	CTTG	2	8	1570306	1570313	0 %	50 %	25 %	25 %	225855184
26498	NC_012466	TGG	2	6	1570365	1570370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225855184
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26500	NC_012466	GACG	2	8	1570424	1570431	25 %	0 %	50 %	25 %	225855184

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